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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Combined Oxidative Phosphorylation Deficiency 52 | | ISO | RGD:1350532 | 7240710 | | OMIM | | |
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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Combined Oxidative Phosphorylation Deficiency 52 | | ISO | RGD:1350532 | 7240710 | | OMIM | | |
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1. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Maio N and Rouault TA, Biochim Biophys Acta. 2015 Jun;1853(6):1493-512. doi: 10.1016/j.bbamcr.2014.09.009. Epub 2014 Sep 19. |
3. | MGD data from the GO Consortium |
4. | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
5. | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
6. | RGD automated data pipeline |
7. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
8. | RGD, Sept. 2003 |
9. | Strausberg RL, etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Dec 24;99(26):16899-903. Epub 2002 Dec 11. |
PMID:9738949 | PMID:14651853 | PMID:16527810 | PMID:16787928 | PMID:16847322 | PMID:18614015 | PMID:20873749 | PMID:26702583 | PMID:30053369 |
Nfs1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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NFS1 (Homo sapiens - human) |
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Nfs1 (Mus musculus - house mouse) |
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Nfs1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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NFS1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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NFS1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Nfs1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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NFS1 (Sus scrofa - pig) |
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NFS1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Nfs1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D3Rat237 |
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RH128176 |
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RH139369 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 3 | 36 | 50 | 41 | 4 | 41 | 3 | 6 | 57 | 35 | 29 | 9 | 3 |
Low | 7 | 7 | 15 | 5 | 5 | 17 | 12 | 2 | 5 | ||||
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_053462 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_006235365 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_006235451 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | AC118414 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
AF336041 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BC072482 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BC089205 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BC104699 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
CH474050 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000119 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000026820 ⟹ ENSRNOP00000026820 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000072945 ⟹ ENSRNOP00000066678 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_053462 ⟹ NP_445914 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_006235451 ⟹ XP_006235513 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
||||||||
Sequence: |
Protein RefSeqs | NP_445914 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_006235513 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | AAH89205 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
AAI04700 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
AAK12337 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
EDL85865 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
EDL85866 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
EDL85867 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
Q99P39 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_445914 ⟸ NM_053462 |
- UniProtKB: | Q3MHT2 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000066678 ⟸ ENSRNOT00000072945 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000026820 ⟸ ENSRNOT00000026820 |
RefSeq Acc Id: | XP_006235513 ⟸ XM_006235451 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-Q99P39-F1-model_v2 | AlphaFold | Q99P39 | 1-451 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13692594 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R3119 | ||||||||
Type: | initiation region | ||||||||
Name: | Nfs1_2 | ||||||||
Description: | NFS1 cysteine desulfurase | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Alternative Promoters: | null; see alsoEPDNEW_R3121 | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:620912 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-47104 | BioCyc |
BioCyc Pathway | PWY-7250 [[2Fe-2S] iron-sulfur cluster biosynthesis] | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000019736 | Ensembl, UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOG00000045686 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000026820 | UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOP00000066678 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000026820 | UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOT00000072945 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
Gene3D-CATH | 3.40.640.10 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
3.90.1150.10 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
IMAGE_CLONE | IMAGE:7104648 | IMAGE-MGC_LOAD |
IMAGE:7189705 | IMAGE-MGC_LOAD | |
IMAGE:7189856 | IMAGE-MGC_LOAD | |
InterPro | Aminotrans_V_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Aminotrans_V_PyrdxlP_BS | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Cys_deSase_IscS | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Cysteine_dSase | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PyrdxlP-dep_Trfase | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PyrdxlP-dep_Trfase_dom1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PyrdxlP-dep_Trfase_major | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:84594 | UniProtKB/TrEMBL, UniProtKB/TrEMBL |
MGC_CLONE | MGC:105371 | IMAGE-MGC_LOAD |
MGC:124952 | IMAGE-MGC_LOAD | |
MGC:91577 | IMAGE-MGC_LOAD | |
NCBI Gene | 84594 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR11601:SF34 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | Aminotran_5 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Nfs1 | PhenoGen |
PIRSF | NifS | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
PROSITE | AA_TRANSFER_CLASS_5 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Superfamily-SCOP | SSF53383 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
TIGRFAMs | IscS | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | NFS1_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot |
Q3MHT2 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
Q5FWU2_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
Q99P39 | ENTREZGENE |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
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2015-07-21 | Nfs1 | NFS1 cysteine desulfurase | LOC100911034 | cysteine desulfurase, mitochondrial-like | Data Merged | 737654 | APPROVED |
2013-08-14 | Nfs1 | NFS1 cysteine desulfurase | Nfs1 | NFS1 nitrogen fixation 1 homolog (S. cerevisiae) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2012-07-05 | LOC100911034 | cysteine desulfurase, mitochondrial-like | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
2008-09-24 | Nfs1 | NFS1 nitrogen fixation 1 homolog (S. cerevisiae) | Nfs1 | nitrogen fixation gene 1 (S. cerevisiae) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2005-01-20 | Nfs1 | nitrogen fixation gene 1 (S. cerevisiae) | Nifs | cysteine desulfurase | Symbol and Name updated | 1299863 | APPROVED |
2002-08-07 | Nifs | cysteine desulfurase | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |