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CROSS-SPECIES ANATOMY - ANNOTATIONS

The Basic subset of the UBERON integrated, cross-species anatomy ontology is downloaded weekly from http://berkeleybop.org/ontologies/uberon/basic.obo. For more information about this ontology see the "About" page on the UBERON website at http://uberon.github.io/about.html.

Term:somite
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Accession:UBERON:0002329 term browser browse the term
Definition:Somites are spheres of epithelial cells that form sequentially along the anterior-posterior axis of the embryo through mesenchymal to epithelial transition of the presomitic mesoderm.
Comment:When the somite becomes segmented from the segmental plate, it is composed of an epithelial sac enclosing mesenchymal somitocoel cells. Thereafter the somite differentiates into two parts, the ventro-medial mesenchymal sclerotome and the dorso-lateral epithelial dermomyotome. This change in the epithelial somite depends on surrounding tissue [PMID:15906248]
Synonyms:exact_synonym: mesodermal cluster
 related_synonym: epimere;   epimere mesoderm;   epithelial somite;   somites;   somitic mesoderm;   somitus
 xref: AAO:0010569;   AEO:0001015;   BTO:0001558;   EHDAA2:0003436;   EHDAA:366;   EHDAA:699;   EMAPA:31169;   FMA:85522;   GAID:1306;   MAT:0000068;   MESH:A16.254.425.660.750;   MIAA:0000068;   NCIT:C34302;   TAO:0000155;   UMLS:C0376449;   VHOG:0000191;   XAO:0000058;   ZFA:0000155;   http://en.wikipedia.org/wiki/Somite;   http://linkedlifedata.com/resource/umls/id/C0376449
 external_ontology: n/a NCBITaxon:7712



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  UBERON ontology 0
    anatomical entity 0
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          somite 0
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            trunk somite + 0
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  UBERON ontology 0
    anatomical entity 0
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        anatomical structure 0
          multicellular anatomical structure 0
            multicellular organism 0
              organism subdivision 0
                main body axis 0
                  subdivision of organism along main body axis 0
                    trunk 0
                      trunk mesenchyme 0
                        trunk paraxial mesoderm 0
                          presumptive segmental plate 0
                            presomitic mesoderm 0
                              somite 0
                                dermatome + 0
                                dermomyotome + 0
                                head somite + 0
                                myotome + 0
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