Sox2 (SRY (sex determining region Y)-box 2) - Rat Genome Database

Send us a Message



 Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap)  (beta) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer) Overgo Probe Designer
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease COVID-19 Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes GERRC (Gene Editing Rat Resource Center) Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Poster Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
Gene: Sox2 (SRY (sex determining region Y)-box 2) Mus musculus
Analyze
Symbol: Sox2
Name: SRY (sex determining region Y)-box 2
RGD ID: 1558014
MGI Page MGI
Description: Enables DNA binding activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; and RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding activity. Involved in several processes, including negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; neuronal stem cell population maintenance; and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Acts upstream of or within several processes, including forebrain development; respiratory system development; and sensory organ morphogenesis. Located in cytoplasm and nucleus. Part of chromatin and transcription regulator complex. Is expressed in several structures, including alimentary system; central nervous system; early conceptus; genitourinary system; and sensory organ. Human ortholog(s) of this gene implicated in breast cancer; nasal cavity cancer; and syndromic microphthalmia 3. Orthologous to human SOX2 (SRY-box transcription factor 2).
Type: protein-coding
RefSeq Status: REVIEWED
Previously known as: lc; lcc; Sox; Sox-2; SRY-box containing gene 2; transcription factor SOX-2; ys; ysb
RGD Orthologs
Human
Rat
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Genes
More Info more info ...
Latest Assembly: GRCm39 - Mouse Genome Assembly GRCm39
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm39334,704,144 - 34,706,610 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl334,704,554 - 34,706,610 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm38334,649,995 - 34,652,461 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl334,650,405 - 34,652,461 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv37334,548,927 - 34,551,383 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv36334,841,604 - 34,844,008 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera334,551,711 - 34,554,169 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map3A3NCBI
cM Map316.93NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Gene-Chemical Interaction Annotations     Click to see Annotation Detail View
(20S)-ginsenoside Rg3  (ISO)
(R)-pantothenic acid  (ISO)
(S)-naringenin  (ISO)
1,2-dichloroethane  (EXP)
17alpha-ethynylestradiol  (ISO)
17beta-estradiol  (ISO)
17beta-estradiol 3-benzoate  (ISO)
2,2',4,4'-Tetrabromodiphenyl ether  (EXP,ISO)
2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine  (EXP,ISO)
2-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-\{[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl](methyl)amino\}-2-(propan-2-yl)pentanenitrile  (ISO)
3-isobutyl-1-methyl-7H-xanthine  (ISO)
3-methyladenine  (EXP)
4,4'-sulfonyldiphenol  (ISO)
5-aza-2'-deoxycytidine  (EXP)
5-azacytidine  (ISO)
5-fluorouracil  (EXP)
acrylamide  (ISO)
aflatoxin B1  (ISO)
aflatoxin M1  (ISO)
aldehydo-D-glucose  (ISO)
all-trans-retinoic acid  (EXP,ISO)
anthra[1,9-cd]pyrazol-6(2H)-one  (ISO)
antirheumatic drug  (ISO)
apigenin  (ISO)
Aroclor 1254  (ISO)
arotinoid acid  (ISO)
arsane  (EXP,ISO)
arsenic atom  (EXP,ISO)
arsenite(3-)  (ISO)
arsenous acid  (ISO)
aspartame  (ISO)
benzo[a]pyrene  (EXP,ISO)
bis(2-ethylhexyl) phthalate  (ISO)
bisphenol A  (EXP,ISO)
bromochloroacetic acid  (EXP)
buta-1,3-diene  (EXP)
butanal  (ISO)
cadmium dichloride  (EXP)
cadmium sulfate  (EXP)
carbofuran  (ISO)
carbon atom  (ISO)
carbon nanotube  (EXP)
carboplatin  (ISO)
carvedilol  (EXP,ISO)
celecoxib  (ISO)
CGP 52608  (ISO)
CHIR 99021  (ISO)
chlordecone  (EXP)
chloroprene  (EXP)
chlorpromazine  (ISO)
chromium(6+)  (EXP)
chrysene  (EXP)
ciprofloxacin  (ISO)
cisplatin  (ISO)
Citreoviridin  (EXP)
cobalt atom  (ISO)
cobalt dichloride  (ISO)
colforsin daropate hydrochloride  (ISO)
cortisol  (ISO)
crystal violet  (ISO)
Cuprizon  (ISO)
curcumin  (EXP)
D-glucose  (ISO)
decabromodiphenyl ether  (ISO)
deoxycholic acid  (EXP)
dexamethasone  (EXP,ISO)
diarsenic trioxide  (ISO)
diethylstilbestrol  (ISO)
dioxygen  (ISO)
dorsomorphin  (ISO)
eckol  (ISO)
elemental carbon  (ISO)
ethanol  (ISO)
etodolac  (ISO)
etoposide  (ISO)
fluoxetine  (EXP)
flurbiprofen  (EXP)
folic acid  (EXP)
fonofos  (ISO)
formaldehyde  (ISO)
gemcitabine  (ISO)
genistein  (ISO)
glucose  (ISO)
glycerol 2-phosphate  (EXP)
GS-441524  (EXP)
hexachlorophene  (EXP)
hydroquinone  (ISO)
Indeno[1,2,3-cd]pyrene  (ISO)
isoorientin  (ISO)
ivermectin  (ISO)
kaempferol  (ISO)
L-ascorbic acid  (EXP,ISO)
L-ascorbic acid 2-phosphate  (ISO)
lapatinib  (ISO)
lead diacetate  (EXP)
lupeol  (EXP)
LY294002  (EXP)
mercury dibromide  (ISO)
methylmercury chloride  (ISO)
methylparaben  (ISO)
miconazole  (EXP)
naphthalene  (EXP)
nickel dichloride  (ISO)
Nonylphenol  (EXP)
ochratoxin A  (ISO)
ozone  (EXP)
p-chloromercuribenzoic acid  (ISO)
paclitaxel  (ISO)
panobinostat  (ISO)
paracetamol  (ISO)
paraquat  (EXP)
parathion  (ISO)
perfluorooctane-1-sulfonic acid  (EXP)
phenylephrine  (ISO)
phenylmercury acetate  (ISO)
poly(I:C)  (ISO)
prostaglandin E2  (ISO)
quercetin  (ISO)
remdesivir  (EXP)
resveratrol  (ISO)
SB 431542  (ISO)
serpentine asbestos  (ISO)
silicon dioxide  (ISO)
silver atom  (EXP,ISO)
silver(0)  (EXP,ISO)
sirolimus  (EXP)
sodium arsenate  (ISO)
sodium arsenite  (EXP,ISO)
sterigmatocystin  (ISO)
Tanshinone I  (EXP,ISO)
taurocholic acid  (EXP)
temozolomide  (ISO)
terbufos  (ISO)
Tetrachlorobisphenol A  (ISO)
titanium dioxide  (EXP,ISO)
trichloroethene  (ISO)
trichostatin A  (ISO)
triclosan  (EXP)
triphenyl phosphate  (EXP)
Triptolide  (ISO)
Tungsten carbide  (ISO)
urethane  (ISO)
valproic acid  (ISO)
vanadyl sulfate  (ISO)
verapamil  (ISO)
vinclozolin  (ISO)
vorinostat  (ISO)
XAV939  (ISO)
zoledronic acid  (ISO)

Gene Ontology Annotations     Click to see Annotation Detail View

Biological Process
adenohypophysis development  (IMP,ISO)
anatomical structure formation involved in morphogenesis  (IMP)
anatomical structure morphogenesis  (IBA)
cell differentiation  (IBA)
cell fate commitment  (IDA)
cell fate specification  (IMP)
cellular response to cadmium ion  (IDA)
cerebral cortex development  (IMP)
detection of mechanical stimulus involved in equilibrioception  (IMP)
detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound  (IMP)
diencephalon morphogenesis  (IMP)
embryonic organ development  (IMP)
endodermal cell fate specification  (ISO)
epithelial tube branching involved in lung morphogenesis  (IDA)
eye development  (ISO)
forebrain development  (ISO)
forebrain neuron differentiation  (IMP)
gene expression  (IMP)
inner ear development  (ISO)
inner ear morphogenesis  (IMP)
lens induction in camera-type eye  (IGI)
lung alveolus development  (IDA)
male genitalia development  (IMP)
negative regulation of canonical Wnt signaling pathway  (IDA,ISO)
negative regulation of cell cycle G1/S phase transition  (ISO)
negative regulation of cell differentiation  (IMP)
negative regulation of epithelial cell proliferation  (ISO)
negative regulation of neuron differentiation  (IDA)
negative regulation of osteoblast differentiation  (IDA)
negative regulation of transcription by RNA polymerase II  (IGI)
negative regulation of Wnt signaling pathway  (IGI)
neuroblast proliferation  (IMP)
neuron differentiation  (IDA,IMP)
neuron fate commitment  (IMP)
neuronal stem cell population maintenance  (IGI)
Notch signaling pathway  (IDA)
olfactory placode formation  (IGI)
osteoblast differentiation  (IDA,ISO)
pigment biosynthetic process  (IMP)
pituitary gland development  (ISO)
positive regulation of cell differentiation  (ISO)
positive regulation of cell-cell adhesion  (ISO)
positive regulation of DNA-templated transcription  (ISO)
positive regulation of epithelial cell differentiation  (IDA)
positive regulation of MAPK cascade  (ISO)
positive regulation of neuroblast proliferation  (IMP)
positive regulation of neuron differentiation  (IMP)
positive regulation of Notch signaling pathway  (IDA)
positive regulation of transcription by RNA polymerase II  (IDA,IGI,IMP,ISO)
regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process  (ISO)
regulation of DNA-templated transcription  (IBA,IDA,ISO)
regulation of gene expression  (ISO)
regulation of myofibroblast cell apoptotic process  (ISO)
regulation of neurogenesis  (IGI)
regulation of transcription by RNA polymerase II  (IDA)
response to growth factor  (ISO)
response to organic substance  (IDA)
response to oxygen-glucose deprivation  (ISO)
response to retinoic acid  (IDA)
response to wounding  (ISO)
retina morphogenesis in camera-type eye  (IMP)
sensory perception of sound  (IMP)
somatic stem cell population maintenance  (IMP,ISO)
stem cell differentiation  (IDA)
stem cell population maintenance  (IMP)
tissue regeneration  (ISO)
tongue development  (IMP)
trophectodermal cell differentiation  (IMP)
Wnt signaling pathway  (IGI)

Cellular Component
chromatin  (IDA)
cytoplasm  (IDA,ISO)
cytosol  (ISO)
nucleoplasm  (ISO,TAS)
nucleus  (IC,IDA,ISO)
transcription regulator complex  (IDA)

Phenotype Annotations     Click to see Annotation Detail View

Mammalian Phenotype
abnormal adenohypophysis development  (IAGP)
abnormal adenohypophysis morphology  (IAGP)
abnormal auchene hair morphology  (IAGP)
abnormal autophagy  (IAGP)
abnormal awl hair morphology  (IAGP)
abnormal brain morphology  (IAGP)
abnormal bronchiole epithelium morphology  (IAGP)
abnormal cerebral cortex morphology  (IAGP)
abnormal cochlear hair cell morphology  (IAGP)
abnormal corpus callosum morphology  (IAGP)
abnormal dentate gyrus morphology  (IAGP)
abnormal digestive system physiology  (IAGP)
abnormal distortion product otoacoustic emission  (IAGP)
abnormal Ebner's gland morphology  (IAGP)
abnormal ectoderm development  (IAGP)
abnormal ependyma morphology  (IAGP)
abnormal epiglottis morphology  (IAGP)
abnormal esophageal squamous epithelium morphology  (IAGP)
abnormal esophagus morphology  (IAGP)
abnormal eye development  (IAGP)
abnormal eye size  (IAGP)
abnormal fungiform papillae morphology  (IAGP)
abnormal guard hair morphology  (IAGP)
abnormal hair growth  (IAGP)
abnormal hippocampus development  (IAGP)
abnormal inner ear morphology  (IAGP)
abnormal lens epithelium morphology  (IAGP)
abnormal lens induction  (IAGP)
abnormal lens morphology  (IAGP)
abnormal lung epithelium morphology  (IAGP)
abnormal nervous system morphology  (IAGP)
abnormal nervous system physiology  (IAGP)
abnormal neural tube morphology  (IAGP)
abnormal neuron differentiation  (IAGP)
abnormal neuronal precursor proliferation  (IAGP)
abnormal olfactory cortex morphology  (IAGP)
abnormal optic disk morphology  (IEA)
abnormal palate morphology  (IAGP)
abnormal pillar cell morphology  (IAGP)
abnormal pinna reflex  (IAGP)
abnormal pituitary diverticulum morphology  (IAGP)
abnormal pituitary gland morphology  (IAGP)
abnormal placing response  (IAGP)
abnormal radial glial cell morphology  (IAGP)
abnormal respiratory mucosa goblet cell morphology  (IAGP)
abnormal retina blood vessel morphology  (IEA)
abnormal retina morphology  (IAGP)
abnormal retina progenitor cell morphology  (IAGP)
abnormal salivary gland morphology  (IAGP)
abnormal semicircular canal morphology  (IAGP)
abnormal seminiferous tubule morphology  (IAGP)
abnormal sensory capabilities/reflexes/nociception  (IAGP)
abnormal stomach morphology  (IAGP)
abnormal sulcus ampullaris morphology  (IAGP)
abnormal survival  (IAGP)
abnormal thalamus morphology  (IAGP)
abnormal tongue morphology  (IAGP)
abnormal vestibular saccule morphology  (IAGP)
abnormal zigzag hair morphology  (IAGP)
absent anterior lingual gland  (IAGP)
absent club cells  (IAGP)
absent cochlear hair cells  (IAGP)
absent cochlear nerve compound action potential  (IAGP)
absent dentate gyrus  (IAGP)
absent ectoplacental cone  (IAGP)
absent egg cylinders  (IAGP)
absent embryonic epiblast  (IAGP)
absent nasal placodes  (IAGP)
absent palatine gland  (IAGP)
absent respiratory motile cilia  (IAGP)
absent respiratory mucosa goblet cells  (IAGP)
absent vestibular hair cells  (IAGP)
anophthalmia  (IAGP)
bidirectional circling  (IAGP)
bifurcated Rathke's pouch  (IAGP)
circling  (IAGP)
cleft secondary palate  (IAGP)
deafness  (IAGP)
decreased adrenocorticotropin level  (IAGP)
decreased body size  (IAGP)
decreased cochlear coiling  (IAGP)
decreased cochlear nerve compound action potential  (IAGP)
decreased corpus callosum size  (IAGP)
decreased growth hormone level  (IAGP)
decreased luteinizing hormone level  (IAGP)
decreased male germ cell number  (IAGP)
decreased osteosarcoma incidence  (IAGP)
decreased prolactin level  (IAGP)
decreased somatotroph cell number  (IAGP)
decreased thyroid-stimulating hormone level  (IAGP)
delayed palatal shelf elevation  (IAGP)
dilated cochlea  (IAGP)
diluted coat color  (IAGP)
disorganized retina layers  (IAGP)
dystonia  (IAGP)
edema  (IAGP)
embryonic growth retardation  (IEA)
embryonic lethality between implantation and placentation, complete penetrance  (IAGP)
embryonic lethality between implantation and somite formation, complete penetrance  (IAGP)
embryonic lethality prior to organogenesis  (IEA)
enhanced contextual conditioning behavior  (IEA)
enlarged lateral ventricles  (IAGP)
enlarged third ventricle  (IAGP)
esophageal atresia  (IAGP)
failure of palatal shelf elevation  (IAGP)
gastrointestinal ulcer  (IAGP)
head bobbing  (IAGP)
head tossing  (IAGP)
impaired hearing  (IAGP)
impaired righting response  (IAGP)
impaired swimming  (IAGP)
increased lens epithelium apoptosis  (IAGP)
increased or absent threshold for auditory brainstem response  (IAGP)
increased pituitary gland tumor incidence  (IAGP)
increased trophoblast giant cell number  (IAGP)
irregularly shaped pupil  (IEA)
loss of hippocampal neurons  (IAGP)
microphthalmia  (IAGP)
motor neuron degeneration  (IAGP)
neonatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
no abnormal phenotype detected  (IAGP)
nonconvulsive seizures  (IAGP)
oligozoospermia  (IAGP)
optic nerve hypoplasia  (IAGP)
palatal shelves fail to meet at midline  (IAGP)
postnatal lethality  (IAGP)
postnatal lethality, incomplete penetrance  (IAGP)
premature death  (IAGP)
prenatal lethality, incomplete penetrance  (IAGP)
preweaning lethality, complete penetrance  (IEA)
reduced male fertility  (IAGP)
respiratory distress  (IAGP)
retina hyperplasia  (IAGP)
retina hypoplasia  (IAGP)
seizures  (IAGP)
small adenohypophysis  (IAGP)
small hippocampus  (IAGP)
small testis  (IAGP)
small utricle  (IAGP)
small vestibular saccule  (IAGP)
stomach inflammation  (IAGP)
tongue inflammation  (IAGP)
tracheoesophageal fistula  (IAGP)
yellow coat color  (IAGP)
References

References - curated
# Reference Title Reference Citation
1. The detrimental effects of diabetes on pluripotency determined by KLF4, SOX2, C-MYC and OCT4 immunoreactivity in rat testes. Aktug H, etal., Adv Clin Exp Med. 2013 May-Jun;22(3):327-35.
2. Immunohistochemical expression of SOX2 in vulvar intraepithelial neoplasia and squamous cell carcinoma. Brustmann H and Brunner A, Int J Gynecol Pathol. 2013 May;32(3):323-8. doi: 10.1097/PGP.0b013e31825d820e.
3. Sox2 nuclear expression is closely associated with poor prognosis in patients with histologically node-negative oral tongue squamous cell carcinoma. Du L, etal., Oral Oncol. 2011 Aug;47(8):709-13. doi: 10.1016/j.oraloncology.2011.05.017.
4. Mutations in SOX2 cause anophthalmia. Fantes J, etal., Nat Genet. 2003 Apr;33(4):461-3. Epub 2003 Mar 3.
5. Increased SOX2 expression in less differentiated breast carcinomas and their lymph node metastases. Huang YH, etal., Histopathology. 2014 Mar;64(4):494-503. doi: 10.1111/his.12257. Epub 2013 Nov 28.
6. Prognostic impact of the expression of ALDH1 and SOX2 in urothelial cancer of the upper urinary tract. Kitamura H, etal., Mod Pathol. 2013 Jan;26(1):117-24. doi: 10.1038/modpathol.2012.139. Epub 2012 Aug 17.
7. SOX2 and nestin expression in human melanoma: an immunohistochemical and experimental study. Laga AC, etal., Exp Dermatol. 2011 Apr;20(4):339-45. doi: 10.1111/j.1600-0625.2011.01247.x.
8. SOX2 expression is upregulated in adult spinal cord after contusion injury in both oligodendrocyte lineage and ependymal cells. Lee HJ, etal., J Neurosci Res. 2013 Feb;91(2):196-210. doi: 10.1002/jnr.23151. Epub 2012 Nov 21.
9. Sox2 expression in breast tumours and activation in breast cancer stem cells. Leis O, etal., Oncogene. 2012 Mar 15;31(11):1354-65. doi: 10.1038/onc.2011.338. Epub 2011 Aug 8.
10. Identification of key genes and pathways associated with cholangiocarcinoma development based on weighted gene correlation network analysis. Liu J, etal., PeerJ. 2019 Oct 31;7:e7968. doi: 10.7717/peerj.7968. eCollection 2019.
11. MGDs mouse GO annotations MGD data from the GO Consortium
12. MGD IEA MGD IEA
13. Novel SOX2 partner-factor domain mutation in a four-generation family. Mihelec M, etal., Eur J Hum Genet. 2009 Nov;17(11):1417-22. doi: 10.1038/ejhg.2009.79. Epub 2009 May 27.
14. OMIM Disease Annotation Pipeline OMIM Disease Annotation Pipeline
15. Mouse MP Annotation Import Pipeline RGD automated import pipeline
16. ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
17. Data Import for Chemical-Gene Interactions RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions
18. Novel SOX2 mutations and genotype-phenotype correlation in anophthalmia and microphthalmia. Schneider A, etal., Am J Med Genet A. 2009 Dec;149A(12):2706-15. doi: 10.1002/ajmg.a.33098.
19. Sex determining region Y-box 2 (SOX2) amplification is an independent indicator of disease recurrence in sinonasal cancer. Schrock A, etal., PLoS One. 2013;8(3):e59201. doi: 10.1371/journal.pone.0059201. Epub 2013 Mar 27.
20. Targeted silencing of the oncogenic transcription factor SOX2 in breast cancer. Stolzenburg S, etal., Nucleic Acids Res. 2012 Aug;40(14):6725-40. Epub 2012 May 4.
21. SOX2 autoantibodies as noninvasive serum biomarker for breast carcinoma. Sun Y, etal., Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2012 Nov;21(11):2043-7. doi: 10.1158/1055-9965.EPI-12-0498. Epub 2012 Jul 25.
22. Long Non-Coding RNA SOX2 Overlapping Transcript Aggravates H9c2 Cell Injury via the miR-215-5p/ZEB2 Axis and Promotes Ischemic Heart Failure in a Rat Model. Tu J, etal., Tohoku J Exp Med. 2021 Jul;254(3):221-231. doi: 10.1620/tjem.254.221.
Additional References at PubMed
PMID:522864   PMID:2137249   PMID:2374589   PMID:7543410   PMID:7590241   PMID:7628452   PMID:7821514   PMID:7924997   PMID:8244390   PMID:8441686   PMID:8625802   PMID:8889548  
PMID:8921394   PMID:8951082   PMID:9000753   PMID:9108377   PMID:9161426   PMID:9512512   PMID:9609835   PMID:9649510   PMID:9669521   PMID:9750190   PMID:9814708   PMID:9851841  
PMID:9851853   PMID:9851982   PMID:10037800   PMID:10049573   PMID:10349636   PMID:10446282   PMID:10512182   PMID:10603348   PMID:10767561   PMID:10804179   PMID:10925158   PMID:11042159  
PMID:11069887   PMID:11071752   PMID:11076764   PMID:11076861   PMID:11217851   PMID:11404013   PMID:11544199   PMID:11566864   PMID:11714669   PMID:12036291   PMID:12167158   PMID:12381664  
PMID:12446761   PMID:12466851   PMID:12471260   PMID:12477932   PMID:12514105   PMID:12522767   PMID:12584449   PMID:12642482   PMID:12665572   PMID:12732652   PMID:12756228   PMID:12798291  
PMID:12815626   PMID:12923055   PMID:14651936   PMID:14660441   PMID:14681479   PMID:15039943   PMID:15057272   PMID:15082719   PMID:15084457   PMID:15113840   PMID:15121842   PMID:15139292  
PMID:15219627   PMID:15226823   PMID:15240551   PMID:15262984   PMID:15452066   PMID:15456859   PMID:15557334   PMID:15580630   PMID:15618518   PMID:15652703   PMID:15695336   PMID:15711057  
PMID:15716345   PMID:15781477   PMID:15846349   PMID:15857914   PMID:15860457   PMID:15863505   PMID:15882093   PMID:15893981   PMID:15988017   PMID:16026334   PMID:16102745   PMID:16141072  
PMID:16141073   PMID:16166252   PMID:16168404   PMID:16267092   PMID:16284245   PMID:16306355   PMID:16410412   PMID:16410827   PMID:16432183   PMID:16481355   PMID:16539717   PMID:16543359  
PMID:16547000   PMID:16598713   PMID:16631155   PMID:16632597   PMID:16651659   PMID:16714766   PMID:16767105   PMID:16857183   PMID:16919269   PMID:16932809   PMID:16954384   PMID:17015430  
PMID:17060609   PMID:17066077   PMID:17097055   PMID:17107998   PMID:17140559   PMID:17189626   PMID:17196193   PMID:17198697   PMID:17267691   PMID:17309606   PMID:17409236   PMID:17428831  
PMID:17470285   PMID:17507372   PMID:17507402   PMID:17515932   PMID:17522155   PMID:17533120   PMID:17535249   PMID:17604700   PMID:17610371   PMID:17687036   PMID:17699610   PMID:17728342  
PMID:17729296   PMID:17825048   PMID:17855428   PMID:17875931   PMID:17880938   PMID:17883393   PMID:17916349   PMID:17948866   PMID:18083014   PMID:18157569   PMID:18171687   PMID:18199879  
PMID:18238855   PMID:18282814   PMID:18287078   PMID:18287559   PMID:18287938   PMID:18291358   PMID:18304314   PMID:18332127   PMID:18349072   PMID:18351630   PMID:18366076   PMID:18367557  
PMID:18371380   PMID:18371391   PMID:18374910   PMID:18379823   PMID:18400104   PMID:18404215   PMID:18424556   PMID:18447642   PMID:18448678   PMID:18454139   PMID:18462697   PMID:18480279  
PMID:18489003   PMID:18493325   PMID:18522499   PMID:18522731   PMID:18522874   PMID:18524893   PMID:18524904   PMID:18539113   PMID:18559478   PMID:18562289   PMID:18577384   PMID:18588871  
PMID:18590718   PMID:18626943   PMID:18632939   PMID:18635867   PMID:18638478   PMID:18678597   PMID:18701545   PMID:18719084   PMID:18728187   PMID:18755297   PMID:18775421   PMID:18778700  
PMID:18794329   PMID:18794345   PMID:18802003   PMID:18806776   PMID:18816825   PMID:18820178   PMID:18826945   PMID:18832072   PMID:18832390   PMID:18927476   PMID:18997111   PMID:19011097  
PMID:19022741   PMID:19027001   PMID:19038788   PMID:19056886   PMID:19066578   PMID:19088086   PMID:19093031   PMID:19097117   PMID:19097184   PMID:19136965   PMID:19139101   PMID:19147497  
PMID:19168680   PMID:19191219   PMID:19217427   PMID:19297409   PMID:19300477   PMID:19303846   PMID:19321785   PMID:19328208   PMID:19334279   PMID:19349578   PMID:19357274   PMID:19369396  
PMID:19389353   PMID:19403656   PMID:19412431   PMID:19412548   PMID:19416500   PMID:19427409   PMID:19439492   PMID:19474151   PMID:19490090   PMID:19502490   PMID:19524524   PMID:19531481  
PMID:19536159   PMID:19542359   PMID:19544422   PMID:19570848   PMID:19591226   PMID:19596317   PMID:19605494   PMID:19618463   PMID:19633665   PMID:19666823   PMID:19666824   PMID:19701198  
PMID:19705445   PMID:19723505   PMID:19723802   PMID:19733164   PMID:19734891   PMID:19740739   PMID:19741146   PMID:19748502   PMID:19767420   PMID:19786569   PMID:19796621   PMID:19796622  
PMID:19805295   PMID:19816951   PMID:19842188   PMID:19877272   PMID:19882665   PMID:19896444   PMID:19906845   PMID:19906857   PMID:19913004   PMID:19913007   PMID:19913010   PMID:19948250  
PMID:19955426   PMID:20007774   PMID:20008041   PMID:20011520   PMID:20017954   PMID:20043902   PMID:20058045   PMID:20059953   PMID:20071536   PMID:20079728   PMID:20109530   PMID:20123909  
PMID:20131355   PMID:20144606   PMID:20147377   PMID:20171203   PMID:20179095   PMID:20186345   PMID:20211142   PMID:20235171   PMID:20237275   PMID:20237281   PMID:20335479   PMID:20362541  
PMID:20400693   PMID:20404134   PMID:20412781   PMID:20413611   PMID:20417196   PMID:20418906   PMID:20457761   PMID:20460368   PMID:20460369   PMID:20484817   PMID:20489730   PMID:20503364  
PMID:20503368   PMID:20510365   PMID:20531390   PMID:20533405   PMID:20548776   PMID:20573694   PMID:20610763   PMID:20621055   PMID:20631180   PMID:20637190   PMID:20646110   PMID:20661473  
PMID:20687156   PMID:20702706   PMID:20720539   PMID:20729831   PMID:20733081   PMID:20798046   PMID:20804972   PMID:20805985   PMID:20808958   PMID:20833365   PMID:20852734   PMID:20855650  
PMID:20869108   PMID:20871603   PMID:20873986   PMID:20890044   PMID:20932939   PMID:20945330   PMID:20950430   PMID:20963821   PMID:20975950   PMID:21036460   PMID:21061038   PMID:21062744  
PMID:21068310   PMID:21074523   PMID:21076177   PMID:21084383   PMID:21103067   PMID:21103394   PMID:21115610   PMID:21125652   PMID:21131959   PMID:21138975   PMID:21146598   PMID:21149574  
PMID:21185279   PMID:21205789   PMID:21205797   PMID:21220025   PMID:21220101   PMID:21223962   PMID:21228158   PMID:21233129   PMID:21245162   PMID:21248112   PMID:21256837   PMID:21262217  
PMID:21267068   PMID:21280162   PMID:21300049   PMID:21303850   PMID:21311564   PMID:21321941   PMID:21331042   PMID:21337463   PMID:21348597   PMID:21350014   PMID:21354309   PMID:21360794  
PMID:21376038   PMID:21420948   PMID:21431469   PMID:21433225   PMID:21436036   PMID:21451048   PMID:21451052   PMID:21468047   PMID:21472479   PMID:21472480   PMID:21497086   PMID:21502507  
PMID:21504946   PMID:21512031   PMID:21515253   PMID:21516249   PMID:21525287   PMID:21529752   PMID:21532573   PMID:21543769   PMID:21549328   PMID:21561989   PMID:21562282   PMID:21576358  
PMID:21589869   PMID:21613325   PMID:21632926   PMID:21636786   PMID:21655085   PMID:21663792   PMID:21674058   PMID:21677159   PMID:21703370   PMID:21731673   PMID:21736876   PMID:21743007  
PMID:21752936   PMID:21766338   PMID:21771810   PMID:21771816   PMID:21776083   PMID:21781958   PMID:21799872   PMID:21803035   PMID:21803296   PMID:21826226   PMID:21849552   PMID:21852401  
PMID:21873635   PMID:21880902   PMID:21886788   PMID:21925604   PMID:21927024   PMID:21930787   PMID:21956995   PMID:21962512   PMID:21976703   PMID:21978088   PMID:21982232   PMID:21985610  
PMID:21989918   PMID:22012572   PMID:22075149   PMID:22085726   PMID:22087235   PMID:22090492   PMID:22159122   PMID:22160720   PMID:22182523   PMID:22186729   PMID:22186731   PMID:22190459  
PMID:22194602   PMID:22198669   PMID:22232070   PMID:22232554   PMID:22234186   PMID:22235191   PMID:22258620   PMID:22266795   PMID:22278924   PMID:22292060   PMID:22318628   PMID:22327294  
PMID:22334647   PMID:22334693   PMID:22337526   PMID:22340499   PMID:22344693   PMID:22354878   PMID:22355722   PMID:22362888   PMID:22371395   PMID:22411169   PMID:22411557   PMID:22421044  
PMID:22421361   PMID:22442076   PMID:22461560   PMID:22461901   PMID:22479204   PMID:22491945   PMID:22495934   PMID:22496561   PMID:22508726   PMID:22513373   PMID:22522080   PMID:22532528  
PMID:22542185   PMID:22542624   PMID:22546692   PMID:22560077   PMID:22561201   PMID:22562503   PMID:22570694   PMID:22578469   PMID:22588081   PMID:22608532   PMID:22649246   PMID:22669107  
PMID:22669820   PMID:22675207   PMID:22675208   PMID:22678773   PMID:22679103   PMID:22689450   PMID:22705977   PMID:22711520   PMID:22717580   PMID:22745311   PMID:22745796   PMID:22767514  
PMID:22789544   PMID:22792072   PMID:22814375   PMID:22819339   PMID:22835638   PMID:22847514   PMID:22855803   PMID:22865702   PMID:22902753   PMID:22909387   PMID:22912670   PMID:22931209  
PMID:22936997   PMID:22945632   PMID:22949635   PMID:22954964   PMID:22956844   PMID:22973011   PMID:22980982   PMID:22988430   PMID:22991444   PMID:22992803   PMID:22992956   PMID:22993445  
PMID:22998872   PMID:23006325   PMID:23007396   PMID:23028343   PMID:23028652   PMID:23029233   PMID:23034635   PMID:23042739   PMID:23056351   PMID:23070814   PMID:23071813   PMID:23108051  
PMID:23122586   PMID:23132246   PMID:23135265   PMID:23145058   PMID:23153495   PMID:23169531   PMID:23169551   PMID:23190887   PMID:23192966   PMID:23193000   PMID:23213213   PMID:23217425  
PMID:23223237   PMID:23226461   PMID:23228673   PMID:23249739   PMID:23260487   PMID:23266329   PMID:23269686   PMID:23279263   PMID:23283338   PMID:23284756   PMID:23301561   PMID:23312516  
PMID:23316968   PMID:23318633   PMID:23324743   PMID:23332746   PMID:23341776   PMID:23386720   PMID:23420609   PMID:23426374   PMID:23431057   PMID:23434913   PMID:23437007   PMID:23444355  
PMID:23447615   PMID:23447624   PMID:23449471   PMID:23462474   PMID:23462476   PMID:23466739   PMID:23470161   PMID:23472872   PMID:23473982   PMID:23474895   PMID:23487311   PMID:23499385  
PMID:23515312   PMID:23517308   PMID:23523683   PMID:23542691   PMID:23553930   PMID:23571214   PMID:23575864   PMID:23589895   PMID:23596255   PMID:23614009   PMID:23618354   PMID:23620511  
PMID:23623502   PMID:23624311   PMID:23630450   PMID:23635313   PMID:23637172   PMID:23638914   PMID:23644063   PMID:23649630   PMID:23658188   PMID:23665444   PMID:23666531   PMID:23673330  
PMID:23674600   PMID:23677168   PMID:23708003   PMID:23712846   PMID:23720040   PMID:23720416   PMID:23728800   PMID:23747191   PMID:23748610   PMID:23749646   PMID:23751362   PMID:23754801  
PMID:23760504   PMID:23761906   PMID:23765158   PMID:23767866   PMID:23776550   PMID:23791527   PMID:23792023   PMID:23798425   PMID:23813480   PMID:23817546   PMID:23818142   PMID:23861058  
PMID:23863479   PMID:23867475   PMID:23874697   PMID:23884445   PMID:23884446   PMID:23884650   PMID:23884928   PMID:23892456   PMID:23904595   PMID:23913642   PMID:23918377   PMID:23918385  
PMID:23918393   PMID:23924632   PMID:23934214   PMID:23946445   PMID:23948231   PMID:24009519   PMID:24013503   PMID:24036311   PMID:24038357   PMID:24038449   PMID:24052940   PMID:24058167  
PMID:24073291   PMID:24083387   PMID:24086156   PMID:24094323   PMID:24094324   PMID:24107947   PMID:24115331   PMID:24115909   PMID:24116102   PMID:24120664   PMID:24125957   PMID:24131634  
PMID:24145799   PMID:24151333   PMID:24154525   PMID:24167708   PMID:24183939   PMID:24191021   PMID:24209760   PMID:24209762   PMID:24218621   PMID:24227653   PMID:24236178   PMID:24243579  
PMID:24244203   PMID:24257626   PMID:24268575   PMID:24274029   PMID:24301314   PMID:24301385   PMID:24307298   PMID:24309208   PMID:24324671   PMID:24324735   PMID:24333658   PMID:24335253  
PMID:24335282   PMID:24336726   PMID:24348270   PMID:24355921   PMID:24357321   PMID:24360543   PMID:24381249   PMID:24391519   PMID:24392139   PMID:24401276   PMID:24431450   PMID:24465223  
PMID:24475213   PMID:24483844   PMID:24487391   PMID:24508530   PMID:24523460   PMID:24524909   PMID:24550288   PMID:24553927   PMID:24553933   PMID:24565836   PMID:24599129   PMID:24630727  
PMID:24631216   PMID:24633704   PMID:24639535   PMID:24647733   PMID:24669837   PMID:24673559   PMID:24705138   PMID:24727670   PMID:24746758   PMID:24753163   PMID:24771490   PMID:24771701  
PMID:24781987   PMID:24792116   PMID:24794706   PMID:24803588   PMID:24806673   PMID:24832538   PMID:24835466   PMID:24839873   PMID:24843006   PMID:24859004   PMID:24859262   PMID:24909994  
PMID:24912173   PMID:24917498   PMID:24925912   PMID:24939938   PMID:24952961   PMID:24953650   PMID:24954133   PMID:24970044   PMID:24983448   PMID:25011550   PMID:25026204   PMID:25042802  
PMID:25043473   PMID:25044744   PMID:25057208   PMID:25057212   PMID:25066162   PMID:25070536   PMID:25077433   PMID:25091041   PMID:25099074   PMID:25100655   PMID:25103589   PMID:25109817  
PMID:25111779   PMID:25114215   PMID:25142465   PMID:25152336   PMID:25176648   PMID:25182747   PMID:25184679   PMID:25186760   PMID:25201875   PMID:25210856   PMID:25232121   PMID:25249462  
PMID:25252086   PMID:25258086   PMID:25263278   PMID:25273085   PMID:25279559   PMID:25282615   PMID:25297105   PMID:25299669   PMID:25309446   PMID:25327963   PMID:25331604   PMID:25335925  
PMID:25336744   PMID:25340657   PMID:25371362   PMID:25371369   PMID:25373907   PMID:25391964   PMID:25392491   PMID:25395668   PMID:25402856   PMID:25411503   PMID:25411508   PMID:25418731  
PMID:25444903   PMID:25446535   PMID:25456500   PMID:25458895   PMID:25467916   PMID:25468937   PMID:25480985   PMID:25482558   PMID:25486255   PMID:25488119   PMID:25497456   PMID:25501223  
PMID:25501893   PMID:25505333   PMID:25512300   PMID:25512558   PMID:25516972   PMID:25521379   PMID:25527292   PMID:25532873   PMID:25535395   PMID:25537195   PMID:25556659   PMID:25556712  
PMID:25576924   PMID:25601450   PMID:25605784   PMID:25609618   PMID:25624266   PMID:25641698   PMID:25664857   PMID:25689717   PMID:25689933   PMID:25708924   PMID:25729924   PMID:25754111  
PMID:25757017   PMID:25762221   PMID:25773539   PMID:25775517   PMID:25778822   PMID:25786798   PMID:25790853   PMID:25792196   PMID:25804738   PMID:25805847   PMID:25809880   PMID:25810472  
PMID:25813538   PMID:25825708   PMID:25865348   PMID:25875008   PMID:25888505   PMID:25901318   PMID:25904789   PMID:25907274   PMID:25915623   PMID:25922526   PMID:25923646   PMID:25936505  
PMID:25940188   PMID:25972180   PMID:25988834   PMID:25992972   PMID:25997579   PMID:25999820   PMID:26005002   PMID:26010446   PMID:26025376   PMID:26026081   PMID:26029045   PMID:26067252  
PMID:26073538   PMID:26094033   PMID:26108463   PMID:26139524   PMID:26139602   PMID:26142281   PMID:26143639   PMID:26158450   PMID:26160903   PMID:26203155   PMID:26206133   PMID:26209645  
PMID:26209818   PMID:26209882   PMID:26220976   PMID:26235047   PMID:26235626   PMID:26235979   PMID:26248544   PMID:26251011   PMID:26256211   PMID:26265007   PMID:26265629   PMID:26269429  
PMID:26288816   PMID:26290228   PMID:26292759   PMID:26302206   PMID:26329597   PMID:26329601   PMID:26348989   PMID:26362256   PMID:26369386   PMID:26383973   PMID:26387953   PMID:26400936  
PMID:26411543   PMID:26411691   PMID:26439398   PMID:26440894   PMID:26441343   PMID:26445504   PMID:26453549   PMID:26455409   PMID:26457609   PMID:26474499   PMID:26496195   PMID:26504244  
PMID:26520399   PMID:26523946   PMID:26525805   PMID:26534985   PMID:26538639   PMID:26542008   PMID:26555052   PMID:26579598   PMID:26586225   PMID:26593875   PMID:26609159   PMID:26621269  
PMID:26640231   PMID:26651292   PMID:26651607   PMID:26655900   PMID:26658019   PMID:26661618   PMID:26691508   PMID:26701169   PMID:26702830   PMID:26718003   PMID:26740489   PMID:26745185  
PMID:26780186   PMID:26785054   PMID:26786414   PMID:26795843   PMID:26802325   PMID:26818521   PMID:26826497   PMID:26839365   PMID:26846112   PMID:26849971   PMID:26857994   PMID:26859490  
PMID:26864488   PMID:26876175   PMID:26903504   PMID:26905199   PMID:26912775   PMID:26921474   PMID:26932670   PMID:26947975   PMID:26949256   PMID:26961948   PMID:26971449   PMID:26988140  
PMID:27009580   PMID:27015308   PMID:27031842   PMID:27072135   PMID:27073218   PMID:27076429   PMID:27079169   PMID:27080130   PMID:27084449   PMID:27090805   PMID:27121005   PMID:27122033  
PMID:27131881   PMID:27141870   PMID:27142930   PMID:27143755   PMID:27144312   PMID:27144456   PMID:27171428   PMID:27173853   PMID:27174565   PMID:27185863   PMID:27188978   PMID:27203669  
PMID:27210758   PMID:27214567   PMID:27223328   PMID:27225728   PMID:27226320   PMID:27241892   PMID:27246266   PMID:27251626   PMID:27271278   PMID:27281218   PMID:27294512   PMID:27300003  
PMID:27302397   PMID:27320915   PMID:27320921   PMID:27335464   PMID:27341756   PMID:27351100   PMID:27364009   PMID:27369076   PMID:27376984   PMID:27378146   PMID:27392482   PMID:27411055  
PMID:27414798   PMID:27414999   PMID:27435629   PMID:27453501   PMID:27465826   PMID:27493992   PMID:27498859   PMID:27504805   PMID:27518316   PMID:27523618   PMID:27559308   PMID:27564454  
PMID:27565344   PMID:27578777   PMID:27578785   PMID:27578791   PMID:27579714   PMID:27582319   PMID:27586544   PMID:27611684   PMID:27615595   PMID:27616671   PMID:27620979   PMID:27631552  
PMID:27631609   PMID:27633988   PMID:27634570   PMID:27641601   PMID:27654891   PMID:27660324   PMID:27667971   PMID:27677711   PMID:27717094   PMID:27728803   PMID:27732862   PMID:27736991  
PMID:27748998   PMID:27755610   PMID:27760310   PMID:27773674   PMID:27773701   PMID:27784329   PMID:27789623   PMID:27789627   PMID:27790870   PMID:27791111   PMID:27806288   PMID:27806305  
PMID:27829154   PMID:27845622   PMID:27861515   PMID:27870829   PMID:27871073   PMID:27871306   PMID:27883036   PMID:27895551   PMID:27902722   PMID:27910949   PMID:27917898   PMID:27918583  
PMID:27930333   PMID:27932500   PMID:27936229   PMID:27957530   PMID:27966429   PMID:27974163   PMID:28007959   PMID:28009287   PMID:28011038   PMID:28052023   PMID:28052057   PMID:28077718  
PMID:28087714   PMID:28100021   PMID:28118374   PMID:28118982   PMID:28128212   PMID:28166426   PMID:28171747   PMID:28181574   PMID:28188246   PMID:28199486   PMID:28212747   PMID:28231465  
PMID:28232627   PMID:28253866   PMID:28266911   PMID:28272472   PMID:28299779   PMID:28300292   PMID:28317875   PMID:28323616   PMID:28345658   PMID:28368402   PMID:28368416   PMID:28373172  
PMID:28401892   PMID:28402857   PMID:28408205   PMID:28424158   PMID:28434801   PMID:28436127   PMID:28442710   PMID:28445456   PMID:28455369   PMID:28472653   PMID:28474670   PMID:28489004  
PMID:28501478   PMID:28506465   PMID:28506993   PMID:28506998   PMID:28512199   PMID:28515211   PMID:28524856   PMID:28546511   PMID:28560839   PMID:28566702   PMID:28579317   PMID:28584103  
PMID:28584195   PMID:28595361   PMID:28619823   PMID:28619992   PMID:28623666   PMID:28642583   PMID:28682643   PMID:28685891   PMID:28687930   PMID:28715412   PMID:28728023   PMID:28733161  
PMID:28733464   PMID:28733588   PMID:28737769   PMID:28742024   PMID:28742026   PMID:28743796   PMID:28746823   PMID:28766996   PMID:28768199   PMID:28777373   PMID:28778798   PMID:28780049  
PMID:28794184   PMID:28807898   PMID:28808228   PMID:28816361   PMID:28826820   PMID:28833847   PMID:28837861   PMID:28838968   PMID:28859094   PMID:28870992   PMID:28880149   PMID:28892064  
PMID:28892484   PMID:28919367   PMID:28931573   PMID:28939666   PMID:28943241   PMID:28945921   PMID:28954202   PMID:28992244   PMID:29017029   PMID:29019984   PMID:29031500   PMID:29059194  
PMID:29084802   PMID:29099309   PMID:29106906   PMID:29107558   PMID:29117559   PMID:29137925   PMID:29138408   PMID:29140246   PMID:29141232   PMID:29150673   PMID:29161339   PMID:29166577  
PMID:29168693   PMID:29170629   PMID:29174332   PMID:29174333   PMID:29178409   PMID:29180410   PMID:29180573   PMID:29180744   PMID:29197504   PMID:29199954   PMID:29208952   PMID:29217752  
PMID:29241683   PMID:29249356   PMID:29249622   PMID:29256862   PMID:29258872   PMID:29272992   PMID:29285798   PMID:29294103   PMID:29311744   PMID:29321583   PMID:29326173   PMID:29335337  
PMID:29335358   PMID:29340033   PMID:29351579   PMID:29352015   PMID:29358044   PMID:29361054   PMID:29361558   PMID:29383478   PMID:29386106   PMID:29397878   PMID:29412136   PMID:29432416  
PMID:29462287   PMID:29463648   PMID:29474907   PMID:29487166   PMID:29507213   PMID:29514090   PMID:29530878   PMID:29536590   PMID:29553487   PMID:29559340   PMID:29570951   PMID:29572359  
PMID:29574045   PMID:29578405   PMID:29587142   PMID:29588831   PMID:29610440   PMID:29611808   PMID:29623612   PMID:29636380   PMID:29700203   PMID:29706463   PMID:29727663   PMID:29732603  
PMID:29743593   PMID:29745895   PMID:29751817   PMID:29769265   PMID:29784671   PMID:29855337   PMID:29867343   PMID:29867344   PMID:29869046   PMID:29874522   PMID:29874574   PMID:29879109  
PMID:29885287   PMID:29899403   PMID:29915126   PMID:29922981   PMID:29933066   PMID:29939162   PMID:29945863   PMID:29950483   PMID:29964027   PMID:29969095   PMID:29981310   PMID:30008200  
PMID:30017590   PMID:30026265   PMID:30026551   PMID:30037926   PMID:30038234   PMID:30044992   PMID:30061166   PMID:30063206   PMID:30065628   PMID:30085028   PMID:30089022   PMID:30093553  
PMID:30100263   PMID:30129215   PMID:30133047   PMID:30142401   PMID:30146491   PMID:30153454   PMID:30177510   PMID:30179592   PMID:30179675   PMID:30189017   PMID:30194919   PMID:30201686  
PMID:30217595   PMID:30224493   PMID:30240734   PMID:30254141   PMID:30266827   PMID:30270571   PMID:30271956   PMID:30286078   PMID:30297694   PMID:30305289   PMID:30307165   PMID:30318151  
PMID:30329130   PMID:30332632   PMID:30343898   PMID:30347220   PMID:30348676   PMID:30352686   PMID:30382588   PMID:30389848   PMID:30410537   PMID:30426815   PMID:30442713   PMID:30472156  
PMID:30485816   PMID:30498430   PMID:30504125   PMID:30504829   PMID:30523785   PMID:30526858   PMID:30548789   PMID:30559277   PMID:30560934   PMID:30566254   PMID:30566428   PMID:30569122  
PMID:30578296   PMID:30595499   PMID:30595533   PMID:30595537   PMID:30597194   PMID:30613351   PMID:30626697   PMID:30635555   PMID:30639828   PMID:30648289   PMID:30651296   PMID:30654938  
PMID:30655340   PMID:30658984   PMID:30661984   PMID:30661985   PMID:30692224   PMID:30700829   PMID:30709655   PMID:30720908   PMID:30735538   PMID:30753104   PMID:30772301   PMID:30782824  
PMID:30809284   PMID:30814219   PMID:30833597   PMID:30842446   PMID:30846445   PMID:30849367   PMID:30858607   PMID:30862721   PMID:30871468   PMID:30889310   PMID:30893593   PMID:30912742  
PMID:30914320   PMID:30914971   PMID:30918330   PMID:30929920   PMID:30938680   PMID:30944105   PMID:30953627   PMID:30959515   PMID:31018127   PMID:31043608   PMID:31056475   PMID:31073041  
PMID:31077553   PMID:31077711   PMID:31079925   PMID:31082736   PMID:31092598   PMID:31097699   PMID:31152002   PMID:31171776   PMID:31187730   PMID:31197172   PMID:31209173   PMID:31227770  
PMID:31232700   PMID:31235634   PMID:31242446   PMID:31242448   PMID:31249377   PMID:31269445   PMID:31273213   PMID:31276493   PMID:31291587   PMID:31305241   PMID:31315026   PMID:31315906  
PMID:31317506   PMID:31318166   PMID:31319858   PMID:31340161   PMID:31356635   PMID:31358900   PMID:31371378   PMID:31375664   PMID:31383796   PMID:31415124   PMID:31416963   PMID:31422875  
PMID:31444221   PMID:31445376   PMID:31461644   PMID:31462248   PMID:31481660   PMID:31481792   PMID:31485717   PMID:31487081   PMID:31488567   PMID:31493975   PMID:31515109   PMID:31526806  
PMID:31556488   PMID:31562139   PMID:31569049   PMID:31570121   PMID:31570588   PMID:31575647   PMID:31588228   PMID:31604927   PMID:31636950   PMID:31646784   PMID:31663646   PMID:31670387  
PMID:31676552   PMID:31678344   PMID:31712428   PMID:31722212   PMID:31724774   PMID:31740755   PMID:31746095   PMID:31758234   PMID:31761722   PMID:31767619   PMID:31772009   PMID:31794431  
PMID:31797926   PMID:31801076   PMID:31806049   PMID:31812516   PMID:31813798   PMID:31814023   PMID:31816056   PMID:31843520   PMID:31844668   PMID:31857493   PMID:31871317   PMID:31875961  
PMID:31911949   PMID:31913118   PMID:31913463   PMID:31919497   PMID:31919899   PMID:31927035   PMID:31932950   PMID:31943155   PMID:31969356   PMID:31988094   PMID:31988190   PMID:31994726  
PMID:31997540   PMID:32001436   PMID:32016422   PMID:32029747   PMID:32037591   PMID:32049024   PMID:32059772   PMID:32103003   PMID:32106289   PMID:32115408   PMID:32127020   PMID:32127497  
PMID:32147304   PMID:32150534   PMID:32154873   PMID:32156757   PMID:32161758   PMID:32186707   PMID:32199613   PMID:32238932   PMID:32243674   PMID:32246510   PMID:32251342   PMID:32258033  
PMID:32271885   PMID:32277787   PMID:32286318   PMID:32289736   PMID:32294450   PMID:32299058   PMID:32315612   PMID:32317081   PMID:32385093   PMID:32386572   PMID:32404924   PMID:32414917  
PMID:32439755   PMID:32453714   PMID:32471461   PMID:32482884   PMID:32484994   PMID:32499648   PMID:32501282   PMID:32510763   PMID:32515350   PMID:32518258   PMID:32527007   PMID:32553182  
PMID:32597756   PMID:32664967   PMID:32672815   PMID:32674056   PMID:32675174   PMID:32701653   PMID:32703236   PMID:32708917   PMID:32723825   PMID:32737294   PMID:32758484   PMID:32760291  
PMID:32783935   PMID:32788677   PMID:32792512   PMID:32792525   PMID:32803714   PMID:32805026   PMID:32826903   PMID:32848819   PMID:32855415   PMID:32855417   PMID:32866472   PMID:32880858  
PMID:32907846   PMID:32943498   PMID:33020269   PMID:33042990   PMID:33053343   PMID:33053360   PMID:33057384   PMID:33099273   PMID:33108146   PMID:33110232   PMID:33127852   PMID:33162027  
PMID:33192618   PMID:33200984   PMID:33203851   PMID:33212773   PMID:33220177   PMID:33288908   PMID:33304758   PMID:33309869   PMID:33382037   PMID:33393905   PMID:33397924   PMID:33399538  
PMID:33406432   PMID:33414188   PMID:33414275   PMID:33422527   PMID:33428297   PMID:33436552   PMID:33452132   PMID:33462115   PMID:33470495   PMID:33472062   PMID:33495473   PMID:33529466  
PMID:33542216   PMID:33547135   PMID:33557613   PMID:33574062   PMID:33574085   PMID:33591268   PMID:33593819   PMID:33597191   PMID:33602870   PMID:33608529   PMID:33622105   PMID:33675690  
PMID:33692105   PMID:33692421   PMID:33722956   PMID:33723039   PMID:33723076   PMID:33723434   PMID:33739574   PMID:33790322   PMID:33790465   PMID:33795231   PMID:33795534   PMID:33795686  
PMID:33805206   PMID:33854232   PMID:33887203   PMID:33929320   PMID:33951080   PMID:33964205   PMID:33976153   PMID:33990559   PMID:34001891   PMID:34003106   PMID:34007995   PMID:34009125  
PMID:34011608   PMID:34016714   PMID:34031387   PMID:34042968   PMID:34046991   PMID:34061311   PMID:34061953   PMID:34099510   PMID:34107249   PMID:34107259   PMID:34121118   PMID:34124068  
PMID:34133940   PMID:34184730   PMID:34234180   PMID:34237032   PMID:34256037   PMID:34262022   PMID:34266958   PMID:34279757   PMID:34286693   PMID:34289374   PMID:34301885   PMID:34349220  
PMID:34359927   PMID:34395423   PMID:34402594   PMID:34403806   PMID:34405343   PMID:34419458   PMID:34432485   PMID:34446717   PMID:34469723   PMID:34478631   PMID:34478646   PMID:34478649  
PMID:34486668   PMID:34497269   PMID:34536973   PMID:34544869   PMID:34547456   PMID:34550336   PMID:34556581   PMID:34614421   PMID:34644528   PMID:34677125   PMID:34757798   PMID:34758021  
PMID:34767545   PMID:34769078   PMID:34772946   PMID:34815315   PMID:34819616   PMID:34851738   PMID:34880251   PMID:34908109   PMID:34931379   PMID:34932949   PMID:34943873   PMID:34974536  
PMID:34996870   PMID:35008655   PMID:35017475   PMID:35020876   PMID:35038200   PMID:35063082   PMID:35082601   PMID:35089129   PMID:35105859   PMID:35159260   PMID:35171666   PMID:35173232  
PMID:35177595   PMID:35210419   PMID:35245348   PMID:35252209   PMID:35255002   PMID:35264162   PMID:35273595   PMID:35294885   PMID:35297517   PMID:35299237   PMID:35303432   PMID:35309931  
PMID:35320729   PMID:35361248   PMID:35365601   PMID:35379703   PMID:35421372   PMID:35451126   PMID:35512705   PMID:35538503   PMID:35575074   PMID:35618699   PMID:35623353   PMID:35626641  
PMID:35652338   PMID:35666215   PMID:35676931   PMID:35685988   PMID:35710138   PMID:35729116   PMID:35762573   PMID:35781329   PMID:35803279   PMID:35815610   PMID:35830795   PMID:35830925  
PMID:35831953   PMID:35848514   PMID:35853870   PMID:35858560   PMID:35864088   PMID:35876795   PMID:35898686   PMID:35925886   PMID:35931079   PMID:35950911   PMID:35966594   PMID:35975307  
PMID:35976093   PMID:35981753   PMID:35988542   PMID:35998584   PMID:35998585   PMID:36008456   PMID:36027907   PMID:36028316   PMID:36029179   PMID:36042367   PMID:36046192   PMID:36051443  
PMID:36067402   PMID:36078123   PMID:36081908   PMID:36100434   PMID:36103829   PMID:36115458   PMID:36123354   PMID:36131367   PMID:36142249   PMID:36167966   PMID:36196585   PMID:36197846  
PMID:36218069   PMID:36238685   PMID:36252002   PMID:36253375   PMID:36265906   PMID:36323321   PMID:36332016   PMID:36334348   PMID:36353976   PMID:36385105   PMID:36398878   PMID:36399562  
PMID:36402907   PMID:36412518   PMID:36433959   PMID:36440275   PMID:36440598   PMID:36459087   PMID:36476860   PMID:36494345   PMID:36521641   PMID:36547788   PMID:36590296   PMID:36595695  
PMID:36602867   PMID:36619565   PMID:36627077   PMID:36627412   PMID:36693128   PMID:36764291   PMID:36794954   PMID:36867267   PMID:36917980   PMID:36943865   PMID:37024462  


Genomics

Comparative Map Data
Sox2
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm39334,704,144 - 34,706,610 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl334,704,554 - 34,706,610 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm38334,649,995 - 34,652,461 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl334,650,405 - 34,652,461 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv37334,548,927 - 34,551,383 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv36334,841,604 - 34,844,008 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera334,551,711 - 34,554,169 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map3A3NCBI
cM Map316.93NCBI
SOX2
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh383181,711,925 - 181,714,436 (+)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh38.p13 Ensembl3181,711,925 - 181,714,436 (+)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh373181,429,713 - 181,432,224 (+)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 363182,912,416 - 182,914,918 (+)NCBINCBI36Build 36hg18NCBI36
Build 343182,912,423 - 182,914,923NCBI
Celera3179,863,407 - 179,865,909 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map3q26.33NCBI
HuRef3178,834,536 - 178,837,048 (+)NCBIHuRef
CHM1_13181,392,587 - 181,395,099 (+)NCBICHM1_1
T2T-CHM13v2.03184,516,501 - 184,519,012 (+)NCBIT2T-CHM13v2.0
Sox2
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
mRatBN7.22117,536,929 - 117,539,338 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl2117,536,929 - 117,539,338 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
UTH_Rnor_SHR_Utx2124,123,587 - 124,125,999 (+)NCBIRnor_SHR
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.02122,236,249 - 122,238,661 (+)NCBIRnor_SHRSP
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.02116,863,148 - 116,865,560 (+)NCBIRnor_WKY
Rnor_6.02121,165,137 - 121,167,545 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl2121,165,137 - 121,167,545 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.02140,810,593 - 140,813,001 (+)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.42120,969,021 - 120,971,430 (+)NCBIRGSC3.4RGSC_v3.4rn4RGSC3.4
Celera2112,569,723 - 112,572,132 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map2q24NCBI
Sox2
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)
Chinchilla AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChiLan1.0 EnsemblNW_00495542010,671,978 - 10,672,934 (+)EnsemblChiLan1.0
ChiLan1.0NW_00495542010,671,888 - 10,674,080 (+)NCBIChiLan1.0ChiLan1.0
SOX2
(Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee)
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
NHGRI_mPanPan13179,585,136 - 179,587,627 (+)NCBINHGRI_mPanPan1
Mhudiblu_PPA_v03178,744,881 - 178,747,392 (+)NCBIMhudiblu_PPA_v0Mhudiblu_PPA_v0panPan3
PanPan1.13186,922,223 - 186,924,785 (+)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl3186,922,705 - 186,923,662 (+)Ensemblpanpan1.1panPan2
SOX2
(Canis lupus familiaris - dog)
Dog AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
CanFam3.13414,853,000 - 14,855,153 (+)NCBICanFam3.1CanFam3.1canFam3CanFam3.1
Dog10K_Boxer_Tasha3418,934,171 - 18,936,303 (+)NCBIDog10K_Boxer_Tasha
ROS_Cfam_1.03414,755,806 - 14,757,946 (+)NCBIROS_Cfam_1.0
UMICH_Zoey_3.13414,797,347 - 14,799,478 (+)NCBIUMICH_Zoey_3.1
UNSW_CanFamBas_1.03414,782,119 - 14,784,242 (+)NCBIUNSW_CanFamBas_1.0
UU_Cfam_GSD_1.03415,026,650 - 15,028,779 (+)NCBIUU_Cfam_GSD_1.0
Sox2
(Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel)
Squirrel AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HiC_Itri_2NW_024405602111,588,129 - 111,590,044 (+)NCBIHiC_Itri_2
SpeTri2.0 EnsemblNW_0049365661,631,822 - 1,632,613 (-)EnsemblSpeTri2.0
SpeTri2.0NW_0049365661,630,698 - 1,632,607 (-)NCBISpeTri2.0SpeTri2.0SpeTri2.0
SOX2
(Sus scrofa - pig)
Pig AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
Sscrofa11.1 Ensembl13119,668,476 - 119,669,435 (+)EnsemblSscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa11.113119,668,476 - 119,669,435 (+)NCBISscrofa11.1Sscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa10.213128,979,657 - 128,980,616 (+)NCBISscrofa10.2Sscrofa10.2susScr3
Pig Cytomap13q23-q41NCBI
SOX2
(Chlorocebus sabaeus - green monkey)
Green Monkey AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChlSab1.1157,673,581 - 7,676,812 (-)NCBIChlSab1.1ChlSab1.1chlSab2
ChlSab1.1 Ensembl157,674,867 - 7,675,826 (-)EnsemblChlSab1.1ChlSab1.1 EnsemblchlSab2
Vero_WHO_p1.0NW_02366606316,496,978 - 16,500,141 (-)NCBIVero_WHO_p1.0Vero_WHO_p1.0
Sox2
(Heterocephalus glaber - naked mole-rat)
Naked Mole-Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HetGla_female_1.0 EnsemblNW_00462473059,570,915 - 59,571,871 (+)EnsemblHetGla_female_1.0HetGla_female_1.0 EnsemblhetGla2
HetGla 1.0NW_00462473059,570,879 - 59,573,001 (+)NCBIHetGla_female_1.0HetGla 1.0hetGla2

Variants

.
Variants in Sox2
83 total Variants
miRNA Target Status

Confirmed Target Of
miRNA GeneMature miRNAMethod NameResult TypeData TypeSupport TypePMID
Mir134mmu-miR-134-5pMirtarbaseexternal_infoqRT-PCR//Luciferase reporter assay//Western blotFunctional MTI18806776
Mir134mmu-miR-134-3pMirecordsexternal_info{changed}NA18806776
Mir9-3mmu-miR-9-3pOncomiRDBexternal_infoNANA21531766
Mir429mmu-miR-429-5pOncomiRDBexternal_infoNANA23111103
Mir140mmu-miR-140-3pOncomiRDBexternal_infoNANA23060440

Predicted Target Of
Summary Value
Count of predictions:212
Count of miRNA genes:163
Interacting mature miRNAs:173
Transcripts:ENSMUST00000099151
Prediction methods:Miranda, Rnahybrid, Targetscan
Result types:miRGate_prediction

The detailed report is available here: Full Report CSV TAB Printer

miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/).
For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here.


QTLs in Region (GRCm39)
The following QTLs overlap with this region.    Full Report CSV TAB Printer Gviewer
RGD IDSymbolNameLODP ValueTraitSub TraitChrStartStopSpecies
26884436Zlq3_mzygomatic length QTL 3, 10 week (mouse)33265060142405761Mouse
1300559Thypr3_mthymocyte proliferative response 3 (mouse)Not determined3452541938525519Mouse
1558925Hivan1_mHIV-associated nephropathy 1 (mouse)Not determined3758617468716946Mouse
4142399Aec1_mautoimmune exocrinopathy 1 (mouse)Not determined7586174102690034Mouse
4141116Lgaq4_mlate growth adjusted QTL 4 (mouse)Not determined1024922183184946Mouse
4141255W10q3_mweight 10 weeks QTL 3 (mouse)Not determined1024922183184946Mouse
4141563Lgq3_mlate growth QTL 3 (mouse)Not determined1024922183184946Mouse
39128206Lwq18_mliver weight QTL 18 (mouse)31024922183184946Mouse
1357584Splq6_mspleen weight QTL 6 (mouse)Not determined31024922183184946Mouse
1357440Hrtpq1_mheart weight percentage QTL 1 (mouse)Not determined31024922183184946Mouse
1301358Eae20_mexperimental allergic encephalomyelitis 20 (mouse)Not determined31163045345630591Mouse
26884427Cvht4_mcranial vault height 4, 10 week (mouse)316054164109707316Mouse
13207570Tcq12_mtotal cholesterol QTL 12 (mouse)316504164130163649Mouse
4142092Tgq13_mtriglyceride QTL 13 (mouse)Not determined1828816852288168Mouse
1301114Ssial2_msusceptibility to sialadenitis 2 (mouse)Not determined32017486254180103Mouse
26884422Cvht7_mcranial vault height 7, 16 week (mouse)328954149118893649Mouse
1302056Orgwq4_morgan weight QTL 4 (mouse)Not determined330067588147304689Mouse
1300961Bh4p_mbar holding four paws (mouse)Not determined33183785465837997Mouse
12910778Pwgrq13_mpost-weaning growth rate QTL 13 (mouse)33263576058017363Mouse
12910781Pwgrq12_mpost-weaning growth rate QTL 12 (mouse)33263576058017363Mouse
1357689Mdmsc1_mmodifier of muscularity 1 (mouse)Not determined33332720145916479Mouse
10412073Ssen2_msuseptibility to Sendai virus 2 (mouse)Not determined33353546567535615Mouse
9587784Afw13_mabdominal fat weight QTL 13 (mouse)Not determined33375204567752228Mouse
10043882Bwtq13_mbody weight QTL 13 (mouse)Not determined33375204567752228Mouse
15039332Nmrs6_mNAFLD-associated magnetic resonance shift 6 (mouse)33417074168170741Mouse
15039336Nmrs2_mNAFLD-associated magnetic resonance shift 2 (mouse)33457610368576103Mouse

Markers in Region
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
MGSCv37334,549,528 - 34,549,731UniSTSGRCm37
MGSCv37334,550,945 - 34,551,275UniSTSGRCm37
MGSCv37334,549,848 - 34,549,978UniSTSGRCm37
MGSCv37334,549,713 - 34,550,124UniSTSGRCm37
MGSCv37334,551,034 - 34,551,217UniSTSGRCm37
MGSCv37334,549,338 - 34,550,297UniSTSGRCm37
Celera334,552,499 - 34,552,910UniSTS
Celera334,552,314 - 34,552,517UniSTS
Celera334,552,634 - 34,552,764UniSTS
Celera334,553,731 - 34,554,061UniSTS
Celera334,553,820 - 34,554,003UniSTS
Celera334,552,124 - 34,553,083UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
cM Map315.0UniSTS
X94127  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,651,738 - 34,651,925UniSTSGRCm38
MGSCv37334,550,660 - 34,550,847UniSTSGRCm37
Celera334,553,446 - 34,553,633UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Whitehead_YAC3 UniSTS
PMC304100P2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,650,996 - 34,651,117UniSTSGRCm38
MGSCv37334,549,918 - 34,550,039UniSTSGRCm37
Celera334,552,704 - 34,552,825UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,650,416 - 34,651,375UniSTSGRCm38
MGSCv37334,549,338 - 34,550,297UniSTSGRCm37
Celera334,552,124 - 34,553,083UniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,650,791 - 34,651,202UniSTSGRCm38
MGSCv37334,549,713 - 34,550,124UniSTSGRCm37
Celera334,552,499 - 34,552,910UniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,652,112 - 34,652,295UniSTSGRCm38
MGSCv37334,551,034 - 34,551,217UniSTSGRCm37
Celera334,553,820 - 34,554,003UniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
cM Map315.0UniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,652,023 - 34,652,353UniSTSGRCm38
MGSCv37334,550,945 - 34,551,275UniSTSGRCm37
Celera334,553,731 - 34,554,061UniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
cM Map315.0UniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,650,606 - 34,650,809UniSTSGRCm38
MGSCv37334,549,528 - 34,549,731UniSTSGRCm37
Celera334,552,314 - 34,552,517UniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
GRCm38334,650,926 - 34,651,056UniSTSGRCm38
MGSCv37334,549,848 - 34,549,978UniSTSGRCm37
Celera334,552,634 - 34,552,764UniSTS
Cytogenetic Map3A3UniSTS
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS
Sox2  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map3A2-BUniSTS


Expression


Sequence

Nucleotide Sequences
RefSeq Transcripts NM_011443 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
GenBank Nucleotide AB108673 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AB221649 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK131933 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK149358 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AL606746 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AW494059 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  BC057574 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  BM938133 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  BY713734 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  CD353783 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  CD354017 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  CF164429 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  CH466530 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  CX205480 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U31967 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  X94127 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles

Reference Sequences
RefSeq Acc Id: ENSMUST00000099151   ⟹   ENSMUSP00000096755
RefSeq Status:
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl334,704,554 - 34,706,610 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl334,650,405 - 34,652,461 (+)Ensembl
RefSeq Acc Id: NM_011443   ⟹   NP_035573
RefSeq Status: REVIEWED
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39334,704,144 - 34,706,610 (+)NCBI
GRCm38334,649,995 - 34,652,461 (+)NCBI
MGSCv37334,548,927 - 34,551,383 (+)RGD
Celera334,551,711 - 34,554,169 (+)RGD
cM Map3 ENTREZGENE
Sequence:
Reference Sequences
RefSeq Acc Id: NP_035573   ⟸   NM_011443
- UniProtKB: P48432 (UniProtKB/Swiss-Prot),   Q60I23 (UniProtKB/TrEMBL),   A0A6P5PAM1 (UniProtKB/TrEMBL)
- Sequence:
RefSeq Acc Id: ENSMUSP00000096755   ⟸   ENSMUST00000099151
Protein Domains
HMG box

Protein Structures
Name Modeler Protein Id AA Range Protein Structure
AF-P48432-F1-model_v2 AlphaFold P48432 1-319 view protein structure

Promoters
RGD ID:6834493
Promoter ID:MM_KWN:34043
Type:CpG-Island
SO ACC ID:SO:0000170
Source:MPROMDB
Tissues & Cell Lines:Brain,   ES_Cell,   Kidney,   Lung
Transcripts:NM_011443
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
MGSCv36334,548,141 - 34,550,152 (+)MPROMDB
RGD ID:6880474
Promoter ID:EPDNEW_M3687
Type:initiation region
Name:Sox2_1
Description:Mus musculus SRY -box 2 , mRNA.
SO ACC ID:SO:0000170
Source:EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/)
Experiment Methods:Single-end sequencing.
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm38334,649,997 - 34,650,057EPDNEW

Additional Information

Database Acc Id Source(s)
AGR Gene MGI:98364 AgrOrtholog
Ensembl Genes ENSMUSG00000074637 Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
Ensembl Protein ENSMUSP00000096755 ENTREZGENE
  ENSMUSP00000096755.3 UniProtKB/TrEMBL
Ensembl Transcript ENSMUST00000099151 ENTREZGENE
  ENSMUST00000099151.6 UniProtKB/TrEMBL
Gene3D-CATH 1.10.30.10 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
InterPro HMG_box_dom UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  HMG_box_dom_sf UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  SOX_fam UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
KEGG Report mmu:20674 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
MGD MGI:98364 ENTREZGENE
NCBI Gene 20674 ENTREZGENE
PANTHER PTHR10270:SF231 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  SOX TRANSCRIPTION FACTOR UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Pfam HMG_box UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  SOXp UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
PhenoGen Sox2 PhenoGen
PROSITE HMG_BOX_2 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
SMART HMG UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Superfamily-SCOP SSF47095 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
UniProt A0A6P5PAM1 ENTREZGENE
  P48432 ENTREZGENE
  Q3UES8_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  Q3V2B6_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  Q60I23 ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
  SOX2_MOUSE UniProtKB/Swiss-Prot


Nomenclature History
Date Current Symbol Current Name Previous Symbol Previous Name Description Reference Status
2013-11-26 Sox2  SRY (sex determining region Y)-box 2    SRY-box containing gene 2  Symbol and/or name change 5135510 APPROVED