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InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
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Gene Annotator (Annotation Comparison) |
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 MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
 GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
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MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
Imported Annotations - CTD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| substance-related disorder | ISO | RGD:732274 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:20098672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction AnnotationsGene Ontology AnnotationsDisease Annotations
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Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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References - curated| 1. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | MGD data from the GO Consortium |
| 3. | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data October 15, 2003 |
| 4. | Otaki JM and Firestein S, Dev Biol 1999 Aug 1;212(1):165-81. |
| 5. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 6. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 7. | Silva JP, etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jul 19;108(29):12113-8. doi: 10.1073/pnas.1019434108. Epub 2011 Jul 1. |
References - uncurated| PubMed | 12000766 |
Comparative Map Data| Tenm2 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| TENM2 (Homo sapiens - human) |
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| Tenm2 (Mus musculus - house mouse) |
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| Tenm2 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| TENM2 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| TENM2 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Tenm2 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| TENM2 (Sus scrofa - pig) |
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| TENM2 (Chlorocebus sabaeus - African green monkey) |
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| Tenm2 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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Position Markers| D10Mit5 |
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| D10Rat42 |
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| D10Rat75 |
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| D10Rat179 |
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| D11Mit232 |
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| BE102452 |
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| RH138576 |
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| D3Bwg1534e |
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| RH144521 |
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| BE096193 |
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| AI501498 |
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| AW529537 |
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| AU049925 |
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QTLs in Region (Rnor_6.0)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
miRNA Target Status
| The detailed report is available here: | | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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RNA-SEQ Expression| alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
| High | |||||||||||||
| Medium | 60 | ||||||||||||
| Low | 3 | 10 | 20 | 4 | 8 | 4 | 7 | 7 | 14 | 2 | 33 | 3 | 7 |
| Below cutoff | 22 | 33 | 33 | 11 | 33 | 1 | 3 | 32 | 8 | 8 | 1 |
Nucleotide Sequences| RefSeq Transcripts | NM_020088 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| GenBank Nucleotide | AABR07029288 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| AABR07029289 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029290 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029291 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029292 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029293 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029294 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029295 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029296 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029297 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AABR07029298 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063181 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063182 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063183 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063184 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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| AAHX01063186 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063187 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063188 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063189 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063190 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063191 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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| AAHX01063199 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063200 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063201 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063202 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063203 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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| AAHX01063206 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063207 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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| AAHX01063209 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063210 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063211 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
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| AAHX01063213 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063214 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AAHX01063215 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AF086607 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AF086608 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AF086609 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AF086610 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000011922 ⟹ ENSRNOP00000011922 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_020088 ⟹ NP_064473 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
GTGAGCATTCCCGGAAACGCAGCTGAGTTGTTGGACAACAGACGTCCACCCAGTCGGTGGGTAAhide sequence |
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_064473 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| GenBank Protein | AAD47383 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| AAD47384 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| AAD47385 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| AAD47386 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Q9R1K2 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_064473 ⟸ NM_020088 |
| - UniProtKB: | Q9R1K2 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MDVKDRRHRSLTRGRCGKECRYTSSSLDSEDCRVPTQKSYSSSETLKAYDHDSRMHYGNRVTDLhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000011922 ⟸ ENSRNOT00000011922 |
TranscriptomeStrain Sequence Variants (Rnor 6.0)
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:727907 | AgrOrtholog |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000027341 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000011922 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000011922 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Gene3D-CATH | 2.120.10.30 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| InterPro | 6-blade_b-propeller_TolB-like | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| CarboxyPept-like_regulatory | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| EGF-like_Ca-bd_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| EGF-like_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| IPR006530 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Rhs_assc_core | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Ten-2/3 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Ten_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| Tox-GHH_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:117242 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 117242 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PTHR11219:SF8 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| Pfam | Ten_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| Tox-GHH | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Tenm2 | PhenoGen |
| PROSITE | EGF_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| EGF_2 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| EGF_3 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| TENEURIN_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| SMART | EGF | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| EGF_CA | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Superfamily-SCOP | SSF49464 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| TIGRFAMs | Rhs_assc_core | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
| YD_repeat_2x | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
| UniGene | Rn.229571 | ENTREZGENE |
| UniProt | A0A096P6L6_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| Q9R1K2 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
| UniProt Secondary | Q9R1J9 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Q9R1K0 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q9R1K1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2012-10-11 | Tenm2 | teneurin transmembrane protein 2 | Odz2 | odz, odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-09-09 | Odz2 | odz, odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Odz2 | odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2005-07-08 | Odz2 | odd Oz/ten-m homolog 2 (Drosophila) | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
RGD Curation Notes| Note Type | Note | Reference |
|---|---|---|
| gene_expression | expressed in many types of neurons, including pyramidal cells in the cerebral cortex and tufted cells in the olfactory bulb during development | 1299591 |
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| More on Tenm2 | |
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Alliance Gene |
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NCBI Gene |
|
Ensembl Gene |
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|
JBrowse: rn5 rn6 |
|
NCBI Genome Data Viewer |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 727907 |
| Created: | 2003-11-05 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2020-08-20 |
| Status: | ACTIVE |
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RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.
