Sox9 (SRY (sex determining region Y)-box 9) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Sox9 (SRY (sex determining region Y)-box 9) Mus musculus
Analyze
Symbol: Sox9
Name: SRY (sex determining region Y)-box 9
RGD ID: 1322514
MGI Page MGI
Description: Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; beta-catenin binding activity; and nucleic acid binding activity. Involved in several processes, including intracellular signal transduction; positive regulation of morphogenesis of an epithelium; and regulation of signal transduction. Acts upstream of or within several processes, including neurogenesis; skeletal system development; and urogenital system development. Located in nucleus. Part of transcription regulator complex. Is expressed in several structures, including alimentary system; central nervous system; embryo mesenchyme; genitourinary system; and sensory organ. Used to study campomelic dysplasia. Human ortholog(s) of this gene implicated in 46,XX sex reversal 2; 46,XY sex reversal 10; campomelic dysplasia; lung cancer; and lung carcinoma. Orthologous to human SOX9 (SRY-box transcription factor 9).
Type: protein-coding
RefSeq Status: VALIDATED
Previously known as: 2010306G03Rik; AV220920; KIAA4243; mKIAA4243; mSox9; SRY-box containing gene 9; transcription factor SOX-9
RGD Orthologs
Human
Rat
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Genes
More Info more info ...
Latest Assembly: GRCm39 - Mouse Genome Assembly GRCm39
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm3911112,673,036 - 112,678,583 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl11112,673,050 - 112,678,586 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm3811112,782,210 - 112,787,757 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl11112,782,224 - 112,787,760 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv3711112,643,524 - 112,649,071 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv3611112,598,314 - 112,603,839 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera11124,540,008 - 124,545,554 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map11E2NCBI
cM Map1177.27NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Gene-Chemical Interaction Annotations     Click to see Annotation Detail View
(+)-taxifolin  (ISO)
(S)-nicotine  (ISO)
1,1-dichloroethene  (EXP)
1,2-dichloroethane  (EXP)
1,2-dimethylhydrazine  (EXP)
17alpha-ethynylestradiol  (EXP,ISO)
17beta-estradiol  (EXP,ISO)
17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one  (ISO)
2,2',4,4'-Tetrabromodiphenyl ether  (EXP)
2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine  (EXP,ISO)
2-hydroxypropanoic acid  (ISO)
3,3',5,5'-tetrabromobisphenol A  (EXP)
3,4-methylenedioxymethamphetamine  (EXP)
3-chloropropane-1,2-diol  (ISO)
3-Nitrobenzanthrone  (ISO)
4,4'-diaminodiphenylmethane  (EXP)
4,4'-sulfonyldiphenol  (EXP)
4-hydroxyphenyl retinamide  (EXP)
5-aza-2'-deoxycytidine  (ISO)
5-azacytidine  (EXP)
acetamide  (ISO)
acrylamide  (ISO)
afimoxifene  (ISO)
aflatoxin B1  (ISO)
all-trans-retinoic acid  (EXP,ISO)
all-trans-retinol  (EXP)
allethrin  (ISO)
ammonium chloride  (ISO)
androgen antagonist  (ISO)
anthra[1,9-cd]pyrazol-6(2H)-one  (ISO)
arachidonic acid  (ISO)
arsane  (ISO)
arsenic atom  (ISO)
arsenite(3-)  (ISO)
atrazine  (ISO)
avobenzone  (ISO)
azoxystrobin  (ISO)
benzo[a]pyrene  (EXP,ISO)
Benzo[ghi]perylene  (ISO)
berberine  (ISO)
bis(2-ethylhexyl) phthalate  (EXP,ISO)
bisphenol A  (EXP,ISO)
Bisphenol B  (ISO)
Brusatol  (ISO)
buta-1,3-diene  (EXP)
Butylbenzyl phthalate  (ISO)
caffeine  (ISO)
calcitriol  (ISO)
cannabidiol  (ISO)
carbon nanotube  (EXP)
carmustine  (ISO)
CGP 52608  (ISO)
CHIR 99021  (EXP,ISO)
chlordecone  (EXP)
chlorpyrifos  (ISO)
choline  (EXP)
chromium(6+)  (EXP)
ciguatoxin CTX1B  (EXP)
cisplatin  (ISO)
clobetasol  (EXP)
copper atom  (ISO)
copper(0)  (ISO)
copper(II) sulfate  (ISO)
corticosterone  (ISO)
coumestrol  (ISO)
crocidolite asbestos  (ISO)
crotonaldehyde  (ISO)
Cuprizon  (ISO)
curcumin  (ISO)
cyclosporin A  (ISO)
cyhalothrin  (ISO)
cypermethrin  (ISO)
decabromodiphenyl ether  (ISO)
dexamethasone  (EXP,ISO)
dextran sulfate  (EXP)
dibenz[a,h]anthracene  (EXP)
dibutyl phthalate  (EXP,ISO)
dicrotophos  (ISO)
diethyl maleate  (ISO)
diheptyl phthalate  (ISO)
diisobutyl phthalate  (ISO)
Diisodecyl phthalate  (ISO)
dioxygen  (EXP,ISO)
dipentyl phthalate  (ISO)
disodium selenite  (EXP)
diuron  (ISO)
dorsomorphin  (ISO)
doxorubicin  (EXP,ISO)
elemental selenium  (ISO)
endosulfan  (ISO)
Enterolactone  (ISO)
enzalutamide  (ISO)
erlotinib hydrochloride  (ISO)
ethanol  (EXP,ISO)
fenvalerate  (ISO)
folic acid  (EXP)
formaldehyde  (ISO)
gallic acid  (ISO)
genistein  (EXP)
geraniol  (ISO)
glycerol 2-phosphate  (ISO)
glycidol  (ISO)
hyaluronic acid  (EXP)
hydralazine  (ISO)
hydrogen peroxide  (EXP)
indole-3-methanol  (ISO)
iohexol  (ISO)
ionomycin  (EXP)
iopamidol  (ISO)
iron atom  (ISO)
iron(0)  (ISO)
kaempferol  (EXP)
L-ascorbic acid  (ISO)
L-methionine  (EXP)
lead diacetate  (EXP)
leflunomide  (ISO)
Licochalcone B  (ISO)
methapyrilene  (ISO)
methylisothiazolinone  (ISO)
mifepristone  (ISO)
Mofezolac (TN)  (EXP)
Monobutylphthalate  (EXP)
N-benzyloxycarbonyl-L-leucyl-L-leucyl-L-leucinal  (ISO)
nickel sulfate  (ISO)
nicotinamide  (ISO)
nicotine  (ISO)
oxybenzone  (ISO)
ozone  (EXP)
panobinostat  (ISO)
paracetamol  (EXP)
paraquat  (EXP,ISO)
PD 0325901  (ISO)
perfluorododecanoic acid  (ISO)
perfluorononanoic acid  (ISO)
perfluorooctane-1-sulfonic acid  (ISO)
PhIP  (ISO)
pirinixic acid  (EXP)
prednisolone  (ISO)
progesterone  (EXP,ISO)
prostaglandin E2  (EXP)
prostaglandin F2alpha  (EXP)
rac-lactic acid  (ISO)
resmethrin  (EXP)
resveratrol  (EXP,ISO)
rotenone  (EXP,ISO)
SB 203580  (ISO)
SB 431542  (ISO)
selenium atom  (ISO)
silicon dioxide  (ISO)
silver atom  (EXP,ISO)
silver(0)  (EXP,ISO)
sirolimus  (EXP)
sodium arsenite  (EXP,ISO)
sodium fluoride  (EXP)
Soman  (ISO)
sulfamethoxazole  (ISO)
sulforaphane  (ISO)
sunitinib  (ISO)
tacrolimus hydrate  (EXP)
tamoxifen  (EXP,ISO)
temozolomide  (ISO)
tert-butyl hydroperoxide  (ISO)
testosterone  (ISO)
tetrachloromethane  (EXP)
thimerosal  (EXP)
thioacetamide  (ISO)
titanium dioxide  (EXP)
torin 1  (ISO)
triacsin C  (ISO)
tributylstannane  (EXP)
trichostatin A  (ISO)
triclosan  (ISO)
triphenyl phosphate  (EXP)
troglitazone  (ISO)
urethane  (ISO)
valproic acid  (EXP,ISO)
vitamin E  (ISO)
vorinostat  (ISO)
XL147  (EXP)
zearalenone  (EXP)
zileuton  (EXP)
ziram  (ISO)
zoledronic acid  (ISO)

Gene Ontology Annotations     Click to see Annotation Detail View

Biological Process
anterior head development  (IMP)
aortic valve morphogenesis  (ISO)
apoptotic process  (IMP)
astrocyte fate commitment  (IGI)
bone mineralization  (IMP)
branching involved in ureteric bud morphogenesis  (IEP)
bronchus cartilage development  (IMP)
cAMP-mediated signaling  (ISO)
canonical Wnt signaling pathway  (IDA)
cartilage condensation  (IMP)
cartilage development  (IDA,IMP,ISO)
cell differentiation  (IEA)
cell fate commitment  (IGI)
cell population proliferation  (IMP)
cell proliferation involved in heart morphogenesis  (IMP)
cell-cell adhesion  (IMP)
cellular response to epidermal growth factor stimulus  (IDA)
cellular response to heparin  (IDA)
cellular response to interleukin-1  (ISO)
cellular response to mechanical stimulus  (IDA)
cellular response to retinoic acid  (IDA,ISO)
cellular response to transforming growth factor beta stimulus  (IEP,ISO)
central nervous system development  (IEP)
chondrocyte development  (IMP)
chondrocyte differentiation  (IBA,IDA,IEP,IMP)
chondrocyte differentiation involved in endochondral bone morphogenesis  (ISO)
chondrocyte hypertrophy  (IMP)
chromatin remodeling  (ISO)
cochlea morphogenesis  (IMP)
cytoskeleton organization  (IMP)
endocardial cushion morphogenesis  (IMP)
endochondral bone morphogenesis  (IMP)
endocrine pancreas development  (IMP)
epidermal growth factor receptor signaling pathway  (IDA)
epithelial cell proliferation  (IMP)
epithelial cell proliferation involved in prostatic bud elongation  (IMP)
epithelial to mesenchymal transition  (IMP)
epithelial tube branching involved in lung morphogenesis  (IGI,IMP)
ERK1 and ERK2 cascade  (IDA)
extracellular matrix assembly  (IMP)
extracellular matrix organization  (IMP)
gene expression  (IMP)
glandular epithelial cell differentiation  (IMP)
glial cell fate specification  (IMP)
growth plate cartilage chondrocyte growth  (IMP)
hair follicle development  (IMP)
Harderian gland development  (IMP)
heart development  (IBA,IMP)
heart valve development  (IMP)
heart valve formation  (IMP)
heart valve morphogenesis  (IMP)
homeostasis of number of cells within a tissue  (IMP)
intestinal epithelial cell differentiation  (IMP)
intestinal epithelial structure maintenance  (IMP)
intrahepatic bile duct development  (IMP)
lacrimal gland development  (IMP)
limb bud formation  (IEP)
lung epithelial cell differentiation  (IMP)
lung smooth muscle development  (IMP)
male germ-line sex determination  (IMP)
male gonad development  (IEP,IGI,IMP,ISO)
male sex determination  (IGI)
mammary gland development  (IEP)
mesenchymal cell apoptotic process  (IMP)
mesenchymal cell proliferation  (IMP)
metanephric nephron tubule formation  (IGI)
metanephric tubule development  (IEP)
morphogenesis of a branching epithelium  (IGI,IMP)
morphogenesis of an epithelium  (IBA)
negative regulation of apoptotic process  (IMP,ISO)
negative regulation of beta-catenin-TCF complex assembly  (IMP)
negative regulation of biomineral tissue development  (IMP,ISO)
negative regulation of bone mineralization  (IMP)
negative regulation of canonical Wnt signaling pathway  (IDA,IMP)
negative regulation of chondrocyte differentiation  (IMP)
negative regulation of DNA-templated transcription  (IDA,IMP,ISO)
negative regulation of epithelial cell differentiation  (IMP)
negative regulation of epithelial cell proliferation  (IMP)
negative regulation of fatty acid oxidation  (IDA)
negative regulation of gene expression  (IMP)
negative regulation of immune system process  (IMP)
negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process  (IMP)
negative regulation of miRNA transcription  (ISO)
negative regulation of myoblast differentiation  (IDA)
negative regulation of ossification  (IMP,ISO)
negative regulation of osteoblast differentiation  (IDA,IMP)
negative regulation of photoreceptor cell differentiation  (IGI)
negative regulation of transcription by RNA polymerase II  (IBA,ISO)
neural crest cell development  (IMP)
neuron fate specification  (IMP)
Notch signaling pathway  (IDA)
notochord development  (IEP)
nucleosome assembly  (ISO)
oligodendrocyte differentiation  (IBA,IMP)
ossification  (IEP)
otic vesicle development  (IEP)
otic vesicle formation  (IMP)
positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis  (IMP)
positive regulation of cartilage development  (IDA,ISO)
positive regulation of cell population proliferation  (IMP,ISO)
positive regulation of cell proliferation involved in heart morphogenesis  (IMP)
positive regulation of chondrocyte differentiation  (IBA,IDA,IMP,ISO)
positive regulation of chondrocyte proliferation  (ISO)
positive regulation of DNA-templated transcription  (IDA,IMP,ISO)
positive regulation of epithelial cell differentiation  (IMP)
positive regulation of epithelial cell migration  (IMP,ISO,ISS)
positive regulation of epithelial cell proliferation  (IMP)
positive regulation of extracellular matrix assembly  (IMP)
positive regulation of gene expression  (IGI,ISO)
positive regulation of kidney development  (IGI)
positive regulation of male gonad development  (ISO)
positive regulation of mesenchymal cell proliferation  (IMP)
positive regulation of mesenchymal stem cell differentiation  (ISO)
positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling  (IMP)
positive regulation of protein catabolic process  (IDA)
positive regulation of protein phosphorylation  (IDA,IMP)
positive regulation of stem cell proliferation  (IMP)
positive regulation of transcription by RNA polymerase II  (IDA,IGI,IMP,ISO)
prostate gland development  (IEP)
prostate gland morphogenesis  (IMP)
protein kinase B signaling  (IMP)
protein localization to nucleus  (IDA)
protein phosphorylation  (IDA)
protein-containing complex assembly  (ISO)
regulation of branching involved in lung morphogenesis  (IMP)
regulation of cell adhesion  (IMP)
regulation of cell cycle process  (ISO)
regulation of cell differentiation  (IMP)
regulation of cell population proliferation  (IMP)
regulation of cell proliferation involved in tissue homeostasis  (IMP)
regulation of DNA-templated transcription  (TAS)
regulation of epithelial cell proliferation involved in lung morphogenesis  (IMP)
regulation of gene expression  (IDA)
regulation of transcription by RNA polymerase II  (IBA,IDA)
renal vesicle induction  (IMP)
response to fatty acid  (IDA)
response to organic cyclic compound  (ISO)
retina development in camera-type eye  (IGI)
retinal rod cell differentiation  (IGI)
Sertoli cell development  (IGI,ISO)
Sertoli cell differentiation  (IMP)
signal transduction  (IMP)
skeletal system development  (ISO)
somatic stem cell population maintenance  (IMP)
spermatogenesis  (IGI)
stem cell proliferation  (IMP)
tissue homeostasis  (IMP)
trachea cartilage development  (IMP)
transcription by RNA polymerase II  (IDA,IGI)
type I pneumocyte differentiation  (IMP)
ureter development  (IGI)
ureter morphogenesis  (IGI)
ureter smooth muscle cell differentiation  (IMP)
ureter urothelium development  (IEP)

Cellular Component

Phenotype Annotations     Click to see Annotation Detail View

Mammalian Phenotype
abnormal angiogenesis  (IAGP)
abnormal ankle joint morphology  (IAGP)
abnormal atrioventricular cushion morphology  (IAGP)
abnormal atrioventricular valve morphology  (IAGP)
abnormal axial skeleton morphology  (IAGP)
abnormal blood circulation  (IAGP)
abnormal blood vessel morphology  (IAGP)
abnormal bone marrow cavity morphology  (IAGP)
abnormal bone mineralization  (IAGP)
abnormal bone ossification  (IAGP)
abnormal bone remodeling  (IAGP)
abnormal branching involved in lung morphogenesis  (IAGP)
abnormal cartilage development  (IAGP)
abnormal cell differentiation  (IAGP)
abnormal chondrocyte physiology  (IAGP)
abnormal circulating chemokine level  (IAGP)
abnormal coat/ hair morphology  (IAGP)
abnormal craniofacial bone morphology  (IAGP)
abnormal craniofacial development  (IAGP)
abnormal craniofacial morphology  (IAGP)
abnormal cranium morphology  (IAGP)
abnormal dorsal root ganglion morphology  (IAGP)
abnormal endochondral bone ossification  (IAGP)
abnormal epidermal layer morphology  (IAGP)
abnormal epiphyseal plate morphology  (IAGP)
abnormal fetal atrioventricular canal morphology  (IAGP)
abnormal foot pad morphology  (IAGP)
abnormal forelimb stylopod morphology  (IAGP)
abnormal forelimb zeugopod morphology  (IAGP)
abnormal hair follicle bulge morphology  (IAGP)
abnormal hair follicle matrix region morphology  (IAGP)
abnormal hair follicle morphology  (IAGP)
abnormal hair follicle outer root sheath morphology  (IAGP)
abnormal hair growth  (IAGP)
abnormal hair shaft morphology  (IAGP)
abnormal head shape  (IAGP)
abnormal heart valve morphology  (IAGP)
abnormal humerus morphology  (IAGP)
abnormal hyoid bone morphology  (IAGP)
abnormal ilium morphology  (IAGP)
abnormal interatrial septum morphology  (IAGP)
abnormal ischium morphology  (IAGP)
abnormal laryngeal cartilage morphology  (IAGP)
abnormal limb bone morphology  (IAGP)
abnormal limb bud morphology  (IAGP)
abnormal limb development  (IAGP)
abnormal long bone epiphyseal plate proliferative zone  (IAGP)
abnormal long bone hypertrophic chondrocyte zone  (IAGP)
abnormal long bone morphology  (IAGP)
abnormal lung epithelium morphology  (IAGP)
abnormal male meiosis  (IAGP)
abnormal mandible morphology  (IAGP)
abnormal Meckel's cartilage morphology  (IAGP)
abnormal metacarpal bone morphology  (IAGP)
abnormal mitral valve morphology  (IAGP)
abnormal osteoblast differentiation  (IAGP)
abnormal pancreas development  (IAGP)
abnormal pelvic girdle bone morphology  (IAGP)
abnormal primary sex determination  (IAGP)
abnormal primitive urogenital sinus morphology  (IAGP)
abnormal pubis morphology  (IAGP)
abnormal respiration  (IAGP)
abnormal rib morphology  (IAGP)
abnormal rostral-caudal body axis extension  (IAGP)
abnormal scapula morphology  (IAGP)
abnormal scapular spine morphology  (IAGP)
abnormal seminiferous tubule morphology  (IAGP)
abnormal skeleton development  (IAGP)
abnormal skeleton morphology  (IAGP)
abnormal skin condition  (IAGP)
abnormal skin morphology  (IAGP)
abnormal spleen morphology  (IAGP)
abnormal sternebra morphology  (IAGP)
abnormal sternum morphology  (IAGP)
abnormal tail morphology  (IAGP)
abnormal temporomandibular joint morphology  (IAGP)
abnormal tendon morphology  (IAGP)
abnormal testis development  (IAGP)
abnormal trabecular bone morphology  (IAGP)
abnormal tracheal cartilage morphology  (IAGP)
abnormal tricuspid valve morphology  (IAGP)
abnormal trunk neural crest cell morphology  (IAGP)
abnormal ureter morphology  (IAGP)
abnormal ureter physiology  (IAGP)
abnormal ureter smooth muscle morphology  (IAGP)
abnormal vertebrae development  (IAGP)
abnormal vertebrae morphology  (IAGP)
abnormal vertebral body morphology  (IAGP)
abnormal xiphoid process morphology  (IAGP)
absent basisphenoid bone  (IAGP)
absent cartilage  (IAGP)
absent deltoid tuberosity  (IAGP)
absent hyoid bone body  (IAGP)
absent hyoid bone lesser horns  (IAGP)
absent incus  (IAGP)
absent Leydig cells  (IAGP)
absent malleus  (IAGP)
absent Meckel's cartilage  (IAGP)
absent nasal capsule  (IAGP)
absent presphenoid bone  (IAGP)
absent stapes  (IAGP)
absent sternum  (IAGP)
absent styloid process  (IAGP)
absent testis cords  (IAGP)
absent thyroid cartilage  (IAGP)
adactyly  (IAGP)
alopecia  (IAGP)
bifurcated tongue  (IAGP)
bowed fibula  (IAGP)
bowed radius  (IAGP)
bowed tibia  (IAGP)
bowed ulna  (IAGP)
calcified mitral valve  (IAGP)
chondrodystrophy  (IAGP)
cleft secondary palate  (IAGP)
congestive heart failure  (IAGP)
conotruncal ridge hypoplasia  (IAGP)
cryptorchism  (IAGP)
decreased B cell number  (IAGP)
decreased body height  (IAGP)
decreased body length  (IAGP)
decreased body size  (IAGP)
decreased body weight  (IAGP)
decreased bone mass  (IAGP)
decreased cell migration  (IAGP)
decreased cell proliferation  (IAGP)
decreased compact bone thickness  (IAGP)
decreased cranium length  (IAGP)
decreased glucagon secretion  (IAGP)
decreased hair follicle number  (IAGP)
decreased hematocrit  (IAGP)
decreased insulin secretion  (IAGP)
decreased length of long bones  (IAGP)
decreased lymphocyte cell number  (IAGP)
decreased pancreatic alpha cell mass  (IAGP)
decreased pancreatic beta cell mass  (IAGP)
decreased pancreatic delta cell number  (IAGP)
decreased percent body fat/body weight  (IAGP)
decreased PP cell number  (IAGP)
decreased Sertoli cell number  (IAGP)
decreased skeletal muscle mass  (IAGP)
decreased T cell number  (IAGP)
decreased total body fat amount  (IAGP)
decreased trabecular bone thickness  (IAGP)
dermatitis  (IAGP)
dilated ureter  (IAGP)
disproportionate dwarf  (IAGP)
distended abdomen  (IAGP)
distended urinary bladder  (IAGP)
domed cranium  (IAGP)
dry skin  (IAGP)
early eyelid opening  (IAGP)
embryonic lethality during organogenesis, complete penetrance  (IAGP)
embryonic lethality during organogenesis, incomplete penetrance  (IAGP)
embryonic lethality prior to organogenesis  (IAGP)
embryonic lethality, complete penetrance  (IAGP)
enlarged spleen  (IAGP)
extramedullary hematopoiesis  (IAGP)
failure of Mullerian duct regression  (IAGP)
female infertility  (IAGP)
hair follicle degeneration  (IAGP)
heart hypoplasia  (IAGP)
hunched posture  (IAGP)
hydroureter  (IAGP)
impaired cranial neural crest cell differentiation  (IAGP)
impaired skin barrier function  (IAGP)
impaired ureteric peristalsis  (IAGP)
increased bone marrow cell number  (IAGP)
increased circulating interleukin-17 level  (IAGP)
increased hair follicle apoptosis  (IAGP)
increased hemoglobin content  (IAGP)
increased IgE level  (IAGP)
increased interleukin-17 secretion  (IAGP)
increased leukocyte cell number  (IAGP)
increased macrophage cell number  (IAGP)
increased neutrophil cell number  (IAGP)
increased pruritus  (IAGP)
increased spleen red pulp amount  (IAGP)
increased T-helper 1 cell number  (IAGP)
increased T-helper 17 cell number  (IAGP)
increased T-helper 2 cell number  (IAGP)
increased trunk neural crest cell apoptosis  (IAGP)
increased vascular endothelial cell number  (IAGP)
increased width of hypertrophic chondrocyte zone  (IAGP)
kyphosis  (IAGP)
lethality throughout fetal growth and development, incomplete penetrance  (IAGP)
lumbar vertebral fusion  (IAGP)
lung cyst  (IAGP)
mandibular condyloid process hypoplasia  (IAGP)
meteorism  (IAGP)
micrognathia  (IAGP)
neonatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
neonatal lethality, incomplete penetrance  (IAGP)
no abnormal phenotype detected  (IAGP)
osteoporosis  (IAGP)
pancreatic islet hyperplasia  (IAGP)
pericardial edema  (IAGP)
perinatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
perinatal lethality, incomplete penetrance  (IAGP)
postnatal growth retardation  (IAGP)
postnatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
postnatal lethality, incomplete penetrance  (IAGP)
premature bone ossification  (IAGP)
premature death  (IAGP)
premature endochondral bone ossification  (IAGP)
preweaning lethality, complete penetrance  (IAGP)
primary sex reversal  (IAGP)
reduced male fertility  (IAGP)
respiratory distress  (IAGP)
rib fusion  (IAGP)
scapular bone hypoplasia  (IAGP)
sex reversal  (IAGP)
short femur  (IAGP)
short humerus  (IAGP)
short limbs  (IAGP)
short mandible  (IAGP)
short maxilla  (IAGP)
short radius  (IAGP)
short snout  (IAGP)
short sternum  (IAGP)
short tail  (IAGP)
short ulna  (IAGP)
shortened head  (IAGP)
small lung  (IAGP)
small mandible  (IAGP)
small mandibular condyloid process  (IAGP)
small pubis  (IAGP)
small scapula  (IAGP)
small thoracic cage  (IAGP)
thick epidermis  (IAGP)
thick interventricular septum  (IAGP)
thrombocytosis  (IAGP)
References

References - curated
# Reference Title Reference Citation
1. Campomelic dysplasia and autosomal sex reversal caused by mutations in an SRY-related gene. Foster JW, etal., Nature. 1994 Dec 8;372(6506):525-30.
2. MGDs mouse GO annotations MGD data from the GO Consortium
3. MGD IEA MGD IEA
4. OMIM Disease Annotation Pipeline OMIM Disease Annotation Pipeline
5. ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
6. Data Import for Chemical-Gene Interactions RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions
7. Sox9 expression during fracture repair. Shintaku Y, etal., Cells Tissues Organs. 2011;194(1):38-48. doi: 10.1159/000322557. Epub 2011 Jan 22.
8. SOX9 dependent FOXA1 expression promotes tumorigenesis in lung carcinoma. Wang X, etal., Biochem Biophys Res Commun. 2019 Aug 13;516(1):236-244. doi: 10.1016/j.bbrc.2019.05.169. Epub 2019 Jun 17.
Additional References at PubMed
PMID:7543410   PMID:7590241   PMID:7704013   PMID:7704017   PMID:7760812   PMID:8001137   PMID:8441686   PMID:8661048   PMID:8672134   PMID:8782821   PMID:8787755   PMID:8921394  
PMID:8995757   PMID:9119111   PMID:9171829   PMID:9264261   PMID:9286593   PMID:9428417   PMID:9541211   PMID:9636074   PMID:9637690   PMID:9724758   PMID:9755172   PMID:9876178  
PMID:9879712   PMID:9882503   PMID:10037800   PMID:10072439   PMID:10319868   PMID:10340758   PMID:10349636   PMID:10412367   PMID:10486311   PMID:10518490   PMID:10545231   PMID:10556064  
PMID:10572046   PMID:10588871   PMID:10631182   PMID:10704890   PMID:10804169   PMID:10805756   PMID:10888606   PMID:10951505   PMID:10960788   PMID:10976045   PMID:11042159   PMID:11044607  
PMID:11071752   PMID:11076861   PMID:11101852   PMID:11105052   PMID:11180829   PMID:11180959   PMID:11217851   PMID:11290325   PMID:11371614   PMID:11404013   PMID:11430871   PMID:11431689  
PMID:11509181   PMID:11566859   PMID:11668602   PMID:11702786   PMID:11707075   PMID:11792318   PMID:11807034   PMID:11857796   PMID:11869287   PMID:11875113   PMID:11893523   PMID:11900462  
PMID:11951052   PMID:11964482   PMID:12009021   PMID:12086465   PMID:12086466   PMID:12124942   PMID:12124946   PMID:12130543   PMID:12133909   PMID:12152071   PMID:12168674   PMID:12169669  
PMID:12223418   PMID:12381733   PMID:12413903   PMID:12414734   PMID:12420222   PMID:12441290   PMID:12441295   PMID:12466851   PMID:12477932   PMID:12508230   PMID:12510713   PMID:12538525  
PMID:12538527   PMID:12573259   PMID:12606408   PMID:12617806   PMID:12646629   PMID:12651897   PMID:12677004   PMID:12719432   PMID:12732652   PMID:12782625   PMID:12798287   PMID:12799063  
PMID:12815626   PMID:12832536   PMID:12842915   PMID:12878728   PMID:12883905   PMID:12902164   PMID:12915303   PMID:12919674   PMID:12952940   PMID:13679320   PMID:14522944   PMID:14530442  
PMID:14595844   PMID:14597763   PMID:14602680   PMID:14628051   PMID:14668414   PMID:14681479   PMID:14684986   PMID:14689607   PMID:15030763   PMID:15056615   PMID:15096597   PMID:15107406  
PMID:15110048   PMID:15115764   PMID:15123739   PMID:15132997   PMID:15148302   PMID:15161093   PMID:15162500   PMID:15162501   PMID:15162515   PMID:15186480   PMID:15192080   PMID:15206957  
PMID:15210554   PMID:15229180   PMID:15240568   PMID:15289436   PMID:15305294   PMID:15328018   PMID:15328019   PMID:15355562   PMID:15355563   PMID:15371327   PMID:15384171   PMID:15385158  
PMID:15389629   PMID:15465492   PMID:15489334   PMID:15529345   PMID:15533830   PMID:15579706   PMID:15581864   PMID:15581876   PMID:15585950   PMID:15590666   PMID:15618518   PMID:15634692  
PMID:15634706   PMID:15645446   PMID:15652702   PMID:15665004   PMID:15680364   PMID:15680367   PMID:15691760   PMID:15694126   PMID:15699338   PMID:15716345   PMID:15733672   PMID:15749074  
PMID:15759267   PMID:15760903   PMID:15769848   PMID:15778499   PMID:15781876   PMID:15790596   PMID:15800003   PMID:15829514   PMID:15836771   PMID:15866163   PMID:15866164   PMID:15872058  
PMID:15878625   PMID:15882577   PMID:15889150   PMID:15893981   PMID:15923624   PMID:15936751   PMID:15937924   PMID:15944188   PMID:15944199   PMID:15968591   PMID:15975938   PMID:15979579  
PMID:16015334   PMID:16023419   PMID:16085486   PMID:16120640   PMID:16127703   PMID:16133146   PMID:16141072   PMID:16141073   PMID:16145660   PMID:16169709   PMID:16185683   PMID:16203988  
PMID:16207751   PMID:16207837   PMID:16306355   PMID:16308330   PMID:16326388   PMID:16368932   PMID:16380715   PMID:16382150   PMID:16387856   PMID:16408284   PMID:16425238   PMID:16452715  
PMID:16488195   PMID:16504022   PMID:16537572   PMID:16546851   PMID:16564520   PMID:16602821   PMID:16604525   PMID:16672333   PMID:16675530   PMID:16678811   PMID:16700629   PMID:16712836  
PMID:16728472   PMID:16791844   PMID:16818445   PMID:16824508   PMID:16877353   PMID:16877546   PMID:16881063   PMID:16887829   PMID:16894610   PMID:16990585   PMID:17001316   PMID:17014841  
PMID:17035289   PMID:17041600   PMID:17067568   PMID:17084361   PMID:17126317   PMID:17131407   PMID:17138667   PMID:17142326   PMID:17191253   PMID:17194222   PMID:17199044   PMID:17222543  
PMID:17241776   PMID:17260385   PMID:17267606   PMID:17274974   PMID:17277314   PMID:17289022   PMID:17303760   PMID:17317783   PMID:17350610   PMID:17360777   PMID:17433257   PMID:17436279  
PMID:17440973   PMID:17448459   PMID:17470636   PMID:17477400   PMID:17481601   PMID:17486547   PMID:17488194   PMID:17504919   PMID:17525254   PMID:17537790   PMID:17537799   PMID:17540364  
PMID:17544391   PMID:17563382   PMID:17576802   PMID:17586487   PMID:17592132   PMID:17609112   PMID:17609113   PMID:17616727   PMID:17644814   PMID:17681175   PMID:17698607   PMID:17707671  
PMID:17728348   PMID:17765889   PMID:17822689   PMID:17848526   PMID:17875931   PMID:17913788   PMID:17916629   PMID:17940049   PMID:17967876   PMID:18036209   PMID:18052755   PMID:18094249  
PMID:18096605   PMID:18155190   PMID:18184726   PMID:18193955   PMID:18213646   PMID:18218620   PMID:18232736   PMID:18243104   PMID:18250097   PMID:18250098   PMID:18256198   PMID:18287078  
PMID:18287559   PMID:18301969   PMID:18325490   PMID:18330926   PMID:18334251   PMID:18353863   PMID:18359901   PMID:18367557   PMID:18374910   PMID:18377888   PMID:18390577   PMID:18391523  
PMID:18391535   PMID:18393307   PMID:18403409   PMID:18403418   PMID:18410737   PMID:18415932   PMID:18436715   PMID:18446812   PMID:18449196   PMID:18452912   PMID:18454134   PMID:18480165  
PMID:18495817   PMID:18498355   PMID:18506848   PMID:18514492   PMID:18519685   PMID:18539921   PMID:18554416   PMID:18557758   PMID:18559420   PMID:18585372   PMID:18588511   PMID:18593557  
PMID:18617533   PMID:18624832   PMID:18626943   PMID:18633137   PMID:18644788   PMID:18677406   PMID:18684439   PMID:18691704   PMID:18703590   PMID:18718475   PMID:18723011   PMID:18725516  
PMID:18729207   PMID:18776145   PMID:18787067   PMID:18794798   PMID:18794802   PMID:18802027   PMID:18823970   PMID:18924236   PMID:18927153   PMID:18927154   PMID:18942146   PMID:18948417  
PMID:18981061   PMID:19041858   PMID:19047045   PMID:19059214   PMID:19075394   PMID:19097117   PMID:19098141   PMID:19100252   PMID:19100728   PMID:19103169   PMID:19113914   PMID:19116663  
PMID:19123128   PMID:19124014   PMID:19135992   PMID:19161225   PMID:19165927   PMID:19168674   PMID:19168680   PMID:19191219   PMID:19201862   PMID:19211672   PMID:19211811   PMID:19217896  
PMID:19224984   PMID:19228882   PMID:19229034   PMID:19234473   PMID:19235731   PMID:19254573   PMID:19261698   PMID:19268447   PMID:19269320   PMID:19269367   PMID:19273610   PMID:19286674  
PMID:19287386   PMID:19304889   PMID:19306868   PMID:19334288   PMID:19356224   PMID:19358209   PMID:19369401   PMID:19383632   PMID:19384968   PMID:19386269   PMID:19389355   PMID:19391114  
PMID:19403103   PMID:19419310   PMID:19422820   PMID:19427409   PMID:19429785   PMID:19460349   PMID:19463158   PMID:19476490   PMID:19487809   PMID:19490914   PMID:19501582   PMID:19520072  
PMID:19538736   PMID:19549635   PMID:19590010   PMID:19594829   PMID:19605502   PMID:19616114   PMID:19618463   PMID:19618468   PMID:19635472   PMID:19660448   PMID:19661464   PMID:19680541  
PMID:19696014   PMID:19703439   PMID:19712269   PMID:19718027   PMID:19723505   PMID:19725955   PMID:19729026   PMID:19737917   PMID:19741146   PMID:19748502   PMID:19749746   PMID:19753101  
PMID:19757380   PMID:19759178   PMID:19766620   PMID:19767744   PMID:19769959   PMID:19776033   PMID:19777594   PMID:19782673   PMID:19796622   PMID:19805515   PMID:19815519   PMID:19820183  
PMID:19828801   PMID:19876815   PMID:19884258   PMID:19913006   PMID:19914171   PMID:19933217   PMID:19952280   PMID:20025746   PMID:20034104   PMID:20034106   PMID:20034107   PMID:20040500  
PMID:20056916   PMID:20058045   PMID:20059953   PMID:20103652   PMID:20106865   PMID:20110327   PMID:20144603   PMID:20152828   PMID:20152829   PMID:20170518   PMID:20171203   PMID:20171206  
PMID:20179096   PMID:20181744   PMID:20185687   PMID:20206616   PMID:20211142   PMID:20212115   PMID:20215352   PMID:20236942   PMID:20237275   PMID:20335360   PMID:20335364   PMID:20346939  
PMID:20347762   PMID:20356956   PMID:20386744   PMID:20400693   PMID:20403959   PMID:20404326   PMID:20458606   PMID:20463215   PMID:20466812   PMID:20501333   PMID:20530484   PMID:20530870  
PMID:20531390   PMID:20533404   PMID:20534694   PMID:20534695   PMID:20540774   PMID:20571031   PMID:20576618   PMID:20593410   PMID:20627083   PMID:20627960   PMID:20628604   PMID:20660756  
PMID:20676705   PMID:20692247   PMID:20707994   PMID:20736371   PMID:20737507   PMID:20806356   PMID:20808958   PMID:20833365   PMID:20857084   PMID:20871603   PMID:20881014   PMID:20890042  
PMID:20932939   PMID:20940257   PMID:20965161   PMID:20969844   PMID:20978074   PMID:20980404   PMID:20981830   PMID:21035938   PMID:21038449   PMID:21045211   PMID:21062860   PMID:21062863  
PMID:21098570   PMID:21113151   PMID:21113154   PMID:21115610   PMID:21129374   PMID:21148187   PMID:21162077   PMID:21170031   PMID:21183788   PMID:21194568   PMID:21194678   PMID:21212101  
PMID:21215372   PMID:21216305   PMID:21228004   PMID:21252157   PMID:21254332   PMID:21256960   PMID:21262812   PMID:21262861   PMID:21266405   PMID:21267068   PMID:21281624   PMID:21287656  
PMID:21293032   PMID:21297010   PMID:21307091   PMID:21316585   PMID:21335239   PMID:21346191   PMID:21350014   PMID:21367821   PMID:21383077   PMID:21384471   PMID:21385574   PMID:21385577  
PMID:21402740   PMID:21408140   PMID:21427128   PMID:21427722   PMID:21455939   PMID:21464233   PMID:21466799   PMID:21484342   PMID:21494559   PMID:21504045   PMID:21512138   PMID:21512159  
PMID:21538804   PMID:21559298   PMID:21571217   PMID:21592645   PMID:21628799   PMID:21636786   PMID:21654156   PMID:21654186   PMID:21664901   PMID:21670299   PMID:21677159   PMID:21708104  
PMID:21743471   PMID:21749862   PMID:21750032   PMID:21750036   PMID:21756198   PMID:21757499   PMID:21763240   PMID:21763481   PMID:21771810   PMID:21786021   PMID:21795715   PMID:21799743  
PMID:21803035   PMID:21807129   PMID:21820362   PMID:21826198   PMID:21826226   PMID:21829703   PMID:21856296   PMID:21866153   PMID:21869831   PMID:21872590   PMID:21873635   PMID:21878906  
PMID:21880149   PMID:21887724   PMID:21888903   PMID:21896736   PMID:21898486   PMID:21900680   PMID:21911092   PMID:21935430   PMID:21943152   PMID:21945074   PMID:21953591   PMID:21963425  
PMID:21965329   PMID:21983003   PMID:21991325   PMID:21995959   PMID:22020075   PMID:22028024   PMID:22046352   PMID:22071108   PMID:22072985   PMID:22096075   PMID:22110751   PMID:22128028  
PMID:22130515   PMID:22131019   PMID:22143895   PMID:22144232   PMID:22156581   PMID:22178591   PMID:22186409   PMID:22216134   PMID:22223437   PMID:22227295   PMID:22246670   PMID:22258620  
PMID:22262692   PMID:22271799   PMID:22275192   PMID:22275227   PMID:22277947   PMID:22290230   PMID:22294746   PMID:22300732   PMID:22312437   PMID:22318228   PMID:22323600   PMID:22331706  
PMID:22337375   PMID:22342532   PMID:22344693   PMID:22360967   PMID:22377357   PMID:22385965   PMID:22387309   PMID:22393260   PMID:22407321   PMID:22411303   PMID:22421045   PMID:22421361  
PMID:22427063   PMID:22461559   PMID:22465667   PMID:22496664   PMID:22500632   PMID:22508511   PMID:22523547   PMID:22529374   PMID:22532563   PMID:22536403   PMID:22546693   PMID:22547066  
PMID:22580282   PMID:22609278   PMID:22613723   PMID:22629237   PMID:22675208   PMID:22675211   PMID:22696231   PMID:22698544   PMID:22705479   PMID:22708793   PMID:22711520   PMID:22713487  
PMID:22766025   PMID:22768305   PMID:22770217   PMID:22777888   PMID:22778034   PMID:22795539   PMID:22827036   PMID:22833126   PMID:22833566   PMID:22837482   PMID:22843502   PMID:22848431  
PMID:22874919   PMID:22876201   PMID:22916278   PMID:22927467   PMID:22940690   PMID:22949635   PMID:22949652   PMID:22972626   PMID:22972715   PMID:22980982   PMID:22988430   PMID:22991339  
PMID:22991445   PMID:22999937   PMID:23001562   PMID:23006325   PMID:23006330   PMID:23009899   PMID:23027386   PMID:23028652   PMID:23034633   PMID:23041177   PMID:23042739   PMID:23055936  
PMID:23064761   PMID:23071096   PMID:23071697   PMID:23087174   PMID:23088431   PMID:23091613   PMID:23095882   PMID:23095887   PMID:23102580   PMID:23102581   PMID:23109723   PMID:23133399  
PMID:23136395   PMID:23149718   PMID:23175628   PMID:23177622   PMID:23201021   PMID:23201164   PMID:23223288   PMID:23236180   PMID:23238123   PMID:23239739   PMID:23260145   PMID:23266329  
PMID:23274689   PMID:23277114   PMID:23288785   PMID:23300469   PMID:23300479   PMID:23306204   PMID:23307615   PMID:23313125   PMID:23315995   PMID:23322385   PMID:23325761   PMID:23325811  
PMID:23326237   PMID:23341776   PMID:23349075   PMID:23360989   PMID:23362348   PMID:23370147   PMID:23383321   PMID:23386589   PMID:23389444   PMID:23408910   PMID:23423383   PMID:23431054  
PMID:23444355   PMID:23449223   PMID:23449471   PMID:23454691   PMID:23458899   PMID:23466739   PMID:23467742   PMID:23471965   PMID:23475960   PMID:23481305   PMID:23481413   PMID:23482494  
PMID:23487314   PMID:23516376   PMID:23516551   PMID:23519980   PMID:23523683   PMID:23555292   PMID:23555309   PMID:23558405   PMID:23615282   PMID:23616593   PMID:23616926   PMID:23620511  
PMID:23633963   PMID:23635786   PMID:23637336   PMID:23641053   PMID:23650549   PMID:23660500   PMID:23671695   PMID:23684747   PMID:23685333   PMID:23699523   PMID:23717575   PMID:23720048  
PMID:23727861   PMID:23746980   PMID:23762831   PMID:23786676   PMID:23792766   PMID:23818325   PMID:23823474   PMID:23824573   PMID:23840004   PMID:23840809   PMID:23843232   PMID:23843306  
PMID:23852729   PMID:23860260   PMID:23874228   PMID:23884445   PMID:23884891   PMID:23891934   PMID:23907671   PMID:23913870   PMID:23924632   PMID:23926259   PMID:23946534   PMID:23951403  
PMID:23974039   PMID:23987514   PMID:23994639   PMID:23996959   PMID:24009392   PMID:24009529   PMID:24012369   PMID:24014021   PMID:24036309   PMID:24045232   PMID:24058167   PMID:24075995  
PMID:24080509   PMID:24094323   PMID:24098470   PMID:24120474   PMID:24125957   PMID:24141719   PMID:24143185   PMID:24144697   PMID:24146773   PMID:24154528   PMID:24155239   PMID:24161523  
PMID:24163148   PMID:24167250   PMID:24191021   PMID:24198279   PMID:24218567   PMID:24218621   PMID:24227653   PMID:24248941   PMID:24257626   PMID:24269712   PMID:24274029   PMID:24276541  
PMID:24298056   PMID:24301385   PMID:24344131   PMID:24347445   PMID:24349082   PMID:24363063   PMID:24385915   PMID:24390927   PMID:24401276   PMID:24416910   PMID:24424161   PMID:24431450  
PMID:24436304   PMID:24449835   PMID:24452333   PMID:24453340   PMID:24475193   PMID:24482174   PMID:24482234   PMID:24492243   PMID:24496623   PMID:24501377   PMID:24532713   PMID:24551211  
PMID:24551245   PMID:24576537   PMID:24583262   PMID:24586192   PMID:24604556   PMID:24631216   PMID:24633789   PMID:24634209   PMID:24637075   PMID:24661562   PMID:24673559   PMID:24680892  
PMID:24680895   PMID:24700457   PMID:24711445   PMID:24721715   PMID:24725274   PMID:24726282   PMID:24727668   PMID:24735878   PMID:24743337   PMID:24760772   PMID:24760871   PMID:24778262  
PMID:24784881   PMID:24793290   PMID:24813615   PMID:24831012   PMID:24854998   PMID:24856513   PMID:24862038   PMID:24875170   PMID:24899573   PMID:24912173   PMID:24917498   PMID:24917674  
PMID:24924191   PMID:24929016   PMID:24934569   PMID:24939938   PMID:24952961   PMID:24956260   PMID:24970044   PMID:24970776   PMID:24972088   PMID:24990742   PMID:24990743   PMID:25004243  
PMID:25034710   PMID:25038043   PMID:25043184   PMID:25043473   PMID:25063451   PMID:25074915   PMID:25082703   PMID:25083987   PMID:25088423   PMID:25100655   PMID:25101494   PMID:25107471  
PMID:25114215   PMID:25127126   PMID:25142465   PMID:25148367   PMID:25176043   PMID:25179941   PMID:25186293   PMID:25193593   PMID:25209997   PMID:25224227   PMID:25228773   PMID:25229425  
PMID:25261715   PMID:25262822   PMID:25299585   PMID:25299669   PMID:25312494   PMID:25336744   PMID:25344072   PMID:25344368   PMID:25371362   PMID:25376471   PMID:25380565   PMID:25406395  
PMID:25419849   PMID:25428889   PMID:25432534   PMID:25446530   PMID:25446537   PMID:25452386   PMID:25464126   PMID:25495347   PMID:25501893   PMID:25515659   PMID:25516972   PMID:25523391  
PMID:25527076   PMID:25527186   PMID:25535917   PMID:25546433   PMID:25556712   PMID:25564625   PMID:25576928   PMID:25587042   PMID:25594183   PMID:25605784   PMID:25609427   PMID:25617432  
PMID:25623042   PMID:25626636   PMID:25629959   PMID:25641697   PMID:25652387   PMID:25668066   PMID:25680202   PMID:25687338   PMID:25691658   PMID:25710594   PMID:25715394   PMID:25715395  
PMID:25725066   PMID:25725069   PMID:25727890   PMID:25733872   PMID:25746793   PMID:25761772   PMID:25775596   PMID:25784544   PMID:25790853   PMID:25794678   PMID:25799994   PMID:25800090  
PMID:25808752   PMID:25859222   PMID:25888505   PMID:25889273   PMID:25902485   PMID:25917818   PMID:25919081   PMID:25922531   PMID:25926361   PMID:25956904   PMID:25966682   PMID:25972016  
PMID:26001784   PMID:26033091   PMID:26045173   PMID:26058470   PMID:26062936   PMID:26062940   PMID:26093309   PMID:26095047   PMID:26108792   PMID:26116666   PMID:26134413   PMID:26146088  
PMID:26150426   PMID:26151572   PMID:26156633   PMID:26170137   PMID:26186931   PMID:26188246   PMID:26194606   PMID:26199344   PMID:26203155   PMID:26212662   PMID:26234751   PMID:26235047  
PMID:26235536   PMID:26235626   PMID:26279573   PMID:26288816   PMID:26290048   PMID:26292757   PMID:26295701   PMID:26321050   PMID:26329601   PMID:26333992   PMID:26362256   PMID:26395480  
PMID:26402323   PMID:26440894   PMID:26450967   PMID:26455392   PMID:26494792   PMID:26505114   PMID:26525672   PMID:26527273   PMID:26536904   PMID:26538639   PMID:26545946   PMID:26546974  
PMID:26550799   PMID:26553654   PMID:26555052   PMID:26586225   PMID:26598619   PMID:26634652   PMID:26644382   PMID:26651607   PMID:26653852   PMID:26657766   PMID:26657772   PMID:26685160  
PMID:26689699   PMID:26697723   PMID:26701347   PMID:26739452   PMID:26771085   PMID:26776520   PMID:26777999   PMID:26794256   PMID:26806292   PMID:26839365   PMID:26856660   PMID:26859889  
PMID:26864488   PMID:26865184   PMID:26869074   PMID:26890219   PMID:26910875   PMID:26911688   PMID:26921474   PMID:26939755   PMID:26940020   PMID:26944677   PMID:26952977   PMID:26952979  
PMID:26959361   PMID:26992132   PMID:27000654   PMID:27002001   PMID:27009039   PMID:27012200   PMID:27018594   PMID:27043282   PMID:27046536   PMID:27056911   PMID:27088858   PMID:27100146  
PMID:27118120   PMID:27120339   PMID:27145737   PMID:27160681   PMID:27164562   PMID:27199373   PMID:27210758   PMID:27213272   PMID:27226320   PMID:27235933   PMID:27238423   PMID:27241892  
PMID:27250101   PMID:27257806   PMID:27261459   PMID:27262401   PMID:27270601   PMID:27287812   PMID:27292641   PMID:27292642   PMID:27302397   PMID:27325675   PMID:27328324   PMID:27335464  
PMID:27341756   PMID:27351100   PMID:27352137   PMID:27358050   PMID:27362800   PMID:27381226   PMID:27412481   PMID:27429045   PMID:27436052   PMID:27471255   PMID:27491074   PMID:27498191  
PMID:27506979   PMID:27527664   PMID:27531557   PMID:27560488   PMID:27577269   PMID:27578791   PMID:27585590   PMID:27593694   PMID:27605619   PMID:27606421   PMID:27606668   PMID:27616714  
PMID:27621061   PMID:27621062   PMID:27638301   PMID:27647853   PMID:27654891   PMID:27697904   PMID:27701636   PMID:27706140   PMID:27709799   PMID:27713395   PMID:27732085   PMID:27736991  
PMID:27739607   PMID:27740873   PMID:27748998   PMID:27806288   PMID:27827819   PMID:27862528   PMID:27869164   PMID:27871073   PMID:27881681   PMID:27941074   PMID:27989796   PMID:27993987  
PMID:28011632   PMID:28013293   PMID:28027321   PMID:28045957   PMID:28059449   PMID:28069589   PMID:28069742   PMID:28071588   PMID:28107452   PMID:28118982   PMID:28123425   PMID:28150810  
PMID:28162974   PMID:28166224   PMID:28169396   PMID:28172500   PMID:28192800   PMID:28263186   PMID:28279198   PMID:28285099   PMID:28323137   PMID:28323616   PMID:28327634   PMID:28336567  
PMID:28340616   PMID:28371069   PMID:28386540   PMID:28402857   PMID:28408205   PMID:28414273   PMID:28423321   PMID:28426816   PMID:28432216   PMID:28434617   PMID:28472341   PMID:28496037  
PMID:28501478   PMID:28506998   PMID:28512199   PMID:28520221   PMID:28527696   PMID:28538179   PMID:28546511   PMID:28576773   PMID:28580283   PMID:28619823   PMID:28619824   PMID:28625870  
PMID:28627474   PMID:28630873   PMID:28637242   PMID:28650345   PMID:28687932   PMID:28724751   PMID:28758904   PMID:28770354   PMID:28790014   PMID:28793255   PMID:28797033   PMID:28800889  
PMID:28807898   PMID:28807899   PMID:28807903   PMID:28809397   PMID:28814327   PMID:28827394   PMID:28838957   PMID:28859094   PMID:28892058   PMID:28893945   PMID:28900034   PMID:28923684  
PMID:28928395   PMID:28931923   PMID:28938467   PMID:28943241   PMID:28947535   PMID:28949961   PMID:28954202   PMID:28959031   PMID:28960679   PMID:28983104   PMID:29031500   PMID:29042436  
PMID:29044125   PMID:29056748   PMID:29058721   PMID:29059173   PMID:29068314   PMID:29100091   PMID:29106906   PMID:29107072   PMID:29109128   PMID:29131159   PMID:29174564   PMID:29180572  
PMID:29180744   PMID:29190781   PMID:29196261   PMID:29222391   PMID:29223978   PMID:29273440   PMID:29285798   PMID:29292497   PMID:29294332   PMID:29317485   PMID:29324782   PMID:29330353  
PMID:29337183   PMID:29342370   PMID:29361054   PMID:29361553   PMID:29386246   PMID:29409032   PMID:29420474   PMID:29425963   PMID:29428562   PMID:29440304   PMID:29449451   PMID:29459093  
PMID:29483576   PMID:29511023   PMID:29513653   PMID:29516783   PMID:29523871   PMID:29526868   PMID:29532549   PMID:29532564   PMID:29540665   PMID:29567669   PMID:29578405   PMID:29587145  
PMID:29602800   PMID:29604291   PMID:29609731   PMID:29615464   PMID:29618652   PMID:29636449   PMID:29644115   PMID:29659575   PMID:29689273   PMID:29691400   PMID:29700121   PMID:29712669  
PMID:29729398   PMID:29735531   PMID:29735715   PMID:29751002   PMID:29769265   PMID:29771958   PMID:29777903   PMID:29795630   PMID:29798841   PMID:29852132   PMID:29853617   PMID:29853630  
PMID:29879429   PMID:29885287   PMID:29899135   PMID:29899403   PMID:29903884   PMID:29920846   PMID:29922981   PMID:29929043   PMID:29941866   PMID:29950483   PMID:29950673   PMID:29956664  
PMID:29970477   PMID:29975682   PMID:29986868   PMID:29986869   PMID:29986870   PMID:29992973   PMID:30002128   PMID:30008325   PMID:30010625   PMID:30021842   PMID:30022023   PMID:30022162  
PMID:30026494   PMID:30040984   PMID:30048641   PMID:30057417   PMID:30067986   PMID:30085028   PMID:30093553   PMID:30100263   PMID:30111653   PMID:30126902   PMID:30127719   PMID:30134070  
PMID:30135482   PMID:30153454   PMID:30166332   PMID:30166336   PMID:30185873   PMID:30186101   PMID:30188892   PMID:30194919   PMID:30201295   PMID:30212841   PMID:30228104   PMID:30285093  
PMID:30305289   PMID:30355480   PMID:30375389   PMID:30377232   PMID:30389914   PMID:30392226   PMID:30392800   PMID:30413887   PMID:30424580   PMID:30470800   PMID:30478225   PMID:30487608  
PMID:30504125   PMID:30504126   PMID:30504829   PMID:30504911   PMID:30509557   PMID:30518625   PMID:30552336   PMID:30559459   PMID:30576429   PMID:30578393   PMID:30590051   PMID:30595533  
PMID:30604848   PMID:30617207   PMID:30630826   PMID:30635419   PMID:30638933   PMID:30649340   PMID:30651296   PMID:30658984   PMID:30664861   PMID:30668728   PMID:30685387   PMID:30696710  
PMID:30735494   PMID:30737693   PMID:30745426   PMID:30758073   PMID:30765281   PMID:30767782   PMID:30773487   PMID:30782824   PMID:30853440   PMID:30871468   PMID:30872705   PMID:30883226  
PMID:30884041   PMID:30886049   PMID:30889310   PMID:30912742   PMID:30916783   PMID:30944105   PMID:30951662   PMID:30983567   PMID:30988352   PMID:31002540   PMID:31010826   PMID:31038803  
PMID:31064775   PMID:31073041   PMID:31076486   PMID:31084574   PMID:31104943   PMID:31105007   PMID:31116734   PMID:31121357   PMID:31142573   PMID:31153924   PMID:31160421   PMID:31201281  
PMID:31221640   PMID:31242446   PMID:31242448   PMID:31285319   PMID:31310588   PMID:31319059   PMID:31320326   PMID:31320650   PMID:31323030   PMID:31336386   PMID:31351040   PMID:31358994  
PMID:31412250   PMID:31442442   PMID:31461644   PMID:31469182   PMID:31485717   PMID:31518072   PMID:31524221   PMID:31530896   PMID:31534052   PMID:31540914   PMID:31548395   PMID:31555647  
PMID:31562139   PMID:31562240   PMID:31586559   PMID:31604927   PMID:31618630   PMID:31625560   PMID:31669249   PMID:31672914   PMID:31685810   PMID:31712577   PMID:31719045   PMID:31724774  
PMID:31748609   PMID:31754036   PMID:31755607   PMID:31776260   PMID:31779270   PMID:31813798   PMID:31836612   PMID:31844668   PMID:31851932   PMID:31896583   PMID:31898934   PMID:31910233  
PMID:31913463   PMID:31923241   PMID:31924792   PMID:31932351   PMID:31940751   PMID:31949107   PMID:31949165   PMID:31953387   PMID:31961823   PMID:31968244   PMID:32001436   PMID:32002646  
PMID:32005677   PMID:32011766   PMID:32017444   PMID:32020708   PMID:32032549   PMID:32059775   PMID:32103177   PMID:32127497   PMID:32141129   PMID:32147495   PMID:32160556   PMID:32186512  
PMID:32212902   PMID:32274496   PMID:32290615   PMID:32294451   PMID:32317081   PMID:32317630   PMID:32319178   PMID:32320893   PMID:32344102   PMID:32350257   PMID:32365547   PMID:32369453  
PMID:32393888   PMID:32394892   PMID:32398354   PMID:32414917   PMID:32424153   PMID:32439755   PMID:32439762   PMID:32439983   PMID:32450490   PMID:32450947   PMID:32452519   PMID:32453714  
PMID:32460513   PMID:32493750   PMID:32515350   PMID:32521267   PMID:32537491   PMID:32541003   PMID:32541010   PMID:32579270   PMID:32580935   PMID:32595833   PMID:32616504   PMID:32679061  
PMID:32703236   PMID:32715478   PMID:32736681   PMID:32744119   PMID:32747435   PMID:32768399   PMID:32800757   PMID:32845239   PMID:32852840   PMID:32855415   PMID:32886109   PMID:32887795  
PMID:32901292   PMID:32917586   PMID:32938906   PMID:32943498   PMID:32950463   PMID:32974338   PMID:32991838   PMID:32994318   PMID:33004521   PMID:33008598   PMID:33022123   PMID:33027692  
PMID:33051257   PMID:33073849   PMID:33080014   PMID:33099273   PMID:33127578   PMID:33155500   PMID:33195234   PMID:33199444   PMID:33201874   PMID:33217406   PMID:33259516   PMID:33305798  
PMID:33326799   PMID:33328171   PMID:33328221   PMID:33363172   PMID:33393905   PMID:33399274   PMID:33428297   PMID:33436499   PMID:33442887   PMID:33448926   PMID:33462220   PMID:33483579  
PMID:33486744   PMID:33505018   PMID:33512716   PMID:33515576   PMID:33526661   PMID:33527355   PMID:33542216   PMID:33574062   PMID:33597301   PMID:33602870   PMID:33605987   PMID:33626352  
PMID:33627800   PMID:33666296   PMID:33694203   PMID:33707608   PMID:33754063   PMID:33781831   PMID:33810480   PMID:33811703   PMID:33846290   PMID:33871356   PMID:33882290   PMID:33887203  
PMID:33912929   PMID:33913480   PMID:33935652   PMID:33945466   PMID:33947861   PMID:33951080   PMID:33963183   PMID:33985544   PMID:34007995   PMID:34010630   PMID:34013328   PMID:34021911  
PMID:34057178   PMID:34091985   PMID:34108685   PMID:34121118   PMID:34150754   PMID:34155146   PMID:34193412   PMID:34233187   PMID:34237032   PMID:34242585   PMID:34260913   PMID:34266896  
PMID:34267243   PMID:34279220   PMID:34286693   PMID:34289374   PMID:34301885   PMID:34321999   PMID:34330843   PMID:34331943   PMID:34336815   PMID:34338282   PMID:34346313   PMID:34348153  
PMID:34351428   PMID:34361001   PMID:34368113   PMID:34407390   PMID:34423345   PMID:34428430   PMID:34432485   PMID:34433040   PMID:34433966   PMID:34471129   PMID:34542211   PMID:34557486  
PMID:34571027   PMID:34590686   PMID:34624205   PMID:34625577   PMID:34651294   PMID:34671097   PMID:34677125   PMID:34730112   PMID:34732852   PMID:34767545   PMID:34815802   PMID:34851738  
PMID:34880251   PMID:34918413   PMID:34921112   PMID:34928956   PMID:34929174   PMID:34932949   PMID:34968783   PMID:35075134   PMID:35084365   PMID:35103284   PMID:35108221   PMID:35110543  
PMID:35112129   PMID:35119382   PMID:35140200   PMID:35140269   PMID:35218327   PMID:35225230   PMID:35253855   PMID:35292640   PMID:35293576   PMID:35294885   PMID:35315790   PMID:35317954  
PMID:35318743   PMID:35337816   PMID:35342336   PMID:35364055   PMID:35398294   PMID:35398376   PMID:35421372   PMID:35503090   PMID:35504891   PMID:35512705   PMID:35557949   PMID:35568059  
PMID:35611752   PMID:35613264   PMID:35676931   PMID:35689447   PMID:35704566   PMID:35705036   PMID:35720180   PMID:35781329   PMID:35821145   PMID:35839257   PMID:35840551   PMID:35858326  
PMID:35863746   PMID:35878429   PMID:35905011   PMID:35906245   PMID:35910788   PMID:35927240   PMID:35927244   PMID:35965621   PMID:36026443  


Genomics

Comparative Map Data
Sox9
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm3911112,673,036 - 112,678,583 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl11112,673,050 - 112,678,586 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm3811112,782,210 - 112,787,757 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl11112,782,224 - 112,787,760 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv3711112,643,524 - 112,649,071 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv3611112,598,314 - 112,603,839 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera11124,540,008 - 124,545,554 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map11E2NCBI
cM Map1177.27NCBI
SOX9
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh381772,121,020 - 72,126,416 (+)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh38.p13 Ensembl1772,121,020 - 72,126,416 (+)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh371770,117,161 - 70,122,557 (+)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 361767,628,756 - 67,634,156 (+)NCBINCBI36Build 36hg18NCBI36
Build 341767,628,755 - 67,634,156NCBI
Celera1766,688,499 - 66,693,898 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map17q24.3NCBI
HuRef1765,510,108 - 65,515,656 (+)NCBIHuRef
CHM1_11770,181,222 - 70,186,622 (+)NCBICHM1_1
T2T-CHM13v2.01772,994,224 - 72,999,619 (+)NCBIT2T-CHM13v2.0
Sox9
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
mRatBN7.21097,806,485 - 97,811,994 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl1097,806,485 - 97,811,994 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
Rnor_6.010101,288,528 - 101,294,030 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl10101,288,489 - 101,293,379 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.010100,964,754 - 100,970,581 (+)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.410102,392,187 - 102,394,256 (+)NCBIRGSC3.4RGSC_v3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.110102,408,236 - 102,408,622 (+)NCBI
Celera1096,424,278 - 96,429,703 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map10q32.1NCBI
Sox9
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)