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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | atrial fibrillation | | ISO | RGD:731815 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:29892015, PMID:30061737 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | atrial fibrillation | | ISO | RGD:731815 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:29892015, PMID:30061737 | |
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1. | Caricasole A, etal., J Biol Chem. 2002 Feb 15;277(7):4790-6. Epub 2001 Nov 21. |
2. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
3. | Goto K and Kondo H, Proc Natl Acad Sci U S A 1993 Aug 15;90(16):7598-602. |
4. | KEGG |
5. | Kwitek AE, etal., Genome Res. 2004 Apr;14(4):750-7 |
6. | MGD data from the GO Consortium |
7. | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
8. | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
9. | RGD automated data pipeline |
10. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
11. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
12. | Sato M, etal., Pharmacology. 2013;92(1-2):99-107. doi: 10.1159/000351849. Epub 2013 Aug 16. |
13. | Tentative Sequence Data IDs. TIGR Gene Index, Rat Data |
PMID:12832407 | PMID:15896305 | PMID:16019106 | PMID:19087171 | PMID:19691842 | PMID:19826069 | PMID:20657643 | PMID:22627129 | PMID:23012479 | PMID:23467923 | PMID:23503970 | PMID:30053369 |
Dgkb (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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DGKB (Homo sapiens - human) |
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Dgkb (Mus musculus - house mouse) |
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Dgkb (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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DGKB (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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DGKB (Canis lupus familiaris - dog) |
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Dgkb (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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DGKB (Sus scrofa - pig) |
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DGKB (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Dgkb (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D6Rat26 |
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D6Got70 |
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D6Arb11 |
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BF400076 |
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RH127545 |
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RH144556 |
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BF386108 |
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BF386309 |
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RH94439 |
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RH135215 |
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AU049028 |
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S0226 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 29 | 1 | |||||||||||
Low | 2 | 32 | 16 | 16 | 8 | 8 | 37 | 25 | 24 | 11 | 8 | ||
Below cutoff | 1 | 9 | 16 | 16 | 3 | 16 | 3 | 8 | 9 | 13 |
RefSeq Transcripts | NM_019304 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_008764649 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017594328 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017594329 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017594330 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017594331 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017594332 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039112775 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039112776 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039112777 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039112778 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | D16100 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
JACYVU010000164 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000063874 ⟹ ENSRNOP00000058842 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000111621 ⟹ ENSRNOP00000082015 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_019304 ⟹ NP_062177 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_008764649 ⟹ XP_008762871 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017594328 ⟹ XP_017449817 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017594329 ⟹ XP_017449818 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017594330 ⟹ XP_017449819 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039112775 ⟹ XP_038968703 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039112776 ⟹ XP_038968704 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039112777 ⟹ XP_038968705 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039112778 ⟹ XP_038968706 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
Protein RefSeqs | NP_062177 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_008762871 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_017449817 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_017449818 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_017449819 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038968703 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038968704 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038968705 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038968706 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | BAA03675 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
P49621 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_062177 ⟸ NM_019304 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_008762871 ⟸ XM_008764649 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017449817 ⟸ XM_017594328 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017449819 ⟸ XM_017594330 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017449818 ⟸ XM_017594329 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000058842 ⟸ ENSRNOT00000063874 |
RefSeq Acc Id: | XP_038968703 ⟸ XM_039112775 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
RefSeq Acc Id: | XP_038968705 ⟸ XM_039112777 |
- Peptide Label: | isoform X4 |
RefSeq Acc Id: | XP_038968704 ⟸ XM_039112776 |
- Peptide Label: | isoform X3 |
RefSeq Acc Id: | XP_038968706 ⟸ XM_039112778 |
- Peptide Label: | isoform X5 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000082015 ⟸ ENSRNOT00000111621 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-P49621-F1-model_v2 | AlphaFold | P49621 | 1-801 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:2488 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-37770 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000030771 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000058842 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOP00000082015 | ENTREZGENE | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000063874 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
ENSRNOT00000111621 | ENTREZGENE | |
Gene3D-CATH | 1.10.238.110 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
3.40.50.10330 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
InterPro | ATP-NAD_kinase_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
DAG_kinase_typeI_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
DGK | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
DGK_typeI_N_sf | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Diacylglycerol_kin_accessory | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Diacylglycerol_kinase_cat_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EF-hand-dom_pair | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EF_Hand_1_Ca_BS | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EF_hand_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
NAD/diacylglycerol_kinase_sf | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PE/DAG-bd | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:54248 | UniProtKB/Swiss-Prot |
NCBI Gene | 54248 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR11255 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | C1_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
DAG_kinase_N | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
DAGK_acc | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
DAGK_cat | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EF-hand_7 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
PhenoGen | Dgkb | PhenoGen |
PROSITE | DAGK | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
EF_HAND_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EF_HAND_2 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
ZF_DAG_PE_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
ZF_DAG_PE_2 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
SMART | DAGKa | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
DAGKc | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
EFh | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
SM00109 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
Superfamily-SCOP | SSF111331 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
SSF47473 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
TIGR | TC231297 | |
UniProt | DGKB_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot |
F1LP01_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
P49621 | ENTREZGENE |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2002-11-06 | Dgkb | diacylglycerol kinase, beta | Dagk | Diacylglycerol kinase 90kDa | Symbol and Name updated | 625702 | APPROVED |
2002-06-10 | Dagk | Diacylglycerol kinase 90kDa | Symbol and Name status set to approved | 70586 | APPROVED |
Note Type | Note | Reference |
---|---|---|
gene_cellular_localization | protein localized to membrane fractions | 728585 |
gene_domains | protein contains an EF-hand motif, a cysteine-rich zinc-finger like sequence, and a putative ATP-binding site | 728585 |
gene_expression | mRNA expressed specifically in neuronal populations, including caudate-putamen, accumbens nucleus and the olfactory tubercle | 728585 |
gene_protein | 90 kDA protein is made up of 801 amino acids | 728585 |