NR3C1 (nuclear receptor subfamily 3 group C member 1) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: NR3C1 (nuclear receptor subfamily 3 group C member 1) Homo sapiens
Analyze
Symbol: NR3C1
Name: nuclear receptor subfamily 3 group C member 1
RGD ID: 732227
HGNC Page HGNC
Description: Exhibits several functions, including DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; Hsp90 protein binding activity; and transcription regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Involved in cellular response to dexamethasone stimulus; cellular response to transforming growth factor beta stimulus; and regulation of transcription by RNA polymerase II. Localizes to cytosol; nuclear speck; and protein-containing complex. Implicated in several diseases, including anorexia nervosa; lung disease (multiple); major depressive disorder; obesity; and renal cell carcinoma. Biomarker of several diseases, including lung disease (multiple); lupus nephritis; nephrotic syndrome (multiple); obstructive sleep apnea; and primary biliary cholangitis.
Type: protein-coding
RefSeq Status: REVIEWED
Also known as: GCCR; GCR; GCRST; glucocorticoid nuclear receptor variant 1; glucocorticoid receptor; GR; GRL; nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant DL-1; nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant hGR-B(54); nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant hGR-B(77); nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant hGR-B(93); nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant NS-1; nuclear receptor subfamily 3, group c, member 1; nuclear receptor subfamily 3, group C, member 1 (glucocorticoid receptor)
RGD Orthologs
Mouse
Rat
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Genes
More Info more info ...
Related Pseudogenes: NR3C1P1  
Allele / Splice: See ClinVar data
Latest Assembly: GRCh38 - Human Genome Assembly GRCh38
Position:
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh38.p13 Ensembl5143,277,931 - 143,435,512 (-)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh385143,277,931 - 143,435,512 (-)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh375142,657,496 - 142,815,077 (-)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 365142,637,689 - 142,795,270 (-)NCBINCBI36hg18NCBI36
Build 345142,639,324 - 142,763,087NCBI
Celera5138,738,770 - 138,896,297 (-)NCBI
Cytogenetic Map5q31.3NCBI
HuRef5137,804,733 - 137,962,312 (-)NCBIHuRef
CHM1_15142,091,205 - 142,248,804 (-)NCBICHM1_1
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Disease Annotations     Click to see Annotation Detail View
46, XX Disorders of Sex Development  (EXP)
anorexia nervosa  (IDA)
asthma  (IAGP,IDA,IEP,ISO)
atrial fibrillation  (EXP)
bipolar disorder  (EXP)
brain ischemia  (ISO)
Burns  (ISO)
cataract  (ISO)
chronic obstructive pulmonary disease  (IDA,IEP)
Cocaine-Related Disorders  (EXP)
congestive heart failure  (ISO)
coronary artery disease  (IAGP)
Cushing Syndrome  (IDA,ISO)
Drug-Related Side Effects and Adverse Reactions  (EXP)
Edema  (ISO)
end stage renal disease  (ISO)
endometriosis  (EXP)
Endotoxemia  (ISO)
Experimental Autoimmune Encephalomyelitis  (ISO)
Experimental Diabetes Mellitus  (ISO)
Fetal Growth Retardation  (ISO)
Glucocorticoid Receptor Deficiency  (IAGP)
glucose metabolism disease  (EXP)
Hereditary Neoplastic Syndromes  (IAGP)
hypertension  (EXP,ISO)
hypokalemia  (EXP)
interstitial lung disease  (IEP)
lipoid nephrosis  (IEP)
lung disease  (IAGP,ISO)
lung non-small cell carcinoma  (IEP)
lupus nephritis  (IEP,ISO)
major depressive disorder  (IAGP)
Malocclusion  (ISO)
mental depression  (EXP,ISO)
mood disorder  (EXP)
muscular atrophy  (ISO)
nephrotic syndrome  (IEP)
nephrotic syndrome type 2  (IEP)
Neurodevelopmental Disorders  (IAGP)
obesity  (IAGP,IEA,ISO)
obstructive lung disease  (EXP)
obstructive sleep apnea  (IEP)
ocular hypertension  (EXP)
Perennial Allergic Rhinitis  (IEP)
polycystic ovary syndrome  (ISO)
post-traumatic stress disorder  (ISO)
primary biliary cholangitis  (IEP)
primary hyperaldosteronism  (ISS)
prostate cancer  (IAGP)
Prostatic Neoplasms  (EXP)
psychotic disorder  (EXP)
pulmonary sarcoidosis  (IEP)
renal cell carcinoma  (IDA,IEP)
rheumatoid arthritis  (ISO)
schizophrenia  (EXP)
Sepsis  (ISO)
sinusitis  (IEP)
status epilepticus  (ISO)
Stroke  (ISO)
Transplant Rejection  (IDA)
type 2 diabetes mellitus  (ISO)
uveitis  (ISO)
visual epilepsy  (ISO)

Gene-Chemical Interaction Annotations     Click to see Annotation Detail View
(+)-pilocarpine  (ISO)
(-)-anisomycin  (EXP)
(-)-epigallocatechin 3-gallate  (EXP)
(3,4-dihydroxyphenyl)acetic acid  (ISO)
(S)-amphetamine  (ISO)
(S)-colchicine  (EXP)
(S)-nicotine  (ISO)
1,1,1-Trichloro-2-(o-chlorophenyl)-2-(p-chlorophenyl)ethane  (EXP)
1,2,3,4,7,8-Hexachlorodibenzofuran  (ISO)
1,2-dimethylhydrazine  (ISO)
1,4-dithiothreitol  (EXP,ISO)
1-[2-(benzhydryloxy)ethyl]-4-(3-phenylpropyl)piperazine  (ISO)
1-[3-(dimethylamino)propyl]-1-(4-fluorophenyl)-1,3-dihydro-2-benzofuran-5-carbonitrile  (EXP)
1-bromopropane  (ISO)
1-chloro-2,4-dinitrobenzene  (EXP)
1-naphthyl isothiocyanate  (ISO)
11-deoxycorticosterone  (EXP,ISO)
11-deoxycortisol  (EXP)
15-deoxy-Delta(12,14)-prostaglandin J2  (EXP,ISO)
17alpha-ethynylestradiol  (ISO)
17alpha-hydroxyprogesterone  (EXP)
17beta-estradiol  (EXP,ISO)
17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one  (ISO)
2,2',4,4',5,5'-hexachlorobiphenyl  (EXP)
2,2',4,4'-Tetrabromodiphenyl ether  (EXP,ISO)
2,2',4,4'-tetrachlorobiphenyl  (EXP)
2,2',5,5'-tetrachlorobiphenyl  (EXP)
2,3',4,4',5-Pentachlorobiphenyl  (EXP)
2,3,4,7,8-Pentachlorodibenzofuran  (ISO)
2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine  (EXP,ISO)
2,4-dibromophenyl 2,4,5-tribromophenyl ether  (EXP)
2,4-dinitrotoluene  (ISO)
2,6-dinitrotoluene  (ISO)
2-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-\{[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl](methyl)amino\}-2-(propan-2-yl)pentanenitrile  (ISO)
2-aminophenol  (EXP)
3,3',5,5'-tetrabromobisphenol A  (EXP,ISO)
3,4-Dimethylbenzaldehyde  (EXP)
3,4-methylenedioxymethamphetamine  (ISO)
3-methylcholanthrene  (EXP,ISO)
3-phenoxybenzoic acid  (EXP)
3alpha-hydroxy-5beta-pregnan-20-one  (ISO)
4'-hydroxydiclofenac  (EXP)
4,4'-sulfonyldiphenol  (EXP,ISO)
4-(ethoxymethylene)-2-phenyloxazol-5-one  (EXP)
4-hydroxynon-2-enal  (ISO)
4-hydroxyphenyl retinamide  (ISO)
5-aza-2'-deoxycytidine  (EXP)
5-methoxy-2-\{[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]sulfinyl\}-1H-benzimidazole  (ISO)
6-propyl-2-thiouracil  (ISO)
8-Br-cAMP  (EXP)
acetamide  (ISO)
acrolein  (EXP)
actinomycin D  (ISO)
aflatoxin B1  (EXP)
agomelatine  (ISO)
albuterol  (EXP)
aldehydo-D-glucose  (ISO)
aldosterone  (EXP,ISO)
all-trans-retinoic acid  (EXP,ISO)
alpha-pinene  (EXP)
amiodarone  (ISO)
amitriptyline  (ISO)
ammonium chloride  (ISO)
amphetamine  (ISO)
anthra[1,9-cd]pyrazol-6(2H)-one  (ISO)
antirheumatic drug  (EXP)
arsane  (ISO)
arsenic acid  (ISO)
arsenic atom  (ISO)
arsenite(3-)  (EXP,ISO)
arsenous acid  (EXP)
atrazine  (EXP,ISO)
Aurin  (EXP)
avobenzone  (EXP)
aziridines  (EXP,ISO)
beclomethasone  (EXP,ISO)
benzbromarone  (ISO)
benzene  (EXP)
benzo[a]pyrene  (EXP,ISO)
benzo[a]pyrene diol epoxide I  (EXP)
Benzoyl peroxide  (ISO)
betamethasone  (EXP)
bifenthrin  (EXP)
bis(2-chloroethyl) sulfide  (EXP)
bis(2-ethylhexyl) phthalate  (EXP)
bisphenol A  (EXP,ISO)
Bisphenol A diglycidyl ether  (EXP,ISO)
Bisphenol B  (EXP)
bisphenol F  (EXP,ISO)
bleomycin A2  (ISO)
budesonide  (EXP,ISO)
butachlor  (EXP)
butanal  (EXP)
Butylparaben  (EXP,ISO)
cadmium atom  (EXP,ISO)
cadmium dichloride  (EXP)
caffeine  (ISO)
carbamazepine  (EXP,ISO)
carbon nanotube  (ISO)
celecoxib  (ISO)
chlorpromazine  (ISO)
choline  (ISO)
chromium(6+)  (EXP)
ciclopirox  (EXP)
cidofovir anhydrous  (EXP)
ciglitazone  (ISO)
cisplatin  (EXP,ISO)
citalopram  (EXP)
clodronic acid  (EXP)
clofibrate  (ISO)
clotrimazole  (EXP)
clozapine  (ISO)
cobalt atom  (ISO)
cocaine  (EXP,ISO)
colforsin daropate hydrochloride  (EXP)
compound 48/80  (ISO)
copper(II) sulfate  (EXP)
corticosterone  (EXP,ISO)
corticotropin  (EXP)
cortisol  (EXP,ISO)
cortisone  (EXP)
cortivazol  (EXP)
coumestrol  (EXP)
curcumin  (EXP,ISO)
cycloheximide  (ISO)
cyclosporin A  (EXP,ISO)
cyhalothrin  (EXP)
cypermethrin  (EXP)
D-glucose  (ISO)
daunorubicin  (EXP)
DDE  (EXP)
DDT  (EXP)
deflazacort  (EXP)
dehydroepiandrosterone  (EXP)
desipramine  (EXP)
dexamethasone  (EXP,ISO)
diarsenic trioxide  (EXP)
dibutyl phthalate  (ISO)
dichloromethane  (ISO)
diclofenac  (EXP)
Dicyclohexyl phthalate  (ISO)
diisopropyl fluorophosphate  (EXP)
dioxygen  (EXP)
disodium selenite  (EXP)
dopamine  (ISO)
dorsomorphin  (EXP)
doxorubicin  (EXP,ISO)
elemental selenium  (EXP)
endrin  (ISO)
entinostat  (EXP)
ethanol  (ISO)
ethiofencarb  (EXP)
ethyl myristate  (EXP)
fenchone  (EXP)
fenvalerate  (ISO)
fludrocortisone  (EXP)
flumethasone  (EXP)
fluoranthene  (ISO)
fluoxetine  (EXP,ISO)
flutamide  (EXP,ISO)
fluticasone  (EXP,ISO)
folic acid  (ISO)
folpet  (ISO)
formaldehyde  (EXP)
formoterol fumarate  (EXP)
fumonisin B1  (ISO)
furan  (ISO)
Fusarenone X  (ISO)
gamma-hexachlorocyclohexane  (ISO)
genistein  (EXP)
gentamycin  (ISO)
geraniol  (EXP)
ginsenoside Re  (EXP)
glafenine  (ISO)
glucose  (ISO)
hexadecanoic acid  (EXP)
homovanillic acid  (ISO)
hydralazine  (EXP)
hydrogen peroxide  (EXP)
ibuprofen  (EXP,ISO)
idazoxan  (ISO)
irinotecan  (EXP)
isoquinolines  (EXP)
ketoconazole  (EXP,ISO)
L-1,4-dithiothreitol  (EXP,ISO)
L-ascorbic acid  (EXP)
L-ethionine  (ISO)
L-methionine  (ISO)
lamotrigine  (EXP)
lead diacetate  (ISO)
lead(0)  (ISO)
lead(2+)  (ISO)
leflunomide  (EXP,ISO)
lipopolysaccharide  (ISO)
lithium atom  (ISO)
lithium chloride  (ISO)
lithium hydride  (ISO)
medroxyprogesterone acetate  (EXP)
melatonin  (EXP,ISO)
menadione  (EXP)
mercury dibromide  (EXP)
mercury dichloride  (ISO)
metformin  (EXP)
methamphetamine  (ISO)
methapyrilene  (ISO)
methotrexate  (EXP)
methoxychlor  (EXP)
methylmercury chloride  (EXP)
methylparaben  (ISO)
methylprednisolone aceponate  (EXP)
methylseleninic acid  (EXP)
methyltestosterone  (ISO)
miconazole  (EXP)
mifepristone  (EXP,ISO)
mirex  (ISO)
mitomycin C  (ISO)
mitoxantrone  (EXP)
molybdate  (ISO)
mometasone furoate  (EXP,ISO)
morphine  (ISO)
N,O-dimethyltyramine  (ISO)
N-acetyl-L-cysteine  (EXP)
N-benzyloxycarbonyl-L-leucyl-L-leucyl-L-leucinal  (EXP,ISO)
N-butylbenzenesulfonamide  (EXP)
N-methyl-4-phenylpyridinium  (EXP)
N-nitrosodiethylamine  (ISO)
nefazodone  (ISO)
nickel dichloride  (EXP)
nickel sulfate  (EXP)
nicotine  (ISO)
nimesulide  (ISO)
nitric oxide  (EXP)
okadaic acid  (ISO)
omeprazole  (ISO)
oxaliplatin  (ISO)
ozone  (EXP,ISO)
paracetamol  (EXP)
paraquat  (EXP)
pararosaniline free base  (EXP)
parathion  (EXP)
perfluorooctane-1-sulfonic acid  (ISO)
perfluorooctanoic acid  (ISO)
phenobarbital  (EXP,ISO)
Phenoxybenzamine  (ISO)
phenylbutazone  (EXP)
phenylephrine  (ISO)
phenylmercury acetate  (EXP)
phenytoin  (EXP,ISO)
phorbol 13-acetate 12-myristate  (EXP,ISO)
phorone  (ISO)
phosgene  (ISO)
pirinixic acid  (ISO)
Polygodial  (ISO)
potassium chloride  (ISO)
potassium chromate  (EXP)
prednisolone  (EXP)
prednisone  (ISO)
prednylidene  (EXP)
pregnenolone 16alpha-carbonitrile  (EXP,ISO)
progesterone  (EXP,ISO)
promegestone  (EXP)
propiconazole  (ISO)
propylparaben  (EXP)
protoporphyrin  (EXP)
puromycin  (ISO)
quercetin  (EXP,ISO)
raloxifene  (EXP)
reactive oxygen species  (EXP)
reserpine  (ISO)
resmethrin  (EXP)
resveratrol  (EXP,ISO)
rifampicin  (EXP)
rimonabant  (ISO)
rotenone  (EXP)
S-methyl methanethiosulfonate  (ISO)
Salmeterol xinafoate  (EXP)
SB 203580  (EXP)
SB 431542  (EXP)
SCH 23390  (ISO)
selenium atom  (EXP)
selenous acid  (EXP)
senecionine  (ISO)
silicon dioxide  (ISO)
sirolimus  (ISO)
sodium arsenate  (ISO)
sodium arsenite  (EXP,ISO)
sodium dichromate  (ISO)
spiperone  (ISO)
spiroxamine  (EXP)
succimer  (ISO)
sulfasalazine  (EXP)
sulforaphane  (EXP)
sunitinib  (EXP)
tacrolimus hydrate  (ISO)
tamoxifen  (EXP,ISO)
Tanshinone I  (EXP)
tauroursodeoxycholic acid  (EXP,ISO)
tenofovir disoproxil fumarate  (EXP)
terbutaline  (EXP)
teriflunomide  (EXP)
tert-butyl hydroperoxide  (EXP)
testosterone  (ISO)
tetrachloromethane  (ISO)
tetramethrin  (EXP)
tetraphene  (ISO)
thioacetamide  (ISO)
thiram  (EXP)
thyroxine  (ISO)
titanium dioxide  (ISO)
tolcapone  (ISO)
tolterodine tartrate  (EXP)
tolylfluanid  (EXP,ISO)
topotecan  (ISO)
torcetrapib  (EXP)
triamcinolone  (EXP)
triamcinolone acetonide  (EXP,ISO)
tributyl phosphate  (EXP)
Tributyltin oxide  (ISO)
trichloroethene  (ISO)
trichostatin A  (EXP,ISO)
trifluoperazine  (ISO)
triphenyl phosphate  (EXP)
Triptolide  (EXP,ISO)
triptonide  (ISO)
troglitazone  (EXP)
trovafloxacin  (ISO)
undecan-2-one  (EXP)
urethane  (EXP)
ursodeoxycholic acid  (EXP,ISO)
valdecoxib  (ISO)
valproic acid  (EXP,ISO)
venlafaxine hydrochloride  (ISO)
verapamil  (ISO)
vinclozolin  (ISO)
vorinostat  (EXP)
zearalenone  (EXP)
zidovudine  (EXP)
zinc atom  (EXP,ISO)
zinc oxide  (EXP)
zinc(0)  (EXP,ISO)

Gene Ontology Annotations     Click to see Annotation Detail View

Biological Process
adrenal gland development  (ISO)
aging  (ISO)
androgen metabolic process  (ISO)
apoptotic process  (IEA)
brain development  (ISO)
cell division  (IEA)
cellular response to dexamethasone stimulus  (IMP,ISO)
cellular response to glucocorticoid stimulus  (IDA)
cellular response to magnesium ion  (ISO)
cellular response to steroid hormone stimulus  (IDA)
cellular response to transforming growth factor beta stimulus  (IDA)
chromatin organization  (IEA)
chromatin remodeling  (ISO)
chromatin-mediated maintenance of transcription  (ISO)
chromosome segregation  (IEA)
circadian rhythm  (ISO)
female pregnancy  (ISO)
glucocorticoid mediated signaling pathway  (IEA)
glucocorticoid metabolic process  (ISO)
glucocorticoid receptor signaling pathway  (IEA,ISO)
intracellular steroid hormone receptor signaling pathway  (IBA)
lung development  (ISO)
mammary gland duct morphogenesis  (ISO)
maternal behavior  (ISO)
muscle atrophy  (ISO)
negative regulation of apoptotic process  (ISO)
negative regulation of glucocorticoid mediated signaling pathway  (ISO)
negative regulation of synaptic plasticity  (ISO)
negative regulation of transcription by RNA polymerase II  (IDA,IMP)
negative regulation of transcription, DNA-templated  (IDA)
negative regulation of vascular permeability  (ISO)
positive regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development  (ISO)
positive regulation of dendritic spine development  (ISO)
positive regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway  (ISO)
positive regulation of glutamate secretion  (ISO)
positive regulation of neuron apoptotic process  (ISO)
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II  (IDA)
positive regulation of transcription by RNA polymerase II  (IDA,IMP,ISO)
regulation of cell population proliferation  (ISO)
regulation of glucocorticoid biosynthetic process  (ISO)
regulation of gluconeogenesis  (ISO)
regulation of glucose metabolic process  (ISO)
regulation of transcription by RNA polymerase II  (IBA)
regulation of transcription, DNA-templated  (IDA,IEA,ISO)
response to activity  (ISO)
response to arsenic-containing substance  (ISO)
response to calcium ion  (ISO)
response to corticosterone  (ISO)
response to dexamethasone  (ISO)
response to electrical stimulus  (ISO)
response to inactivity  (ISO)
response to insulin  (ISO)
response to mercury ion  (ISO)
response to radiation  (ISO)
signal transduction  (TAS)
transcription initiation from RNA polymerase II promoter  (TAS)

Cellular Component

Molecular Pathway Annotations     Click to see Annotation Detail View
References

References - curated
1. Arai Y, etal., Cancer Invest. 2008 Feb;26(1):35-40.
2. Bailey MA, etal., Hypertension. 2009 Oct;54(4):890-6. Epub 2009 Jul 27.
3. Baserga M, etal., Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol. 2007 May;292(5):R1943-55. Epub 2007 Feb 1.
4. Becker KG, etal., Nat Genet. 2004 May;36(5):431-2.
5. Bertorelli G, etal., Pulm Pharmacol Ther. 2008;21(1):214-21. Epub 2007 Mar 24.
6. Bousquet E, etal., PLoS One. 2012;7(11):e49036. doi: 10.1371/journal.pone.0049036. Epub 2012 Nov 9.
7. Chen P, etal., Int Urol Nephrol. 2011 Mar;43(1):167-74. Epub 2010 Apr 24.
8. Corvol H, etal., Respir Res. 2007 Nov 29;8:88.
9. de Carvalho CR, etal., Sarcoidosis. 1990 Sep;7(2):93-5.
10. Duma D, etal., Crit Care Med. 2004 Nov;32(11):2304-10.
11. Earp JC, etal., J Pharmacol Exp Ther. 2008 Aug;326(2):532-45. Epub 2008 Apr 30.
12. Ekuni D, etal., Neuromolecular Med. 2011 Sep;13(3):197-203. Epub 2011 Jul 13.
13. GOA_HUMAN data from the GO Consortium
14. Goldbart AD, etal., Pediatr Res. 2005 Feb;57(2):232-6. Epub 2004 Dec 20.
15. Han SH, etal., Nephrol Dial Transplant. 2008 Jan;23(1):169-75. Epub 2007 Sep 22.
16. He XJ, etal., Zhonghua Er Ke Za Zhi. 2005 Feb;43(2):109-12.
17. Ichimaru N, etal., Transpl Int. 2000;13(4):255-9.
18. Invitti C, etal., Biol Psychiatry. 1999 Jun 1;45(11):1467-71.
19. Ishida A, etal., Auris Nasus Larynx. 2010 Oct;37(5):584-8. Epub 2010 Feb 24.
20. Ke X, etal., Physiol Genomics. 2010 Jul 7;42(2):177-89. Epub 2010 Apr 13.
21. Korgun ET, etal., Folia Histochem Cytobiol. 2011;49(2):325-34.
22. Korn SH, etal., Respir Med. 1998 Sep;92(9):1102-9.
23. Kovacs P, etal., Biochem Biophys Res Commun 1997 Jun 18;235(2):343-8
24. Krishnamurthy P, etal., Horm Metab Res. 2008 Mar;40(3):194-8. Epub 2008 Feb 4.
25. Lee BH, etal., Neonatology. 2007;91(1):12-9. Epub 2006 Nov 10.
26. Li M, etal., Neurol Sci. 2011 Aug;32(4):625-31. Epub 2011 May 17.
27. Lin RC, etal., Hypertension. 2003 Mar;41(3):404-7. Epub 2003 Feb 10.
28. Liu C, etal., J Pharmacol Exp Ther. 2011 Oct;339(1):203-9. Epub 2011 Jul 7.
29. Liu DH, etal., Crit Care Med. 2002 Mar;30(3):623-7.
30. Liu L, etal., Zhongguo Zhong Yao Za Zhi. 2011 May;36(10):1342-7.
31. Liu T, etal., Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Bao. 2010 Apr;32(2):147-50. doi: 10.3881/j.issn.1000-503X.2010.02.004.
32. Lu X, etal., Zhong Xi Yi Jie He Xue Bao. 2009 Feb;7(2):121-4.
33. Lu YS, etal., Lung Cancer. 2006 Sep;53(3):303-10. Epub 2006 Jun 27.
34. Lyu J, etal., Invest Ophthalmol Vis Sci. 2003 May;44(5):2034-40.
35. Marissal-Arvy N, etal., Metabolism. 2010 Aug 17.
36. Marti A, etal., BMC Med Genet. 2006 May 25;7:50.
37. Michea L, etal., Hypertension. 2008 Aug;52(2):295-300. Epub 2008 Jun 30.
38. Ogino H, etal., J Infect Chemother. 2009 Apr;15(2):113-7. Epub 2009 Apr 25.
39. OMIM Disease Annotation Pipeline
40. Park E, etal., J Obstet Gynaecol Res. 2012 Feb;38(2):396-407. doi: 10.1111/j.1447-0756.2011.01705.x. Epub 2011 Dec 19.
41. Perez H, etal., Neurosci Lett. 2010 Oct 8;483(1):41-6. Epub 2010 Jul 30.
42. Perisic T, etal., Respiration. 2009;77(1):70-5. Epub 2008 Sep 18.
43. Pietras T, etal., Mol Biol Rep. 2010 Nov 27.
44. Pipeline to import Pathway Interaction Database annotations from NCI into RGD
45. Pipeline to import SMPDB annotations from SMPDB into RGD
46. Pratt WB, etal., Handb Exp Pharmacol. 2006;(172):111-38.
47. RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
48. RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions
49. RGD automated import pipeline for human HPO-to-gene-to-disease annotations
50. Roth M, etal., N Engl J Med. 2004 Aug 5;351(6):560-74.
51. Ruiz N, etal., Brain Res. 2011 Dec 2;1426:86-95. Epub 2011 Oct 8.
52. Saldiva PH, etal., Chest. 1985 Sep;88(3):417-9.
53. Shi KH, etal., Zhong Xi Yi Jie He Xue Bao. 2010 Aug;8(8):785-9.
54. Takano K, etal., J Pharmacol Exp Ther. 2011 Feb;336(2):381-90. Epub 2010 Nov 5.
55. ter Borg PC, etal., Neth J Med. 2004 Oct;62(9):326-31.
56. Tronche F, etal., Nat Genet. 1999 Sep;23(1):99-103.
57. Tziraki AA, etal., Clin Biochem. 2007 Nov;40(16-17):1188-93. Epub 2007 Aug 21.
58. van den Brandt J, etal., Am J Pathol. 2007 Mar;170(3):1041-53.
59. Wang TM, etal., Zhongguo Dang Dai Er Ke Za Zhi. 2010 Jan;12(1):47-50.
60. Watanabe S and Suzaki H, In Vivo. 2008 Jan-Feb;22(1):37-42.
61. Wu XL, etal., Chin J Integr Med. 2011 Apr;17(4):277-82. Epub 2011 Apr 21.
62. Wu YX, etal., Zhongguo Wei Zhong Bing Ji Jiu Yi Xue. 2011 Jul;23(7):426-9.
63. Yakirevich E, etal., Hum Pathol. 2011 Nov;42(11):1684-92. Epub 2011 Apr 29.
64. Zhang Y, etal., Clin Exp Pharmacol Physiol. 2010 Nov;37(11):1044-8. doi: 10.1111/j.1440-1681.2010.05429.x.
65. Zhao M, etal., Invest Ophthalmol Vis Sci. 2011 Aug 11;52(9):6340-7. Print 2011 Sep.
66. Zinker B, etal., Metabolism. 2007 Mar;56(3):380-7.
67. Zucchi FC, etal., Exp Transl Stroke Med. 2010 Sep 22;2(1):18.
Additional References at PubMed
PMID:1152650   PMID:1469072   PMID:1562545   PMID:1612132   PMID:1704018   PMID:1707881   PMID:1865905   PMID:1894621   PMID:1958537   PMID:2019585   PMID:2026589   PMID:2793174  
PMID:2867473   PMID:3597702   PMID:3841189   PMID:6261922   PMID:6266631   PMID:6509026   PMID:6621034   PMID:7254211   PMID:7264103   PMID:7295795   PMID:7491111   PMID:7621901  
PMID:7659084   PMID:7683692   PMID:7724608   PMID:7769088   PMID:7796394   PMID:7823959   PMID:7873448   PMID:7877627   PMID:7887964   PMID:8051160   PMID:8089152   PMID:8107808  
PMID:8125298   PMID:8139547   PMID:8157642   PMID:8223438   PMID:8269959   PMID:8288028   PMID:8290595   PMID:8316249   PMID:8341706   PMID:8349631   PMID:8358712   PMID:8358735  
PMID:8445027   PMID:8449898   PMID:8530516   PMID:8621522   PMID:8621628   PMID:8645634   PMID:8733011   PMID:8800208   PMID:8863343   PMID:8878484   PMID:8898375   PMID:9038175  
PMID:9079630   PMID:9089287   PMID:9115274   PMID:9128241   PMID:9148915   PMID:9150737   PMID:9154805   PMID:9162033   PMID:9195923   PMID:9199329   PMID:9215863   PMID:9261129  
PMID:9334248   PMID:9334723   PMID:9348235   PMID:9353307   PMID:9388192   PMID:9426156   PMID:9435432   PMID:9482670   PMID:9528750   PMID:9584182   PMID:9590696   PMID:9603979  
PMID:9637764   PMID:9649342   PMID:9671457   PMID:9703718   PMID:9742105   PMID:9817600   PMID:9873044   PMID:9874563   PMID:9915858   PMID:9920895   PMID:9928932   PMID:10066374  
PMID:10085091   PMID:10187825   PMID:10359081   PMID:10364267   PMID:10391209   PMID:10430878   PMID:10477749   PMID:10480874   PMID:10490647   PMID:10508170   PMID:10517667   PMID:10518526  
PMID:10566686   PMID:10567404   PMID:10601862   PMID:10639135   PMID:10659697   PMID:10688647   PMID:10691735   PMID:10713165   PMID:10713182   PMID:10731636   PMID:10784585   PMID:10848625  
PMID:10866662   PMID:10887960   PMID:10898924   PMID:10902803   PMID:10903152   PMID:10903900   PMID:10933727   PMID:10958685   PMID:10995388   PMID:11005817   PMID:11027313   PMID:11080152  
PMID:11096094   PMID:11101523   PMID:11117529   PMID:11119758   PMID:11146632   PMID:11152650   PMID:11154266   PMID:11158330   PMID:11162542   PMID:11229437   PMID:11238589   PMID:11250851  
PMID:11266503   PMID:11279115   PMID:11287026   PMID:11344238   PMID:11358809   PMID:11358960   PMID:11435610   PMID:11463861   PMID:11555652   PMID:11562347   PMID:11571596   PMID:11589680  
PMID:11591700   PMID:11673782   PMID:11689055   PMID:11701741   PMID:11704662   PMID:11708406   PMID:11710540   PMID:11711524   PMID:11739747   PMID:11751894   PMID:11792840   PMID:11812797  
PMID:11818365   PMID:11873873   PMID:11932321   PMID:11971959   PMID:11983486   PMID:11996936   PMID:11997177   PMID:12000743   PMID:12011091   PMID:12039077   PMID:12039962   PMID:12050230  
PMID:12093808   PMID:12099703   PMID:12114257   PMID:12114309   PMID:12118039   PMID:12144530   PMID:12145329   PMID:12151000   PMID:12193561   PMID:12208951   PMID:12225995   PMID:12237016  
PMID:12237292   PMID:12351458   PMID:12351702   PMID:12361945   PMID:12379213   PMID:12430185   PMID:12444143   PMID:12466272   PMID:12477485   PMID:12477932   PMID:12487626   PMID:12552091  
PMID:12569182   PMID:12581885   PMID:12595526   PMID:12612067   PMID:12634356   PMID:12637494   PMID:12642036   PMID:12686538   PMID:12711001   PMID:12730237   PMID:12738786   PMID:12748280  
PMID:12754700   PMID:12773562   PMID:12773573   PMID:12787894   PMID:12805402   PMID:12807506   PMID:12810720   PMID:12843156   PMID:12864802   PMID:12874288   PMID:12902338   PMID:12903052  
PMID:12917342   PMID:12920235   PMID:12933681   PMID:12974633   PMID:14521715   PMID:14522952   PMID:14616881   PMID:14617768   PMID:14634838   PMID:14715855   PMID:14733805   PMID:14739255  
PMID:14749509   PMID:14764763   PMID:14764810   PMID:14966297   PMID:14978255   PMID:14987994   PMID:15004035   PMID:15016838   PMID:15044598   PMID:15062560   PMID:15142377   PMID:15159550  
PMID:15171715   PMID:15212141   PMID:15265776   PMID:15265780   PMID:15276593   PMID:15289446   PMID:15292341   PMID:15372022   PMID:15380361   PMID:15459252   PMID:15462611   PMID:15489334  
PMID:15497438   PMID:15501915   PMID:15511603   PMID:15521959   PMID:15531761   PMID:15545613   PMID:15550679   PMID:15557560   PMID:15576061   PMID:15576464   PMID:15590693   PMID:15591061  
PMID:15591535   PMID:15604093   PMID:15638722   PMID:15657031   PMID:15698551   PMID:15713213   PMID:15725353   PMID:15746190   PMID:15755863   PMID:15761032   PMID:15769988   PMID:15770078  
PMID:15774500   PMID:15784617   PMID:15797250   PMID:15826950   PMID:15832179   PMID:15862824   PMID:15866175   PMID:15870285   PMID:15879558   PMID:15895983   PMID:15916966   PMID:15919839  
PMID:15933212   PMID:15941832   PMID:15955845   PMID:15956716   PMID:16083972   PMID:16131566   PMID:16134770   PMID:16143103   PMID:16150697   PMID:16189295   PMID:16192984   PMID:16204701  
PMID:16216909   PMID:16222046   PMID:16236267   PMID:16239257   PMID:16263717   PMID:16319314   PMID:16362036   PMID:16380507   PMID:16387802   PMID:16423881   PMID:16429131   PMID:16446173  
PMID:16450310   PMID:16458268   PMID:16469772   PMID:16523501   PMID:16580345   PMID:16606617   PMID:16610949   PMID:16610957   PMID:16615046   PMID:16619302   PMID:16621324   PMID:16624805  
PMID:16636127   PMID:16638864   PMID:16648810   PMID:16676134   PMID:16684836   PMID:16728402   PMID:16728546   PMID:16740143   PMID:16759008   PMID:16762839   PMID:16806906   PMID:16809634  
PMID:16849409   PMID:16855182   PMID:16888650   PMID:16890204   PMID:16895953   PMID:16914312   PMID:16971495   PMID:16973758   PMID:16980656   PMID:17003263   PMID:17043312   PMID:17065567  
PMID:17070695   PMID:17081986   PMID:17116691   PMID:17133261   PMID:17167179   PMID:17184882   PMID:17185395   PMID:17186943   PMID:17236775   PMID:17239375   PMID:17242171   PMID:17242172  
PMID:17291258   PMID:17382897   PMID:17387179   PMID:17392827   PMID:17395275   PMID:17404046   PMID:17407502   PMID:17438138   PMID:17442162   PMID:17455211   PMID:17460547   PMID:17490654  
PMID:17496926   PMID:17512111   PMID:17517920   PMID:17522428   PMID:17532759   PMID:17535992   PMID:17540466   PMID:17552871   PMID:17556642   PMID:17559307   PMID:17563720   PMID:17572486  
PMID:17592773   PMID:17602195   PMID:17633252   PMID:17633260   PMID:17635946   PMID:17641689   PMID:17681029   PMID:17682054   PMID:17703412   PMID:17704997   PMID:17716631   PMID:17848410  
PMID:17853270   PMID:17884810   PMID:17937535   PMID:17951535   PMID:17952860   PMID:17978169   PMID:17989362   PMID:18028994   PMID:18029348   PMID:18079322   PMID:18086889   PMID:18096310  
PMID:18156379   PMID:18160712   PMID:18165172   PMID:18182467   PMID:18194492   PMID:18195193   PMID:18219286   PMID:18248637   PMID:18269582   PMID:18286599   PMID:18295813   PMID:18331827  
PMID:18337589   PMID:18343955   PMID:18362306   PMID:18385010   PMID:18398271   PMID:18407829   PMID:18408151   PMID:18417736   PMID:18468809   PMID:18483179   PMID:18502562   PMID:18510611  
PMID:18511904   PMID:18515658   PMID:18536531   PMID:18583474   PMID:18595687   PMID:18636124   PMID:18660489   PMID:18663733   PMID:18668364   PMID:18728163   PMID:18772142   PMID:18789525  
PMID:18801933   PMID:18812484   PMID:18818748   PMID:18822299   PMID:18827003   PMID:18830906   PMID:18838498   PMID:18838540   PMID:18854398   PMID:18945813   PMID:18952539   PMID:18958157  
PMID:18983327   PMID:18996102   PMID:19005987   PMID:19007848   PMID:19007849   PMID:19008334   PMID:19019335   PMID:19051288   PMID:19074285   PMID:19086053   PMID:19089807   PMID:19095219  
PMID:19100874   PMID:19133972   PMID:19141540   PMID:19146914   PMID:19174530   PMID:19177170   PMID:19183974   PMID:19188741   PMID:19207316   PMID:19222494   PMID:19230884   PMID:19234455  
PMID:19234457   PMID:19241242   PMID:19248771   PMID:19258923   PMID:19274049   PMID:19275580   PMID:19275583   PMID:19275585   PMID:19282465   PMID:19318444   PMID:19322201   PMID:19336230  
PMID:19336370   PMID:19339282   PMID:19365399   PMID:19372434   PMID:19373457   PMID:19375647   PMID:19413563   PMID:19429432   PMID:19435830   PMID:19450127   PMID:19450611   PMID:19453261  
PMID:19458171   PMID:19463884   PMID:19466222   PMID:19484926   PMID:19491387   PMID:19527514   PMID:19545546   PMID:19548263   PMID:19562035   PMID:19564704   PMID:19570036   PMID:19578796  
PMID:19586900   PMID:19595997   PMID:19605973   PMID:19621425   PMID:19628874   PMID:19633971   PMID:19646928   PMID:19673019   PMID:19683543   PMID:19691529   PMID:19692572   PMID:19723618  
PMID:19758697   PMID:19778524   PMID:19779205   PMID:19782477   PMID:19783104   PMID:19797430   PMID:19801529   PMID:19805480   PMID:19818358   PMID:19841061   PMID:19874574   PMID:19875381  
PMID:19875955   PMID:19913032   PMID:19913121   PMID:19940520   PMID:19948975   PMID:20012529   PMID:20015838   PMID:20015871   PMID:20018896   PMID:20032106   PMID:20035271   PMID:20036846  
PMID:20093418   PMID:20124551   PMID:20137628   PMID:20140262   PMID:20156337   PMID:20156759   PMID:20170710   PMID:20195266   PMID:20195357   PMID:20199670   PMID:20203101   PMID:20211142  
PMID:20219685   PMID:20308989   PMID:20335448   PMID:20347598   PMID:20351714   PMID:20371666   PMID:20371704   PMID:20376328   PMID:20398657   PMID:20399565   PMID:20403506   PMID:20438742  
PMID:20440229   PMID:20446002   PMID:20448266   PMID:20472303   PMID:20484466   PMID:20485444   PMID:20488636   PMID:20503287   PMID:20543003   PMID:20545708   PMID:20547006   PMID:20561560  
PMID:20584071   PMID:20602615   PMID:20619282   PMID:20628086   PMID:20634891   PMID:20660302   PMID:20661446   PMID:20680430   PMID:20697295   PMID:20712049   PMID:20716560   PMID:20727199  
PMID:20731635   PMID:20733583   PMID:20734064   PMID:20841450   PMID:20843780   PMID:20850457   PMID:20855522   PMID:20861124   PMID:20885351   PMID:21050724   PMID:21078539   PMID:21084380  
PMID:21093928   PMID:21127044   PMID:21127047   PMID:21146942   PMID:21147850   PMID:21148795   PMID:21164266   PMID:21169818   PMID:21190962   PMID:21234764   PMID:21354648   PMID:21355091  
PMID:21419342   PMID:21438141   PMID:21438768   PMID:21473041   PMID:21474440   PMID:21477816   PMID:21489275   PMID:21511880   PMID:21521257   PMID:21521940   PMID:21527497   PMID:21531081  
PMID:21633323   PMID:21641918   PMID:21646426   PMID:21664385   PMID:21730049   PMID:21742609   PMID:21750107   PMID:21760925   PMID:21764460   PMID:21788965   PMID:21789663   PMID:21803757  
PMID:21853119   PMID:21868756   PMID:21873635   PMID:21881570   PMID:21883217   PMID:21900206   PMID:21912096   PMID:21930780   PMID:21945289   PMID:21971518   PMID:21980503   PMID:21984896  
PMID:21988832   PMID:21995950   PMID:22003412   PMID:22008062   PMID:22015776   PMID:22018181   PMID:22022502   PMID:22032841   PMID:22048965   PMID:22068557   PMID:22083731   PMID:22085474  
PMID:22088926   PMID:22170608   PMID:22174376   PMID:22177699   PMID:22185489   PMID:22205602   PMID:22227972   PMID:22295073   PMID:22357529   PMID:22366879   PMID:22371499   PMID:22410078  
PMID:22425674   PMID:22427805   PMID:22441538   PMID:22444201   PMID:22457708   PMID:22469783   PMID:22487832   PMID:22507373   PMID:22516378   PMID:22516993   PMID:22533504   PMID:22570980  
PMID:22576823   PMID:22587663   PMID:22587831   PMID:22592921   PMID:22698871   PMID:22714792   PMID:22728713   PMID:22771494   PMID:22773829   PMID:22781842   PMID:22798432   PMID:22801563  
PMID:22810058   PMID:22812453   PMID:22832351   PMID:22846929   PMID:22848740   PMID:22851186   PMID:22855579   PMID:22863883   PMID:22879541   PMID:22889053   PMID:22922069   PMID:23028665  
PMID:23033538   PMID:23033539   PMID:23046934   PMID:23055001   PMID:23055525   PMID:23068076   PMID:23072594   PMID:23073785   PMID:23123359   PMID:23124618   PMID:23125313   PMID:23127816  
PMID:23132854   PMID:23137715   PMID:23148886   PMID:23151527   PMID:23176645   PMID:23178279   PMID:23196783   PMID:23204024   PMID:23209664   PMID:23212335   PMID:23219223   PMID:23222642  
PMID:23228967   PMID:23239753   PMID:23239757   PMID:23267834   PMID:23290588   PMID:23297131   PMID:23307810   PMID:23325854   PMID:23329746   PMID:23334186   PMID:23339905   PMID:23355259  
PMID:23391271   PMID:23392094   PMID:23393177   PMID:23426617   PMID:23428870   PMID:23435844   PMID:23440419   PMID:23449091   PMID:23493285   PMID:23499945   PMID:23506845   PMID:23523565  
PMID:23527567   PMID:23543128   PMID:23548248   PMID:23566423   PMID:23603102   PMID:23623868   PMID:23658782   PMID:23759144   PMID:23778418   PMID:23793025   PMID:23814048   PMID:23820903  
PMID:23823477   PMID:23845513   PMID:23878391   PMID:23892638   PMID:23892712   PMID:23963647   PMID:23979790   PMID:23986795   PMID:24012103   PMID:24097989   PMID:24128430   PMID:24166279  
PMID:24186266   PMID:24291004   PMID:24316275   PMID:24399729   PMID:24417561   PMID:24418538   PMID:24418810   PMID:24422633   PMID:24429396   PMID:24462205   PMID:24465557   PMID:24466047  
PMID:24483153   PMID:24500711   PMID:24515279   PMID:24535466   PMID:24559102   PMID:24602212   PMID:24615402   PMID:24622770   PMID:24626943   PMID:24629067   PMID:24658140   PMID:24661442  
PMID:24702814   PMID:24728165   PMID:24736075   PMID:24741566   PMID:24753260   PMID:24816241   PMID:24832930   PMID:24895125   PMID:24915124   PMID:24946471   PMID:24949977   PMID:24952347  
PMID:25015855   PMID:25023132   PMID:25036637   PMID:25043756   PMID:25048180   PMID:25058354   PMID:25080589   PMID:25104270   PMID:25113244   PMID:25138562   PMID:25150144   PMID:25155432  
PMID:25202013   PMID:25301232   PMID:25402006   PMID:25422592   PMID:25459891   PMID:25479081   PMID:25511704   PMID:25518867   PMID:25601472   PMID:25609649   PMID:25640832   PMID:25644744  
PMID:25649164   PMID:25665148   PMID:25687413   PMID:25712143   PMID:25724472   PMID:25745955   PMID:25748343   PMID:25762479   PMID:25765757   PMID:25771224   PMID:25772595   PMID:25775514  
PMID:25815773   PMID:25847991   PMID:25875334   PMID:25879559   PMID:25889020   PMID:25894104   PMID:25894927   PMID:25899090   PMID:25912394   PMID:25926062   PMID:25938942   PMID:25942041  
PMID:25951242   PMID:25953903   PMID:25970251   PMID:25982579   PMID:26032496   PMID:26055322   PMID:26080088   PMID:26088140   PMID:26118026   PMID:26139210   PMID:26152664   PMID:26183204  
PMID:26186654   PMID:26212138   PMID:26228405   PMID:26230484   PMID:26242202   PMID:26267475   PMID:26270571   PMID:26304264   PMID:26327302   PMID:26343289   PMID:26387521   PMID:26408078  
PMID:26424557   PMID:26480216   PMID:26483373   PMID:26496610   PMID:26508788   PMID:26541474   PMID:26556219   PMID:26585459   PMID:26593036   PMID:26596278   PMID:26635083   PMID:26638075  
PMID:26647360   PMID:26689331   PMID:26711253   PMID:26745667   PMID:26751645   PMID:26782558   PMID:26804907   PMID:26821164   PMID:26822442   PMID:26822444   PMID:26822445   PMID:26825173  
PMID:26873309   PMID:26907965   PMID:26938822   PMID:27000245   PMID:27003716   PMID:27013342   PMID:27016732   PMID:27030168   PMID:27036026   PMID:27060168   PMID:27076634   PMID:27086273  
PMID:27120390   PMID:27179949   PMID:27211791   PMID:27226058   PMID:27253665   PMID:27323143   PMID:27334923   PMID:27353360   PMID:27378548   PMID:27391809   PMID:27397864   PMID:27400218  
PMID:27401254   PMID:27427534   PMID:27428087   PMID:27475889   PMID:27484907   PMID:27496643   PMID:27507764   PMID:27509264   PMID:27549215   PMID:27560795   PMID:27565349   PMID:27600822  
PMID:27620456   PMID:27632388   PMID:27634941   PMID:27649075   PMID:27653086   PMID:27660999   PMID:27690709   PMID:27697223   PMID:27717743   PMID:27741480   PMID:27803151   PMID:27817096  
PMID:27993966   PMID:27998979   PMID:28056052   PMID:28179212   PMID:28223352   PMID:28237884   PMID:28240298   PMID:28246044   PMID:28292649   PMID:28373129   PMID:28375666   PMID:28378594  
PMID:28381557   PMID:28384542   PMID:28396564   PMID:28397446   PMID:28400302   PMID:28473536   PMID:28514442   PMID:28537252   PMID:28578002   PMID:28591827   PMID:28611094   PMID:28612935  
PMID:28641498   PMID:28686058   PMID:28759007   PMID:28923345   PMID:28928407   PMID:28935859   PMID:28984075   PMID:28992366   PMID:29033349   PMID:29058930   PMID:29100173   PMID:29100174  
PMID:29150654   PMID:29158265   PMID:29158269   PMID:29162170   PMID:29162187   PMID:29207898   PMID:29275786   PMID:29350771   PMID:29352737   PMID:29381656   PMID:29432878   PMID:29433075  
PMID:29434340   PMID:29444898   PMID:29507755   PMID:29513137   PMID:29526633   PMID:29580902   PMID:29587872   PMID:29650294   PMID:29662162   PMID:29685454   PMID:29729712   PMID:29733691  
PMID:29738565   PMID:29748590   PMID:29761890   PMID:29762667   PMID:29772231   PMID:29793048   PMID:29796117   PMID:29802709   PMID:29880220   PMID:29904891   PMID:29921868   PMID:30020469  
PMID:30079801   PMID:30176278   PMID:30196744   PMID:30201977   PMID:30250038   PMID:30278546   PMID:30304965   PMID:30369516   PMID:30408722   PMID:30445609   PMID:30480407   PMID:30486748  
PMID:30544846   PMID:30545316   PMID:30553025   PMID:30580022   PMID:30639698   PMID:30664640   PMID:30676498   PMID:30707907   PMID:30718983   PMID:30737927   PMID:30742779   PMID:30769091  
PMID:30813528   PMID:30850964   PMID:30999951   PMID:31066465   PMID:31091453   PMID:31147715   PMID:31167788   PMID:31182584   PMID:31225872   PMID:31323199   PMID:31328390   PMID:31334877  
PMID:31388769   PMID:31438539   PMID:31467278   PMID:31511352   PMID:31545224   PMID:31582756   PMID:31598691   PMID:31613324   PMID:31645658   PMID:31675993   PMID:31724909   PMID:31731185  
PMID:31772120   PMID:31820730   PMID:31855178   PMID:31861264   PMID:31905108   PMID:31929189   PMID:31980649   PMID:31982660   PMID:32032633   PMID:32106831   PMID:32218512   PMID:32315214  
PMID:32510471   PMID:32652588   PMID:32814053   PMID:32816914   PMID:32886236   PMID:32949992   PMID:32957930   PMID:33127380   PMID:33229537   PMID:33547294  


Genomics

Candidate Gene Status
NR3C1 is a candidate Gene for QTL BW456_H
NR3C1 is a candidate Gene for QTL BW455_H
Comparative Map Data
NR3C1
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh38.p13 Ensembl5143,277,931 - 143,435,512 (-)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh385143,277,931 - 143,435,512 (-)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh375142,657,496 - 142,815,077 (-)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 365142,637,689 - 142,795,270 (-)NCBINCBI36hg18NCBI36
Build 345142,639,324 - 142,763,087NCBI
Celera5138,738,770 - 138,896,297 (-)NCBI
Cytogenetic Map5q31.3NCBI
HuRef5137,804,733 - 137,962,312 (-)NCBIHuRef
CHM1_15142,091,205 - 142,248,804 (-)NCBICHM1_1
Nr3c1
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm391839,543,598 - 39,652,485 (-)NCBIGRCm39mm39
GRCm39 Ensembl1839,543,598 - 39,652,474 (-)Ensembl
GRCm381839,410,545 - 39,519,421 (-)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl1839,410,545 - 39,519,421 (-)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv371839,570,199 - 39,646,899 (-)NCBIGRCm37mm9NCBIm37
MGSCv361839,537,961 - 39,615,820 (-)NCBImm8
Celera1840,761,405 - 40,838,026 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map18B3NCBI
cM Map1821.09NCBI
Nr3c1
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
mRatBN7.21831,271,681 - 31,393,320 (-)NCBI
Rnor_6.0 Ensembl1831,728,373 - 31,749,647 (-)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.01831,728,373 - 32,704,022 (-)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.01831,408,742 - 31,442,725 (-)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
Rnor_5.01832,347,227 - 32,348,480 (-)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.41832,371,496 - 32,459,145 (-)NCBIRGSC3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.11832,406,765 - 32,494,411 (-)NCBI
Celera1830,905,394 - 30,993,522 (-)NCBICelera
RH 3.4 Map18442.9RGD
Cytogenetic Map18p11NCBI
Nr3c1
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)
Chinchilla AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChiLan1.0 EnsemblNW_00495541510,494,640 - 10,586,221 (+)EnsemblChiLan1.0
ChiLan1.0NW_00495541510,494,704 - 10,585,778 (+)NCBIChiLan1.0ChiLan1.0
NR3C1
(Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee)
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
PanPan1.15144,741,452 - 144,865,341 (-)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl5144,741,452 - 144,865,269 (-)Ensemblpanpan1.1panPan2
Mhudiblu_PPA_v05138,634,278 - 139,089,171 (-)NCBIMhudiblu_PPA_v0panPan3
NR3C1
(Canis lupus familiaris - dog)
Dog AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
CanFam3.1238,124,568 - 38,242,510 (-)NCBICanFam3.1CanFam3.1canFam3CanFam3.1
CanFam3.1 Ensembl238,123,190 - 38,240,755 (-)EnsemblCanFam3.1canFam3CanFam3.1
Dog10K_Boxer_Tasha235,173,176 - 35,283,390 (-)NCBI
ROS_Cfam_1.0238,573,084 - 38,692,463 (-)NCBI
UMICH_Zoey_3.1235,654,977 - 35,765,222 (-)NCBI
UNSW_CanFamBas_1.0236,468,553 - 36,579,023 (-)NCBI
UU_Cfam_GSD_1.0237,270,194 - 37,380,458 (-)NCBI
Nr3c1
(Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel)
Squirrel AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HiC_Itri_2NW_024407213149,386,116 - 149,482,864 (+)NCBI
SpeTri2.0NW_00493650410,960,069 - 11,056,834 (+)NCBISpeTri2.0SpeTri2.0SpeTri2.0
NR3C1
(Sus scrofa - pig)
Pig AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
Sscrofa11.1 Ensembl2144,822,937 - 144,956,095 (-)EnsemblSscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa11.12144,822,937 - 144,956,451 (-)NCBISscrofa11.1Sscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa10.22151,051,816 - 151,185,046 (-)NCBISscrofa10.2Sscrofa10.2susScr3
NR3C1
(Chlorocebus sabaeus - African green monkey)
Vervet AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChlSab1.12345,904,926 - 46,031,804 (-)NCBI
ChlSab1.1 Ensembl2345,904,873 - 46,031,125 (-)Ensembl
Nr3c1
(Heterocephalus glaber - naked mole-rat)
Molerat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HetGla 1.0NW_0046247742,496,276 - 2,603,894 (-)NCBI

Position Markers
D5S2378  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,658,700 - 142,658,795UniSTSGRCh37
Build 365142,638,893 - 142,638,988RGDNCBI36
Celera5138,739,974 - 138,740,069RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,805,937 - 137,806,032UniSTS
TNG Radiation Hybrid Map566804.0UniSTS
Stanford-G3 RH Map54033.0UniSTS
GeneMap99-G3 RH Map54028.0UniSTS
RH68907  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,659,369 - 142,659,451UniSTSGRCh37
Build 365142,639,562 - 142,639,644RGDNCBI36
Celera5138,740,643 - 138,740,725RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,806,606 - 137,806,688UniSTS
GeneMap99-GB4 RH Map5539.2UniSTS
NCBI RH Map5891.6UniSTS
G42349  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,756,500 - 142,756,600UniSTSGRCh37
Build 365142,736,693 - 142,736,793RGDNCBI36
Celera5138,837,692 - 138,837,792RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,903,669 - 137,903,769UniSTS
RH104235  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,775,965 - 142,776,138UniSTSGRCh37
Build 365142,756,158 - 142,756,331RGDNCBI36
Celera5138,857,157 - 138,857,330RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,923,134 - 137,923,307UniSTS
GeneMap99-GB4 RH Map5539.2UniSTS
Nr3c1  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,779,569 - 142,780,035UniSTSGRCh37
GRCh375142,780,132 - 142,780,288UniSTSGRCh37
Build 365142,760,325 - 142,760,481RGDNCBI36
Celera5138,860,762 - 138,861,228UniSTS
Celera5138,861,325 - 138,861,481RGD
HuRef5137,926,738 - 137,927,204UniSTS
SHGC-110504  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,725,916 - 142,726,188UniSTSGRCh37
Build 365142,706,109 - 142,706,381RGDNCBI36
Celera5138,807,108 - 138,807,380RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,873,085 - 137,873,357UniSTS
TNG Radiation Hybrid Map566825.0UniSTS
SHGC-111096  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,762,373 - 142,762,669UniSTSGRCh37
Build 365142,742,566 - 142,742,862RGDNCBI36
Celera5138,843,565 - 138,843,861RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,909,542 - 137,909,838UniSTS
TNG Radiation Hybrid Map566840.0UniSTS
D5S2472  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,659,849 - 142,660,185UniSTSGRCh37
Build 365142,640,042 - 142,640,378RGDNCBI36
Celera5138,741,123 - 138,741,459RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,807,086 - 137,807,422UniSTS
TNG Radiation Hybrid Map566801.0UniSTS
Whitehead-YAC Contig Map5 UniSTS
GeneMap99-G3 RH Map54028.0UniSTS
L31444  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,807,919 - 142,808,057UniSTSGRCh37
Build 365142,788,112 - 142,788,250RGDNCBI36
Celera5138,889,109 - 138,889,247RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,955,096 - 137,955,234UniSTS
bac51148T  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,705,580 - 142,705,745UniSTSGRCh37
Build 365142,685,773 - 142,685,938RGDNCBI36
Celera5138,786,772 - 138,786,937RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,852,750 - 137,852,915UniSTS
bac51616T  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,716,013 - 142,716,222UniSTSGRCh37
Build 365142,696,206 - 142,696,415RGDNCBI36
Celera5138,797,205 - 138,797,414RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,863,183 - 137,863,392UniSTS
G65702  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,756,473 - 142,756,727UniSTSGRCh37
Build 365142,736,666 - 142,736,920RGDNCBI36
Celera5138,837,665 - 138,837,919RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,903,642 - 137,903,896UniSTS
PMC64995P2  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,779,318 - 142,780,011UniSTSGRCh37
Build 365142,759,511 - 142,760,204RGDNCBI36
Celera5138,860,511 - 138,861,204RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,926,487 - 137,927,180UniSTS
NR3C1_1004  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,660,735 - 142,661,600UniSTSGRCh37
Build 365142,640,928 - 142,641,793RGDNCBI36
Celera5138,742,009 - 138,742,874RGD
HuRef5137,807,972 - 137,808,837UniSTS
RH16558  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,671,792 - 142,671,950UniSTSGRCh37
Build 365142,651,985 - 142,652,143RGDNCBI36
Celera5138,753,001 - 138,753,159RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,818,965 - 137,819,123UniSTS
GeneMap99-GB4 RH Map5539.2UniSTS
NCBI RH Map5891.6UniSTS
SHGC-58162  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,712,094 - 142,712,265UniSTSGRCh37
Build 365142,692,287 - 142,692,458RGDNCBI36
Celera5138,793,286 - 138,793,457RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,859,264 - 137,859,435UniSTS
TNG Radiation Hybrid Map566814.0UniSTS
D5S1871  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,697,554 - 142,697,780UniSTSGRCh37
Build 365142,677,747 - 142,677,973RGDNCBI36
Celera5138,778,746 - 138,778,972RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,844,724 - 137,844,950UniSTS
Whitehead-RH Map5449.2UniSTS
Whitehead-YAC Contig Map5 UniSTS
NCBI RH Map5891.6UniSTS
STS-U25029  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,674,551 - 142,674,701UniSTSGRCh37
Build 365142,654,744 - 142,654,894RGDNCBI36
Celera5138,755,760 - 138,755,910RGD
Cytogenetic Map5q31.3UniSTS
HuRef5137,821,724 - 137,821,874UniSTS
GeneMap99-GB4 RH Map5538.87UniSTS
NCBI RH Map5891.6UniSTS
Nr3c1  
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCh375142,779,569 - 142,780,035UniSTSGRCh37
GRCh375142,780,132 - 142,780,288UniSTSGRCh37
Build 365142,760,325 - 142,760,481RGDNCBI36
Celera5138,860,762 - 138,861,228UniSTS
Celera5138,861,325 - 138,861,481RGD
HuRef5137,926,738 - 137,927,204UniSTS

miRNA Target Status

Confirmed Target Of
miRNA GeneMature miRNAMethod NameResult TypeData TypeSupport TypePMID
MIR18Ahsa-miR-18a-5pMirtarbaseexternal_infoLuciferase reporter assay//Western blot//pMIR-REPOFunctional MTI19131573
MIR124-2hsa-miR-124-3pMirtarbaseexternal_infoLuciferase reporter assay//Western blot//pMIR-REPOFunctional MTI19131573
MIR130Bhsa-miR-130b-3pOncomiRDBexternal_infoNANA21761344
MIR142hsa-miR-142-3pOncomiRDBexternal_infoNANA21979877

Predicted Target Of
Summary Value
Count of predictions:6863
Count of miRNA genes:1048
Interacting mature miRNAs:1249
Transcripts:ENST00000231509, ENST00000343796, ENST00000394464, ENST00000394466, ENST00000415690, ENST00000416954, ENST00000424646, ENST00000502500, ENST00000502892, ENST00000503201, ENST00000503701, ENST00000504336, ENST00000504572, ENST00000505058, ENST00000508760, ENST00000510170, ENST00000514699
Prediction methods:Microtar, Miranda, Rnahybrid
Result types:miRGate_prediction

The detailed report is available here: Full Report CSV TAB Printer<