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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Colorectal Neoplasms | | ISO | RGD:1322398 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:15720808 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Colorectal Neoplasms | | ISO | RGD:1322398 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:15720808 | |
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1. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Halder SK, etal., Cancer Res. 2006 Jun 15;66(12):6156-66. |
3. | Lisinski I, etal., Biochem Biophys Res Commun. 2006 Jun 16;344(4):1179-85. Epub 2006 Apr 21. |
4. | MGD data from the GO Consortium |
5. | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
6. | Pipeline to import Pathway Interaction Database annotations from NCI into RGD |
7. | RGD automated data pipeline |
8. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
9. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PMID:9856985 | PMID:12477932 | PMID:17929853 | PMID:18984161 | PMID:20513430 | PMID:22658674 | PMID:22681889 | PMID:23687415 | PMID:24577865 | PMID:25931508 | PMID:32373981 |
Strap (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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STRAP (Homo sapiens - human) |
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Strap (Mus musculus - house mouse) |
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Strap (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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STRAP (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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STRAP (Canis lupus familiaris - dog) |
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LOC101973836 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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STRAP (Sus scrofa - pig) |
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LOC103218694 (Chlorocebus sabaeus - African green monkey) |
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Strap (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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RH140463 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 3 | 43 | 57 | 41 | 19 | 41 | 8 | 11 | 74 | 35 | 41 | 11 | 8 |
Low | |||||||||||||
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_001011969 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
GenBank Nucleotide | BC083714 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
CH473964 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000151 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000009923 ⟹ ENSRNOP00000009923 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
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RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000074673 ⟹ ENSRNOP00000067434 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001011969 ⟹ NP_001011969 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
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Sequence: |
Protein RefSeqs | NP_001011969 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
GenBank Protein | AAH83714 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EDM01582 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
Q5XIG8 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001011969 ⟸ NM_001011969 |
- UniProtKB: | Q5XIG8 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000009923 ⟸ ENSRNOT00000009923 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000067434 ⟸ ENSRNOT00000074673 |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1311114 | AgrOrtholog |
RGD:6498120 | AgrOrtholog | |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000007134 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
ENSRNOG00000048985 | Ensembl, UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000009923 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
ENSRNOP00000067434 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000009923 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
ENSRNOT00000074673 | UniProtKB/TrEMBL | |
Gene3D-CATH | 2.130.10.10 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
IMAGE_CLONE | IMAGE:7190676 | IMAGE-MGC_LOAD |
InterPro | G-protein_beta_WD-40_rep | UniProtKB/Swiss-Prot |
WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
WD40_repeat | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
WD40_repeat_CS | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
WD40_repeat_dom | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
WD40_repeat_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:297699 | UniProtKB/Swiss-Prot |
MGC_CLONE | MGC:94605 | IMAGE-MGC_LOAD |
NCBI Gene | 297699 | ENTREZGENE |
Pfam | WD40 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Strap | PhenoGen |
PRINTS | GPROTEINBRPT | UniProtKB/Swiss-Prot |
PROSITE | WD_REPEATS_1 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
WD_REPEATS_2 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
WD_REPEATS_REGION | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL | |
SMART | WD40 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
Superfamily-SCOP | SSF50978 | UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL |
UniProt | M0RCV0_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Q5XIG8 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2021-03-09 | Strap | serine/threonine kinase receptor associated protein | LOC100910575 | serine-threonine kinase receptor-associated protein-like | Data Merged | 737654 | PROVISIONAL |
2012-07-05 | LOC100910575 | serine-threonine kinase receptor-associated protein-like | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
2005-12-06 | Strap | serine/threonine kinase receptor associated protein | Strap_predicted | serine/threonine kinase receptor associated protein (predicted) | Symbol and Name updated | 1559027 | APPROVED |
2005-01-12 | Strap_predicted | serine/threonine kinase receptor associated protein (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |