![]()
Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | malignant astrocytoma | | ISO | RGD:1314216 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:17049657 | |
|
![]()
Imported Disease Annotations - CTDTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | malignant astrocytoma | | ISO | RGD:1314216 | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:17049657 | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
2. | GOA data from the GO Consortium |
3. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
4. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PMID:10673337 | PMID:10871863 | PMID:12853976 | PMID:15131260 | PMID:15343267 | PMID:18369314 | PMID:19289085 | PMID:20412773 | PMID:21512031 | PMID:22020941 | PMID:23824537 | PMID:31829064 |
PMID:32054526 | PMID:32375631 | PMID:34457109 |
Lats2 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LATS2 (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lats2 (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lats2 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LATS2 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LATS2 (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lats2 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LATS2 (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LATS2 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lats2 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
|
RH139371 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
AI233961 |
|
The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | renal system | reproductive system | respiratory system | appendage | |
High | |||||||||||||
Medium | 38 | 12 | 4 | 11 | 4 | 2 | 2 | 52 | 35 | 35 | 11 | 2 | |
Low | 3 | 5 | 45 | 37 | 8 | 37 | 6 | 9 | 22 | 6 | 6 | ||
Below cutoff |
RefSeq Transcripts | NM_001107267 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_008770748 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_039093320 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | CH474049 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
FQ225050 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
FQ232012 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JACYVU010000269 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOT00000087978 ⟹ ENSRNOP00000072969 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | NM_001107267 ⟹ NP_001100737 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_008770748 ⟹ XP_008768970 | ||||||||||||
RefSeq Status: | |||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_039093320 ⟹ XP_038949248 | ||||||||
RefSeq Status: | |||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
Protein RefSeqs | NP_001100737 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_008768970 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038949248 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | EDM14356 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001100737 ⟸ NM_001107267 |
- UniProtKB: | A0A0G2K4A8 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XP_008768970 ⟸ XM_008770748 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
- UniProtKB: | A0A0G2K4A8 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSRNOP00000072969 ⟸ ENSRNOT00000087978 |
RefSeq Acc Id: | XP_038949248 ⟸ XM_039093320 |
- Peptide Label: | isoform X1 |
Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
AF-A0A0G2K4A8-F1-model_v2 | AlphaFold | A0A0G2K4A8 | 1-1042 | view protein structure |
eQTL | View at Phenogen | |
WGCNA | View at Phenogen | |
Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
|
Chromosome | Start Pos | End Pos | Reference Nucleotide | Variant Nucleotide | Variant Type | Strain |
15 | 36727989 | 36727990 | T | A | snv | SS/JrHsdMcwi (MCW) |
Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | RGD:1305906 | AgrOrtholog |
BioCyc Gene | G2FUF-13598 | BioCyc |
Ensembl Genes | ENSRNOG00000056343 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Protein | ENSRNOP00000072969 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Ensembl Transcript | ENSRNOT00000087978 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
InterPro | AGC-kinase_C | UniProtKB/TrEMBL |
Kinase-like_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
LATS2 | UniProtKB/TrEMBL | |
Pkinase_C | UniProtKB/TrEMBL | |
Prot_kinase_cat_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
Protein_kinase_ATP_BS | UniProtKB/TrEMBL | |
Ser/Thr_kinase_AS | UniProtKB/TrEMBL | |
UBA-like | UniProtKB/TrEMBL | |
UBA/transl_elong_EF1B_N_euk | UniProtKB/TrEMBL | |
KEGG Report | rno:305922 | UniProtKB/TrEMBL |
NCBI Gene | 305922 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR24356:SF149 | UniProtKB/TrEMBL |
Pfam | Pkinase | UniProtKB/TrEMBL |
Pkinase_C | UniProtKB/TrEMBL | |
PhenoGen | Lats2 | PhenoGen |
PROSITE | AGC_KINASE_CTER | UniProtKB/TrEMBL |
PROTEIN_KINASE_ATP | UniProtKB/TrEMBL | |
PROTEIN_KINASE_DOM | UniProtKB/TrEMBL | |
PROTEIN_KINASE_ST | UniProtKB/TrEMBL | |
UBA | UniProtKB/TrEMBL | |
SMART | S_TK_X | UniProtKB/TrEMBL |
S_TKc | UniProtKB/TrEMBL | |
Superfamily-SCOP | Kinase_like | UniProtKB/TrEMBL |
UBA_like | UniProtKB/TrEMBL | |
UniProt | A0A0G2K4A8 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2014-02-26 | Lats2 | large tumor suppressor kinase 2 | Lats2 | large tumor suppressor 2 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2012-07-19 | Lats2 | large tumor suppressor 2 | Lats2 | large tumor suppressor, homolog 2 (Drosophila) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2012-01-17 | Lats2 | large tumor suppressor, homolog 2 (Drosophila) | Lats2 | large tumor suppressor 2 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
2008-04-30 | Lats2 | large tumor suppressor 2 | Lats2_predicted | large tumor suppressor 2 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
2005-01-12 | Lats2_predicted | large tumor suppressor 2 (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |