Acta2 (actin alpha 2, smooth muscle, aorta) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Acta2 (actin alpha 2, smooth muscle, aorta) Mus musculus
Analyze
Symbol: Acta2
Name: actin alpha 2, smooth muscle, aorta
RGD ID: 1616012
MGI Page MGI
Description: Enables protein kinase binding activity. Acts upstream of or within regulation of blood pressure and vascular associated smooth muscle contraction. Located in actin cytoskeleton and smooth muscle contractile fiber. Is expressed in several structures, including cardiovascular system; extraembryonic component; genitourinary system; gut; and respiratory system. Human ortholog(s) of this gene implicated in Moyamoya disease and thoracic aortic aneurysm. Orthologous to human ACTA2 (actin alpha 2, smooth muscle).
Type: protein-coding
RefSeq Status: REVIEWED
Also known as: 0610041G09Rik; a-; a-SMA; Ac; actin, alpha 2, smooth muscle, aorta; actin, alpha, vascular smooth muscle; actin, aortic smooth muscle; Actvs; al; alpha-actin-2; alphaSMA; SM; SMAalpha; SMalphaA
RGD Orthologs
Human
Rat
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Genes
More Info more info ...
Related Pseudogenes: Gm14739  
Latest Assembly: GRCm38 - Mouse Genome Assembly GRCm38
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm391934,217,736 - 34,232,985 (-)NCBIGRCm39mm39
GRCm39 Ensembl1934,218,490 - 34,232,990 (-)Ensembl
GRCm381934,240,336 - 34,255,585 (-)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl1934,241,090 - 34,255,590 (-)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv371934,315,581 - 34,329,826 (-)NCBIGRCm37mm9NCBIm37
MGSCv361934,307,088 - 34,321,333 (-)NCBImm8
Celera1935,018,279 - 35,032,476 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map19C1NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Gene-Chemical Interaction Annotations     Click to see Annotation Detail View
(+)-schisandrin B  (ISO)
(+)-Tetrandrine  (ISO)
(-)-citrinin  (ISO)
(-)-demecolcine  (ISO)
(-)-epigallocatechin 3-gallate  (EXP,ISO)
(25R)-cholest-5-ene-3beta,26-diol  (ISO)
(2R,4R)-1-[(2S)-5-(diaminomethylideneamino)-2-[(3-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-8-yl)sulfonylamino]-1-oxopentyl]-4-methyl-2-piperidinecarboxylic acid  (EXP)
(R)-lipoic acid  (ISO)
(S)-colchicine  (ISO)
(S)-naringenin  (ISO)
(S)-nicotine  (EXP)
1,2-dimethylhydrazine  (EXP)
1-naphthyl isothiocyanate  (ISO)
1-octadec-9-enoylglycero-3-phosphate  (EXP)
11-deoxycorticosterone  (EXP)
17alpha-ethynylestradiol  (EXP,ISO)
17beta-estradiol  (ISO)
17beta-estradiol 3-benzoate  (ISO)
2,2',4,4'-Tetrabromodiphenyl ether  (EXP)
2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine  (EXP,ISO)
2,3,7,8-Tetrachlorodibenzofuran  (EXP,ISO)
2,6-di-tert-butyl-4-methylphenol  (ISO)
2-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-\{[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl](methyl)amino\}-2-(propan-2-yl)pentanenitrile  (ISO)
2-amino-2-deoxy-D-galactopyranose  (ISO)
2-arachidonoylglycerol  (ISO)
2-butoxyethanol  (EXP)
2-methylcholine  (ISO)
25-hydroxycholesterol  (ISO)
26-hydroxycholesterol  (ISO)
3,3',4,4'-tetrachlorobiphenyl  (EXP)
3,4-dihydroxybenzaldehyde  (ISO)
3-[3-(tert-butylsulfanyl)-1-(4-chlorobenzyl)-5-(propan-2-yl)-1H-indol-2-yl]-2,2-dimethylpropanoic acid  (ISO)
3-isobutyl-1-methyl-7H-xanthine  (EXP,ISO)
3-methyladenine  (ISO)
3-methylcholanthrene  (EXP)
3-phenylprop-2-enal  (ISO)
4,4'-sulfonyldiphenol  (EXP)
4-hydroxyphenyl retinamide  (EXP)
4-phenylbutyric acid  (ISO)
5-(1,4-diazepane-1-sulfonyl)isoquinoline  (EXP)
5-aza-2'-deoxycytidine  (ISO)
5-azacytidine  (ISO)
6-chloro-2,3,4,9-tetrahydro-1H-carbazole-1-carboxamide  (ISO)
9-cis-retinoic acid  (ISO)
Ac-Ser-Asp-Lys-Pro-OH  (EXP,ISO)
acetaldehyde  (ISO)
acrylamide  (ISO)
acteoside  (ISO)
aflatoxin B1  (ISO)
AICA ribonucleotide  (ISO)
aldehydo-D-glucose  (ISO)
aldosterone  (ISO)
all-trans-retinoic acid  (EXP,ISO)
all-trans-retinol  (ISO)
allyl isothiocyanate  (EXP)
AM-251  (ISO)
andrographolide  (EXP,ISO)
anthocyanin  (EXP,ISO)
anthra[1,9-cd]pyrazol-6(2H)-one  (EXP)
apocynin  (ISO)
arecoline  (ISO)
argatroban  (EXP)
aristolochic acid  (EXP,ISO)
Aroclor 1254  (EXP)
arsane  (ISO)
arsenic atom  (ISO)
arsenite(3-)  (EXP)
arsenous acid  (EXP,ISO)
artesunate  (EXP,ISO)
ATP  (ISO)
atrazine  (ISO)
baicalein  (ISO)
benazepril  (ISO)
benzene  (ISO)
benzo[a]pyrene  (EXP,ISO)
benzo[a]pyrene diol epoxide I  (ISO)
berberine  (ISO)
beryllium sulfate  (ISO)
betulin  (ISO)
betulinic acid  (ISO)
bexarotene  (ISO)
bezafibrate  (EXP,ISO)
bis(2-chloroethyl) sulfide  (ISO)
bis(2-ethylhexyl) phthalate  (ISO)
bisphenol A  (EXP,ISO)
bisphenol F  (EXP)
bleomycin A2  (EXP,ISO)
boric acid  (ISO)
buta-1,3-diene  (EXP)
C.I. Natural Red 20  (ISO)
cadmium dichloride  (EXP,ISO)
caffeine  (ISO)
calcitriol  (EXP,ISO)
captan  (EXP)
captopril  (EXP,ISO)
carbon nanotube  (EXP,ISO)
carvedilol  (ISO)
celastrol  (EXP,ISO)
celecoxib  (ISO)
ceruletide  (EXP)
chenodeoxycholic acid  (EXP)
chlordecone  (EXP)
chlorogenic acid  (ISO)
chlorohydrocarbon  (EXP)
chlorothalonil  (ISO)
chlorpyrifos  (EXP)
choline  (EXP,ISO)
chromium(6+)  (EXP)
chrysin  (EXP)
ciglitazone  (ISO)
cisplatin  (ISO)
clobetasol  (EXP)
clodronic acid  (ISO)
Clofop  (ISO)
cobalt dichloride  (ISO)
colforsin daropate hydrochloride  (ISO)
copper atom  (EXP,ISO)
copper(0)  (EXP,ISO)
copper(II) sulfate  (EXP,ISO)
crocidolite asbestos  (EXP,ISO)
cucurbitacin B  (EXP)
cucurbitacin E  (EXP,ISO)
curcumin  (EXP,ISO)
cyanocob(III)alamin  (EXP)
cyclosporin A  (EXP,ISO)
cystamine  (ISO)
cytochalasin D  (ISO)
D-glucose  (ISO)
dapagliflozin  (ISO)
DAPT  (ISO)
DDT  (ISO)
delphinidin  (EXP)
desferrioxamine B  (ISO)
dexamethasone  (EXP,ISO)
Diacetylmonoxime  (ISO)
Diallyl sulfide  (ISO)
diallyl trisulfide  (ISO)
diarsenic trioxide  (EXP,ISO)
dibenziodolium  (ISO)
dibutyl phthalate  (EXP,ISO)
dicrotophos  (ISO)
diethyl malate  (EXP)
dihydrolipoic acid  (ISO)
diisononyl phthalate  (EXP)
dimethyl fumarate  (ISO)
dimethyl sulfoxide  (ISO)
diminazene diaceturate  (ISO)
Diosbulbin B  (EXP)
dioxygen  (EXP,ISO)
disodium selenite  (ISO)
disulfiram  (ISO)
diuron  (ISO)
dorsomorphin  (ISO)
doxorubicin  (EXP,ISO)
doxycycline  (EXP)
ebselen  (ISO)
emodin  (ISO)
enalapril  (ISO)
endosulfan  (ISO)
entinostat  (ISO)
eplerenone  (ISO)
ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-one  (ISO)
ethanol  (EXP,ISO)
ethyl methanesulfonate  (ISO)
fasudil hydrochloride  (EXP)
fenamidone  (EXP)
fenofibrate  (EXP,ISO)
finasteride  (ISO)
fingolimod hydrochloride  (EXP)
folic acid  (EXP,ISO)
folpet  (EXP)
formaldehyde  (EXP,ISO)
formoterol fumarate  (ISO)
fructose  (ISO)
gadolinium trichloride  (ISO)
gamma-mangostin  (EXP,ISO)
Ganoderic acid A  (EXP)
gefitinib  (EXP)
genistein  (ISO)
geraniol  (ISO)
Ginkgoic acid  (EXP)
Ginkgolide A  (EXP)
glucagon  (EXP)
glucose  (ISO)
glycyrrhetinate  (ISO)
glycyrrhetinic acid  (ISO)
glycyrrhizinic acid  (ISO)
graphene oxide  (EXP)
heparin  (ISO)
heptachlor  (ISO)
hesperetin  (ISO)
hexachlorobenzene  (EXP)
hexadecanoic acid  (ISO)
homocysteine  (EXP)
Honokiol  (EXP,ISO)
hyaluronic acid  (ISO)
hydrogen peroxide  (EXP,ISO)
ICI 118551  (ISO)
imperatorin  (ISO)
indole-3-methanol  (ISO)
irbesartan  (ISO)
irinotecan  (EXP)
iron(2+) sulfate (anhydrous)  (ISO)
isoorientin  (ISO)
isoprenaline  (EXP,ISO)
isorhamnetin  (EXP,ISO)
ivermectin  (ISO)
jaspamide  (ISO)
kaempferol  (EXP)
L-ascorbic acid  (ISO)
L-cysteine  (ISO)
L-methionine  (EXP,ISO)
lamivudine  (ISO)
lapatinib  (ISO)
latrunculin B  (ISO)
leukotriene B4  (EXP,ISO)
limonene  (ISO)
lipoic acid  (ISO)
lipopolysaccharide  (ISO)
losartan  (EXP,ISO)
lovastatin  (ISO)
lucanthone  (ISO)
luteolin  (EXP)
LY 364947  (EXP)
LY294002  (ISO)
malonaldehyde  (ISO)
manganese(II) chloride  (ISO)
melatonin  (ISO)
mercaptoethanol  (ISO)
mesalamine  (ISO)
metacetamol  (EXP)
metformin  (ISO)
methotrexate  (ISO)
methyl methanesulfonate  (ISO)
methylglyoxal  (EXP)
methylmercury chloride  (ISO)
methylseleninic acid  (ISO)
mirtazapine  (EXP)
mitogen  (ISO)
MK-2206  (ISO)
ML-7  (ISO)
monocrotaline  (ISO)
montelukast  (ISO)
morin  (ISO)
myricitrin  (EXP)
N-acetyl-1,4-benzoquinone imine  (ISO)
N-acetyl-L-cysteine  (EXP,ISO)
N-benzyloxycarbonyl-L-leucyl-L-leucyl-L-leucinal  (EXP)
N-nitrosodiethylamine  (EXP,ISO)
N-nitrosodimethylamine  (EXP,ISO)
naloxone  (ISO)
nickel atom  (ISO)
nickel dichloride  (EXP,ISO)
nickel subsulfide  (ISO)
niclosamide  (EXP,ISO)
nicotine  (EXP)
nitrofen  (EXP)
nocodazole  (ISO)
NS-398  (ISO)
ochratoxin A  (EXP,ISO)
octreotide  (ISO)
olaparib  (EXP)
oleanolic acid  (EXP,ISO)
oleic acid  (ISO)
olmesartan  (ISO)
ouabain  (ISO)
Pachymic acid  (ISO)
paclitaxel  (ISO)
panobinostat  (ISO)
paracetamol  (EXP,ISO)
paraquat  (EXP,ISO)
Pentoxifylline  (ISO)
perindopril  (ISO)
phenethyl isothiocyanate  (ISO)
phenobarbital  (ISO)
phenylephrine  (ISO)
phenylmercury acetate  (ISO)
PhIP  (ISO)
pioglitazone  (EXP,ISO)
pirfenidone  (EXP,ISO)
pirinixic acid  (EXP)
poly(guanylic acid)  (ISO)
potassium dichromate  (EXP)
pregnenolone 16alpha-carbonitrile  (EXP)
proanthocyanidin  (ISO)
probucol  (ISO)
progesterone  (ISO)
propanal  (ISO)
prostaglandin E2  (ISO)
puerarin  (EXP)
pyrrolidine dithiocarbamate  (ISO)
quartz  (ISO)
quercetin  (EXP,ISO)
radon atom  (EXP,ISO)
radon(0)  (EXP,ISO)
resveratrol  (EXP,ISO)
Rhein  (ISO)
ridaforolimus  (ISO)
rifaximin  (ISO)
rimonabant  (ISO)
rivaroxaban  (ISO)
Ro 31-8220  (ISO)
rosmarinic acid  (ISO)
rotenone  (EXP,ISO)
Salvianolic acid A  (ISO)
salvianolic acid B  (ISO)
saroglitazar  (ISO)
SB 203580  (ISO)
SB 431542  (EXP,ISO)
SCH772984  (EXP)
serpentine asbestos  (ISO)
Shikonin  (ISO)
sildenafil citrate  (ISO)
silicon dioxide  (EXP,ISO)
silver atom  (EXP)
silver(0)  (EXP)
simvastatin  (ISO)
sirolimus  (ISO)
sodium arsenate  (EXP)
sodium arsenite  (EXP,ISO)
sodium dichromate  (EXP)
sodium fluoride  (EXP,ISO)
sorafenib  (ISO)
sorbinil  (ISO)
spironolactone  (ISO)
SR 144528  (EXP)
streptozocin  (EXP,ISO)
sulfasalazine  (ISO)
sulforaphane  (EXP,ISO)
sunitinib  (ISO)
Swertiamarin  (ISO)
tacrolimus hydrate  (EXP)
tamoxifen  (EXP)
Tanshinone I  (ISO)
taurine  (EXP,ISO)
testosterone  (ISO)
tetrachloromethane  (EXP,ISO)
tetramethylpyrazine  (EXP,ISO)
thalidomide  (ISO)
thapsigargin  (ISO)
theophylline  (ISO)
thioacetamide  (EXP,ISO)
thymidine  (ISO)
thymoquinone  (EXP,ISO)
Tiron  (EXP)
titanium dioxide  (EXP)
tolcapone  (ISO)
TRAM-34  (ISO)
triadimefon  (ISO)
tributylstannane  (ISO)
trichostatin A  (EXP,ISO)
troglitazone  (ISO)
tunicamycin  (ISO)
urethane  (ISO)
valproic acid  (EXP,ISO)
vancomycin  (EXP)
verapamil  (ISO)
vildagliptin  (EXP)
vinclozolin  (ISO)
vitamin D  (EXP)
vitamin E  (ISO)
vitamin K  (ISO)
vorinostat  (ISO)
warfarin  (ISO)
WIN 55212-2  (EXP,ISO)
XL147  (EXP)
Y-27632  (EXP,ISO)
zileuton  (ISO)
zinc atom  (EXP)
zinc(0)  (EXP)
zoledronic acid  (EXP,ISO)

Molecular Pathway Annotations     Click to see Annotation Detail View
References

Additional References at PubMed
PMID:1555776   PMID:1601869   PMID:1701491   PMID:2398068   PMID:2712823   PMID:3194212   PMID:6725286   PMID:7502236   PMID:7744768   PMID:8186145   PMID:8573719   PMID:8575061  
PMID:8601035   PMID:8614465   PMID:8616889   PMID:8698823   PMID:8905017   PMID:8937744   PMID:9224674   PMID:9367982   PMID:9368764   PMID:9374392   PMID:9384381   PMID:9449696  
PMID:9486664   PMID:9636077   PMID:9693135   PMID:9799237   PMID:9826522   PMID:9827803   PMID:9834195   PMID:10079220   PMID:10101119   PMID:10208749   PMID:10215630   PMID:10217254  
PMID:10331973   PMID:10349636   PMID:10373225   PMID:10375497   PMID:10391686   PMID:10409505   PMID:10411402   PMID:10419690   PMID:10457010   PMID:10491653   PMID:10518221   PMID:10556292  
PMID:10579975   PMID:10615402   PMID:10686609   PMID:10700190   PMID:10706142   PMID:10725239   PMID:10751175   PMID:10809671   PMID:10821773   PMID:10833443   PMID:10842358   PMID:10878607  
PMID:10892744   PMID:10903171   PMID:10906778   PMID:10943840   PMID:10970822   PMID:10976050   PMID:11002344   PMID:11032855   PMID:11042159   PMID:11053242   PMID:11062473   PMID:11066038  
PMID:11066097   PMID:11076861   PMID:11121372   PMID:11124112   PMID:11159348   PMID:11164852   PMID:11171335   PMID:11217851   PMID:11285230   PMID:11287183   PMID:11303904   PMID:11309372  
PMID:11344305   PMID:11357193   PMID:11416142   PMID:11439183   PMID:11440971   PMID:11457727   PMID:11493558   PMID:11507771   PMID:11509733   PMID:11532251   PMID:11562355   PMID:11578869  
PMID:11668599   PMID:11729236   PMID:11731255   PMID:11747814   PMID:11748835   PMID:11784060   PMID:11807029   PMID:11809759   PMID:11891179   PMID:11892011   PMID:11934868   PMID:11971873  
PMID:12074562   PMID:12093914   PMID:12112468   PMID:12142029   PMID:12142349   PMID:12160745   PMID:12242711   PMID:12244553   PMID:12297046   PMID:12355421   PMID:12361971   PMID:12361974  
PMID:12368298   PMID:12370313   PMID:12393102   PMID:12413905   PMID:12441304   PMID:12446788   PMID:12466202   PMID:12466851   PMID:12477932   PMID:12478370   PMID:12588999   PMID:12606287  
PMID:12619136   PMID:12629673   PMID:12631064   PMID:12666204   PMID:12697838   PMID:12748302   PMID:12750314   PMID:12781691   PMID:12812790   PMID:12815630   PMID:12818570   PMID:12867591  
PMID:12869509   PMID:12874279   PMID:12879075   PMID:12885771   PMID:12907752   PMID:12917290   PMID:12921739   PMID:12950082   PMID:12970115   PMID:12970361   PMID:14499647   PMID:14500699  
PMID:14513355   PMID:14517255   PMID:14567980   PMID:14607778   PMID:14610273   PMID:14627725   PMID:14659802   PMID:14697353   PMID:14706070   PMID:14713950   PMID:15136151   PMID:15138255  
PMID:15162513   PMID:15175244   PMID:15207855   PMID:15226263   PMID:15226394   PMID:15234214   PMID:15239958   PMID:15280212   PMID:15282311   PMID:15282343   PMID:15302855   PMID:15331365  
PMID:15371328   PMID:15383601   PMID:15459110   PMID:15465019   PMID:15466160   PMID:15472070   PMID:15489334   PMID:15510105   PMID:15528466   PMID:15536133   PMID:15548578   PMID:15572151  
PMID:15572153   PMID:15576410   PMID:15579434   PMID:15590741   PMID:15591414   PMID:15592099   PMID:15610731   PMID:15626744   PMID:15637299   PMID:15668254   PMID:15681399   PMID:15687262  
PMID:15689378   PMID:15733665   PMID:15740708   PMID:15817462   PMID:15821017   PMID:15829524   PMID:15843414   PMID:15857912   PMID:15875024   PMID:15882861   PMID:15907457   PMID:15907834  
PMID:15923608   PMID:15929941   PMID:15936338   PMID:15951419   PMID:15964817   PMID:15977181   PMID:15987699   PMID:15996652   PMID:16003770   PMID:16049112   PMID:16049333   PMID:16079292  
PMID:16093352   PMID:16107612   PMID:16141072   PMID:16141073   PMID:16183868   PMID:16204380   PMID:16224065   PMID:16284122   PMID:16293765   PMID:16314531   PMID:16314533   PMID:16324690  
PMID:16344855   PMID:16354690   PMID:16391003   PMID:16400024   PMID:16413489   PMID:16414041   PMID:16436378   PMID:16439479   PMID:16458083   PMID:16459152   PMID:16463373   PMID:16466398  
PMID:16470615   PMID:16496285   PMID:16510507   PMID:16511601   PMID:16537897   PMID:16538658   PMID:16540513   PMID:16546160   PMID:16554359   PMID:16556914   PMID:16557299   PMID:16579983  
PMID:16602821   PMID:16606664   PMID:16614351   PMID:16618389   PMID:16638982   PMID:16675530   PMID:16687131   PMID:16690984   PMID:16698852   PMID:16723488   PMID:16790075   PMID:16802330  
PMID:16829511   PMID:16831171   PMID:16839542   PMID:16847256   PMID:16873063   PMID:16875435   PMID:16880535   PMID:16887829   PMID:16895970   PMID:16912273   PMID:16943282   PMID:16952347  
PMID:16956603   PMID:16957025   PMID:16989802   PMID:17035289   PMID:17039375   PMID:17069789   PMID:17079275   PMID:17090535   PMID:17108969   PMID:17129766   PMID:17142808   PMID:17143286  
PMID:17159898   PMID:17172448   PMID:17183527   PMID:17187062   PMID:17196193   PMID:17199044   PMID:17202422   PMID:17226818   PMID:17258700   PMID:17261592   PMID:17272814   PMID:17273555  
PMID:17276340   PMID:17277743   PMID:17286605   PMID:17296941   PMID:17310383   PMID:17329363   PMID:17332426   PMID:17336907   PMID:17428829   PMID:17428830   PMID:17438136   PMID:17485440  
PMID:17490411   PMID:17493607   PMID:17499702   PMID:17519029   PMID:17522155   PMID:17530030   PMID:17556662   PMID:17560563   PMID:17573777   PMID:17584888   PMID:17601530   PMID:17626061  
PMID:17628518   PMID:17651609   PMID:17656671   PMID:17685488   PMID:17687003   PMID:17706958   PMID:17717145   PMID:17767158   PMID:17804598   PMID:17823374   PMID:17823941   PMID:17882221  
PMID:17898695   PMID:17904217   PMID:17967885   PMID:17989236   PMID:18028902   PMID:18039851   PMID:18043734   PMID:18059000   PMID:18063572   PMID:18093989   PMID:18097059   PMID:18097475  
PMID:18173746   PMID:18194151   PMID:18196599   PMID:18213589   PMID:18224708   PMID:18231602   PMID:18243171   PMID:18245384   PMID:18256198   PMID:18265012   PMID:18267097   PMID:18287559  
PMID:18296617   PMID:18304521   PMID:18316483   PMID:18321928   PMID:18330927   PMID:18332105   PMID:18344281   PMID:18345009   PMID:18367557   PMID:18371348   PMID:18374325   PMID:18374910  
PMID:18398001   PMID:18400219   PMID:18401410   PMID:18417617   PMID:18424556   PMID:18462699   PMID:18463632   PMID:18467647   PMID:18508041   PMID:18514180   PMID:18515089   PMID:18528438  
PMID:18538758   PMID:18539270   PMID:18539926   PMID:18554416   PMID:18559979   PMID:18570254   PMID:18572159   PMID:18582859   PMID:18583714   PMID:18585372   PMID:18591670   PMID:18606782  
PMID:18627106   PMID:18651661   PMID:18653563   PMID:18667074   PMID:18710724   PMID:18725519   PMID:18775691   PMID:18776146   PMID:18776147   PMID:18778700   PMID:18779384   PMID:18784615  
PMID:18804439   PMID:18816823   PMID:18816838   PMID:18830417   PMID:18832390   PMID:18924607   PMID:18952909   PMID:18977342   PMID:18990706   PMID:19004856   PMID:19008920   PMID:19015276  
PMID:19017799   PMID:19060336   PMID:19073828   PMID:19087347   PMID:19091769   PMID:19097117   PMID:19100728   PMID:19116663   PMID:19208343   PMID:19217431   PMID:19223466   PMID:19233133  
PMID:19250981   PMID:19253341   PMID:19259391   PMID:19265663   PMID:19269978   PMID:19272526   PMID:19285011   PMID:19297558   PMID:19299468   PMID:19303107   PMID:19361496   PMID:19398761  
PMID:19398960   PMID:19403103   PMID:19403928   PMID:19407242   PMID:19411629   PMID:19411759   PMID:19412431   PMID:19415626   PMID:19419974   PMID:19437030   PMID:19445942   PMID:19498055  
PMID:19515997   PMID:19530136   PMID:19531353   PMID:19563798   PMID:19587446   PMID:19619540   PMID:19646988   PMID:19660448   PMID:19661150   PMID:19672307   PMID:19686679   PMID:19690389  
PMID:19705428   PMID:19705443   PMID:19706423   PMID:19710174   PMID:19710239   PMID:19720827   PMID:19729839   PMID:19737616   PMID:19741192   PMID:19745164   PMID:19776009   PMID:19786569  
PMID:19797768   PMID:19798050   PMID:19809516   PMID:19816508   PMID:19820125   PMID:19835853   PMID:19835856   PMID:19853364   PMID:19855129   PMID:19855135   PMID:19897741   PMID:19906871  
PMID:19910638   PMID:19914233   PMID:19917259   PMID:19926856   PMID:19961844   PMID:20007915   PMID:20013655   PMID:20019329   PMID:20023660   PMID:20048339   PMID:20059958   PMID:20063415  
PMID:20071345   PMID:20079728   PMID:20080568   PMID:20093484   PMID:20096780   PMID:20110314   PMID:20110535   PMID:20122914   PMID:20139349   PMID:20152176   PMID:20152829   PMID:20223754  
PMID:20223757   PMID:20225612   PMID:20227816   PMID:20230754   PMID:20335479   PMID:20347762   PMID:20364082   PMID:20371769   PMID:20378849   PMID:20404134   PMID:20430747   PMID:20439428  
PMID:20439457   PMID:20457809   PMID:20478304   PMID:20506548   PMID:20525685   PMID:20551517   PMID:20553735   PMID:20558824   PMID:20568247   PMID:20570943   PMID:20584329   PMID:20595636  
PMID:20619341   PMID:20630939   PMID:20637749   PMID:20647008   PMID:20658693   PMID:20691046   PMID:20691176   PMID:20692235   PMID:20713964   PMID:20727874   PMID:20730909   PMID:20803506  
PMID:20805501   PMID:20829512   PMID:20843830   PMID:20847311   PMID:20848592   PMID:20848783   PMID:20857207   PMID:20862291   PMID:20877641   PMID:20881014   PMID:20882677   PMID:20883684  
PMID:20884876   PMID:20937270   PMID:20947685   PMID:20947821   PMID:20970343   PMID:20975697   PMID:20978081   PMID:20981830   PMID:21035938   PMID:21059267   PMID:21068062   PMID:21098571  
PMID:21124978   PMID:21125652   PMID:21129374   PMID:21148187   PMID:21177177   PMID:21181199   PMID:21181944   PMID:21216305   PMID:21228004   PMID:21252157   PMID:21267068   PMID:21270765  
PMID:21281623   PMID:21282641   PMID:21294146   PMID:21303954   PMID:21307095   PMID:21307259   PMID:21311046   PMID:21335239   PMID:21339645   PMID:21350012   PMID:21350014   PMID:21350194  
PMID:21350214   PMID:21352545   PMID:21368298   PMID:21371421   PMID:21385574   PMID:21389089   PMID:21401944   PMID:21408140   PMID:21437200   PMID:21438071   PMID:21447555   PMID:21460241  
PMID:21464233   PMID:21490399   PMID:21512031   PMID:21515253   PMID:21515254   PMID:21515289   PMID:21536740   PMID:21565284   PMID:21565611   PMID:21593423   PMID:21595780   PMID:21596842  
PMID:21597012   PMID:21601656   PMID:21606205   PMID:21606590   PMID:21613322   PMID:21624358   PMID:21643937   PMID:21659474   PMID:21677750   PMID:21693521   PMID:21699792   PMID:21708977  
PMID:21731775   PMID:21749862   PMID:21750033   PMID:21757651   PMID:21757658   PMID:21768263   PMID:21778429   PMID:21779394   PMID:21791606   PMID:21803035   PMID:21820362   PMID:21852397  
PMID:21855915   PMID:21873635   PMID:21876535   PMID:21905163   PMID:21920357   PMID:21936019   PMID:21948713   PMID:21949750   PMID:21953612   PMID:21956870   PMID:21959220   PMID:21979435  
PMID:21983963   PMID:21985298   PMID:21989917   PMID:22031887   PMID:22095287   PMID:22123032   PMID:22129828   PMID:22135020   PMID:22138056   PMID:22147907   PMID:22158707   PMID:22171010  
PMID:22183742   PMID:22207710   PMID:22225908   PMID:22241839   PMID:22247257   PMID:22275227   PMID:22306086   PMID:22312437   PMID:22331032   PMID:22354871   PMID:22363445   PMID:22364862  
PMID:22371395   PMID:22396765   PMID:22402963   PMID:22403730   PMID:22406641   PMID:22421048   PMID:22437503   PMID:22474292   PMID:22485132   PMID:22491404   PMID:22498737   PMID:22511595  
PMID:22511632   PMID:22511778   PMID:22569553   PMID:22665518   PMID:22682244   PMID:22687751   PMID:22692047   PMID:22693350   PMID:22711842   PMID:22723296   PMID:22723298   PMID:22730381  
PMID:22772757   PMID:22783020   PMID:22790009   PMID:22837482   PMID:22860096   PMID:22878413   PMID:22880002   PMID:22898663   PMID:22899851   PMID:22926762   PMID:22940113   PMID:22949635  
PMID:22951644   PMID:22972987   PMID:22975322   PMID:22975327   PMID:22983360   PMID:22983395   PMID:22987639   PMID:22992803   PMID:22996691   PMID:23023706   PMID:23048191   PMID:23055941  
PMID:23063659   PMID:23063798   PMID:23071697   PMID:23087175   PMID:23091613   PMID:23097346   PMID:23136395   PMID:23175628   PMID:23178076   PMID:23190887   PMID:23195221   PMID:23201579  
PMID:23213427   PMID:23253249   PMID:23266329   PMID:23300485   PMID:23305098   PMID:23319349   PMID:23320101   PMID:23360989   PMID:23369715   PMID:23371862   PMID:23371905   PMID:23372771  
PMID:23382837   PMID:23395391   PMID:23404107   PMID:23405202   PMID:23406903   PMID:23408915   PMID:23409123   PMID:23429478   PMID:23431188   PMID:23437302   PMID:23444297   PMID:23449535  
PMID:23451260   PMID:23459939   PMID:23462468   PMID:23466739   PMID:23477786   PMID:23478408   PMID:23499552   PMID:23523683   PMID:23526493   PMID:23526992   PMID:23542581   PMID:23554936  
PMID:23591430   PMID:23591991   PMID:23601687   PMID:23603510   PMID:23606057   PMID:23613464   PMID:23620511   PMID:23633653   PMID:23637774   PMID:23645682   PMID:23649798   PMID:23671695  
PMID:23676498   PMID:23685333   PMID:23696835   PMID:23723064   PMID:23724822   PMID:23741013   PMID:23742148   PMID:23744273   PMID:23760953   PMID:23789091   PMID:23806616   PMID:23812634  
PMID:23817199   PMID:23840065   PMID:23862012   PMID:23871867   PMID:23873040   PMID:23884445   PMID:23895934   PMID:23903190   PMID:23918940   PMID:23920106   PMID:23924632   PMID:23933587  
PMID:23946447   PMID:23946491   PMID:23946498   PMID:24000064   PMID:24019067   PMID:24019535   PMID:24023956   PMID:24056078   PMID:24058167   PMID:24068960   PMID:24095903   PMID:24106278  
PMID:24107967   PMID:24120474   PMID:24129405   PMID:24131868   PMID:24135140   PMID:24153254   PMID:24161570   PMID:24218621   PMID:24260306   PMID:24260555   PMID:24262428   PMID:24274029  
PMID:24278332   PMID:24278461   PMID:24302887   PMID:24336287   PMID:24348274   PMID:24353058   PMID:24391734   PMID:24401276   PMID:24401374   PMID:24412386   PMID:24415412   PMID:24418654  
PMID:24425002   PMID:24478334   PMID:24550361   PMID:24560999   PMID:24598388   PMID:24623077   PMID:24633789   PMID:24661562   PMID:24667410   PMID:24674670   PMID:24680892   PMID:24700724  
PMID:24711139   PMID:24714781   PMID:24717433   PMID:24727670   PMID:24733830   PMID:24753151   PMID:24755984   PMID:24760871   PMID:24764452   PMID:24764455   PMID:24785085   PMID:24793170  
PMID:24803182   PMID:24805242   PMID:24828040   PMID:24839873   PMID:24840128   PMID:24845380   PMID:24854998   PMID:24858485   PMID:24868594   PMID:24879059   PMID:24886827   PMID:24894949  
PMID:24924191   PMID:24927569   PMID:24970776   PMID:25009997   PMID:25035421   PMID:25083995   PMID:25084151   PMID:25100655   PMID:25127126   PMID:25135772   PMID:25138596   PMID:25139745  
PMID:25139858   PMID:25139991   PMID:25145936   PMID:25166724   PMID:25193593   PMID:25209997   PMID:25242040   PMID:25244320   PMID:25250575   PMID:25264302   PMID:25269082   PMID:25336743  
PMID:25344368   PMID:25358792   PMID:25359725   PMID:25377219   PMID:25377550   PMID:25382630   PMID:25389758   PMID:25395543   PMID:25416281   PMID:25428115   PMID:25428889   PMID:25446274  
PMID:25505152   PMID:25516967   PMID:25521757   PMID:25555806   PMID:25572963   PMID:25575930   PMID:25576926   PMID:25576928   PMID:25631042   PMID:25670795   PMID:25670798   PMID:25681586  
PMID:25684979   PMID:25687138   PMID:25690651   PMID:25690654   PMID:25691664   PMID:25703143   PMID:25715394   PMID:25715398   PMID:25725066   PMID:25727890   PMID:25762570   PMID:25848030  
PMID:25860837   PMID:25917826   PMID:25920569   PMID:25922531   PMID:25925587   PMID:25958091   PMID:25968320   PMID:25980463   PMID:25992544   PMID:26020233   PMID:26027726   PMID:26027930  
PMID:26046524   PMID:26053665   PMID:26054850   PMID:26057579   PMID:26093309   PMID:26114487   PMID:26138478   PMID:26188246   PMID:26214525   PMID:26231217   PMID:26235536   PMID:26235626  
PMID:26243870   PMID:26246508   PMID:26253400   PMID:26261569   PMID:26276819   PMID:26305214   PMID:26329601   PMID:26353049   PMID:26367489   PMID:26387456   PMID:26411367   PMID:26420484  
PMID:26446156   PMID:26453897   PMID:26460096   PMID:26479710   PMID:26481065   PMID:26493106   PMID:26511927   PMID:26515110   PMID:26529187   PMID:26529256   PMID:26534985   PMID:26539991  
PMID:26542011   PMID:26545946   PMID:26552887   PMID:26555052   PMID:26559382   PMID:26630461   PMID:26641715   PMID:26658478   PMID:26701347   PMID:26718006   PMID:26721501   PMID:26721931  
PMID:26739565   PMID:26742650   PMID:26743624   PMID:26774483   PMID:26821812   PMID:26821948   PMID:26854927   PMID:26858344   PMID:26872874   PMID:26878215   PMID:26923665   PMID:26930384  
PMID:26934381   PMID:26953188   PMID:26984772   PMID:27009605   PMID:27019112   PMID:27056911   PMID:27064749   PMID:27084889   PMID:27120339   PMID:27140400   PMID:27155222   PMID:27176050  
PMID:27180624   PMID:27181681   PMID:27194451   PMID:27194944   PMID:27313318   PMID:27358050   PMID:27364009   PMID:27398409   PMID:27402760   PMID:27456656   PMID:27463512   PMID:27499244  
PMID:27504807   PMID:27511831   PMID:27514653   PMID:27538444   PMID:27596755   PMID:27621060   PMID:27621062   PMID:27631609   PMID:27634010   PMID:27634219   PMID:27642710   PMID:27687499  
PMID:27687577   PMID:27702788   PMID:27734842   PMID:27736991   PMID:27748998   PMID:27752085   PMID:27789626   PMID:27810937   PMID:27816607   PMID:27825850   PMID:27861515   PMID:27870635  
PMID:27880905   PMID:27892540   PMID:27899284   PMID:27917469   PMID:27956219   PMID:27997827   PMID:28002412   PMID:28011038   PMID:28028137   PMID:28036337   PMID:28049658   PMID:28052263  
PMID:28052872   PMID:28074039   PMID:28090691   PMID:28092265   PMID:28111199   PMID:28162974   PMID:28179430   PMID:28188211   PMID:28195173   PMID:28292896   PMID:28329690   PMID:28378742  
PMID:28432216   PMID:28454120   PMID:28455378   PMID:28461455   PMID:28467108   PMID:28494873   PMID:28501478   PMID:28512199   PMID:28527294   PMID:28535371   PMID:28538179   PMID:28539333  
PMID:28574994   PMID:28576768   PMID:28576770   PMID:28619823   PMID:28634350   PMID:28663440   PMID:28684544   PMID:28698625   PMID:28709801   PMID:28727763   PMID:28737171   PMID:28754713  
PMID:28763805   PMID:28771943   PMID:28791750   PMID:28797033   PMID:28813421   PMID:28827394   PMID:28835419   PMID:28844842   PMID:28859094   PMID:28924218   PMID:28943241   PMID:28952437  
PMID:28973166   PMID:29023691   PMID:29028795   PMID:29033846   PMID:29035278   PMID:29093270   PMID:29106382   PMID:29109083   PMID:29114040   PMID:29117561   PMID:29167274   PMID:29176738  
PMID:29181608   PMID:29202929   PMID:29209878   PMID:29222402   PMID:29237738   PMID:29251627   PMID:29266319   PMID:29285798   PMID:29320561   PMID:29360039   PMID:29361518   PMID:29361560  
PMID:29361573   PMID:29371594   PMID:29374072   PMID:29409032   PMID:29428562   PMID:29436516   PMID:29437553   PMID:29456135   PMID:29483576   PMID:29516783   PMID:29561727   PMID:29567669  
PMID:29567677   PMID:29593327   PMID:29618843   PMID:29636669   PMID:29638158   PMID:29654745   PMID:29665133   PMID:29700112   PMID:29700203   PMID:29743679   PMID:29768039   PMID:29772070  
PMID:29795630   PMID:29853539   PMID:29853617   PMID:29920846   PMID:29934521   PMID:29950483   PMID:29956664   PMID:29961567   PMID:29975682   PMID:30022023   PMID:30026494   PMID:30061411  
PMID:30098998   PMID:30111655   PMID:30135315   PMID:30153454   PMID:30254276   PMID:30289388   PMID:30301918   PMID:30305288   PMID:30332639   PMID:30348760   PMID:30355615   PMID:30372567  
PMID:30375389   PMID:30389913   PMID:30389914   PMID:30409884   PMID:30457570   PMID:30472119   PMID:30550785   PMID:30566624   PMID:30578393   PMID:30594504   PMID:30604742   PMID:30642836  
PMID:30649340   PMID:30651296   PMID:30670377   PMID:30696710   PMID:30700554   PMID:30713523   PMID:30718289   PMID:30796970   PMID:30818997   PMID:30850660   PMID:30898767   PMID:30916783  
PMID:30936179   PMID:30943054   PMID:30962377   PMID:30988302   PMID:31024075   PMID:31028279   PMID:31042497   PMID:31062503   PMID:31068622   PMID:31084574   PMID:31115505   PMID:31138815  
PMID:31167144   PMID:31175693   PMID:31180722   PMID:31199666   PMID:31201155   PMID:31212972   PMID:31221639   PMID:31234534   PMID:31241461   PMID:31241463   PMID:31246945   PMID:31323030  
PMID:31366218   PMID:31400222   PMID:31405951   PMID:31415243   PMID:31444215   PMID:31476284   PMID:31513549   PMID:31535973   PMID:31539501   PMID:31555647   PMID:31575647   PMID:31604927  
PMID:31634485   PMID:31645357   PMID:31719045   PMID:31719172   PMID:31756413   PMID:31758944   PMID:31761722   PMID:31767619   PMID:31776260   PMID:31789590   PMID:31808745   PMID:31875961  
PMID:31917811   PMID:31953387   PMID:31980640   PMID:32011766   PMID:32015493   PMID:32020697   PMID:32046118   PMID:32059772   PMID:32067289   PMID:32068311   PMID:32078368   PMID:32100913  
PMID:32151560   PMID:32155439   PMID:32243503   PMID:32245120   PMID:32294451   PMID:32317081   PMID:32369453   PMID:32402291   PMID:32413023   PMID:32439762   PMID:32460513   PMID:32483447  
PMID:32515350   PMID:32525258   PMID:32581705   PMID:32586976   PMID:32640236   PMID:32667624   PMID:32741376   PMID:32747435   PMID:32801116   PMID:32855415   PMID:32883967   PMID:32886109  
PMID:32901292   PMID:32909945   PMID:32913122   PMID:32945448   PMID:32945847   PMID:33030203   PMID:33048843   PMID:33057360   PMID:33106502   PMID:33127760   PMID:33132281   PMID:33159885  
PMID:33201874   PMID:33253712   PMID:33299187   PMID:33318148   PMID:33328171   PMID:33328632   PMID:33424621   PMID:33454003   PMID:33470182   PMID:33483469   PMID:33497358   PMID:33547543  
PMID:33635162   PMID:33707239   PMID:33707780   PMID:33723039   PMID:33775822   PMID:33842485   PMID:33905720   PMID:34055805   PMID:34079011  


Genomics

Comparative Map Data
Acta2
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm391934,217,736 - 34,232,985 (-)NCBIGRCm39mm39
GRCm39 Ensembl1934,218,490 - 34,232,990 (-)Ensembl
GRCm381934,240,336 - 34,255,585 (-)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl1934,241,090 - 34,255,590 (-)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv371934,315,581 - 34,329,826 (-)NCBIGRCm37mm9NCBIm37
MGSCv361934,307,088 - 34,321,333 (-)NCBImm8
Celera1935,018,279 - 35,032,476 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map19C1NCBI
ACTA2
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh38.p13 Ensembl1088,935,074 - 88,991,339 (-)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh381088,935,074 - 88,991,397 (-)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh371090,694,831 - 90,751,154 (-)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 361090,684,811 - 90,702,491 (-)NCBINCBI36hg18NCBI36
Build 341090,684,810 - 90,702,491NCBI
Celera1084,441,676 - 84,497,934 (-)NCBI
Cytogenetic Map10q23.31NCBI
HuRef1084,329,337 - 84,385,614 (-)NCBIHuRef
CHM1_11090,976,918 - 91,033,207 (-)NCBICHM1_1
Acta2
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
mRatBN7.21231,746,527 - 231,759,307 (-)NCBImRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl1231,746,548 - 231,759,554 (-)Ensembl
Rnor_6.01252,537,614 - 252,550,394 (-)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl1252,537,615 - 252,550,394 (-)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.01259,760,521 - 259,773,301 (-)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
Celera1228,860,239 - 228,873,019 (-)NCBICelera
Cytogenetic Map1q52NCBI
Acta2
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)
Chinchilla AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChiLan1.0 EnsemblNW_0049554254,026,430 - 4,040,747 (+)EnsemblChiLan1.0
ChiLan1.0NW_0049554254,023,001 - 4,039,980 (+)NCBIChiLan1.0ChiLan1.0
ACTA2
(Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee)
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
PanPan1.11089,164,344 - 89,182,131 (-)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl1089,164,344 - 89,182,080 (-)Ensemblpanpan1.1panPan2
Mhudiblu_PPA_v01085,660,983 - 85,678,729 (-)NCBIMhudiblu_PPA_v0panPan3
ACTA2
(Canis lupus familiaris - dog)
Dog AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
CanFam3.12638,700,434 - 38,714,915 (-)NCBICanFam3.1CanFam3.1canFam3CanFam3.1
CanFam3.1 Ensembl2638,700,480 - 38,711,753 (-)EnsemblCanFam3.1canFam3CanFam3.1
Dog10K_Boxer_Tasha2638,451,228 - 38,465,187 (-)NCBI
ROS_Cfam_1.02640,285,064 - 40,299,518 (-)NCBI
UMICH_Zoey_3.12638,154,857 - 38,169,070 (-)NCBI
UNSW_CanFamBas_1.02637,720,236 - 37,734,291 (-)NCBI
UU_Cfam_GSD_1.02638,990,553 - 39,005,038 (-)NCBI
Acta2
(Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel)
Squirrel AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HiC_Itri_2NW_02440721378,509,060 - 78,526,056 (-)NCBI
SpeTri2.0NW_004936735266,918 - 283,858 (+)NCBISpeTri2.0SpeTri2.0SpeTri2.0
ACTA2
(Sus scrofa - pig)
Pig AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
Sscrofa11.1 Ensembl14100,867,733 - 100,886,713 (-)EnsemblSscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa11.114100,868,145 - 100,886,732 (-)NCBISscrofa11.1Sscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa10.214109,852,854 - 109,871,415 (-)NCBISscrofa10.2Sscrofa10.2susScr3
ACTA2
(Chlorocebus sabaeus - green monkey)
Green Monkey AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChlSab1.1982,358,937 - 82,376,289 (-)NCBI
ChlSab1.1 Ensembl982,359,086 - 82,372,446 (-)Ensembl
Vero_WHO_p1.0NW_02366604843,037,005 - 43,054,486 (-)NCBI
Acta2
(Heterocephalus glaber - naked mole-rat)
Naked Mole-rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HetGla 1.0NW_00462479115,243,074 - 15,259,362 (-)NCBI

Position Markers
RH136613  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm381934,241,615 - 34,241,810UniSTSGRCm38
MGSCv371934,316,105 - 34,316,300UniSTSGRCm37
Celera1935,018,803 - 35,018,998UniSTS
Cytogenetic Map19C3UniSTS
Acta2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map19C3UniSTS
cM Map19 UniSTS
PMC259132P1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm381934,241,522 - 34,241,659UniSTSGRCm38
MGSCv371934,316,012 - 34,316,149UniSTSGRCm37
Celera1935,018,710 - 35,018,847UniSTS
Cytogenetic Map19C3UniSTS
Acta1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map8E2UniSTS
Cytogenetic Map19C3UniSTS
Cytogenetic Map11E2UniSTS
cM Map867.0UniSTS
Acta2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map19C3UniSTS


QTLs in Region (GRCm38)
The following QTLs overlap with this region.    Full Report CSV TAB Printer Gviewer
RGD IDSymbolNameLODP ValueTraitSub TraitChrStartStopSpecies
1300904Chab5_mcholesterol absorption 5 (mouse)Not determined19167640035676563Mouse
26884385Skwq14_mskull length QTL 14, 16 week (mouse)19320000035900000Mouse
1300923Bits4_mbitterness sensitivity 4 (mouse)Not determined19334585237345984Mouse
1301800Faq10_mfluctuating asymmetry QTL 10 (mouse)Not determined19334585237345984Mouse
1300591Pas3_mpulmonary adenoma susceptibility 3 (mouse)Not determined19334585237345984Mouse
1302126Skull26_mskull morphology 26 (mouse)Not determined19334585237345984Mouse
11039522Tbbr4_mTrypanosoma brucei brucei response 4 (mouse)19533596239336106Mouse
1301228Iba4_minduction of brown adipocytes 4 (mouse)Not determined19932831543328421Mouse
1302019Pgia23_mproteoglycan induced arthritis 23 (mouse)Not determined19981005343810202Mouse
14928311Manh85_mmandible shape 85 (mouse)191193738945937389Mouse
10413881Moe2_mmodifier of epilepsy 2 (mouse)191494561648945738Mouse
1301336Alcp23_malcohol preference locus 23 (mouse)Not determined191593520749935319Mouse
1301633Alcp24_malcohol preference locus 24 (mouse)Not determined191593520749935319Mouse
1302004Lfp2_mlong free running period 2 (mouse)Not determined191831776252317981Mouse
1302063Eae19_mexperimental allergic encephalomyelitis 19 (mouse)Not determined191831776252317981Mouse
4142343Moen2_mmodifier of engrailed QTL 2 (mouse)Not determined192025691554257062Mouse
10412251Mnp_mmodifier of Niemann Pick type C1 (mouse)Not determined192025691554257062Mouse
4141659Pbwg20_mpostnatal body weight growth 20 (mouse)Not determined192139025755390480Mouse
1558876W3q14_mweight 3 weeks QTL 14 (mouse)Not determined192233596253923073Mouse
12790634Ebm1_mEpidermolysis Bullosa modifier 1 (mouse)192500000059000000Mouse
1302123Tlsr8_mthymic lymphoma suppressor region 8 (mouse)Not determined192515863842400477Mouse
1301451Ath16_matherosclerosis 16 (mouse)Not determined192543847859438566Mouse
13506250Renmq1_mrenal mercury accumulation QTL 1 (mouse)192739715561397266Mouse
1357568Tgct4_mtesticular germ cell tumor 4 (mouse)Not determined192779458535317981Mouse
4141138Femwf11_mfemur work to failure 11 (mouse)Not determined2815190961431566Mouse
4141562Pas3b_mpulmonary adenoma susceptibility 3b (mouse)Not determined2977296261431566Mouse
1300683Fembm7_mfemoral bone morphometry 7 (mouse)Not determined193015278561431566Mouse
1301410Cd8mts6_mCD8 memory T cell subset 6 (mouse)Not determined193015279261431566Mouse
1301942Pas13_mpulmonary adenoma susceptibility 13 (mouse)Not determined193015279261431566Mouse
1300856Nobq2_mNew Zealand obese QTL 2 (mouse)Not determined193090944161431566Mouse
1301741Lith2_mlithogenic gene 2 (mouse)Not determined193300371961431566Mouse
1301639Stnn_mstriatal neuron number (mouse)Not determined193396351461431566Mouse

miRNA Target Status

Predicted Target Of
Summary Value
Count of predictions:173
Count of miRNA genes:163
Interacting mature miRNAs:164
Transcripts:ENSMUST00000039631
Prediction methods:Miranda, Rnahybrid
Result types:miRGate_prediction

The detailed report is available here: Full Report CSV TAB Printer

miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/).
For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here.


Expression


Sequence


Reference Sequences
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000039631   ⟹   ENSMUSP00000048218
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1934,218,490 - 34,232,990 (-)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1934,241,090 - 34,255,590 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000238147   ⟹   ENSMUSP00000157800
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1934,222,478 - 34,231,630 (-)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1934,245,078 - 34,254,230 (-)Ensembl
RefSeq Acc Id: NM_007392   ⟹   NP_031418
RefSeq Status: REVIEWED
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm391934,217,736 - 34,232,773 (-)NCBI
GRCm381934,240,336 - 34,255,373 (-)NCBI
MGSCv371934,315,581 - 34,329,826 (-)RGD
Celera1935,017,523 - 35,032,513 (-)NCBI
cM Map19 ENTREZGENE
Sequence:
RefSeq Acc Id: XM_006526606   ⟹   XP_006526669
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm391934,222,139 - 34,232,985 (-)NCBI
GRCm381934,244,739 - 34,255,585 (-)NCBI
Sequence:
Reference Sequences
RefSeq Acc Id: NP_031418   ⟸   NM_007392
- UniProtKB: P62737 (UniProtKB/Swiss-Prot)
- Sequence:
RefSeq Acc Id: XP_006526669   ⟸   XM_006526606
- Peptide Label: isoform X1
- Sequence:
RefSeq Acc Id: ENSMUSP00000157800   ⟸   ENSMUST00000238147
RefSeq Acc Id: ENSMUSP00000048218   ⟸   ENSMUST00000039631

Promoters
RGD ID:13679306
Promoter ID:EPDNEW_M23802
Type:multiple initiation site
Name:Acta2_1
Description:Mus musculus actin, alpha 2, smooth muscle, aorta , mRNA.
SO ACC ID:SO:0000170
Source:EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/)
Experiment Methods:Single-end sequencing.
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm381934,255,334 - 34,255,394EPDNEW
RGD ID:6829801
Promoter ID:MM_KWN:26894
Type:Non-CpG
SO ACC ID:SO:0000170
Source:MPROMDB
Tissues & Cell Lines:Lung,   MEF_B4,   MEF_B6
Transcripts:UC008HGF.1
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
MGSCv361934,314,926 - 34,316,267 (-)MPROMDB
RGD ID:6848719
Promoter ID:MM_TRO:5094
Type:Non-CpG
SO ACC ID:SO:0000170
Source:MPROMDB
Tissues & Cell Lines:MEF_B4,   MEF_B6
Transcripts:MTR005676.19.902.4
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
MGSCv361934,322,946 - 34,323,446 (-)MPROMDB
RGD ID:6848716
Promoter ID:MM_TRO:5095
Type:Non-CpG
SO ACC ID:SO:0000170
Source:MPROMDB
Tissues & Cell Lines:3T3L1_Day0,   MEF_B4,   MEF_B6
Transcripts:MTR005676.19.902.3
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
MGSCv361934,326,836 - 34,327,336 (-)MPROMDB
RGD ID:6829767
Promoter ID:MM_KWN:26895
Type:Non-CpG
SO ACC ID:SO:0000170
Source:MPROMDB
Tissues & Cell Lines:3T3L1_Day0,   MEF_B4,   MEF_B6
Transcripts:NM_007392
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
MGSCv361934,329,416 - 34,330,667 (-)MPROMDB

Additional Information

Database Acc Id Source(s)
AGR Gene MGI:87909 AgrOrtholog
Ensembl Genes ENSMUSG00000035783 Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Ensembl Protein ENSMUSP00000048218 ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot
  ENSMUSP00000157800 UniProtKB/TrEMBL
Ensembl Transcript ENSMUST00000039631 ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot
  ENSMUST00000238147 UniProtKB/TrEMBL
InterPro Actin UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Actin/actin-like_CS UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Actin_CS UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  ATPase_NBD UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
KEGG Report mmu:11475 UniProtKB/Swiss-Prot
MGD MGI:87909 ENTREZGENE
NCBI Gene 11475 ENTREZGENE
PANTHER PTHR11937 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Pfam Actin UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
PhenoGen Acta2 PhenoGen
PRINTS ACTIN UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
PROSITE ACTINS_1 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  ACTINS_2 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  ACTINS_ACT_LIKE UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
SMART ACTIN UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Superfamily-SCOP SSF53067 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
UniProt A0A494B9T3_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  ACTA_MOUSE UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE
  Q3U122_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  Q8CF71_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
UniProt Secondary P03996 UniProtKB/Swiss-Prot
  P04108 UniProtKB/Swiss-Prot


Nomenclature History
Date Current Symbol Current Name Previous Symbol Previous Name Description Reference Status
2021-06-29 Acta2  actin alpha 2, smooth muscle, aorta  Acta2  actin, alpha 2, smooth muscle, aorta  Symbol and/or name change 5135510 APPROVED