Imported Disease Annotations - ClinVarTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | genetic disease | | ISO | SFRP1 (Homo sapiens) | 8554872 | ClinVar Annotator: match by term: Inborn genetic diseases | ClinVar | | |
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Imported Disease Annotations - ClinVarTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | genetic disease | | ISO | SFRP1 (Homo sapiens) | 8554872 | ClinVar Annotator: match by term: Inborn genetic diseases | ClinVar | | |
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SFRP1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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SFRP1 (Homo sapiens - human) |
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Sfrp1 (Mus musculus - house mouse) |
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Sfrp1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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Sfrp1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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SFRP1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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Sfrp1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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SFRP1 (Sus scrofa - pig) |
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SFRP1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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Sfrp1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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Variants in SFRP1
484 total Variants |
alimentary part of gastrointestinal system | circulatory system | endocrine system | exocrine system | hemolymphoid system | hepatobiliary system | integumental system | musculoskeletal system | nervous system | reproductive system | respiratory system | adipose tissue | |
High | ||||||||||||
Medium | 4 | 20 | 6 | 6 | 6 | 6 | 3 | 6 | ||||
Low | 1 | 5 | 2 | 6 | 5 | 6 | 7 | |||||
Below cutoff | 1 | 8 |
RefSeq Transcripts | XM_003639564 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
XM_038497519 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_038559971 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_038624008 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
XM_038689771 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | AAEX04000016 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
AB672664 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JAAHUQ010000182 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JAAQRD010000021 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
JAAUVH010000104 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
REHQ01000016 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | ENSCAFT00000009243 ⟹ ENSCAFP00000008577 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSCAFT00000045729 ⟹ ENSCAFP00000037572 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | ENSCAFT00845015374 ⟹ ENSCAFP00845011939 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_003639564 ⟹ XP_003639612 | ||||||||||||
Type: | CODING | ||||||||||||
Position: |
|
||||||||||||
Sequence: |
RefSeq Acc Id: | XM_038497519 ⟹ XP_038353447 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_038559971 ⟹ XP_038415899 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_038624008 ⟹ XP_038479936 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
RefSeq Acc Id: | XM_038689771 ⟹ XP_038545699 | ||||||||
Type: | CODING | ||||||||
Position: |
|
Protein RefSeqs | XP_003639612 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
XP_038353447 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038415899 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038479936 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
XP_038545699 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
GenBank Protein | BAK86425 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
Ensembl Protein | ENSCAFP00000070389.1 | ||
ENSCAFP00030027943.1 | |||
ENSCAFP00040011225.1 | |||
ENSCAFP00845011939 | |||
ENSCAFP00845011939.1 |
RefSeq Acc Id: | XP_003639612 ⟸ XM_003639564 |
- UniProtKB: | A0A8C0JP54 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8C0QEZ7 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I3N6M9 (UniProtKB/TrEMBL) |
- Sequence: |
RefSeq Acc Id: | ENSCAFP00000037572 ⟸ ENSCAFT00000045729 |
RefSeq Acc Id: | ENSCAFP00000008577 ⟸ ENSCAFT00000009243 |
RefSeq Acc Id: | XP_038353447 ⟸ XM_038497519 |
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RefSeq Acc Id: | XP_038545699 ⟸ XM_038689771 |
- UniProtKB: | A0A8C0JP54 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8C0QEZ7 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I3N6M9 (UniProtKB/TrEMBL) |
RefSeq Acc Id: | XP_038415899 ⟸ XM_038559971 |
- UniProtKB: | A0A8C0JP54 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8C0QEZ7 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I3N6M9 (UniProtKB/TrEMBL) |
RefSeq Acc Id: | ENSCAFP00845011939 ⟸ ENSCAFT00845015374 |
Database | Acc Id | Source(s) |
Ensembl Genes | ENSCAFG00000005737 | Ensembl |
ENSCAFG00000057560 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSCAFG00030017408 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSCAFG00040007003 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSCAFG00845008758 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENSCAFT00000094986.1 | UniProtKB/TrEMBL |
ENSCAFT00030032049.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSCAFT00040012970.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
ENSCAFT00845015374 | ENTREZGENE | |
ENSCAFT00845015374.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
Gene3D-CATH | 1.10.2000.10 | UniProtKB/TrEMBL |
2.40.50.120 | UniProtKB/TrEMBL | |
InterPro | Frizzled/SFRP | UniProtKB/TrEMBL |
Frizzled_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
Frizzled_dom_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
Netrin_domain | UniProtKB/TrEMBL | |
Netrin_module_non-TIMP | UniProtKB/TrEMBL | |
SFRP1_CRD | UniProtKB/TrEMBL | |
TIMP-like_OB-fold | UniProtKB/TrEMBL | |
NCBI Gene | SFRP1 | ENTREZGENE |
PANTHER | PTHR11309 | UniProtKB/TrEMBL |
PTHR11309:SF87 | UniProtKB/TrEMBL | |
Pfam | NTR | UniProtKB/TrEMBL |
PF01392 | UniProtKB/TrEMBL | |
PROSITE | NTR | UniProtKB/TrEMBL |
PS50038 | UniProtKB/TrEMBL | |
SMART | C345C | UniProtKB/TrEMBL |
FRI | UniProtKB/TrEMBL | |
Superfamily-SCOP | SSF50242 | UniProtKB/TrEMBL |
SSF63501 | UniProtKB/TrEMBL | |
UniProt | A0A8C0JP54 | ENTREZGENE |
A0A8C0QEZ7 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
A0A8I3N6M9 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
VGNC ID | VGNC:46080 | ENTREZGENE |