Gene-Chemical Interaction Annotations
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miRNA Target Status
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 281 | Count of miRNA genes: | 267 | Interacting mature miRNAs: | 279 | Transcripts: | ENST00000563777 | Prediction methods: | Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | |
The detailed report is available here: | Full Report | CSV | TAB | Printer | ||||
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
Markers in Region
GDB:335751 |
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GDB:434012 |
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L17791 |
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D10S275 |
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D3S1673 |
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D1S1423 |
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UniSTS:484604 |
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Expression
RNA-SEQ Expression
High: > 1000 TPM value
Medium: Between 11 and 1000 TPMLow: Between 0.5 and 10 TPM Below Cutoff: < 0.5 TPM
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | sensory system | adipose tissue | appendage | entire extraembryonic component | |
High | ||||||||||||||||
Medium | 26 | 12 | 9 | 30 | 10 | 6 | 12 | 26 | 7 | 40 | 47 | 2 | ||||
Low | 2239 | 1463 | 1473 | 394 | 1359 | 244 | 2893 | 1383 | 3281 | 373 | 1386 | 1513 | 160 | 1078 | 1663 | 4 |
Below cutoff | 167 | 1516 | 236 | 217 | 554 | 208 | 1456 | 798 | 401 | 38 | 22 | 48 | 9 | 126 | 1125 |
Sequence
Nucleotide Sequences
RefSeq Acc Id: | ENST00000563777 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | NR_024348 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
Type: | NON-CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
Protein Sequences
GenBank Protein | BAC03841 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EAW52191 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
Q494R0 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |