![]()
Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Chemical and Drug Induced Liver Injury | | ISO | RGD:1604569 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25226513 | |
|
![]()
Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Chemical and Drug Induced Liver Injury | | ISO | RGD:1604569 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:25226513 | |
|
|
|
# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
Tmem164 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TMEM164 (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tmem164 (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tmem164 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TMEM164 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TMEM164 (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tmem164 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TMEM164 (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TMEM164 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tmem164 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
|
DXGot161 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RH129607 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RH144390 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BE113681 |
|
The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 3 | 35 | 28 | 12 | 19 | 12 | 74 | 34 | 37 | 11 | |||
Low | 8 | 29 | 29 | 29 | 8 | 11 | 1 | 4 | 8 | ||||
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_001109014 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_008773426 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_008773427 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_008773428 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017602119 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039099936 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039099937 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039099938 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039099940 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039099941 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | BC079345 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
BC093400 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
CH474047 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000448 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000068431 ⟹ ENSRNOP00000062249 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000108646 ⟹ ENSRNOP00000084573 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001109014 ⟹ NP_001102484 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_008773426 ⟹ XP_008771648 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_008773428 ⟹ XP_008771650 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039099936 ⟹ XP_038955864 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039099937 ⟹ XP_038955865 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039099938 ⟹ XP_038955866 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039099940 ⟹ XP_038955868 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_039099941 ⟹ XP_038955869 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
Protein RefSeqs | NP_001102484 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_008771648 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_008771650 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038955864 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038955865 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038955866 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038955868 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038955869 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | EDL85202 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EDL85203 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
EDL85204 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001102484 ⟸ NM_001109014 |
- UniProtKB: | D3ZFX1 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_008771650 ⟸ XM_008773428 |
- Peptide Label: | isoform X5 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_008771648 ⟸ XM_008773426 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- UniProtKB: | D3ZFX1 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000062249 ⟸ ENSRNOT00000068431 |
RefSeq Acc Id: | XP_038955869 ⟸ XM_039099941 |
- Peptide Label: | isoform X5 |
RefSeq Acc Id: | XP_038955868 ⟸ XM_039099940 |
- Peptide Label: | isoform X5 |
RefSeq Acc Id: | XP_038955864 ⟸ XM_039099936 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
RefSeq Acc Id: | XP_038955865 ⟸ XM_039099937 |
- Peptide Label: | isoform X3 |
RefSeq Acc Id: | XP_038955866 ⟸ XM_039099938 |
- Peptide Label: | isoform X4 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000084573 ⟸ ENSRNOT00000108646 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-D3ZFX1-F1-model_v2 | AlphaFold | D3ZFX1 | 1-296 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13701964 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R12488 | ||||||||
Type: | single initiation site | ||||||||
Name: | Tmem164_1 | ||||||||
Description: | transmembrane protein 164 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
|
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1563286 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-1511 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000012787 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000062249 | ENTREZGENE |
ENSRNOP00000062249.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOP00000084573.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000068431 | ENTREZGENE |
ENSRNOT00000068431.3 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOT00000108646.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
InterPro | TMEM164 | UniProtKB/TrEMBL |
KEGG Report | rno:367763 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | 367763 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR20948 | UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | TMEM164 | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Tmem164 | PhenoGen |
UniProt | A0A8I6A1M0_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
D3ZFX1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2008-03-06 | Tmem164 | transmembrane protein 164 | RGD1563286_predicted | similar to Expressed sequence AW547186 (predicted) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2006-03-07 | RGD1563286_predicted | similar to Expressed sequence AW547186 (predicted) | LOC367763 | similar to Expressed sequence AW547186 | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
2006-02-09 | LOC367763 | similar to Expressed sequence AW547186 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |