Gene-Chemical Interaction Annotations
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References
Additional References at PubMed
Genomics
Variants
miRNA Target Status
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 1027 | Count of miRNA genes: | 607 | Interacting mature miRNAs: | 689 | Transcripts: | ENST00000475331, ENST00000475561, ENST00000478959, ENST00000490750, ENST00000492786, ENST00000496593 | Prediction methods: | Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | |
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miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
Markers in Region
D11S734 |
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GDB:631802 |
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PMC120577P1 |
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D12S1979 |
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D3S1673 |
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D8S2279 |
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Expression
RNA-SEQ Expression
High: > 1000 TPM value
Medium: Between 11 and 1000 TPMLow: Between 0.5 and 10 TPM Below Cutoff: < 0.5 TPM
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | sensory system | visual system | adipose tissue | appendage | entire extraembryonic component | pharyngeal arch | |
High | ||||||||||||||||||
Medium | 9 | 1 | 4 | 2 | 1 | 2 | 6 | 8 | 8 | 3 | 43 | 13 | ||||||
Low | 236 | 48 | 377 | 180 | 131 | 80 | 372 | 107 | 970 | 179 | 823 | 646 | 110 | 1 | 78 | 86 | 3 | 2 |
Below cutoff | 2166 | 2661 | 1191 | 320 | 1444 | 260 | 3901 | 2066 | 2694 | 216 | 582 | 931 | 63 | 1116 | 2634 | 2 |
Sequence
Nucleotide Sequences
RefSeq Acc Id: | ENST00000475331 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000475561 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000478959 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENST00000490750 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000492786 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000496593 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENST00000702537 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NR_002775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Type: | NON-CODING | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Position: |
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Sequence: |
Additional Information
External Database Links
Database | Acc Id | Source(s) |
COSMIC | RPLP0P2 | COSMIC |
Ensembl Genes | ENSG00000243742 | Ensembl |
ENSG00000293352 | Ensembl, ENTREZGENE | |
Ensembl Transcript | ENST00000496593 | ENTREZGENE |
GTEx | ENSG00000243742 | GTEx |
ENSG00000293352 | GTEx | |
HGNC ID | HGNC:17960 | ENTREZGENE |
Human Proteome Map | RPLP0P2 | Human Proteome Map |
NCBI Gene | 113157 | ENTREZGENE |
PharmGKB | PA34774 | PharmGKB |
Nomenclature History
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2016-03-14 | RPLP0P2 | ribosomal protein lateral stalk subunit P0 pseudogene 2 | ribosomal protein, large, P0 pseudogene 2 | Symbol and/or name change | 5135510 | APPROVED |