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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | dehydrated hereditary stomatocytosis 1 | | ISO | RGD:1318815 | 7240710 | | OMIM | | Hereditary Lymphedema III | | ISO | RGD:1318815 | 7240710 | | OMIM | | |
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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | dehydrated hereditary stomatocytosis 1 | | ISO | RGD:1318815 | 7240710 | | OMIM | | Hereditary Lymphedema III | | ISO | RGD:1318815 | 7240710 | | OMIM | | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | OMIM Disease Annotation Pipeline | OMIM Disease Annotation Pipeline |
3. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
4. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PMID:8889548 | PMID:16854388 | PMID:20016066 | PMID:20813920 | PMID:22343900 | PMID:26390154 | PMID:27756599 | PMID:29261642 | PMID:29469092 | PMID:29735991 | PMID:30004235 | PMID:30948157 |
PMID:31727906 | PMID:33649312 | PMID:33839418 | PMID:33910401 | PMID:34031557 | PMID:34359915 | PMID:34548087 | PMID:34818570 | PMID:35219748 | PMID:35318857 |
Piezo1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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PIEZO1 (Homo sapiens - human) |
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Piezo1 (Mus musculus - house mouse) |
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Piezo1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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PIEZO1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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PIEZO1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Piezo1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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PIEZO1 (Sus scrofa - pig) |
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PIEZO1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Piezo1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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RH131577 |
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RH141716 |
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MARC_12079-12080:1004624307:1 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 1 | 26 | 28 | 22 | 12 | 22 | 4 | 21 | 30 | 11 | |||
Low | 2 | 17 | 29 | 19 | 7 | 19 | 8 | 11 | 70 | 14 | 10 | 8 | |
Below cutoff | 1 |
RefSeq Transcripts | NM_001077200 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_008772626 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_008772627 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017601325 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097875 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097876 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XR_005496668 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | AB161229 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
AC134009 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BQ196181 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
FQ225645 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000313 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000091139 ⟹ ENSRNOP00000069995 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000105150 ⟹ ENSRNOP00000077382 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001077200 ⟹ NP_001070668 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_008772626 ⟹ XP_008770848 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_008772627 ⟹ XP_008770849 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017601325 ⟹ XP_017456814 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039097875 ⟹ XP_038953803 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039097876 ⟹ XP_038953804 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XR_005496668 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | NON-CODING | ||||||||
Position: |
|
Protein RefSeqs | NP_001070668 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_008770848 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_008770849 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_017456814 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038953803 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038953804 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | BAF03564 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
Q0KL00 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001070668 ⟸ NM_001077200 |
- UniProtKB: | Q0KL00 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_008770849 ⟸ XM_008772627 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_008770848 ⟸ XM_008772626 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017456814 ⟸ XM_017601325 |
- Peptide Label: | isoform X3 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000069995 ⟸ ENSRNOT00000091139 |
RefSeq Acc Id: | XP_038953804 ⟸ XM_039097876 |
- Peptide Label: | isoform X3 |
RefSeq Acc Id: | XP_038953803 ⟸ XM_039097875 |
- Peptide Label: | isoform X3 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000077382 ⟸ ENSRNOT00000105150 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-Q0KL00-F1-model_v2 | AlphaFold | Q0KL00 | 1-2535 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13701209 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R11733 | ||||||||
Type: | single initiation site | ||||||||
Name: | Piezo1_1 | ||||||||
Description: | piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1308822 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-5393 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000056786 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000069995 | ENTREZGENE |
ENSRNOP00000069995.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOP00000077382 | ENTREZGENE | |
ENSRNOP00000077382.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000091139 | ENTREZGENE |
ENSRNOT00000091139.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOT00000105150 | ENTREZGENE | |
ENSRNOT00000105150.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
InterPro | Piezo | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Piezo_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Piezo_RRas-bd_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:361430 | UniProtKB/Swiss-Prot |
NCBI Gene | 361430 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR13167 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | PIEZO | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Piezo_RRas_bdg | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PhenoGen | Piezo1 | PhenoGen |
UniProt | A0A0G2JWS3_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
A0A8I5Y135_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
PIEZ1_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
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2012-07-16 | Piezo1 | piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 | Fam38a | family with sequence similarity 38, member A | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-04-30 | Fam38a | family with sequence similarity 38, member A | Fam38a_predicted | family with sequence similarity 38, member A (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
2005-01-12 | Fam38a_predicted | family with sequence similarity 38, member A (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |