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Imported Disease Annotations - MGITerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | IgA glomerulonephritis | | ISS | RGD:1557415 | 13592920 | OMIM:161950 more ... | MouseDO | | |
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Imported Disease Annotations - MGITerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | IgA glomerulonephritis | | ISS | RGD:1557415 | 13592920 | OMIM:161950 more ... | MouseDO | | |
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1. | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
2. | RGD automated data pipeline |
3. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
4. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PMID:10754304 | PMID:12393901 | PMID:15568026 | PMID:19593445 | PMID:21236258 | PMID:23844157 | PMID:25087510 | PMID:26646413 |
Tnfsf14 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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TNFSF14 (Homo sapiens - human) |
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Tnfsf14 (Mus musculus - house mouse) |
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Tnfsf14 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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TNFSF14 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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TNFSF14 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Tnfsf14 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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TNFSF14 (Sus scrofa - pig) |
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TNFSF14 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Tnfsf14 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | |||||||||||||
Low | 2 | 1 | 29 | 21 | 19 | 21 | 3 | 10 | |||||
Below cutoff | 1 | 20 | 17 | 13 | 13 | 6 | 7 | 7 | 16 | 21 | 1 | 6 |
RefSeq Transcripts | NM_001191803 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_008766755 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039083146 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | CH474092 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
JACYVU010000204 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
LN874407 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000074247 ⟹ ENSRNOP00000067356 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000107320 ⟹ ENSRNOP00000078327 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001191803 ⟹ NP_001178732 | ||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
Position: |
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Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039083146 ⟹ XP_038939074 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Protein RefSeqs | NP_001178732 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_038939074 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | CTQ86172 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EDL83572 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001178732 ⟸ NM_001191803 |
- UniProtKB: | M0RCN2 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000067356 ⟸ ENSRNOT00000074247 |
RefSeq Acc Id: | XP_038939074 ⟸ XM_039083146 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000078327 ⟸ ENSRNOT00000107320 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-M0RCN2-F1-model_v2 | AlphaFold | M0RCN2 | 1-239 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
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Chromosome | Start Pos | End Pos | Reference Nucleotide | Variant Nucleotide | Variant Type | Strain |
9 | 9761525 | 9761526 | G | A | snv | ACI/EurMcwi (MCW), WKY/NCrl (2019), FHH/EurMcwi (MCW), GH/OmrMcwi (MCW), ACI/EurMcwi (RGD), SHR/NHsd (RGD), SHRSP/Gcrc (RGD), WAG/Rij (RGD), WKY/NCrl (RGD), WKY/Gcrc (RGD), ACI/EurMcwi (2019), ACI/N (2020), F344/DuCrl (2019), F344/N (2020), FHH/EurMcwi (2019), FXLE16/Stm (2020), WAG/RijCrl (2020), WKY/N (2020), WN/N (2020), FHL/EurMcwi (MCW), BBDP/Wor (RGD), F344/NCrl (RGD), FHH/EurMcwi (RGD), FHL/EurMcwi (RGD), MHS/Gib (RGD), WKY/NHsd (RGD), BXH2/CubMcwi (2020), BXH3/CubMcwi (2020), F344/NCrl (2019), F344/Stm (2019), HXB10/IpcvMcwi (2019), HXB20/IpcvMcwi (2020), HXB2/IpcvMcwi (2019), HXB4/IpcvMcwi (2020), LEXF3/Stm (2020), MR/N (2020), MWF/Hsd (2019), PVG/Seac (2019), SHRSP/A3NCrl (2019), SHR/OlalpcvMcwi (2019), COP/CrCrl (MCW & UW) |
Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1588572 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-28484 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000047730 | Ensembl, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000067356 | UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000074247 | UniProtKB/TrEMBL |
Gene3D-CATH | 2.60.120.40 | UniProtKB/TrEMBL |
InterPro | TNF | UniProtKB/TrEMBL |
TNF_a/b/c | UniProtKB/TrEMBL | |
Tumour_necrosis_fac-like_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:301133 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | 301133 | ENTREZGENE |
Pfam | TNF | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Tnfsf14 | PhenoGen |
PRINTS | TNECROSISFCT | UniProtKB/TrEMBL |
PROSITE | TNF_2 | UniProtKB/TrEMBL |
SMART | TNF | UniProtKB/TrEMBL |
Superfamily-SCOP | TNF_like | UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | M0RCN2 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2017-03-21 | Tnfsf14 | TNF superfamily member 14 | Tnfsf14 | tumor necrosis factor superfamily member 14 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2015-11-25 | Tnfsf14 | tumor necrosis factor superfamily member 14 | Tnfsf14 | tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 14 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-03-04 | Tnfsf14 | tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 14 | LOC301133 | similar to Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14 (CD258 antigen) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2006-11-19 | LOC301133 | similar to Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14 (CD258 antigen) | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |