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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | congenital disorder of glycosylation type IIf | | ISO | RGD:1322776 | 7240710 | | OMIM | | |
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Imported Disease Annotations - OMIMTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | congenital disorder of glycosylation type IIf | | ISO | RGD:1322776 | 7240710 | | OMIM | | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Rat ISS GO annotations from GOA human gene data--August 2006 | GOA data from the GO Consortium |
3. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
4. | OMIM Disease Annotation Pipeline | OMIM Disease Annotation Pipeline |
5. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
6. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
Slc35a1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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SLC35A1 (Homo sapiens - human) |
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Slc35a1 (Mus musculus - house mouse) |
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Slc35a1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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SLC35A1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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SLC35A1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Slc35a1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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SLC35A1 (Sus scrofa - pig) |
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SLC35A1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Slc35a1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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RH143460 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 3 | 30 | 57 | 41 | 19 | 41 | 1 | 3 | 72 | 35 | 34 | 11 | 1 |
Low | 13 | 7 | 8 | 2 | 7 | 7 | |||||||
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_001107924 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_006237996 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | CH473962 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
FQ213102 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000161 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000011969 ⟹ ENSRNOP00000011969 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000081150 ⟹ ENSRNOP00000071048 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001107924 ⟹ NP_001101394 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
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Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_006237996 ⟹ XP_006238058 | ||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||
Sequence: |
Protein RefSeqs | NP_001101394 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_006238058 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | EDL98597 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001101394 ⟸ NM_001107924 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_006238058 ⟸ XM_006237996 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- UniProtKB: | A0A0G2JZH4 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000011969 ⟸ ENSRNOT00000011969 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000071048 ⟸ ENSRNOT00000081150 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-A0A0G2JZH4-F1-model_v2 | AlphaFold | A0A0G2JZH4 | 1-336 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13693625 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R4144 | ||||||||
Type: | initiation region | ||||||||
Name: | Slc35a1_1 | ||||||||
Description: | solute carrier family 35 member A1 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1311359 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-41654 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000008908 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000011969 | ENTREZGENE |
ENSRNOP00000011969.5 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOP00000071048 | ENTREZGENE | |
ENSRNOP00000071048.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000011969 | ENTREZGENE |
ENSRNOT00000011969.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOT00000081150 | ENTREZGENE | |
ENSRNOT00000081150.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
InterPro | Nuc_sug_transpt | UniProtKB/TrEMBL |
KEGG Report | rno:313139 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | 313139 | ENTREZGENE |
PANTHER | Nuc_sug_transpt | UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | Nuc_sug_transp | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Slc35a1 | PhenoGen |
PIRSF | UDP-gal_transpt | UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | A0A0G2JZH4 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
D3ZZ48_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
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2016-02-25 | Slc35a1 | solute carrier family 35 member A1 | Slc35a1 | solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member A1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-11-20 | Slc35a1 | solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member A1 | Slc35a1 | solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member 1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-04-30 | Slc35a1 | solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member 1 | Slc35a1_predicted | solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member 1 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
2005-01-12 | Slc35a1_predicted | solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member 1 (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |