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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Breast Neoplasms | | ISO | RGD:731785 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:24349381 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Breast Neoplasms | | ISO | RGD:731785 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:24349381 | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Rat ISS GO annotations from GOA human gene data--August 2006 | GOA data from the GO Consortium |
3. | High-density rat radiation hybrid maps containing over 24,000 SSLPs, genes, and ESTs provide a direct link to the rat genome sequence. | Kwitek AE, etal., Genome Res. 2004 Apr;14(4):750-7 |
4. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
5. | Electronic Transfer of LocusLink and RefSeq Data | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
6. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
7. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
8. | Tentative Sequence Identification Numbers | Tentative Sequence Data IDs. TIGR Gene Index, Rat Data |
9. | cDNA cloning, characterization, and brain region-specific expression of a neuromedin-B-preferring bombesin receptor. | Wada E, etal., Neuron 1991 Mar;6(3):421-30. |
Nmbr (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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NMBR (Homo sapiens - human) |
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Nmbr (Mus musculus - house mouse) |
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Nmbr (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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NMBR (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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NMBR (Canis lupus familiaris - dog) |
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Nmbr (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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NMBR (Sus scrofa - pig) |
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NMBR (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Nmbr (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D1Arb44 |
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RH94761 |
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BF389161 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | |||||||||||||
Low | 1 | 1 | 58 | 24 | 17 | 1 | |||||||
Below cutoff | 2 | 22 | 14 | 7 | 6 | 7 | 5 | 7 | 16 | 10 | 23 | 10 | 5 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000016215 ⟹ ENSRNOP00000016215 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000076049 ⟹ ENSRNOP00000067986 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_012799 ⟹ NP_036931 | ||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
Position: |
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Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039101530 ⟹ XP_038957458 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039101531 ⟹ XP_038957459 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NP_036931 ⟸ NM_012799 |
- UniProtKB: | P24053 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000016215 ⟸ ENSRNOT00000016215 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000067986 ⟸ ENSRNOT00000076049 |
RefSeq Acc Id: | XP_038957458 ⟸ XM_039101530 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
RefSeq Acc Id: | XP_038957459 ⟸ XM_039101531 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-P24053-F1-model_v2 | AlphaFold | P24053 | 1-390 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:3181 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-62339 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000012103 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000016215 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOP00000067986.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000016215 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOT00000076049.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
InterPro | Bombsn_rcpt-like | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
GPCR_Rhodpsn | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
GPCR_Rhodpsn_7TM | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
NeuroB_rcpt | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:25264 | UniProtKB/Swiss-Prot |
NCBI Gene | 25264 | ENTREZGENE |
Pfam | 7tm_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Nmbr | PhenoGen |
PRINTS | BOMBESINR | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
GPCRRHODOPSN | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
NEUROMEDINBR | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PROSITE | G_PROTEIN_RECEP_F1_1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
G_PROTEIN_RECEP_F1_2 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
SMART | 7TM_GPCR_Srsx | UniProtKB/Swiss-Prot |
TIGR | TC228092 | |
UniProt | A0A096MJ45_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
F1M5M1_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
NMBR_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
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2021-03-09 | Nmbr | neuromedin B receptor | LOC102552086 | uncharacterized LOC102552086 | Data Merged | 737654 | PROVISIONAL |
2015-07-29 | LOC102552086 | uncharacterized LOC102552086 | LOC681272 | hypothetical protein LOC681272 | Data Merged | 737654 | PROVISIONAL |
2013-12-18 | LOC102552086 | uncharacterized LOC102552086 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
2013-03-29 | Nmbr | neuromedin B receptor | LOC100361806 | neuromedin B receptor | Data Merged | 737654 | PROVISIONAL |
2010-05-05 | LOC100361806 | neuromedin B receptor | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
2006-11-20 | LOC681272 | hypothetical protein LOC681272 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
2002-06-10 | Nmbr | Neuromedin B receptor | Symbol and Name status set to approved | 70586 | APPROVED |
Note Type | Note | Reference |
---|---|---|
gene_function | higher affinity binding to neuromedin-B than to gastrin-releasing peptide (GRP) | 69905 |