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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | X-linked intellectual developmental disorder 108 | | ISO | RGD:1350922 | 7240710 | | OMIM | | |
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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | X-linked intellectual developmental disorder 108 | | ISO | RGD:1350922 | 7240710 | | OMIM | | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
3. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
4. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
Slc9a7 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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SLC9A7 (Homo sapiens - human) |
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Slc9a7 (Mus musculus - house mouse) |
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Slc9a7 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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SLC9A7 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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SLC9A7 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Slc9a7 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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SLC9A7 (Sus scrofa - pig) |
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SLC9A7 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Slc9a7 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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PMC152551P1 |
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PMC275467P1 |
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PMC150974P1 |
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RH138299 |
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Actb |
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PMC85795P4 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 3 | 14 | 50 | ||||||||||
Low | 2 | 24 | 32 | 19 | 5 | 19 | 8 | 11 | 24 | 32 | 35 | 11 | 8 |
Below cutoff | 1 | 18 | 22 | 22 | 22 | 3 | 5 |
RefSeq Transcripts | NM_001108242 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
NM_001401002 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_006256636 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_006256637 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | CH474009 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
JACYVU010000337 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000005623 ⟹ ENSRNOP00000005623 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001108242 ⟹ NP_001101712 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_006256636 ⟹ XP_006256698 | ||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_006256637 ⟹ XP_006256699 | ||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||
Sequence: |
Protein RefSeqs | NP_001101712 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
NP_001387931 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_006256698 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_006256699 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | EDL97690 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001101712 ⟸ NM_001108242 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_006256698 ⟸ XM_006256636 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_006256699 ⟸ XM_006256637 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000005623 ⟸ ENSRNOT00000005623 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-D3ZCI2-F1-model_v2 | AlphaFold | D3ZCI2 | 1-359 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13701700 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R12224 | ||||||||
Type: | single initiation site | ||||||||
Name: | Slc9a7_1 | ||||||||
Description: | solute carrier family 9 member A7 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1561385 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-3172 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000004150 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000005623 | ENTREZGENE |
ENSRNOP00000005623.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000005623 | ENTREZGENE |
ENSRNOT00000005623.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
InterPro | Cation/H_exchanger | UniProtKB/TrEMBL |
Cation/H_exchanger_cons-reg | UniProtKB/TrEMBL | |
NaH_exchanger | UniProtKB/TrEMBL | |
NHE-6/7/9 | UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:317170 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | 317170 | ENTREZGENE |
PANTHER | Cation/H_exchanger_cons-reg | UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | Na_H_Exchanger | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Slc9a7 | PhenoGen |
PRINTS | NAHEXCHNGR | UniProtKB/TrEMBL |
NAHEXCHNGR6 | UniProtKB/TrEMBL | |
TIGRFAMs | b_cpa1 | UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | D3ZCI2_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2016-03-01 | Slc9a7 | solute carrier family 9 member A7 | Slc9a7 | solute carrier family 9, subfamily A (NHE7, cation proton antiporter 7), member 7 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2013-08-02 | Slc9a7 | solute carrier family 9, subfamily A (NHE7, cation proton antiporter 7), member 7 | Slc9a7 | solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 7 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-05-02 | Slc9a7 | solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 7 | Slc9a7 | solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), isoform 7 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-03-07 | Slc9a7 | solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), isoform 7 | Slc9a7_predicted | solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 7 (predicted) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2006-03-30 | Slc9a7_predicted | solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 7 (predicted) | solute carrier family 9, member 7 (predicted) | Name updated | 1299863 | APPROVED | |
2006-03-07 | Slc9a7_predicted | solute carrier family 9, member 7 (predicted) | Slc9a7 | solute carrier family 9, member 7 | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
2006-02-09 | Slc9a7 | solute carrier family 9, member 7 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |