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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | substance-related disorder | | ISO | RGD:732274 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:20098672 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | substance-related disorder | | ISO | RGD:732274 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:20098672 | |
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1. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | MGD data from the GO Consortium |
3. | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data October 15, 2003 |
4. | Otaki JM and Firestein S, Dev Biol 1999 Aug 1;212(1):165-81. |
5. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
6. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
7. | Silva JP, etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jul 19;108(29):12113-8. doi: 10.1073/pnas.1019434108. Epub 2011 Jul 1. |
Tenm2 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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TENM2 (Homo sapiens - human) |
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Tenm2 (Mus musculus - house mouse) |
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Tenm2 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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TENM2 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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TENM2 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Tenm2 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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TENM2 (Sus scrofa - pig) |
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TENM2 (Chlorocebus sabaeus - African green monkey) |
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Tenm2 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D10Mit5 |
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D10Rat42 |
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D10Rat75 |
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D10Rat179 |
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D11Mit232 |
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BE102452 |
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RH138576 |
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D3Bwg1534e |
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RH144521 |
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BE096193 |
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AI501498 |
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AW529537 |
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AU049925 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 60 | ||||||||||||
Low | 3 | 10 | 20 | 4 | 8 | 4 | 7 | 7 | 14 | 2 | 33 | 3 | 7 |
Below cutoff | 22 | 33 | 33 | 11 | 33 | 1 | 3 | 32 | 8 | 8 | 1 |
RefSeq Transcripts | NM_020088 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_039085062 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039085063 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039085064 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039085065 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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XM_039085069 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039085070 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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XM_039085072 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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XM_039085074 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039085075 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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GenBank Nucleotide | AF086607 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
AF086608 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
AF086609 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
AF086610 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000219 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000011922 ⟹ ENSRNOP00000011922 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
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Position: |
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Sequence: |
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Position: |
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Protein RefSeqs | NP_064473 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
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XP_038940997 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038940998 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
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GenBank Protein | AAD47383 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
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AAD47386 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
Q9R1K2 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_064473 ⟸ NM_020088 |
- UniProtKB: | Q9R1K2 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
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- Peptide Label: | isoform X1 |
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- Peptide Label: | isoform X1 |
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- Peptide Label: | isoform X1 |
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- Peptide Label: | isoform X1 |
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RefSeq Acc Id: | XP_038941000 ⟸ XM_039085072 |
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RefSeq Acc Id: | XP_038941002 ⟸ XM_039085074 |
- Peptide Label: | isoform X9 |
RefSeq Acc Id: | XP_038941001 ⟸ XM_039085073 |
- Peptide Label: | isoform X9 |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:727907 | AgrOrtholog |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000027341 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000011922 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000011922 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Gene3D-CATH | 2.120.10.30 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
InterPro | 6-blade_b-propeller_TolB-like | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
CarboxyPept-like_regulatory | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EGF-like_Ca-bd_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
EGF-like_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
IPR006530 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Rhs_assc_core | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Ten-2/3 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Ten_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Tox-GHH_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:117242 | UniProtKB/Swiss-Prot |
NCBI Gene | 117242 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR11219:SF8 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | Ten_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Tox-GHH | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PhenoGen | Tenm2 | PhenoGen |
PROSITE | EGF_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
EGF_2 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EGF_3 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
TENEURIN_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
SMART | EGF | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
EGF_CA | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Superfamily-SCOP | SSF49464 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
TIGRFAMs | Rhs_assc_core | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
YD_repeat_2x | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
UniProt | A0A096P6L6_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Q9R1K2 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
UniProt Secondary | Q9R1J9 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Q9R1K0 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Q9R1K1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2012-10-11 | Tenm2 | teneurin transmembrane protein 2 | Odz2 | odz, odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-09-09 | Odz2 | odz, odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Odz2 | odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2005-07-08 | Odz2 | odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
Note Type | Note | Reference |
---|---|---|
gene_expression | expressed in many types of neurons, including pyramidal cells in the cerebral cortex and tufted cells in the olfactory bulb during development | 1299591 |