Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Parkinson's disease | | ISO | GAK (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:20711177 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 |
Welcome {{ username}}
Message Center
{{ messageCount }} Messages
Watched Genes
{{$index + 1}}. {{ watchedObject.symbol }} (RGD ID:{{watchedObject.rgdId}})
Watched Ontology Terms
{{gene.symbol}}: {{ gene.description }}
|
| You must be logged in to use this feature |
| {{ loginError }} |
|
|
Analyze GeneStrainQTL List |
 Gene Annotator (Functional Annotation) unavailable |
 Gene Annotator (Annotation Distribution) unavailable |
 Variant Visualizer (Genomic Variants) unavailble Variant Visualizer (Genomic Variants) unavailable |
Gene Annotator (Functional Annotation) |
Gene Annotator (Annotation Distribution) |
Variant Visualizer (Genomic Variants) |
 InterViewer (Protein-Protein Interactions) unavailable |
 Gviewer (Genome Viewer) unavailable |
 Variant Visualizer (Damaging Variants) unavailble Variant Visualizer (Damaging Variants) unavailable |
InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
GViewer (Genome Viewer) |
Variant Visualizer (Damaging Variants) |
 Gene Annotator (Annotation Comparison) unavailable |
 OLGA (Gene List Generator) unavailable |
 |
Gene Annotator (Annotation Comparison) |
OLGA (Gene List Generator) |
Excel (Download) |
 MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
 GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
|
MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
|
||||||||||
Gene-Chemical Interaction Annotations Click to see Annotation Detail View
Gene Ontology Annotations Click to see Annotation Detail View
Biological Process
Cellular Component
Molecular Function
Phenotype Annotations Click to see Annotation Detail View
Mammalian Phenotype
Disease Annotations
Click to see Annotation Detail View
|
|
Gene-Chemical Interaction Annotations
Click to see Annotation Detail View
Gene Ontology Annotations
Click to see Annotation Detail View
Biological Process
|
|
|
Cellular Component
|
|
Molecular Function
|
|
|
Phenotype Annotations
Click to see Annotation Detail View
Mammalian Phenotype
|
|
|
References
References - curated
| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Electronic Transfer of Homolog Data | MGD and Homologene mouse data transfer |
| 2. | MGDs mouse GO annotations | MGD data from the GO Consortium |
| 3. | Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNAs. | Okazaki Y, etal., Nature. 2002 Dec 5;420(6915):563-73. |
| 4. | Mouse MP Annotation Import Pipeline | RGD automated import pipeline |
| 5. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 6. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
Additional References at PubMed
| PMID:8889548 | PMID:10349636 | PMID:11042159 | PMID:11076861 | PMID:11217851 | PMID:12477932 | PMID:12520002 | PMID:12904583 | PMID:15226823 | PMID:15489334 | PMID:15752756 | PMID:15782199 |
| PMID:16141072 | PMID:16141073 | PMID:16602821 | PMID:17937931 | PMID:18434600 | PMID:19371378 | PMID:20160091 | PMID:21677750 | PMID:21873635 | PMID:22022498 | PMID:24138026 | PMID:24457600 |
| PMID:24510904 | PMID:25044020 | PMID:26345367 | PMID:30550785 | PMID:30623173 | PMID:32325033 | PMID:32554809 | PMID:32581705 | PMID:33208557 | PMID:35449600 |
Genomics
Comparative Map Data
| Gak (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GAK (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gak (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gak (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GAK (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GAK (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gak (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GAK (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GAK (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gak (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Variants
.
Variants in Gak
1686 total Variants 
|
