Ifnar1 (interferon (alpha and beta) receptor 1) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Ifnar1 (interferon (alpha and beta) receptor 1) Mus musculus
Analyze
Symbol: Ifnar1
Name: interferon (alpha and beta) receptor 1
RGD ID: 1313409
MGI Page MGI
Description: Enables type I interferon binding activity and type I interferon receptor activity. Involved in several processes, including cellular response to interferon-alpha; defense response to symbiont; and positive regulation of macromolecule biosynthetic process. Acts upstream of or within T cell activation; positive regulation of cytokine production; and regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation. Located in plasma membrane. Is expressed in several structures, including alimentary system; central nervous system; genitourinary system; integumental system; and sensory organ. Human ortholog(s) of this gene implicated in hepatitis C and primary immunodeficiency disease. Orthologous to human IFNAR1 (interferon alpha and beta receptor subunit 1).
Type: protein-coding
RefSeq Status: VALIDATED
Previously known as: CD118; I; If; Ifar; IFN-alpha/beta receptor 1; IFN-alpha/betaR; IFN-R-1; Ifnar; Ifrc; INF-a receptor; Infar; interferon alpha/beta receptor 1; interferon-alpha/beta receptor 1; type I interferon receptor 1
RGD Orthologs
Human
Rat
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Orthologs
More Info more info ...
Latest Assembly: GRCm39 - Mouse Genome Assembly GRCm39
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm391691,281,016 - 91,307,411 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl1691,282,126 - 91,304,329 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm381691,485,032 - 91,510,523 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,238 - 91,507,441 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv371691,485,460 - 91,510,768 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv361691,374,108 - 91,396,296 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera1692,562,831 - 92,587,086 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map16C3.3NCBI
cM Map1652.98NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Molecular Pathway Annotations     Click to see Annotation Detail View
Phenotype Annotations     Click to see Annotation Detail View

Mammalian Phenotype
abnormal blood homeostasis  (IAGP)
abnormal CD8-positive, alpha-beta T cell physiology  (IAGP)
abnormal cytokine level  (IAGP)
abnormal cytokine secretion  (IAGP)
abnormal dendritic cell physiology  (IAGP)
abnormal enzyme/coenzyme activity  (IAGP)
abnormal gait  (IAGP)
abnormal immunoglobulin level  (IAGP)
abnormal inflammatory response  (IAGP)
abnormal interferon-gamma secretion  (IAGP)
abnormal leukocyte migration  (IAGP)
abnormal lymphopoiesis  (IAGP)
abnormal macrophage morphology  (IAGP)
abnormal macrophage physiology  (IAGP)
abnormal mononuclear phagocyte morphology  (IAGP)
abnormal neuron physiology  (IAGP)
abnormal NK cell physiology  (IAGP)
abnormal osteoclast morphology  (IAGP)
abnormal response to infection  (IAGP)
abnormal Sertoli cell phagocytosis  (IAGP)
abnormal skin condition  (IAGP)
abnormal spleen morphology  (IAGP)
abnormal susceptibility to infection  (IAGP)
anemia  (IAGP)
astrocytosis  (IAGP)
brain inflammation  (IAGP)
cornea vascularization  (IAGP)
decreased anti-nuclear antigen antibody level  (IAGP)
decreased autoantibody level  (IAGP)
decreased bone mineral density  (IAGP)
decreased fetal size  (IAGP)
decreased IgG level  (IAGP)
decreased IgG1 level  (IAGP)
decreased IgG2a level  (IAGP)
decreased IgG3 level  (IAGP)
decreased IgM level  (IAGP)
decreased interferon-alpha secretion  (IAGP)
decreased interferon-beta secretion  (IAGP)
decreased interleukin-6 secretion  (IAGP)
decreased Ly6C high monocyte number  (IAGP)
decreased NK cell number  (IAGP)
decreased susceptibility to Coronaviridae infection  (IAGP)
decreased susceptibility to Orthomyxoviridae infection  (IAGP)
decreased susceptibility to Orthomyxoviridae infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
decreased susceptibility to systemic lupus erythematosus  (IAGP)
decreased T cell apoptosis  (IAGP)
decreased tumor necrosis factor secretion  (IAGP)
dermatitis  (IAGP)
enlarged lymph nodes  (IAGP)
enlarged spleen  (IAGP)
glomerulonephritis  (IAGP)
growth/size/body region phenotype  (IAGP)
impaired natural killer cell mediated cytotoxicity  (IAGP)
increased anti-double stranded DNA antibody level  (IAGP)
increased anti-nuclear antigen antibody level  (IAGP)
increased autoantibody level  (IAGP)
increased CD4-positive, alpha-beta T cell number  (IAGP)
increased CD8-positive, alpha-beta T cell number  (IAGP)
increased circulating alanine transaminase level  (IAGP)
increased circulating interleukin-10 level  (IAGP)
increased circulating interleukin-12 level  (IAGP)
increased circulating interleukin-18 level  (IAGP)
increased circulating tumor necrosis factor level  (IAGP)
increased IgA level  (IAGP)
increased IgG level  (IAGP)
increased IgG2b level  (IAGP)
increased IgG3 level  (IAGP)
increased IgM level  (IAGP)
increased incidence of induced tumors  (IAGP)
increased incidence of tumors by chemical induction  (IAGP)
increased leukocyte cell number  (IAGP)
increased spleen red pulp amount  (IAGP)
increased spleen weight  (IAGP)
increased susceptibility to Adenoviridae infection  (IEA)
increased susceptibility to bacterial infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased susceptibility to Coronaviridae infection  (IAGP)
increased susceptibility to Coronaviridae infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased susceptibility to Herpesvirales infection  (IAGP)
increased susceptibility to Herpesvirales infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased susceptibility to Orthomyxoviridae infection  (IAGP)
increased susceptibility to Orthomyxoviridae infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased susceptibility to Paramyxoviridae infection  (IAGP)
increased susceptibility to Paramyxoviridae infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased susceptibility to parasitic infection  (IAGP)
increased susceptibility to parasitic infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased susceptibility to Picornaviridae infection  (IAGP)
increased susceptibility to Picornaviridae infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased susceptibility to Poxviridae infection  (IAGP)
increased susceptibility to Riboviria infection  (IAGP)
increased susceptibility to systemic lupus erythematosus  (IAGP)
increased susceptibility to Togaviridae infection  (IAGP)
increased susceptibility to Togaviridae infection induced morbidity/mortality  (IAGP)
increased tumor growth/size  (IAGP)
increased urine protein level  (IAGP)
induced hyperactivity  (IAGP)
joint inflammation  (IAGP)
lethargy  (IAGP)
liver hemorrhage  (IAGP)
lung hemorrhage  (IAGP)
lung inflammation  (IAGP)
meningitis  (IAGP)
perinatal lethality, complete penetrance  (IAGP)
postnatal growth retardation  (IAGP)
pulmonary hyperemia  (IAGP)
rheumatoid arthritis  (IAGP)
salivary gland inflammation  (IAGP)
small lymph nodes  (IAGP)
References

References - curated
# Reference Title Reference Citation
1. IFN-alpha/beta signaling is required for polarization of cytokine responses toward a protective type 1 pattern during experimental cryptococcosis. Biondo C, etal., J Immunol. 2008 Jul 1;181(1):566-73.
2. Mechanism of HCV's resistance to IFN-alpha in cell culture involves expression of functional IFN-alpha receptor 1. Datta S, etal., Virol J. 2011 Jul 14;8(1):351.
3. IRF9 Prevents CD8+ T Cell Exhaustion in an Extrinsic Manner during Acute Lymphocytic Choriomeningitis Virus Infection. Huber M, etal., J Virol. 2017 Oct 27;91(22). pii: JVI.01219-17. doi: 10.1128/JVI.01219-17. Print 2017 Nov 15.
4. Inflammatory monocytes require type I interferon receptor signaling to activate NK cells via IL-18 during a mucosal viral infection. Lee AJ, etal., J Exp Med. 2017 Apr 3;214(4):1153-1167. doi: 10.1084/jem.20160880. Epub 2017 Mar 6.
5. IRF7-dependent type I interferon production induces lethal immune-mediated disease in STAT1 knockout mice infected with lymphocytic choriomeningitis virus. Li W, etal., J Virol. 2014 Jul;88(13):7578-88. doi: 10.1128/JVI.03117-13. Epub 2014 Apr 23.
6. Staphylococcus aureus activates type I IFN signaling in mice and humans through the Xr repeated sequences of protein A. Martin FJ, etal., J Clin Invest. 2009 Jul;119(7):1931-9.
7. MGDs mouse GO annotations MGD data from the GO Consortium
8. MGD IEA MGD IEA
9. KEGG Annotation Import Pipeline Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD
10. A Critical Role for the Type I Interferon Receptor in Virus-Induced Autoimmune Diabetes in Rats. Qaisar N, etal., Diabetes. 2017 Jan;66(1):145-157. doi: 10.2337/db16-0462. Epub 2016 Oct 7.
11. Mouse MP Annotation Import Pipeline RGD automated import pipeline
12. ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations
13. Data Import for Chemical-Gene Interactions RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions
14. Type I interferon signaling regulates Ly6C(hi) monocytes and neutrophils during acute viral pneumonia in mice. Seo SU, etal., PLoS Pathog. 2011 Feb;7(2):e1001304. Epub 2011 Feb 24.
15. Type I IFNs mediate development of postinfluenza bacterial pneumonia in mice. Shahangian A, etal., J Clin Invest. 2009 Jul;119(7):1910-20.
Additional References at PubMed
PMID:1380419   PMID:1533935   PMID:1783381   PMID:2144902   PMID:2153461   PMID:2513475   PMID:3160288   PMID:6154946   PMID:6155698   PMID:6184821   PMID:7479980   PMID:7609046  
PMID:7713924   PMID:7749229   PMID:7759999   PMID:7884863   PMID:7958966   PMID:8009221   PMID:8181059   PMID:8318737   PMID:8496154   PMID:8661709   PMID:8786318   PMID:8889548  
PMID:9104811   PMID:9110990   PMID:9175833   PMID:9244437   PMID:9414161   PMID:9419213   PMID:9525580   PMID:9621024   PMID:9687534   PMID:9696838   PMID:9802982   PMID:10069426  
PMID:10209048   PMID:10233935   PMID:10349636   PMID:10400797   PMID:10441734   PMID:10562320   PMID:10640742   PMID:10666256   PMID:10714556   PMID:10754318   PMID:10756011   PMID:10801979  
PMID:10875919   PMID:10982374   PMID:11034357   PMID:11042159   PMID:11076861   PMID:11114377   PMID:11119576   PMID:11163195   PMID:11217851   PMID:11264360   PMID:11310846   PMID:11369881  
PMID:11390995   PMID:11483767   PMID:11507186   PMID:11559791   PMID:11714812   PMID:11739503   PMID:11745345   PMID:11854363   PMID:11884466   PMID:11932415   PMID:11932417   PMID:11934877  
PMID:11961557   PMID:11964292   PMID:12034028   PMID:12370359   PMID:12391236   PMID:12421964   PMID:12444124   PMID:12444163   PMID:12466851   PMID:12466854   PMID:12466855   PMID:12477932  
PMID:12520002   PMID:12554654   PMID:12584606   PMID:12604309   PMID:12626561   PMID:12642605   PMID:12794114   PMID:12805272   PMID:12872134   PMID:12904583   PMID:12960379   PMID:14502286  
PMID:14532120   PMID:14610273   PMID:14625548   PMID:14662846   PMID:14681479   PMID:14688355   PMID:14706232   PMID:14768061   PMID:14981113   PMID:14990690   PMID:15004277   PMID:15016885  
PMID:15029200   PMID:15047800   PMID:15067057   PMID:15128825   PMID:15265950   PMID:15300247   PMID:15302899   PMID:15302900   PMID:15302901   PMID:15351786   PMID:15356121   PMID:15452235  
PMID:15494163   PMID:15568025   PMID:15611232   PMID:15611291   PMID:15654326   PMID:15657949   PMID:15661915   PMID:15699111   PMID:15723812   PMID:15765122   PMID:15765149   PMID:15767446  
PMID:15782199   PMID:15800576   PMID:15814665   PMID:15843544   PMID:15851485   PMID:15905567   PMID:15905569   PMID:15914553   PMID:15919906   PMID:15951814   PMID:15964802   PMID:15972679  
PMID:16002682   PMID:16051816   PMID:16081792   PMID:16103182   PMID:16116216   PMID:16116224   PMID:16123129   PMID:16129706   PMID:16139798   PMID:16141072   PMID:16141073   PMID:16148142  
PMID:16148148   PMID:16177109   PMID:16177121   PMID:16186160   PMID:16227257   PMID:16237046   PMID:16237096   PMID:16237098   PMID:16254350   PMID:16311601   PMID:16323245   PMID:16413926  
PMID:16455798   PMID:16455962   PMID:16517698   PMID:16525420   PMID:16537611   PMID:16547266   PMID:16547272   PMID:16549598   PMID:16585541   PMID:16602821   PMID:16604192   PMID:16625202  
PMID:16630021   PMID:16639711   PMID:16670325   PMID:16709859   PMID:16715101   PMID:16741252   PMID:16751369   PMID:16760403   PMID:16785492   PMID:16810635   PMID:16868248   PMID:16878177  
PMID:16879257   PMID:16885371   PMID:16920958   PMID:16920966   PMID:16985170   PMID:17005698   PMID:17015750   PMID:17018853   PMID:17027894   PMID:17030789   PMID:17051153   PMID:17066036  
PMID:17082622   PMID:17098395   PMID:17135325   PMID:17151098   PMID:17164250   PMID:17185011   PMID:17190817   PMID:17227820   PMID:17227866   PMID:17229689   PMID:17237394   PMID:17242162  
PMID:17277123   PMID:17277125   PMID:17277142   PMID:17277147   PMID:17312160   PMID:17339421   PMID:17339445   PMID:17360658   PMID:17372008   PMID:17372191   PMID:17389237   PMID:17398124  
PMID:17426143   PMID:17431131   PMID:17452523   PMID:17475783   PMID:17475855   PMID:17475892   PMID:17485512   PMID:17502662   PMID:17506816   PMID:17507470   PMID:17513714   PMID:17513722  
PMID:17513736   PMID:17548519   PMID:17548588   PMID:17579073   PMID:17603494   PMID:17615584   PMID:17635610   PMID:17671179   PMID:17702615   PMID:17785781   PMID:17785847   PMID:17823983  
PMID:17846149   PMID:17928334   PMID:17935177   PMID:17942529   PMID:17950005   PMID:17954566   PMID:17954569   PMID:17968932   PMID:17981792   PMID:18083102   PMID:18086385   PMID:18184798  
PMID:18198209   PMID:18207304   PMID:18223009   PMID:18250422   PMID:18250457   PMID:18282093   PMID:18287559   PMID:18292236   PMID:18322196   PMID:18322213   PMID:18322221   PMID:18339305  
PMID:18354186   PMID:18354215   PMID:18354236   PMID:18362156   PMID:18368052   PMID:18382764   PMID:18390731   PMID:18412159   PMID:18424188   PMID:18453565   PMID:18480244   PMID:18482773  
PMID:18490712   PMID:18490714   PMID:18495762   PMID:18535656   PMID:18562532   PMID:18591384   PMID:18619869   PMID:18641299   PMID:18641348   PMID:18656388   PMID:18663004   PMID:18667505  
PMID:18716002   PMID:18722370   PMID:18787692   PMID:18799577   PMID:18802094   PMID:18824599   PMID:18845149   PMID:18937499   PMID:18978796   PMID:18979509   PMID:19006696   PMID:19009526  
PMID:19039769   PMID:19074283   PMID:19118004   PMID:19121307   PMID:19124753   PMID:19130558   PMID:19154989   PMID:19201883   PMID:19201884   PMID:19201901   PMID:19229247   PMID:19234173  
PMID:19265146   PMID:19319188   PMID:19342641   PMID:19342665   PMID:19357779   PMID:19380790   PMID:19384870   PMID:19406830   PMID:19414755   PMID:19474102   PMID:19483695   PMID:19494276  
PMID:19540914   PMID:19544312   PMID:19553532   PMID:19576795   PMID:19581626   PMID:19587008   PMID:19587448   PMID:19620292   PMID:19620305   PMID:19635913   PMID:19637226   PMID:19687227  
PMID:19717517   PMID:19733096   PMID:19798431   PMID:19805514   PMID:19808647   PMID:19812195   PMID:19828630   PMID:19850889   PMID:19864599   PMID:19877012   PMID:19877013   PMID:19901080  
PMID:19933871   PMID:19939913   PMID:19948722   PMID:19949066   PMID:19960021   PMID:20007534   PMID:20037154   PMID:20042501   PMID:20065291   PMID:20067542   PMID:20071504   PMID:20079668  
PMID:20080755   PMID:20118405   PMID:20123960   PMID:20123961   PMID:20164263   PMID:20176744   PMID:20181884   PMID:20200244   PMID:20200270   PMID:20221252   PMID:20360404   PMID:20386712  
PMID:20395428   PMID:20400700   PMID:20422028   PMID:20427775   PMID:20436908   PMID:20457908   PMID:20465570   PMID:20483775   PMID:20484025   PMID:20513754   PMID:20535209   PMID:20562259  
PMID:20566717   PMID:20566831   PMID:20573823   PMID:20584765   PMID:20585572   PMID:20592088   PMID:20592282   PMID:20605974   PMID:20610651   PMID:20637658   PMID:20637660   PMID:20660347  
PMID:20661430   PMID:20674859   PMID:20699362   PMID:20706988   PMID:20713887   PMID:20720209   PMID:20736166   PMID:20821729   PMID:20861272   PMID:20870934   PMID:20876348   PMID:20926559  
PMID:20943997   PMID:20974942   PMID:20978541   PMID:21041726   PMID:21085181   PMID:21098219   PMID:21115688   PMID:21147921   PMID:21160043   PMID:21178015   PMID:21204785   PMID:21255009  
PMID:21266535   PMID:21267068   PMID:21282509   PMID:21333555   PMID:21349431   PMID:21365015   PMID:21379341   PMID:21383240   PMID:21402764   PMID:21408089   PMID:21446050   PMID:21458307  
PMID:21469086   PMID:21469099   PMID:21471447   PMID:21477795   PMID:21515676   PMID:21518880   PMID:21527253   PMID:21540188   PMID:21592863   PMID:21606371   PMID:21622562   PMID:21674481  
PMID:21677750   PMID:21690321   PMID:21695243   PMID:21699790   PMID:21712396   PMID:21746813   PMID:21757742   PMID:21787891   PMID:21788443   PMID:21804557   PMID:21810605   PMID:21813451  
PMID:21816907   PMID:21830209   PMID:21832166   PMID:21832278   PMID:21841308   PMID:21873635   PMID:21900395   PMID:21902795   PMID:21915277   PMID:21918184   PMID:21931625   PMID:21937652  
PMID:21949815   PMID:21963602   PMID:22022510   PMID:22036947   PMID:22042864   PMID:22044243   PMID:22048770   PMID:22072781   PMID:22114338   PMID:22130542   PMID:22131327   PMID:22138643  
PMID:22156349   PMID:22156592   PMID:22163016   PMID:22206014   PMID:22212606   PMID:22215738   PMID:22227568   PMID:22238311   PMID:22241991   PMID:22250092   PMID:22251703   PMID:22284419  
PMID:22308317   PMID:22308473   PMID:22315415   PMID:22327071   PMID:22379089   PMID:22396045   PMID:22412192   PMID:22419801   PMID:22422888   PMID:22474018   PMID:22474038   PMID:22474394  
PMID:22479645   PMID:22490865   PMID:22504642   PMID:22508860   PMID:22547696   PMID:22555457   PMID:22566567   PMID:22615570   PMID:22622426   PMID:22626807   PMID:22636319   PMID:22672212  
PMID:22706089   PMID:22711893   PMID:22719255   PMID:22761313   PMID:22786773   PMID:22792298   PMID:22802351   PMID:22815273   PMID:22815848   PMID:22821964   PMID:22840842   PMID:22844479  
PMID:22851707   PMID:22875973   PMID:22893686   PMID:22896628   PMID:22904308   PMID:22908290   PMID:22911155   PMID:22933295   PMID:22933629   PMID:22972924   PMID:22973027   PMID:22980983  
PMID:22982991   PMID:23023393   PMID:23035219   PMID:23071286   PMID:23100513   PMID:23125414   PMID:23129613   PMID:23170251   PMID:23175700   PMID:23213237   PMID:23236145   PMID:23260194  
PMID:23273843   PMID:23284054   PMID:23300459   PMID:23307811   PMID:23335246   PMID:23337807   PMID:23337808   PMID:23352234   PMID:23354485   PMID:23365081   PMID:23374343   PMID:23382563  
PMID:23408968   PMID:23412092   PMID:23418322   PMID:23440417   PMID:23449591   PMID:23467932   PMID:23487027   PMID:23499490   PMID:23509366   PMID:23516607   PMID:23527208   PMID:23533183  
PMID:23544010   PMID:23554175   PMID:23580528   PMID:23585679   PMID:23610140   PMID:23623383   PMID:23653476   PMID:23656738   PMID:23657854   PMID:23659714   PMID:23737750   PMID:23770228  
PMID:23771666   PMID:23772034   PMID:23780878   PMID:23785507   PMID:23791647   PMID:23823318   PMID:23840314   PMID:23840854   PMID:23853595   PMID:23863621   PMID:23872679   PMID:23874199  
PMID:23887873   PMID:23903655   PMID:23903830   PMID:23911821   PMID:23913971   PMID:23935197   PMID:23960239   PMID:23972988   PMID:23975863   PMID:23976880   PMID:23980205   PMID:23986582  
PMID:23990781   PMID:23991083   PMID:23997220   PMID:24014876   PMID:24081947   PMID:24105635   PMID:24136200   PMID:24145511   PMID:24145513   PMID:24173228   PMID:24204252   PMID:24216477  
PMID:24244159   PMID:24257618   PMID:24262201   PMID:24278020   PMID:24284323   PMID:24304616   PMID:24307589   PMID:24307739   PMID:24334027   PMID:24335291   PMID:24335529   PMID:24353186  
PMID:24362933   PMID:24367005   PMID:24367096   PMID:24375615   PMID:24376264   PMID:24391507   PMID:24408967   PMID:24409099   PMID:24425713   PMID:24429359   PMID:24434209   PMID:24435166  
PMID:24453359   PMID:24474779   PMID:24478444   PMID:24480543   PMID:24489947   PMID:24493802   PMID:24498220   PMID:24523322   PMID:24530055   PMID:24531377   PMID:24532583   PMID:24555997  
PMID:24574394   PMID:24574405   PMID:24589924   PMID:24598055   PMID:24599590   PMID:24604832   PMID:24631156   PMID:24637670   PMID:24648449   PMID:24688025   PMID:24696235   PMID:24711580  
PMID:24741106   PMID:24743949   PMID:24747678   PMID:24752302   PMID:24789914   PMID:24813850   PMID:24844667   PMID:24889626   PMID:24903089   PMID:24909887   PMID:24931122   PMID:24991014  
PMID:25008915   PMID:25024400   PMID:25073790   PMID:25100843   PMID:25104388   PMID:25122777   PMID:25122792   PMID:25238095   PMID:25253340   PMID:25297874   PMID:25319247   PMID:25320312  
PMID:25333658   PMID:25344724   PMID:25344738   PMID:25392217   PMID:25395663   PMID:25407417   PMID:25409145   PMID:25419628   PMID:25428866   PMID:25456137   PMID:25474197   PMID:25481711  
PMID:25482432   PMID:25525875   PMID:25548216   PMID:25548220   PMID:25569138   PMID:25572843   PMID:25600358   PMID:25604426   PMID:25639361   PMID:25642773   PMID:25653430   PMID:25653440  
PMID:25669994   PMID:25673724   PMID:25692705   PMID:25707806   PMID:25716322   PMID:25719445   PMID:25732191   PMID:25756182   PMID:25774715   PMID:25774716   PMID:25795758   PMID:25843711  
PMID:25849543   PMID:25855746   PMID:25885435   PMID:25896511   PMID:25900439   PMID:25901316   PMID:25902143   PMID:25911755   PMID:25918247   PMID:25921537   PMID:25938762   PMID:25943199  
PMID:25953241   PMID:25954804   PMID:25974304   PMID:25987506   PMID:26019270   PMID:26059829   PMID:26066745   PMID:26077719   PMID:26098211   PMID:26114879   PMID:26134179   PMID:26212250  
PMID:26232452   PMID:26241055   PMID:26259586   PMID:26263500   PMID:26292317   PMID:26311886   PMID:26320999   PMID:26355094   PMID:26407316   PMID:26422247   PMID:26451483   PMID:26457795  
PMID:26461455   PMID:26468541   PMID:26484769   PMID:26519535   PMID:26549455   PMID:26553503   PMID:26562011   PMID:26588782   PMID:26609155   PMID:26612263   PMID:26618925   PMID:26621722  
PMID:26621862   PMID:26627716   PMID:26633895   PMID:26634654   PMID:26670386   PMID:26682986   PMID:26720279   PMID:26739051   PMID:26747000   PMID:26755706   PMID:26787880   PMID:26811327  
PMID:26824662   PMID:26860770   PMID:26867177   PMID:26880763   PMID:26892235   PMID:26912623   PMID:26912904   PMID:26918359   PMID:26928844   PMID:26944200   PMID:26984726   PMID:26984727  
PMID:26992431   PMID:27022155   PMID:27022620   PMID:27043411   PMID:27052162   PMID:27064756   PMID:27069113   PMID:27075414   PMID:27096319   PMID:27128797   PMID:27129230   PMID:27137488  
PMID:27141827   PMID:27143388   PMID:27149521   PMID:27149619   PMID:27151946   PMID:27152708   PMID:27158906   PMID:27160900   PMID:27170753   PMID:27170759   PMID:27180225   PMID:27226090  
PMID:27264175   PMID:27264176   PMID:27267461   PMID:27292635   PMID:27295349   PMID:27310141   PMID:27312374   PMID:27327515   PMID:27328989   PMID:27332732   PMID:27369778   PMID:27391363  
PMID:27400725   PMID:27404846   PMID:27440896   PMID:27459510   PMID:27466421   PMID:27471270   PMID:27477283   PMID:27512060   PMID:27533013   PMID:27565347   PMID:27573814   PMID:27610573  
PMID:27612415   PMID:27621476   PMID:27622045   PMID:27647832   PMID:27653690   PMID:27663672   PMID:27670299   PMID:27677156   PMID:27681121   PMID:27683179   PMID:27701741   PMID:27704310  
PMID:27709605   PMID:27716507   PMID:27740718   PMID:27756058   PMID:27760315   PMID:27793594   PMID:27795415   PMID:27808089   PMID:27812214   PMID:27841872   PMID:27872905   PMID:27884405  
PMID:27912060   PMID:27917412   PMID:27927647   PMID:27974562   PMID:27974667   PMID:27980033   PMID:27995614   PMID:28009279   PMID:28018990   PMID:28087453   PMID:28099860   PMID:28100675  
PMID:28111081   PMID:28134626   PMID:28196594   PMID:28199846   PMID:28222903   PMID:28240606   PMID:28248314   PMID:28250124   PMID:28264970   PMID:28273457   PMID:28289093   PMID:28314593  
PMID:28337202   PMID:28340348   PMID:28356390   PMID:28362871   PMID:28373582   PMID:28380351   PMID:28396343   PMID:28400473   PMID:28402862   PMID:28415995   PMID:28416600   PMID:28424327  
PMID:28432083   PMID:28436428   PMID:28439019   PMID:28468974   PMID:28475892   PMID:28484023   PMID:28503979   PMID:28514692   PMID:28525755   PMID:28525756   PMID:28567448   PMID:28584007  
PMID:28589934   PMID:28598415   PMID:28614719   PMID:28615211   PMID:28615418   PMID:28619948   PMID:28622511   PMID:28630094   PMID:28634194   PMID:28636595   PMID:28636955   PMID:28637751  
PMID:28647375   PMID:28659486   PMID:28678581   PMID:28708997   PMID:28716804   PMID:28723569   PMID:28733313   PMID:28742068   PMID:28747383   PMID:28753426   PMID:28775298   PMID:28836263  
PMID:28846084   PMID:28874687   PMID:28893603   PMID:28894449   PMID:28904198   PMID:28910635   PMID:28921595   PMID:28924035   PMID:28930658   PMID:28959042   PMID:28966054   PMID:28978474  
PMID:29030458   PMID:29055005   PMID:29055012   PMID:29062886   PMID:29070614   PMID:29117563   PMID:29117564   PMID:29127186   PMID:29176737   PMID:29190678   PMID:29203515   PMID:29203528  
PMID:29203786   PMID:29212904   PMID:29230002   PMID:29263859   PMID:29305462   PMID:29317641   PMID:29321274   PMID:29324904   PMID:29330321   PMID:29334492   PMID:29352265   PMID:29364865  
PMID:29367469   PMID:29378173   PMID:29436412   PMID:29445153   PMID:29459437   PMID:29472271   PMID:29507355   PMID:29531213   PMID:29546878   PMID:29558366   PMID:29562174   PMID:29576451  
PMID:29588348   PMID:29590614   PMID:29632368   PMID:29651984   PMID:29669251   PMID:29719256   PMID:29746837   PMID:29752314   PMID:29753658   PMID:29753791   PMID:29786074   PMID:29791904  
PMID:29799838   PMID:29805094   PMID:29844122   PMID:29884703   PMID:29899553   PMID:29915078   PMID:29925850   PMID:29927940   PMID:29972777   PMID:29976926   PMID:29996101   PMID:29997629  
PMID:30002446   PMID:30004580   PMID:30018108   PMID:30021146   PMID:30053014   PMID:30063220   PMID:30067973   PMID:30084830   PMID:30100266   PMID:30111869   PMID:30131424   PMID:30134157  
PMID:30143632   PMID:30199752   PMID:30201994   PMID:30202015   PMID:30224374   PMID:30245008   PMID:30266768   PMID:30266866   PMID:30282022   PMID:30282750   PMID:30297531   PMID:30321322  
PMID:30347820   PMID:30348900   PMID:30392829   PMID:30392830   PMID:30392956   PMID:30403995   PMID:30429338   PMID:30451651   PMID:30463976   PMID:30473701   PMID:30505302   PMID:30511641  
PMID:30517866   PMID:30523277   PMID:30540940   PMID:30573745   PMID:30575728   PMID:30587103   PMID:30587590   PMID:30591559   PMID:30595553   PMID:30618602   PMID:30629917   PMID:30680794  
PMID:30699352   PMID:30723095   PMID:30730897   PMID:30758056   PMID:30759384   PMID:30772497   PMID:30783658   PMID:30787296   PMID:30796216   PMID:30811982   PMID:30811989   PMID:30814285  
PMID:30827680   PMID:30827860   PMID:30830879   PMID:30833347   PMID:30884311   PMID:30886417   PMID:30886418   PMID:30890658   PMID:30902831   PMID:30917523   PMID:30923196   PMID:30944222  
PMID:30962164   PMID:30973865   PMID:30988430   PMID:31019048   PMID:31024525   PMID:31045320   PMID:31053626   PMID:31097261   PMID:31097594   PMID:31103381   PMID:31110314   PMID:31121939  
PMID:31130511   PMID:31141689   PMID:31143178   PMID:31213650   PMID:31216479   PMID:31235953   PMID:31242184   PMID:31243154   PMID:31255879   PMID:31269444   PMID:31293597   PMID:31296770  
PMID:31309159   PMID:31329638   PMID:31337717   PMID:31358656   PMID:31358982   PMID:31366715   PMID:31377243   PMID:31379867   PMID:31385572   PMID:31434732   PMID:31444264   PMID:31477704  
PMID:31484831   PMID:31519886   PMID:31546590   PMID:31548683   PMID:31554802   PMID:31577946   PMID:31578081   PMID:31601808   PMID:31603920   PMID:31607511   PMID:31611644   PMID:31619554  
PMID:31619669   PMID:31619733   PMID:31623059   PMID:31644426   PMID:31653894   PMID:31665636   PMID:31668877   PMID:31694939   PMID:31694960   PMID:31712393   PMID:31714898   PMID:31719183  
PMID:31730616   PMID:31732720   PMID:31742873   PMID:31775040   PMID:31784108   PMID:31790513   PMID:31801066   PMID:31825834   PMID:31825972   PMID:31826984   PMID:31831806   PMID:31877196  
PMID:31883840   PMID:31896593   PMID:31900342   PMID:31937766   PMID:31959883   PMID:31968247   PMID:31972159   PMID:31980536   PMID:32035058   PMID:32044112   PMID:32051274   PMID:32053518  
PMID:32057291   PMID:32066949   PMID:32075740   PMID:32075762   PMID:32101732   PMID:32142632   PMID:32150572   PMID:32152071   PMID:32187187   PMID:32187540   PMID:32204792   PMID:32209467  
PMID:32213589   PMID:32236527   PMID:32242005   PMID:32251280   PMID:32266378   PMID:32269339   PMID:32270034   PMID:32284333   PMID:32314955   PMID:32343675   PMID:32348763   PMID:32373120  
PMID:32392463   PMID:32404939   PMID:32428860   PMID:32433975   PMID:32441445   PMID:32444775   PMID:32454024   PMID:32455700   PMID:32457247   PMID:32460031   PMID:32485165   PMID:32488081  
PMID:32500632   PMID:32514064   PMID:32516576   PMID:32522837   PMID:32527928   PMID:32544190   PMID:32553163   PMID:32553167   PMID:32553273   PMID:32560903   PMID:32561755   PMID:32574690  
PMID:32581235   PMID:32629384   PMID:32640258   PMID:32641828   PMID:32643603   PMID:32661363   PMID:32663191   PMID:32668198   PMID:32690660   PMID:32690888   PMID:32726802   PMID:32727036  
PMID:32727588   PMID:32732870   PMID:32741537   PMID:32750141   PMID:32807917   PMID:32817517   PMID:32822583   PMID:32840576   PMID:32843067   PMID:32870819   PMID:32872451   PMID:32886065  
PMID:32905761   PMID:32907933   PMID:32929218   PMID:32999034   PMID:33020211   PMID:33040466   PMID:33042133   PMID:33073500   PMID:33087405   PMID:33101303   PMID:33101313   PMID:33125891  
PMID:33125892   PMID:33126536   PMID:33147451   PMID:33149141   PMID:33165593   PMID:33173007   PMID:33183319   PMID:33203860   PMID:33208448   PMID:33212011   PMID:33241604   PMID:33257540  
PMID:33261178   PMID:33278357   PMID:33298616   PMID:33315931   PMID:33322152   PMID:33326500   PMID:33326766   PMID:33326784   PMID:33338425   PMID:33354817   PMID:33357409   PMID:33373293  
PMID:33388094   PMID:33410731   PMID:33437899   PMID:33442058   PMID:33469015   PMID:33479228   PMID:33488628   PMID:33510029   PMID:33510463   PMID:33513208   PMID:33519804   PMID:33523878  
PMID:33534867   PMID:33548597   PMID:33584680   PMID:33593970   PMID:33615517   PMID:33649580   PMID:33684179   PMID:33688034   PMID:33691097   PMID:33705489   PMID:33717842   PMID:33731338  
PMID:33741967   PMID:33753025   PMID:33771858   PMID:33773107   PMID:33788263   PMID:33895286   PMID:33912160   PMID:33916486   PMID:33976143   PMID:33995391   PMID:34013842   PMID:34015056  
PMID:34020328   PMID:34044061   PMID:34047696   PMID:34051146   PMID:34077724   PMID:34077751   PMID:34130738   PMID:34151776   PMID:34166614   PMID:34183650   PMID:34197340   PMID:34211367  
PMID:34215755   PMID:34256015   PMID:34267374   PMID:34282144   PMID:34310650   PMID:34315904   PMID:34343497   PMID:34353229   PMID:34398180   PMID:34405956   PMID:34410903   PMID:34423779  
PMID:34428519   PMID:34461359   PMID:34473814   PMID:34495698   PMID:34507063   PMID:34552587   PMID:34556874   PMID:34613772   PMID:34620855   PMID:34625556   PMID:34642183   PMID:34659202  
PMID:34678150   PMID:34694641   PMID:34696439   PMID:34707113   PMID:34709350   PMID:34730391   PMID:34731629   PMID:34757384   PMID:34764281   PMID:34798063   PMID:34800368   PMID:34847356  
PMID:34852237   PMID:34860431   PMID:34878914   PMID:34938294   PMID:34960621   PMID:34963055   PMID:34965963   PMID:35028606   PMID:35032866   PMID:35037428   PMID:35039441   PMID:35055071  
PMID:35119362   PMID:35143611   PMID:35148827   PMID:35148840   PMID:35168003   PMID:35173036   PMID:35245345   PMID:35351885   PMID:35379362   PMID:35417681   PMID:35443157   PMID:35464475  
PMID:35476975   PMID:35524140   PMID:35545033   PMID:35568036   PMID:35584177   PMID:35584393   PMID:35604122   PMID:35613599   PMID:35615356   PMID:35637402   PMID:35640521   PMID:35672321  
PMID:35696583   PMID:35699446   PMID:35702569   PMID:35757750   PMID:35833131   PMID:35834347   PMID:35858541   PMID:35863604   PMID:35864246   PMID:35878016   PMID:35905717   PMID:35911733  
PMID:35931226   PMID:35992159   PMID:35993365   PMID:36016290   PMID:36027915   PMID:36034693   PMID:36038291   PMID:36073546   PMID:36075961   PMID:36106692   PMID:36119026   PMID:36150390  
PMID:36178806   PMID:36198789   PMID:36227523   PMID:36229563   PMID:36264674   PMID:36266311   PMID:36281643   PMID:36291750   PMID:36323311   PMID:36330506   PMID:36351394   PMID:36384131  
PMID:36395068   PMID:36417857   PMID:36417885   PMID:36435827   PMID:36447031   PMID:36458995   PMID:36462502   PMID:36515659   PMID:36571986   PMID:36583876   PMID:36611846   PMID:36717247  
PMID:36719379   PMID:36736322   PMID:36736893   PMID:36750575   PMID:36795561   PMID:36802427   PMID:36804959   PMID:36809763   PMID:36897927   PMID:36917954   PMID:36928642   PMID:36952341  
PMID:37005424   PMID:37013819   PMID:37037810   PMID:37067290   PMID:37068076   PMID:37083328   PMID:37095396   PMID:37115698   PMID:37126986   PMID:37130522   PMID:37148871   PMID:37149684  
PMID:37149862   PMID:37153622   PMID:37182738   PMID:37188813   PMID:37210392   PMID:37243595   PMID:37252952   PMID:37258670   PMID:37279110   PMID:37306593   PMID:37316487   PMID:37335136  
PMID:37341495   PMID:37352855   PMID:37392737   PMID:37406138   PMID:37414907   PMID:37460023   PMID:37478855   PMID:37478856   PMID:37490346   PMID:37523265   PMID:37537212   PMID:37540755  
PMID:37566453   PMID:37566679   PMID:37587335   PMID:37596685   PMID:37603014   PMID:37640708   PMID:37720210   PMID:37725438   PMID:37743411   PMID:37749080   PMID:37762443   PMID:37830597  
PMID:37848036   PMID:37849026   PMID:37863068   PMID:37865045   PMID:37874678   PMID:37876532   PMID:38029747   PMID:38053332   PMID:38085267   PMID:38086794   PMID:38096954   PMID:38136633  
PMID:38141610   PMID:38193729   PMID:38232703   PMID:38274806   PMID:38295788   PMID:38301651   PMID:38315735   PMID:38345473   PMID:38355793   PMID:38359115   PMID:38361945   PMID:38375579  
PMID:38396742   PMID:38408184   PMID:38409240   PMID:38413714   PMID:38424108   PMID:38428422   PMID:38490196   PMID:38538785   PMID:38542150   PMID:38613784   PMID:38618959   PMID:38625924  
PMID:38697107   PMID:38743761   PMID:38755254   PMID:38770087   PMID:38782933   PMID:38788712   PMID:38833371   PMID:38858387   PMID:38858399   PMID:38861331   PMID:38932154   PMID:38980903  
PMID:39002130   PMID:39019005   PMID:39042188   PMID:39052479   PMID:39095477   PMID:39120972   PMID:39147753   PMID:39159381   PMID:39168127   PMID:39196893   PMID:39196958   PMID:39198639  
PMID:39214086   PMID:39286510  


Genomics

Comparative Map Data
Ifnar1
(Mus musculus - house mouse)
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm391691,281,016 - 91,307,411 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl1691,282,126 - 91,304,329 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm381691,485,032 - 91,510,523 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,238 - 91,507,441 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv371691,485,460 - 91,510,768 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv361691,374,108 - 91,396,296 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera1692,562,831 - 92,587,086 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map16C3.3NCBI
cM Map1652.98NCBI
IFNAR1
(Homo sapiens - human)
Human AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCh382133,324,395 - 33,359,864 (+)NCBIGRCh38GRCh38hg38GRCh38
GRCh38.p14 Ensembl2133,324,387 - 33,359,864 (+)EnsemblGRCh38hg38GRCh38
GRCh372134,696,700 - 34,732,170 (+)NCBIGRCh37GRCh37hg19GRCh37
Build 362133,619,084 - 33,653,999 (+)NCBINCBI36Build 36hg18NCBI36
Build 342133,619,083 - 33,653,996NCBI
Celera2119,887,300 - 19,922,214 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map21q22.11ENTREZGENE
HuRef2120,166,044 - 20,200,958 (+)NCBIHuRef
CHM1_12134,259,582 - 34,294,500 (+)NCBICHM1_1
T2T-CHM13v2.02131,696,639 - 31,732,109 (+)NCBIT2T-CHM13v2.0
Ifnar1
(Rattus norvegicus - Norway rat)
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCr81144,211,769 - 44,238,206 (+)NCBIGRCr8
mRatBN7.21130,725,774 - 30,752,227 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl1130,725,790 - 30,749,979 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
UTH_Rnor_SHR_Utx1139,420,142 - 39,442,802 (+)NCBIRnor_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.01132,091,572 - 32,114,232 (+)NCBIRnor_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.01131,257,245 - 31,279,947 (+)NCBIRnor_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
Rnor_6.01131,640,407 - 31,666,839 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl1131,640,407 - 31,664,061 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.01135,248,575 - 35,272,235 (+)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.41131,454,789 - 31,478,449 (+)NCBIRGSC3.4RGSC_v3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.11131,494,121 - 31,518,864 (+)NCBI
Celera1130,393,241 - 30,416,960 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map11q11NCBI
Ifnar1
(Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla)
Chinchilla AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChiLan1.0 EnsemblNW_00495540732,730,953 - 32,754,651 (+)EnsemblChiLan1.0
ChiLan1.0NW_00495540732,730,973 - 32,755,404 (+)NCBIChiLan1.0ChiLan1.0
IFNAR1
(Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee)
Bonobo AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
NHGRI_mPanPan1-v22229,433,955 - 29,471,654 (+)NCBINHGRI_mPanPan1-v2
NHGRI_mPanPan12124,293,349 - 24,331,230 (+)NCBINHGRI_mPanPan1
Mhudiblu_PPA_v02119,683,496 - 19,719,034 (+)NCBIMhudiblu_PPA_v0Mhudiblu_PPA_v0panPan3
PanPan1.12133,058,410 - 33,093,824 (+)NCBIpanpan1.1PanPan1.1panPan2
PanPan1.1 Ensembl2133,058,396 - 33,093,824 (+)Ensemblpanpan1.1panPan2
IFNAR1
(Canis lupus familiaris - dog)
Dog AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
CanFam3.13128,854,765 - 28,876,399 (+)NCBICanFam3.1CanFam3.1canFam3CanFam3.1
Dog10K_Boxer_Tasha3127,950,128 - 27,972,344 (+)NCBIDog10K_Boxer_Tasha
ROS_Cfam_1.03128,160,372 - 28,182,033 (+)NCBIROS_Cfam_1.0
ROS_Cfam_1.0 Ensembl3128,160,333 - 28,195,529 (+)EnsemblROS_Cfam_1.0 Ensembl
UMICH_Zoey_3.13128,027,680 - 28,049,300 (+)NCBIUMICH_Zoey_3.1
UNSW_CanFamBas_1.03128,037,690 - 28,059,324 (+)NCBIUNSW_CanFamBas_1.0
UU_Cfam_GSD_1.03128,540,987 - 28,562,614 (+)NCBIUU_Cfam_GSD_1.0
Ifnar1
(Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel)
Squirrel AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HiC_Itri_2NW_02440497128,493,890 - 28,514,014 (+)NCBIHiC_Itri_2
SpeTri2.0 EnsemblNW_0049365008,953,049 - 8,973,978 (-)EnsemblSpeTri2.0SpeTri2.0 Ensembl
SpeTri2.0NW_0049365008,953,809 - 8,975,261 (-)NCBISpeTri2.0SpeTri2.0SpeTri2.0
IFNAR1
(Sus scrofa - pig)
Pig AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
Sscrofa11.1 Ensembl13196,925,734 - 196,952,239 (+)EnsemblSscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
Sscrofa11.113196,925,731 - 196,951,398 (+)NCBISscrofa11.1Sscrofa11.1susScr11Sscrofa11.1
IFNAR1
(Chlorocebus sabaeus - green monkey)
Green Monkey AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
ChlSab1.1258,824,600 - 58,854,519 (-)NCBIChlSab1.1ChlSab1.1chlSab2
ChlSab1.1 Ensembl258,825,916 - 58,854,568 (-)EnsemblChlSab1.1ChlSab1.1 EnsemblchlSab2
Vero_WHO_p1.0NW_0236660711,327,549 - 1,360,671 (-)NCBIVero_WHO_p1.0Vero_WHO_p1.0
Ifnar1
(Heterocephalus glaber - naked mole-rat)
Naked Mole-Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
HetGla_female_1.0 EnsemblNW_00462474521,546,007 - 21,572,776 (+)EnsemblHetGla_female_1.0HetGla_female_1.0 EnsemblhetGla2
HetGla 1.0NW_00462474521,545,846 - 21,569,719 (+)NCBIHetGla_female_1.0HetGla 1.0hetGla2

Variants

.
Variants in Ifnar1
747 total Variants
miRNA Target Status

Predicted Target Of
Summary Value
Count of predictions:1744
Count of miRNA genes:560
Interacting mature miRNAs:649
Transcripts:ENSMUST00000023689, ENSMUST00000117748, ENSMUST00000123196, ENSMUST00000129878, ENSMUST00000145008
Prediction methods:Miranda, Rnahybrid, Targetscan
Result types:miRGate_prediction

The detailed report is available here: Full Report CSV TAB Printer

miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/).
For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here.


QTLs in Region (GRCm39)
The following QTLs overlap with this region.    Full Report CSV TAB Printer Gviewer
RGD IDSymbolNameLODP ValueTraitSub TraitChrStartStopSpecies
1302194Pgia10_mproteoglycan induced arthritis 10 (mouse)Not determined166860072298008968Mouse
1300928Etia_methanol induced activation (mouse)Not determined166331390797314016Mouse
1558740Bpq9_mblood pressure QTL 9 (mouse)Not determined166332733697327472Mouse
1302096Aod1a_mautoimmune ovarian dysgenesis 1a (mouse)Not determined163544664392573008Mouse
4141113Tgq28_mtriglyceride QTL 28 (mouse)Not determined6298664696986646Mouse
1301125Sluc27_msusceptibility to lung cancer 27 (mouse)Not determined166160864495608764Mouse
4142262Lmr18_mleishmaniasis resistance 18 (mouse)Not determined166912761198008968Mouse
1301032Tauph_mtau phosphorylation (mouse)Not determined166907613298008968Mouse
1301598Renf2_mrenal failure 2 (mouse)Not determined167038025298008968Mouse
11049573Lmr18b_mleishmaniasis resistance 18b (mouse)166912761198008968Mouse
11522753Cocia19_mcocaine-induced activity, QTL 19 (mouse)166925448298008968Mouse
11049574Lmr18a_mleishmaniasis resistance 18a (mouse)166912761198008968Mouse

Markers in Region
px-65a8  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map7A1UniSTS
Cytogenetic Map8B1.2UniSTS
Cytogenetic Map1H2.3-H3UniSTS
Cytogenetic Map17B3UniSTS
Cytogenetic Map10D2UniSTS
Cytogenetic Map8D3UniSTS
Cytogenetic Map16C3.3UniSTS
Cytogenetic Map3G1UniSTS
px-72g5  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map7CUniSTS
Cytogenetic Map3H2UniSTS
Cytogenetic Map10D1UniSTS
Cytogenetic Map3G1UniSTS
Cytogenetic Map9E3.1UniSTS
Cytogenetic Map12B1UniSTS
Cytogenetic Map8D3UniSTS
Cytogenetic Map16A3UniSTS
Cytogenetic Map16C3.3UniSTS
Cytogenetic Map3F2.2UniSTS
Cytogenetic Map3A1UniSTS
Cytogenetic Map8B1.2UniSTS
Cytogenetic Map9A1UniSTS
Cytogenetic Map3DUniSTS
Cytogenetic Map3BUniSTS
cM Map1354.0UniSTS
cM Map91.0UniSTS
cM Map316.4UniSTS
Ifnar1  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map16C3.3UniSTS
cM Map1663.2UniSTS
px-24g4  
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceJBrowse
Cytogenetic Map7CUniSTS
Cytogenetic Map8A1.1UniSTS
Cytogenetic Map5A2UniSTS
Cytogenetic Map3H2UniSTS
Cytogenetic Map3BUniSTS
Cytogenetic MapXA2UniSTS
Cytogenetic Map3F2.3UniSTS
Cytogenetic Map3G1UniSTS
Cytogenetic Map10D2UniSTS
Cytogenetic Map9E3.1UniSTS
Cytogenetic Map12B1UniSTS
Cytogenetic Map8D3UniSTS
Cytogenetic Map16A3UniSTS
Cytogenetic Map15A1UniSTS
Cytogenetic Map16C3.3UniSTS
Cytogenetic Map3F2.2UniSTS
Cytogenetic Map3A1UniSTS
Cytogenetic Map10D1UniSTS
Cytogenetic Map14E2.2UniSTS
Cytogenetic Map9A1UniSTS
Cytogenetic Map17E2UniSTS
Cytogenetic Map3DUniSTS
Cytogenetic Map17CUniSTS
cM Map91.0UniSTS
cM Map316.4UniSTS
cM Map1740.0UniSTS
cM Map1354.0UniSTS


Expression

RNA-SEQ Expression


Sequence

Nucleotide Sequences
RefSeq Transcripts NM_010508 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  XR_384931 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
GenBank Nucleotide AC132272 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AC150035 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK040184 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK132431 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK136950 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK141630 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK148246 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK153583 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK157555 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK178895 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK193062 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  AK217677 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  BC043935 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  BC052217 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  BC052429 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  BE955685 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  CA322032 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  CH466602 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  M89641 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U06237 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U06238 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U06239 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U06240 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U06241 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U06242 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles
  U06244 (Get FASTA)   NCBI Sequence Viewer   Search GEO for Microarray Profiles

Ensembl Acc Id: ENSMUST00000023689   ⟹   ENSMUSP00000023689
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,282,126 - 91,304,329 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,238 - 91,507,441 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSMUST00000117748   ⟹   ENSMUSP00000112670
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,282,152 - 91,304,329 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,264 - 91,507,441 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSMUST00000123196   ⟹   ENSMUSP00000119160
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,282,137 - 91,304,325 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,249 - 91,507,437 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSMUST00000129878   ⟹   ENSMUSP00000120945
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,282,224 - 91,293,062 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,336 - 91,496,174 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSMUST00000145008
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,282,165 - 91,288,677 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,277 - 91,491,789 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSMUST00000231604
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,289,537 - 91,296,368 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,492,649 - 91,499,480 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSMUST00000232453   ⟹   ENSMUSP00000156150
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,302,192 - 91,303,554 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,505,304 - 91,506,666 (+)Ensembl
Ensembl Acc Id: ENSMUST00000232509   ⟹   ENSMUSP00000156101
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm39 Ensembl1691,282,204 - 91,293,061 (+)Ensembl
GRCm38.p6 Ensembl1691,485,316 - 91,496,173 (+)Ensembl
RefSeq Acc Id: NM_010508   ⟹   NP_034638
RefSeq Status: VALIDATED
Type: CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm391691,282,103 - 91,307,411 (+)NCBI
GRCm381691,485,215 - 91,510,523 (+)NCBI
MGSCv371691,485,460 - 91,510,768 (+)RGD
Celera1692,562,831 - 92,587,086 (+)RGD
cM Map16 ENTREZGENE
Sequence:
RefSeq Acc Id: XR_384931
Type: NON-CODING
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm391691,281,016 - 91,307,411 (+)NCBI
GRCm381691,485,032 - 91,507,438 (+)NCBI
Sequence:
RefSeq Acc Id: NP_034638   ⟸   NM_010508
- Peptide Label: precursor
- UniProtKB: Q80UJ3 (UniProtKB/Swiss-Prot),   P33896 (UniProtKB/Swiss-Prot),   Q3UFX4 (UniProtKB/TrEMBL)
- Sequence:
Ensembl Acc Id: ENSMUSP00000120945   ⟸   ENSMUST00000129878
Ensembl Acc Id: ENSMUSP00000156150   ⟸   ENSMUST00000232453
Ensembl Acc Id: ENSMUSP00000156101   ⟸   ENSMUST00000232509
Ensembl Acc Id: ENSMUSP00000119160   ⟸   ENSMUST00000123196
Ensembl Acc Id: ENSMUSP00000112670   ⟸   ENSMUST00000117748
Ensembl Acc Id: ENSMUSP00000023689   ⟸   ENSMUST00000023689
Protein Structures
Name Modeler Protein Id AA Range Protein Structure
AF-P33896-F1-model_v2 AlphaFold P33896 1-590 view protein structure

Promoters
RGD ID:6827141
Promoter ID:MM_KWN:21697
Type:CpG-Island
SO ACC ID:SO:0000170
Source:MPROMDB
Tissues & Cell Lines:3T3L1_Day0,   3T3L1_Day1,   3T3L1_Day2,   3T3L1_Day3,   3T3L1_Day4,   3T3L1_Day6,   BoneMarrow_0Hour,   BoneMarrow_2Hour,   BoneMarrow_4Hour,   Brain,   ES_Cell,   Kidney,   Liver,   Lung,   MEF_B4,   MEF_B6,   Spleen
Transcripts:NM_010508,   OTTMUST00000067226,   OTTMUST00000067227,   OTTMUST00000085103,   UC007ZXO.1,   UC007ZXP.1
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
MGSCv361691,485,086 - 91,485,707 (+)MPROMDB
RGD ID:13674436
Promoter ID:EPDNEW_M21367
Type:initiation region
Name:Ifnar1_1
Description:Mus musculus interferon receptor 1 , mRNA.
SO ACC ID:SO:0000170
Source:EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/)
Experiment Methods:Single-end sequencing.
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
GRCm381691,485,246 - 91,485,306EPDNEW
RGD ID:6847310
Promoter ID:MM_ACW:21232
Type:Non-CpG
SO ACC ID:SO:0000170
Source:MPROMDB
Tissues & Cell Lines:BoneMarrow_0Hour
Transcripts:IFNAR1.FSEP07
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)Source
MGSCv361691,505,791 - 91,506,291 (+)MPROMDB

Additional Information

Database Acc Id Source(s)
AGR Gene MGI:107658 AgrOrtholog
Ensembl Genes ENSMUSG00000022967 Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Ensembl Transcript ENSMUST00000023689 ENTREZGENE
  ENSMUST00000023689.11 UniProtKB/Swiss-Prot
  ENSMUST00000117748.8 UniProtKB/Swiss-Prot
  ENSMUST00000123196.9 UniProtKB/TrEMBL
  ENSMUST00000129878.2 UniProtKB/TrEMBL
  ENSMUST00000232453.2 UniProtKB/TrEMBL
  ENSMUST00000232509.2 UniProtKB/TrEMBL
Gene3D-CATH 2.60.40.10 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
InterPro FN3_dom UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  FN3_sf UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Ig-like_fold UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Interferon/interleukin_rcp_dom UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Interferon_alpha/beta_rcpt-1 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Type-II_Cytokine-TF_Rcpt UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
KEGG Report mmu:15975 UniProtKB/Swiss-Prot
MGD MGI:107658 ENTREZGENE
NCBI Gene 15975 ENTREZGENE
PANTHER INTERFERON ALPHA/BETA RECEPTOR 1 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  INTERFERON/INTERLEUKIN RECEPTOR UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Pfam Interfer-bind UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
  Tissue_fac UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
PharmGKB IFNAR1 RGD
PhenoGen Ifnar1 PhenoGen
PIRSF IFN_alpha/beta_recept-1 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
PROSITE FN3 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
SMART FN3 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
Superfamily-SCOP SSF49265 UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL
UniProt A0A338P6T9_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  A0A338P6X7_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  A0A384DVB8_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  A0A5P8D1R0_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  E9PWM1_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  INAR1_MOUSE UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE
  Q3U5G8_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
  Q3UFX4 ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL
  Q80UJ3 ENTREZGENE
  Q80UR8_MOUSE UniProtKB/TrEMBL
UniProt Secondary Q80UJ3 UniProtKB/Swiss-Prot