Welcome
{{ username}}
Message Center
{{ messageCount }} Messages
Go to Message Center
Watched Genes
{{$index + 1}}.
{{ watchedObject.symbol }} (RGD ID:{{watchedObject.rgdId}})
Modify Subscription
Unsubscribe
Watched Ontology Terms
{{$index + 1}}.
{{ watchedTerm.term }} ({{watchedTerm.accId}})
Modify Subscription
Unsubscribe
{{gene.symbol}}:
{{ gene.description }}
×
Save List to My RGD
Create Name:
Description:
You must be logged in to use this feature
{{ loginError }}
{{ watchLinkText }}
Select categories you would like to watch. Updates to this gene will be sent to {{ username }}
{{geneWatchAttr}}
Analyze
Gene
Strain
QTL
List
×
Gene Annotator (Functional Annotation)
unavailable
Gene Annotator (Annotation Distribution)
unavailable
Variant Visualizer (Genomic Variants)
unavailble
Variant Visualizer (Genomic Variants)
unavailable
Gene Annotator (Functional Annotation)
Gene Annotator (Annotation Distribution)
Variant Visualizer (Genomic Variants)
InterViewer (Protein-Protein Interactions)
unavailable
Gviewer (Genome Viewer)
unavailable
Variant Visualizer (Damaging Variants) unavailble
Variant Visualizer (Damaging Variants)
unavailable
InterViewer (Protein-Protein Interactions)
GViewer (Genome Viewer)
Variant Visualizer (Damaging Variants)
Gene Annotator (Annotation Comparison)
unavailable
OLGA (Gene List Generator)
unavailable
Gene Annotator (Annotation Comparison)
OLGA (Gene List Generator)
Excel (Download)
MOET (Multi-Ontology Enrichement)
unavailable
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder)
unavailable
MOET (Multi-Ontology Enrichement)
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder)
x
Send Message
x
Send us a Message
Your email
Message
Send
Submit Data
|
Help
|
Video Tutorials
|
News
|
Publications
|
Download
|
REST API
|
Citing RGD
|
Contact
Home
Search RGD
Grant Resources
Citing RGD
About Us
Contact Us
Data
Genes
Variants
Community Projects
QTLs
Strains
Markers
Genome Information
Ontologies
Cell Lines
References
Download
Submit Data
Analysis & Visualization
OntoMate (Literature Search)
JBrowse (Genome Browser)
Synteny Browser (VCMap)
Variant Visualizer
Multi-Ontology Enrichment (MOET)
Gene-Ortholog Location Finder (GOLF)
InterViewer (Protein-Protein Interactions)
PhenoMiner (Quatitative Phenotypes)
Gene Annotator
OLGA (Gene List Generator)
AllianceMine
GViewer (Genome Viewer)
Diseases
Aging & Age-Related Disease
Cancer & Neoplastic Disease
Cardiovascular Disease
Coronavirus Disease
Developmental Disease
Diabetes
Hematologic Disease
Immune & Inflammatory Disease
Infectious Disease
Liver Disease
Neurological Disease
Obesity & Metabolic Syndrome
Renal Disease
Respiratory Disease
Sensory Organ Disease
Phenotypes & Models
Find Models
new
Genetic Models
Autism Models
Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes)
Chinchilla PhenoMiner
Expected Ranges (Quantitative Phenotype)
PhenoMiner Term Comparison
Hybrid Rat Diversity Panel
Phenotypes
Phenotypes in Other Animal Models
Animal Husbandry
Strain Medical Records
Phylogenetics
Strain Availability
Calendar
Rats 101
Submissions
Photo Archive
Pathways
Community
Rat Community Forum
Directory of Rat Laboratories
Video Tutorials
News
RGD Publications
RGD Presentations Archive
Nomenclature Guidelines
Resource Links
Laboratory Resources
Employment Resources
Advanced Search (OLGA)
View As List
View As Table
GENE - TERM ANNOTATION REPORT
RGD ID:
1305483
Species:
Rattus norvegicus
RGD Object:
Gene
Symbol:
Pms2
Name:
PMS1 homolog 2, mismatch repair system component
Acc ID:
DOID:0070275
Term:
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4
Definition:
A Lynch syndrome that has_material_basis_in heterozygous mutation in the PMS2 gene on chromosome 7p22. (DO)
Definition Source(s):
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8072530
"DO" "DO"
Note: Use of the qualifier "multiple interactions" designates that the annotated interaction is comprised of a complex set of reactions and/or regulatory events, possibly involving additional chemicals and/or gene products.
Object Symbol
Qualifier
Evidence
With
Reference
Source
Notes
Original Reference(s)
Pms2
ISO
PMS2 (Homo sapiens)
7240710
OMIM
Pms2
ISO
PMS2 (Homo sapiens)
11554173
CTD
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
Pms2
ISO
PMS2 (Homo sapiens)
8554872
ClinVar
ClinVar Annotator: match by term: Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 4 | ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome 4
PMID:10037723
PMID:10199405
PMID:10479499
PMID:10480359
PMID:10763829
PMID:11574484
PMID:11793469
PMID:12208142
PMID:12714694
PMID:12900794
PMID:14756672
PMID:14978792
PMID:15077197
PMID:15256438
PMID:15304120
PMID:15470502
PMID:15521988
PMID:15845562
PMID:15872200
PMID:15887099
PMID:15887124
PMID:15955779
PMID:16144131
PMID:16199547
PMID:16283678
PMID:16338176
PMID:16426742
PMID:16472587
PMID:16507833
PMID:16609022
PMID:16619239
PMID:16817031
PMID:16873062
PMID:17016615
PMID:17029773
PMID:17072973
PMID:17139668
PMID:17312306
PMID:17557300
PMID:17567544
PMID:17576681
PMID:17976239
PMID:17993636
PMID:18030674
PMID:18178629
PMID:18268114
PMID:18273873
PMID:18310077
PMID:18415027
PMID:18602922
PMID:18619468
PMID:187425
PMID:18768816
PMID:18824584
PMID:19039682
PMID:19092773
PMID:19132747
PMID:19156169
PMID:19250412
PMID:19283792
PMID:19389263
PMID:19479271
PMID:19495563
PMID:19526325
PMID:19690142
PMID:19723918
PMID:1992580
PMID:20176959
PMID:20186688
PMID:20186689
PMID:20205264
PMID:20487569
PMID:20531397
PMID:20533529
PMID:20581245
PMID:20587412
PMID:20624957
PMID:20698049
PMID:21153778
PMID:21204794
PMID:21239990
PMID:21261604
PMID:21356188
PMID:21376568
PMID:21520333
PMID:21618646
PMID:216319
PMID:21701589
PMID:22081473
PMID:22086678
PMID:22120844
PMID:22290698
PMID:22295133
PMID:2235355
PMID:22577899
PMID:22585707
PMID:22608206
PMID:22658618
PMID:22692065
PMID:22703879
PMID:22848017
PMID:22875147
PMID:22918162
PMID:22949379
PMID:22949387
PMID:23012243
PMID:23017166
PMID:23376243
PMID:23435383
PMID:23499907
PMID:23612316
PMID:23629955
PMID:23652311
PMID:23709753
PMID:23729388
PMID:23837913
PMID:23960188
PMID:23981578
PMID:2402700
PMID:24027009
PMID:24033266
PMID:24055113
PMID:24113346
PMID:24130102
PMID:24326041
PMID:24351291
PMID:24362816
PMID:2440087
PMID:24434690
PMID:24440087
PMID:24506336
PMID:24549055
PMID:24556621
PMID:24689082
PMID:24710284
PMID:24728189
PMID:24728327
PMID:24755471
PMID:24763289
PMID:24790682
PMID:24897087
PMID:25006859
PMID:25117502
PMID:25142776
PMID:25151201
PMID:25186627
PMID:25194673
PMID:25274553
PMID:25318351
PMID:25326637
PMID:25345868
PMID:25430799
PMID:25477341
PMID:25479140
PMID:25503501
PMID:25512458
PMID:25525159
PMID:25559809
PMID:25567908
PMID:25637381
PMID:25648859
PMID:25691505
PMID:25741868
PMID:25801821
PMID:25850602
PMID:25856668
PMID:25871621
PMID:25938944
PMID:25964535
PMID:25980754
PMID:25986922
PMID:26110232
PMID:26116798
PMID:26163658
PMID:26202870
PMID:26232782
PMID:26247049
PMID:26249686
PMID:26270727
PMID:26272126
PMID:26318770
PMID:26320870
PMID:26333163
PMID:26391938
PMID:26423401
PMID:26437257
PMID:26467025
PMID:2648339
PMID:26483394
PMID:26517685
PMID:26544533
PMID:26552419
PMID:26556299
PMID:26580448
PMID:26681312
PMID:26689913
PMID:26720728
PMID:26811195
PMID:26824983
PMID:26837502
PMID:26845104
PMID:26866578
PMID:26888055
PMID:26895986
PMID:26898890
PMID:26900293
PMID:26921362
PMID:26976419
PMID:27001570
PMID:27017610
PMID:27028851
PMID:27037742
PMID:27050224
PMID:27060149
PMID:27060170
PMID:27064304
PMID:27082517
PMID:27146957
PMID:27153395
PMID:27203213
PMID:27273229
PMID:27376475
PMID:27379089
PMID:27433846
PMID:27435373
PMID:2744351
PMID:27443514
PMID:27449771
PMID:27476653
PMID:27498913
PMID:27535533
PMID:27589204
PMID:27600092
PMID:27601186
PMID:27616075
PMID:27621404
PMID:27647783
PMID:27696107
PMID:27720647
PMID:27742654
PMID:27806231
PMID:27820123
PMID:27863258
PMID:27878467
PMID:27930734
PMID:27978560
PMID:27997549
PMID:28007021
PMID:28050010
PMID:28051113
PMID:28125078
PMID:28135048
PMID:28135145
PMID:28152038
PMID:28166811
PMID:28195393
PMID:28218421
PMID:28365877
PMID:28381238
PMID:28449805
PMID:28466842
PMID:28491141
PMID:28492532
PMID:28494185
PMID:28502729
PMID:28503720
PMID:28503822
PMID:28514183
PMID:285143
PMID:28528518
PMID:28562508
PMID:28591191
PMID:28596308
PMID:28640387
PMID:28724667
PMID:28726808
PMID:28765196
PMID:28767177
PMID:28805995
PMID:28873162
PMID:28874130
PMID:28888541
PMID:28904067
PMID:28975465
PMID:29128982
PMID:29212164
Pms2
ISO
PMS2 (Homo sapiens)
8554872
ClinVar
ClinVar Annotator: match by term: Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 4 | ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome 4
PMID:29286535
PMID:29300386
PMID:29333623
PMID:29335925
PMID:29345684
PMID:29348823
PMID:29368341
PMID:29445031
PMID:29470806
PMID:29478780
PMID:29489754
PMID:29506128
PMID:29566657
PMID:29570743
PMID:29596542
PMID:29625052
PMID:29667044
PMID:29684080
PMID:29703253
PMID:29752822
PMID:29758216
PMID:29785153
PMID:29875428
PMID:29887214
PMID:29904176
PMID:29915322
PMID:29922827
PMID:29945567
PMID:29946849
PMID:29967336
PMID:30013564
PMID:30019097
PMID:30039884
PMID:30067863
PMID:30077346
PMID:30093976
PMID:30103829
PMID:30113427
PMID:30122538
PMID:30155321
PMID:30161022
PMID:30166348
PMID:30192042
PMID:30256826
PMID:30267214
PMID:30306255
PMID:30322717
PMID:30337059
PMID:30374176
PMID:30376427
PMID:30389464
PMID:30426508
PMID:30447919
PMID:30478739
PMID:30521064
PMID:30572730
PMID:30608896
PMID:30612635
PMID:30613976
PMID:30651582
PMID:30653781
PMID:30676620
PMID:30680046
PMID:30702970
PMID:30729418
PMID:30740824
PMID:30760869
PMID:30764633
PMID:30787465
PMID:30809968
PMID:30833958
PMID:30837682
PMID:31056861
PMID:31068090
PMID:31101557
PMID:31102422
PMID:31118792
PMID:31159747
PMID:31204389
PMID:31269945
PMID:31300551
PMID:31327751
PMID:31332305
PMID:31336956
PMID:31350202
PMID:31360874
PMID:31386297
PMID:31391288
PMID:31410062
PMID:31422574
PMID:31422818
PMID:31428572
PMID:31433215
PMID:31447099
PMID:31465090
PMID:31507588
PMID:31512090
PMID:31589614
PMID:31599855
PMID:31616036
PMID:31650731
PMID:31666926
PMID:31742824
PMID:31780696
PMID:31830689
PMID:31857677
PMID:31860975
PMID:31874108
PMID:31882575
PMID:31883735
PMID:31921681
PMID:31942411
PMID:31948886
PMID:31992580
PMID:32012241
PMID:32039725
PMID:32060697
PMID:32068069
PMID:32090079
PMID:32091409
PMID:32133419
PMID:32255556
PMID:32283892
PMID:32295625
PMID:32369273
PMID:32459922
PMID:32547938
PMID:32566746
PMID:32571878
PMID:32620519
PMID:32628757
PMID:32634176
PMID:32642664
PMID:32652087
PMID:32658311
PMID:32661327
PMID:32719484
PMID:32761968
PMID:32773772
PMID:32775946
PMID:32794040
PMID:32809219
PMID:32832836
PMID:32849802
PMID:32885271
PMID:32906206
PMID:32914570
PMID:32923906
PMID:32959997
PMID:32980694
PMID:33087929
PMID:33120919
PMID:33193653
PMID:33206196
PMID:33258288
PMID:33259954
PMID:33294277
PMID:33359728
PMID:33413596
PMID:33453991
PMID:33471991
PMID:33504652
PMID:33510387
PMID:33535600
PMID:33606809
PMID:33693762
PMID:33753322
PMID:33821390
PMID:33850299
PMID:33881185
PMID:34048176
PMID:34172528
PMID:34178123
PMID:34247610
PMID:34250417
PMID:34253388
PMID:34271781
PMID:34284872
PMID:34285288
PMID:34308366
PMID:34326862
PMID:34350294
PMID:34357101
PMID:34359559
PMID:34371384
PMID:34489406
PMID:34567566
PMID:34646395
PMID:34680242
PMID:35002543
PMID:35089076
PMID:35127508
PMID:35171259
PMID:35189042
PMID:35223509
PMID:35263119
PMID:35264596
PMID:35372080
PMID:35402282
PMID:35430768
PMID:35449176
PMID:35451539
PMID:35451682
PMID:35475445
PMID:35535697
PMID:35734982
PMID:35982947
PMID:36011273
PMID:36134613
PMID:36165864
PMID:36200007
PMID:36243179
PMID:36315513
PMID:36360190
PMID:36446039
PMID:36451132
PMID:36586540
PMID:36627197
PMID:36647049
PMID:36715493
PMID:36931573
PMID:36988593
PMID:36999887
PMID:37536918
PMID:572224
PMID:6144131
PMID:663563
PMID:674263
PMID:7628019
PMID:7629132
PMID:7632227
PMID:7661930
PMID:7704024
PMID:8072530
PMID:8993976
PMID:9419979
PMID:9488480
PMID:9536098
PMID:9683794
Go Back to source page
Continue to Ontology report