Gene-Chemical Interaction Annotations
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References
Additional References at PubMed
Genomics
Clinical Variants
miRNA Target Status
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 136 | Count of miRNA genes: | 135 | Interacting mature miRNAs: | 136 | Transcripts: | ENST00000420557 | Prediction methods: | Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | |
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miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
Markers in Region
D11S3114 |
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D11S2560 |
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Expression
RNA-SEQ Expression
High: > 1000 TPM value
Medium: Between 11 and 1000 TPMLow: Between 0.5 and 10 TPM Below Cutoff: < 0.5 TPM
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | sensory system | visual system | adipose tissue | appendage | entire extraembryonic component | |
High | |||||||||||||||||
Medium | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||
Low | 356 | 72 | 734 | 406 | 163 | 406 | 445 | 165 | 2013 | 74 | 731 | 204 | 4 | 89 | 269 | 1 | |
Below cutoff | 1971 | 1996 | 958 | 187 | 749 | 49 | 3382 | 1655 | 1710 | 289 | 659 | 1281 | 149 | 1 | 1031 | 2156 | 4 |
Sequence
Nucleotide Sequences
RefSeq Acc Id: | ENST00000420557 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000685362 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000686023 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000686336 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000686606 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000686844 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000688160 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000689449 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000690362 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000692709 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NR_026780 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
Type: | NON-CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
Position: |
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Sequence: |
Protein Sequences
GenBank Protein | BAB14475 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EAW47434 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
Q9H8X3 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |