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Gene Annotator (Functional Annotation) |
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InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
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 OLGA (Gene List Generator) unavailable |
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Gene Annotator (Annotation Comparison) |
OLGA (Gene List Generator) |
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 MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
 GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
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MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
Imported Annotations - ClinVar | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neurofibrosarcoma | ISO | RGD:736546 | 8554872 | ClinVar Annotator: match by null | ClinVar | PMID:10470286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| prostate cancer | ISO | RGD:736546 | 8554872 | ClinVar Annotator: match by term: Prostate cancer | ClinVar | PMID:7773287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction AnnotationsGene Ontology AnnotationsDisease Annotations
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Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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References - curated| 1. | Eagle LR, etal., Nat Genet. 1995 Mar;9(3):249-55. |
| 2. | GOA data from the GO Consortium |
| 3. | Kwitek AE, etal., Genome Res. 2004 Apr;14(4):750-7 |
| 4. | Li XJ, etal., Jpn J Cancer Res. 1999 Jul;90(7):740-6. |
| 5. | MGD data from the GO Consortium |
| 6. | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
| 7. | OMIM Disease Annotation Pipeline |
| 8. | RGD automated data pipeline |
| 9. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 10. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 11. | von Boehmer H, etal., Cold Spring Harb Symp Quant Biol 1977;41 Pt 2:539-45. |
| 12. | Wang DY, etal., Pathol Int 2000 May;50(5):373-83. |
| 13. | Wang Y, etal., Cell Mol Biol (Noisy-le-grand). 1997 Mar;43(2):175-88. |
| 14. | Yin X, etal., Oncogene 2001 Aug 2;20(34):4650-64. |
References - uncuratedComparative Map Data| Mxi1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| MXI1 (Homo sapiens - human) |
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| Mxi1 (Mus musculus - house mouse) |
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| Mxi1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| MXI1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| MXI1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Mxi1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| MXI1 (Sus scrofa - pig) |
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Position Markers| RH127398 |
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| BG376247 |
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| RH94430 |
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QTLs in Region (Rnor_6.0)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
miRNA Target Status
| The detailed report is available here: | | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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RNA-SEQ Expression| testis | heart | brain | ovary | uterus | skeletal muscle tissue | colon | gastrocnemius | forebrain | hindbrain | lung | spleen | liver | kidney | adrenal gland | thymus | |
| High | ||||||||||||||||
| Medium | 22 | 43 | 23 | 15 | 4 | 3 | 3 | 8 | 26 | 25 | 11 | 11 | 38 | 35 | 8 | 8 |
| Low | 3 | |||||||||||||||
| Below cutoff |
Nucleotide Sequences| RefSeq Transcripts | NM_013160 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_006231604 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006231605 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006231606 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017588832 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AAHX01000797 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| AC106606 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AF003008 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AY495712 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC081824 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473986 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ223663 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U44728 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000042822 ⟹ ENSRNOP00000040770 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000076387 ⟹ ENSRNOP00000068001 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000076779 ⟹ ENSRNOP00000067990 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_013160 ⟹ NP_037292 | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
GCCGTCTGTGGCGCCTCCTGTCGGCCGGGGGCGGGAGCGCGGAGCCCATGGAGCGGGTGCGGAThide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_006231604 ⟹ XP_006231666 | ||||||||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||
| Sequence: |
ATTTTTTTTTTCCATTCGTATTAAAGCACAGTGCTGTCTACGCAGTTAGGATTTGCGGAGAGGChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_006231605 ⟹ XP_006231667 | ||||||||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||
| Sequence: |
GAGGTTTGCTCTGGAGTGCAGAGTGTGAACATGGCTACGCTTCATCATTCCCCTCCATGCCGAGhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_006231606 ⟹ XP_006231668 | ||||||||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||
| Sequence: |
CGGGGGCGGAGTGGAGTGGGGGTAATGCCGGCTGAAGAGCTGCGGGAGGGGCTCCCTGCTATTGhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017588832 ⟹ XP_017444321 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
GCGCGGCTGGCAAGGGGAGAGTGTGAACATGGCTACGCTTCATCATTCCCCTCCATGCCGAGCChide sequence |
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_037292 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_006231666 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_006231667 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_006231668 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_017444321 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAB16960 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| AAB61595 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| AAH81824 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| AAR95702 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL94419 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL94420 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL94421 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL94422 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL94423 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL94424 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| O09015 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_037292 ⟸ NM_013160 |
| - UniProtKB: | Q642D1 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MERVRMINVQRLLEAAEFLERRERECEHGYASSFPSMPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNThide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_006231666 ⟸ XM_006231604 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A0A096MJ60 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MGKRGRPRKEARCEGAGLVPVAPPAMPPAAAAPQPPAQPEEPAGAKPRCPFSDIFNTSENSMEKhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_006231667 ⟸ XM_006231605 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - UniProtKB: | A0A096MJ49 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNTSTANRSTHNELEKNRRAHLRLCLERLKVLIPLGPDChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_006231668 ⟸ XM_006231606 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - UniProtKB: | A0A096MJ49 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNTSTANRSTHNELEKNRRAHLRLCLERLKVLIPLGPDChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_017444321 ⟸ XM_017588832 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - UniProtKB: | A0A096MJ49 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MPSPRLQHSKPPRRLSRAQKHSSGSSNTSTANRSTHNELEKNRRAHLRLCLERLKVLIPLGPDChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000040770 ⟸ ENSRNOT00000042822 |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000068001 ⟸ ENSRNOT00000076387 |
| RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000067990 ⟸ ENSRNOT00000076779 |
TranscriptomePromoters| RGD ID: | 13690991 | |||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R1514 | |||||||||
| Type: | initiation region | |||||||||
| Name: | Mxi1_2 | |||||||||
| Description: | MAX interactor 1, dimerization protein | |||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | |||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | |||||||||
| Alternative Promoters: | null; see alsoEPDNEW_R1515 | |||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | |||||||||
| Position: |
|
| RGD ID: | 13690994 | |||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R1515 | |||||||||
| Type: | initiation region | |||||||||
| Name: | Mxi1_1 | |||||||||
| Description: | MAX interactor 1, dimerization protein | |||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | |||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | |||||||||
| Alternative Promoters: | null; see alsoEPDNEW_R1514 | |||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | |||||||||
| Position: |
|
Strain Sequence Variants (Rnor 6.0)
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:3128 | AgrOrtholog |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000034078 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000040770 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| ENSRNOP00000067990 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOP00000068001 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000042822 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| ENSRNOT00000076387 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000076779 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 4.10.280.10 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:7133853 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | bHLH_dom | UniProtKB/Swiss-Prot |
| HLH_DNA-bd_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:25701 | UniProtKB/TrEMBL |
| MGC_CLONE | MGC:93544 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 25701 | ENTREZGENE |
| Pfam | HLH | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Mxi1 | PhenoGen |
| PROSITE | BHLH | UniProtKB/Swiss-Prot |
| SMART | HLH | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Superfamily-SCOP | SSF47459 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniGene | Rn.37510 | ENTREZGENE |
| UniProt | A0A096MJ49 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0A096MJ60 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| MXI1_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE | |
| P70542_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| Q642D1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| Q6RKA6_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2015-07-29 | Mxi1 | MAX interactor 1, dimerization protein | LOC100360467 | Max interactor 1-like | Data Merged | 737654 | PROVISIONAL |
| 2013-04-12 | Mxi1 | MAX interactor 1, dimerization protein | LOC100360898 | Max interactor 1-like | Data Merged | 737654 | PROVISIONAL |
| 2012-11-21 | Mxi1 | MAX interactor 1, dimerization protein | Mxi1 | MAX interactor 1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2010-05-06 | LOC100360467 | Max interactor 1-like | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
| 2010-05-05 | LOC100360898 | Max interactor 1-like | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
| 2008-09-09 | Mxi1 | MAX interactor 1 | Mxi1 | Max interacting protein 1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2002-06-10 | Mxi1 | max interacting protein 1 | Symbol and Name status set to approved | 70586 | APPROVED |
RGD Curation Notes| Note Type | Note | Reference |
|---|---|---|
| gene_process | regulates Myc oncoprotein activity thus playing an important role in proliferation, differentiation, and apoptosis | 70302 |
 |
| More on Mxi1 | |
|
Alliance Gene |
|
NCBI Gene |
|
Ensembl Gene |
|
|
JBrowse: rn5 rn6 |
|
NCBI Genome Data Viewer |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 3128 |
| Created: | 2000-05-25 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2019-11-27 |
| Status: | ACTIVE |
 |
 |
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 |
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.
