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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Renal Hypodysplasia/Aplasia 3 | | ISO | RGD:1351643 | 7240710 | | OMIM | | |
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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Renal Hypodysplasia/Aplasia 3 | | ISO | RGD:1351643 | 7240710 | | OMIM | | |
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1. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
3. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
Greb1l (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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GREB1L (Homo sapiens - human) |
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Greb1l (Mus musculus - house mouse) |
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Greb1l (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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GREB1L (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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GREB1L (Canis lupus familiaris - dog) |
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Greb1l (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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GREB1L (Sus scrofa - pig) |
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GREB1L (Chlorocebus sabaeus - African green monkey) |
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Greb1l (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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RH131132 |
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RH131955 |
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AU047007 |
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RH138057 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 2 | 3 | 2 | 2 | 8 | 9 | |||||||
Low | 34 | 53 | 38 | 19 | 38 | 8 | 8 | 66 | 35 | 32 | 11 | 8 | |
Below cutoff | 3 | 6 | 1 | 1 | 1 | 3 |
RefSeq Transcripts | XM_017587815 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_017587816 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017587817 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017587818 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_017601152 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097265 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097266 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097267 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097268 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097269 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097270 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039097272 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | JACYVU010000298 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000033468 ⟹ ENSRNOP00000029000 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
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RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017587816 ⟹ XP_017443305 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017587817 ⟹ XP_017443306 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_017587818 ⟹ XP_017443307 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
||||||||
Sequence: |
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RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Sequence: |
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
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Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
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Position: |
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RefSeq Status: | |||||||||
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Position: |
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Position: |
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RefSeq Acc Id: | XM_039097272 ⟹ XP_038953200 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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Protein RefSeqs | XP_038953193 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_038953194 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038953195 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
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XP_038953198 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038953200 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | XP_017443307 ⟸ XM_017587818 |
- Peptide Label: | isoform X4 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017443304 ⟸ XM_017587815 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
- Sequence: |
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- Peptide Label: | isoform X3 |
- Sequence: |
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- Peptide Label: | isoform X2 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_017456641 ⟸ XM_017601152 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000029000 ⟸ ENSRNOT00000033468 |
RefSeq Acc Id: | XP_038953195 ⟸ XM_039097267 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
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- Peptide Label: | isoform X1 |
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- Peptide Label: | isoform X1 |
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- Peptide Label: | isoform X1 |
RefSeq Acc Id: | XP_038953194 ⟸ XM_039097266 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1562371 | AgrOrtholog |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000023492 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000029000 | UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000033468 | UniProtKB/TrEMBL |
InterPro | GREB1 | UniProtKB/TrEMBL |
GREB1-like | UniProtKB/TrEMBL | |
NCBI Gene | 498819 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR15720 | UniProtKB/TrEMBL |
PTHR15720:SF12 | UniProtKB/TrEMBL | |
Pfam | GREB1 | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Greb1l | PhenoGen |
UniProt | F1LTR0_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2018-04-04 | Greb1l | GREB1 like retinoic acid receptor coactivator | Greb1l | growth regulation by estrogen in breast cancer 1 like | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2016-06-22 | Greb1l | growth regulation by estrogen in breast cancer 1 like | Greb1l | growth regulation by estrogen in breast cancer-like | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2010-05-25 | Greb1l | growth regulation by estrogen in breast cancer-like | RGD1562371 | similar to GREB1 protein isoform a | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-04-30 | RGD1562371 | similar to GREB1 protein isoform a | RGD1562371_predicted | similar to GREB1 protein isoform a (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
2006-03-07 | RGD1562371_predicted | similar to GREB1 protein isoform a (predicted) | LOC498819 | similar to GREB1 protein isoform a | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
2006-02-09 | LOC498819 | similar to GREB1 protein isoform a | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |