Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:dTDP-4-dehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose
go back to main search page
Accession:CHEBI:85368 term browser browse the term
Definition:A dTDP-sugar having 4-dehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose as the sugar component.
Synonyms:exact_synonym: thymidine 5'-[3-(2,6-dideoxy-alpha-D-threo-hexopyranosyl-4-ulose) dihydrogen diphosphate]
 related_synonym: Formula=C16H24N2O14P2;   InChI=1S/C16H24N2O14P2/c1-7-5-18(16(23)17-15(7)22)12-3-9(19)11(30-12)6-28-33(24,25)32-34(26,27)31-13-4-10(20)14(21)8(2)29-13/h5,8-13,19-20H,3-4,6H2,1-2H3,(H,24,25)(H,26,27)(H,17,22,23)/t8-,9+,10-,11-,12-,13-/m1/s1;   InChIKey=AONILRCSLAIOQE-LREJFELKSA-N;   SMILES=C[C@H]1O[C@@H](C[C@@H](O)C1=O)OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H](C[C@@H]1O)n1cc(C)c(=O)[nH]c1=O;   dTDP-4-keto-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose;   dTDP-4-oxo-2,6-dideoxy-D-glucose;   dTDP-4-oxo-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose
 xref: KEGG:C11922;   MetaCyc:CPD-13381;   PDBeChem:3YN;   PMID:21598943;   Reaxys:8298146
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:84537



show annotations for term's descendants           Sort by:

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19844
    role 19820
      biological role 19818
        biochemical role 19525
          metabolite 19512
            prokaryotic metabolite 18592
              bacterial metabolite 18561
                dTDP-4-dehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19844
    subatomic particle 19842
      composite particle 19842
        hadron 19842
          baryon 19842
            nucleon 19809
              atomic nucleus 19842
                atom 19842
                  main group element atom 19792
                    p-block element atom 19792
                      chalcogen 19548
                        oxygen atom 19491
                          oxygen molecular entity 19523
                            hydroxides 19331
                              oxoacid 18762
                                pnictogen oxoacid 14895
                                  phosphorus oxoacid 14485
                                    phosphoric acids 11416
                                      phosphoric acid 13924
                                        phosphoric acid derivative 13830
                                          phosphate 13829
                                            organic phosphate 13829
                                              carbohydrate phosphate 1862
                                                phospho sugar 1699
                                                  aldose phosphate 1705
                                                    aldopentose phosphate 1697
                                                      deoxyaldopentose phosphate 9
                                                        2-deoxyribose phosphate 9
                                                          2'-deoxyribonucleotide 8
                                                            2'-deoxyribonucleoside 5'-phosphate 8
                                                              2'-deoxyribonucleoside 5'-diphosphate 2
                                                                pyrimidine 2'-deoxyribonucleoside 5'-diphosphate 2
                                                                  dTDP 2
                                                                    dTDP-sugar 0
                                                                      dTDP-alpha-D-glucose 0
                                                                        dTDP-D-glucose 0
                                                                          dTDP-4-dehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose 0
paths to the root