Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

SEQUENCE ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Sequence Types and Features Ontology (SO) is downloaded weekly from the SourceForge CVS repository at http://song.cvs.sourceforge.net/viewvc/song/ontology/. For more information about this ontology, see the Sequence Ontology Home Page at http://www.sequenceontology.org/.

Term:promoter_element
go back to main search page
Accession:SO:0001659 term browser browse the term
Definition:An element that can exist within the promoter region of a gene.
Comment:Mmoved from is_a: SO:0001055 transcriptional_cis_regulatory_region as per request from GREEKC initiative in August 2020.
Synonyms:exact_synonym: promoter element



show annotations for term's descendants           Sort by:
 

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  SO ontology 0
    sequence_feature 0
      region 0
        biological_region 0
          gene_component_region 0
            promoter 0
              promoter_element 0
                AP_1_binding_site 0
                Ace2_UAS 0
                CArG_box 0
                CCAAT_motif 0
                CDRE_motif 0
                CRE 0
                CSL_response_element 0
                CTCF_binding_site 0
                CuRE 0
                DMv1_motif 0
                DMv2_motif 0
                DMv3_motif 0
                DMv4_motif 0
                DMv5_motif 0
                DPE1_motif 0
                DRE 0
                FLEX_element 0
                GC_rich_promoter_region 0
                HSE 0
                MCB 0
                NDM2_motif 0
                NDM3_motif 0
                PCB 0
                Pho7_binding_site 0
                STREP_motif 0
                TCS_element 0
                TR_box 0
                core_promoter_element + 0
                forkhead_motif 0
                homol_E_box 0
                mating_type_M_box 0
                pheromone_response_element 0
                regulatory_promoter_element + 0
                sterol_regulatory_element 0
                zinc_repressed_element + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  SO ontology 0
    sequence_feature 0
      region 0
        biological_region 0
          gene_group 0
            gene 0
              gene_member_region 0
                regulatory_region 0
                  transcriptional_cis_regulatory_region 0
                    cis_regulatory_module 0
                      TF_binding_site 0
                        promoter_element 0
                          AP_1_binding_site 0
                          Ace2_UAS 0
                          CArG_box 0
                          CCAAT_motif 0
                          CDRE_motif 0
                          CRE 0
                          CSL_response_element 0
                          CTCF_binding_site 0
                          CuRE 0
                          DMv1_motif 0
                          DMv2_motif 0
                          DMv3_motif 0
                          DMv4_motif 0
                          DMv5_motif 0
                          DPE1_motif 0
                          DRE 0
                          FLEX_element 0
                          GC_rich_promoter_region 0
                          HSE 0
                          MCB 0
                          NDM2_motif 0
                          NDM3_motif 0
                          PCB 0
                          Pho7_binding_site 0
                          STREP_motif 0
                          TCS_element 0
                          TR_box 0
                          core_promoter_element + 0
                          forkhead_motif 0
                          homol_E_box 0
                          mating_type_M_box 0
                          pheromone_response_element 0
                          regulatory_promoter_element + 0
                          sterol_regulatory_element 0
                          zinc_repressed_element + 0
paths to the root