Gene-Chemical Interaction Annotations
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Genomics
Clinical Variants
miRNA Target Status
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 333 | Count of miRNA genes: | 307 | Interacting mature miRNAs: | 328 | Transcripts: | ENST00000318186, ENST00000451762 | Prediction methods: | Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | |
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miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
Markers in Region
SHGC-53374 |
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RH93412 |
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RH119340 |
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RH123684 |
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D4S1204 |
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SHGC-50898 |
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UniSTS:487344 |
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Expression
RNA-SEQ Expression
High: > 1000 TPM value
Medium: Between 11 and 1000 TPMLow: Between 0.5 and 10 TPM Below Cutoff: < 0.5 TPM
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | sensory system | visual system | adipose tissue | appendage | entire extraembryonic component | pharyngeal arch | |
High | ||||||||||||||||||
Medium | 2 | 7 | 7 | 1 | 1 | 2 | 1 | 4 | 100 | 61 | 11 | 10 | 3 | 1 | ||||
Low | 2054 | 2118 | 1352 | 235 | 509 | 110 | 4074 | 1850 | 3632 | 347 | 1388 | 1556 | 134 | 1197 | 2611 | 5 | 2 | |
Below cutoff | 381 | 851 | 362 | 386 | 892 | 351 | 282 | 342 | 2 | 11 | 61 | 44 | 37 | 7 | 177 | 1 |
Sequence
Nucleotide Sequences
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GenBank Protein | AAP76295 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EAX05957 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
EAX05958 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |