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Gene Annotator (Functional Annotation) |
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InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
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Gene Annotator (Annotation Comparison) |
OLGA (Gene List Generator) |
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 MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
 GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
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MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
Imported Annotations - CTD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| obesity | ISO | RGD:731586 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:10849579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction AnnotationsGene Ontology AnnotationsDisease Annotations
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Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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References - curated| 1. | Becker KG, etal., Nat Genet. 2004 May;36(5):431-2. |
| 2. | Bedoui S, etal., J Neuroimmunol 2002 Nov;132(1-2):25-33. |
| 3. | Coletta DK, etal., Obesity (Silver Spring). 2007 Apr;15(4):809-15. |
| 4. | Dimitrijevic M, etal., J Neuroimmunol. 2002 Aug;129(1-2):35-42. |
| 5. | Dimitrijevic M, etal., Peptides. 2008 Dec;29(12):2179-87. doi: 10.1016/j.peptides.2008.08.017. Epub 2008 Sep 3. |
| 6. | Dumont Y, etal., Br J Pharmacol. 2005 Dec;146(8):1069-81. |
| 7. | Fekete C, etal., Endocrinology 2002 Dec;143(12):4513-9. |
| 8. | Gao J, etal., Am J Physiol Endocrinol Metab. 2004 Oct;287(4):E706-11. Epub 2004 Jun 8. |
| 9. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 10. | GOA data from the GO Consortium |
| 11. | Gong HX, etal., Acta Pharmacol Sin. 2003 Jun;24(6):569-75. |
| 12. | Hu Y, etal., J Biol Chem 1996 Oct 18;271(42):26315-9. |
| 13. | Igura K, etal., Rejuvenation Res. 2011 Aug;14(4):393-403. doi: 10.1089/rej.2010.1129. Epub 2011 May 19. |
| 14. | Jenkinson CP, etal., Int J Obes Relat Metab Disord. 2000 May;24(5):580-4. |
| 15. | Kwitek AE, etal., Genome Res. 2004 Apr;14(4):750-7 |
| 16. | Li L, etal., Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2003 Jul 1;23(7):1204-10. Epub 2003 Apr 10. |
| 17. | Li L, etal., J Cardiovasc Transl Res. 2011 Jun;4(3):351-62. doi: 10.1007/s12265-011-9271-5. Epub 2011 Apr 6. |
| 18. | MGD data from the GO Consortium |
| 19. | Morris MJ, etal., Eur J Neurosci. 2007 Feb;25(4):1136-43. |
| 20. | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
| 21. | Parker EM, etal., Eur J Pharmacol 1998 May 15;349(1):97-105. |
| 22. | Parker MS, etal., Mol Cell Endocrinol. 2000 Jun;164(1-2):239-49. |
| 23. | Pons J, etal., Can J Physiol Pharmacol. 2003 Feb;81(2):177-85. |
| 24. | Pronchuk N, etal., Endocrinology. 2002 Feb;143(2):535-43. |
| 25. | RGD automated data pipeline |
| 26. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 27. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 28. | RGD comprehensive gene curation |
| 29. | Silva AP, etal., Neuropharmacology. 2003 Feb;44(2):282-92. |
| 30. | Tang-Christensen M, etal., J Endocrinol. 1998 Nov;159(2):307-12. |
| 31. | Toufexis DJ, etal., J Neuroendocrinol. 2002 Jun;14(6):492-7. |
| 32. | Wang C, etal., Horm Metab Res. 2007 Apr;39(4):262-7. |
| 33. | Woldbye DP, etal., Nat Med. 1997 Jul;3(7):761-4. |
References - uncurated| PubMed | 8700207 9802393 10557353 10698177 12429884 12900925 15044185 15123022 15544855 15582717 16954600 17363455 19419662 19593212 21629996 21771616 23179670 24316073 24444822 25993471 28057538 |
Candidate Gene StatusComparative Map Data| Npy5r (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| NPY5R (Homo sapiens - human) |
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| Npy5r (Mus musculus - house mouse) |
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| Npy5r (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| NPY5R (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| NPY5R (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Npy5r (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| NPY5R (Sus scrofa - pig) |
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| NPY5R (Chlorocebus sabaeus - African green monkey) |
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| Npy5r (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
No map positions available. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position Markers| RH94803 |
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| PMC123072P1 |
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QTLs in Region (Rnor_6.0)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
miRNA Target Status
| The detailed report is available here: | | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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RNA-SEQ Expression| nervous system | renal system | reproductive system | |
| High | |||
| Medium | |||
| Low | 48 | 2 | |
| Below cutoff | 22 | 5 | 18 |
Nucleotide Sequences| RefSeq Transcripts | NM_012869 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_006253013 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006253014 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017599995 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017599996 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017599997 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017599998 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AABR07025003 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| AAHX01087004 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AF044264 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH474045 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U56078 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U66274 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000018976 ⟹ ENSRNOP00000018976 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_012869 ⟹ NP_037001 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
TTGGACTATGGGGGCCGGGAACAGGCGATCTTGAGCCGGGTGTCCGGGGTCTCAGGGACTGTCAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_006253013 ⟹ XP_006253075 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||
| Sequence: |
CTCTCACTCCCCAGCTCCCTCAGCTCCATGTCCCTTGCTCACACCCACACTACTACCCCTTGGAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_006253014 ⟹ XP_006253076 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||
| Sequence: |
CTCTCACTCCCCAGCTCCCTCAGCTCCATGTCCCTTGCTCACACCCACACTACTACCCCTTGGAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017599995 ⟹ XP_017455484 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
||||||||
| Sequence: |
CTCTCACTCCCCAGCTCCCTCAGCTCCATGTCCCTTGCTCACACCCACACTACTACCCCTTGGAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017599996 ⟹ XP_017455485 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
||||||||
| Sequence: |
CTCTCACTCCCCAGCTCCCTCAGCTCCATGTCCCTTGCTCACACCCACACTACTACCCCTTGGAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017599997 ⟹ XP_017455486 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
||||||||
| Sequence: |
CTCTCACTCCCCAGCTCCCTCAGCTCCATGTCCCTTGCTCACACCCACACTACTACCCCTTGGAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017599998 ⟹ XP_017455487 | ||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
||||||||
| Sequence: |
TAACAGTATATACTTACCAGAGTTAATTAATTATTGCTGTATTGACTTTTCACTAGGAAATTGThide sequence |
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_037001 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_006253075 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_006253076 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_017455484 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_017455485 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_017455486 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_017455487 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAC15670 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| AAC52677 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| AAC52845 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL75959 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL75960 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Q63634 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_037001 ⟸ NM_012869 |
| - UniProtKB: | Q63634 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MEFKLEEHFNKTFVTENNTAAARNAAFPAWEDYRGSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_006253075 ⟸ XM_006253013 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | Q63634 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MEFKLEEHFNKTFVTENNTAAARNAAFPAWEDYRGSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_006253076 ⟸ XM_006253014 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | Q63634 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MEFKLEEHFNKTFVTENNTAAARNAAFPAWEDYRGSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_017455484 ⟸ XM_017599995 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | Q63634 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MEFKLEEHFNKTFVTENNTAAARNAAFPAWEDYRGSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_017455485 ⟸ XM_017599996 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | Q63634 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MEFKLEEHFNKTFVTENNTAAARNAAFPAWEDYRGSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_017455486 ⟸ XM_017599997 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | Q63634 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MEFKLEEHFNKTFVTENNTAAARNAAFPAWEDYRGSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_017455487 ⟸ XM_017599998 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | Q63634 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MEFKLEEHFNKTFVTENNTAAARNAAFPAWEDYRGSVDDLQYFLIGLYTFVSLLGFMGNLLILMhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000018976 ⟸ ENSRNOT00000018976 |
TranscriptomeStrain Sequence Variants (Rnor 6.0)
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:3199 | AgrOrtholog |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000014172 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000018976 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000018976 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| InterPro | GPCR_Rhodpsn | UniProtKB/Swiss-Prot |
| GPCR_Rhodpsn_7TM | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| NPY5_rcpt | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| NPY_rcpt | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:25340 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 25340 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PTHR24241:SF139 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Pfam | 7tm_1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Npy5r | PhenoGen |
| PRINTS | GPCRRHODOPSN | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NRPEPTIDEY5R | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| NRPEPTIDEYR | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PROSITE | G_PROTEIN_RECEP_F1_2 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| SMART | 7TM_GPCR_Srsx | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniGene | Rn.10532 | ENTREZGENE |
| UniProt | NPY5R_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
| UniProt Secondary | P70586 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2003-04-09 | Npy5r | neuropeptide Y receptor Y5 | Neuropeptide Y5 receptor | Name updated | 629478 | APPROVED | |
| 2002-06-10 | Npy5r | Neuropeptide Y5 receptor | Symbol and Name status set to approved | 70586 | APPROVED |
RGD Curation Notes| Note Type | Note | Reference |
|---|---|---|
| gene_process | activation involved in an increase in food consumption | 628420 |
 |
| More on Npy5r | |
|
Alliance Gene |
|
NCBI Gene |
|
Ensembl Gene |
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|
JBrowse: rn5 rn6 |
|
NCBI Genome Data Viewer |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 3199 |
| Created: | 2000-05-25 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2020-06-09 |
| Status: | ACTIVE |
 |
 |
 |
 |
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.
