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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | gastrointestinal stromal tumor | | ISO | RGD:1316442 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:27793025 | |
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Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | gastrointestinal stromal tumor | | ISO | RGD:1316442 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:27793025 | |
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# | Reference Title | Reference Citation |
1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
3. | KEGG Annotation Import Pipeline | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
4. | PID Annotation Import Pipeline | Pipeline to import Pathway Interaction Database annotations from NCI into RGD |
5. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PMID:10806483 | PMID:16055717 | PMID:18600476 | PMID:19305393 | PMID:21746835 |
Stk36 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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STK36 (Homo sapiens - human) |
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Stk36 (Mus musculus - house mouse) |
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Stk36 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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STK36 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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STK36 (Canis lupus familiaris - dog) |
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Stk36 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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STK36 (Sus scrofa - pig) |
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STK36 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Stk36 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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D9Mco102 |
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MARC_21861-21862:1027094738:1 |
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The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 43 | 19 | 1 | ||||||||||
Low | 3 | 43 | 57 | 41 | 19 | 41 | 8 | 11 | 31 | 35 | 22 | 10 | 8 |
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_001173986 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_006245174 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_008767221 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | FQ218305 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
JACYVU010000215 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000022839 ⟹ ENSRNOP00000022839 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000112437 ⟹ ENSRNOP00000077934 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001173986 ⟹ NP_001167457 | ||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_006245174 ⟹ XP_006245236 | ||||||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_008767221 ⟹ XP_008765443 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
Protein RefSeqs | NP_001167457 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_006245236 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_008765443 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001167457 ⟸ NM_001173986 |
- UniProtKB: | D3ZA65 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_006245236 ⟸ XM_006245174 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_008765443 ⟸ XM_008767221 |
- Peptide Label: | isoform X2 |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000022839 ⟸ ENSRNOT00000022839 |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000077934 ⟸ ENSRNOT00000112437 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-D3ZA65-F1-model_v2 | AlphaFold | D3ZA65 | 1-1314 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
RGD ID: | 13696756 | ||||||||
Promoter ID: | EPDNEW_R7281 | ||||||||
Type: | initiation region | ||||||||
Name: | Stk36_1 | ||||||||
Description: | serine/threonine kinase 36 | ||||||||
SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
Position: |
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Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1307318 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-27121 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000016913 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000022839 | ENTREZGENE |
ENSRNOP00000022839.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOP00000077934 | ENTREZGENE | |
ENSRNOP00000077934.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000022839 | ENTREZGENE |
ENSRNOT00000022839.8 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSRNOT00000112437 | ENTREZGENE | |
ENSRNOT00000112437.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Gene3D-CATH | 1.25.10.10 | UniProtKB/TrEMBL |
InterPro | ARM-like | UniProtKB/TrEMBL |
ARM-type_fold | UniProtKB/TrEMBL | |
Fused-like | UniProtKB/TrEMBL | |
Kinase-like_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
Prot_kinase_cat_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
Protein_kinase_ATP_BS | UniProtKB/TrEMBL | |
Ser/Thr_kinase_AS | UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:301516 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | 301516 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR22983 | UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | Pkinase | UniProtKB/TrEMBL |
PhenoGen | Stk36 | PhenoGen |
PROSITE | PROTEIN_KINASE_ATP | UniProtKB/TrEMBL |
PROTEIN_KINASE_DOM | UniProtKB/TrEMBL | |
PROTEIN_KINASE_ST | UniProtKB/TrEMBL | |
SMART | S_TKc | UniProtKB/TrEMBL |
Superfamily-SCOP | ARM-type_fold | UniProtKB/TrEMBL |
Kinase_like | UniProtKB/TrEMBL | |
UniProt | A0A8I5Y8C3_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
D3ZA65 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2011-08-01 | Stk36 | serine/threonine kinase 36 | Stk36 | serine/threonine kinase 36 (fused homolog, Drosophila) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-04-30 | Stk36 | serine/threonine kinase 36 (fused homolog, Drosophila) | Stk36_predicted | serine/threonine kinase 36 (fused homolog, Drosophila) (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
2005-01-12 | Stk36_predicted | serine/threonine kinase 36 (fused homolog, Drosophila) (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |