Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

RGD DISEASE ONTOLOGY - ANNOTATIONS

RGD uses the Human Disease Ontology (DO, https://disease-ontology.org/) for disease curation across species. RGD automatically downloads each new release of the ontology on a monthly basis. Some additional terms which are required for RGD's curation purposes but are not currently covered in the official version of DO have been added. As corresponding terms are added to DO, these custom terms are retired and the DO terms substituted in existing annotations and subsequently used for curation.

Term:papillary renal cell carcinoma
go back to main search page
Accession:DOID:4465 term browser browse the term
Definition:A renal cell carcinoma that is characterized by the development of multiple, bilateral papillary renal tumors. (DO)
Synonyms:exact_synonym: RCCP1;   chromophil carcinoma of kidney;   papillary kidney carcinoma;   renal cell carcinoma, papillary 1;   sporadic papillary renal cell carcinoma
 primary_id: OMIM:605074
 alt_id: RDO:9001909
 xref: GARD:9572;   NCI:C27890;   NCI:C6975
For additional species annotation, visit the Alliance of Genome Resources.


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
papillary renal cell carcinoma term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Apc APC regulator of WNT signaling pathway ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma ClinVar PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr18:27,011,710...27,106,323
Ensembl chr18:27,047,382...27,105,531
JBrowse link
G Araf A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:24569458, PMID:26619011 NCBI chr  X:1,369,534...1,391,603
Ensembl chr  X:1,379,194...1,390,873
JBrowse link
G Asz1 ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 4:45,358,574...45,414,177
Ensembl chr 4:45,358,574...45,414,177
JBrowse link
G Atm ATM serine/threonine kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:10571946 NCBI chr 8:58,015,938...58,119,973
Ensembl chr 8:58,015,940...58,120,045
JBrowse link
G Braf B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic
ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1
ClinVar PMID:12068308, PMID:12198537, PMID:12447372, PMID:12460918, PMID:12460919, PMID:12619120, PMID:12644542, PMID:12670889, PMID:12794760, PMID:12960123, PMID:14513361, PMID:14602780, PMID:14679157, PMID:15001635, PMID:15035987, PMID:15126572, PMID:15181070, PMID:15342696, PMID:15356022, PMID:15386408, PMID:15687339, PMID:15998781, PMID:16015629, PMID:16174717, PMID:16187918, PMID:16772349, PMID:17374713, PMID:17488796, PMID:17785355, PMID:18398503, PMID:19001320, PMID:19010912, PMID:19018267, PMID:19238210, PMID:19404918, PMID:19537845, PMID:19561230, PMID:20008640, PMID:20350999, PMID:20413299, PMID:20619739, PMID:20630094, PMID:20818844, PMID:20823850, PMID:20857202, PMID:21107320, PMID:21107323, PMID:21129611, PMID:21156289, PMID:21163703, PMID:21426297, PMID:21483012, PMID:21502544, PMID:21639808, PMID:21641636, PMID:21683865, PMID:21975775, PMID:22038996, PMID:22048237, PMID:22113612, PMID:22180495, PMID:22281684, PMID:22351686, PMID:22356324, PMID:22389471, PMID:22448344, PMID:22536370, PMID:22586120, PMID:22608338, PMID:22649091, PMID:22663011, PMID:22735384, PMID:22743296, PMID:22773810, PMID:22805292, PMID:22972589, PMID:22997239, PMID:23020132, PMID:23031422, PMID:23251002, PMID:23302800, PMID:23325582, PMID:23470635, PMID:23524406, PMID:23549875, PMID:23614898, PMID:23685455, PMID:23812671, PMID:23833300, PMID:23845441, PMID:23918947, PMID:24033266, PMID:24107445, PMID:24112392, PMID:24163374, PMID:24388723, PMID:24446311, PMID:24508103, PMID:24512911, PMID:24576830, PMID:24583796, PMID:24586605, PMID:24594804, PMID:24670642, PMID:24717435, PMID:25024077, PMID:25037139, PMID:25079330, PMID:25157968, PMID:25265492, PMID:25265494, PMID:25370471, PMID:25399551, PMID:25950823, PMID:25989278, PMID:26619011, PMID:26678033, PMID:27404270, PMID:27480103, PMID:28854169, PMID:28891408, PMID:29925953, PMID:31779674, PMID:31891627 NCBI chr 4:67,389,331...67,520,549
Ensembl chr 4:67,396,192...67,520,356
JBrowse link
G Capza2 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 4:44,936,290...44,972,270
Ensembl chr 4:44,936,290...44,972,267
JBrowse link
G Cdkn2a cyclin-dependent kinase inhibitor 2A ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:25741868, PMID:26619011 NCBI chr 5:107,823,323...107,832,405
Ensembl chr 5:107,823,330...107,841,175
JBrowse link
G Cftr CF transmembrane conductance regulator ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 4:42,693,263...42,860,679
Ensembl chr 4:42,692,836...42,860,676
JBrowse link
G Ctnnb1 catenin beta 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:26822237 NCBI chr 8:129,601,511...129,628,378
Ensembl chr 8:129,617,812...129,627,372
JBrowse link
G Eloc elongin C ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 5:2,042,991...2,059,357
Ensembl chr 5:2,042,991...2,059,351
JBrowse link
G Erbb2 erb-b2 receptor tyrosine kinase 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:18413839, PMID:22046346, PMID:23220880, PMID:25157968, PMID:26619011 NCBI chr10:86,367,596...86,391,728
Ensembl chr10:86,367,596...86,391,728
JBrowse link
G Fbxw7 F-box and WD repeat domain containing 7 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 2:184,230,191...184,309,805
Ensembl chr 2:184,231,260...184,309,664
JBrowse link
G Fgfr3 fibroblast growth factor receptor 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:8589699, PMID:8845844, PMID:9438390, PMID:9843049, PMID:10471491, PMID:11038465, PMID:11429702, PMID:11879084, PMID:15772091, PMID:17384684, PMID:19088846, PMID:19331127, PMID:19381019, PMID:19749790, PMID:20542753, PMID:21273588, PMID:22869148, PMID:23200862, PMID:24476948, PMID:25157968, PMID:25606676, PMID:25741868, PMID:26619011, PMID:28249712, PMID:28492532, PMID:30311386 NCBI chr14:82,272,322...82,287,739
Ensembl chr14:82,273,070...82,287,706
JBrowse link
G Hras HRas proto-oncogene, GTPase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic
ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1
ClinVar PMID:11150980, PMID:12210337, PMID:14608654, PMID:16155195, PMID:16170316, PMID:16329078, PMID:16372351, PMID:16443854, PMID:16835863, PMID:16881968, PMID:16969868, PMID:17054105, PMID:17250658, PMID:17412879, PMID:17979197, PMID:18039947, PMID:18247425, PMID:18470943, PMID:18978862, PMID:19206176, PMID:19371735, PMID:19382114, PMID:19669404, PMID:20660566, PMID:20979192, PMID:21834037, PMID:21850009, PMID:22087699, PMID:22317973, PMID:22499344, PMID:22683711, PMID:22926243, PMID:23751039, PMID:24033266, PMID:24129065, PMID:24169525, PMID:24224811, PMID:25157968, PMID:25741868, PMID:25914166, PMID:26619011, PMID:27195699, PMID:27589201, PMID:28027064, PMID:28139825, PMID:28390077, PMID:28492532, PMID:29073591, PMID:29493581, PMID:31775759 NCBI chr 1:214,178,404...214,181,841
Ensembl chr 1:214,178,407...214,181,686
JBrowse link
G Lrrc56 leucine rich repeat containing 56 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic
ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1
ClinVar PMID:11150980, PMID:12210337, PMID:14608654, PMID:16155195, PMID:16170316, PMID:16329078, PMID:16372351, PMID:16443854, PMID:16835863, PMID:16881968, PMID:16969868, PMID:17054105, PMID:17250658, PMID:17412879, PMID:17979197, PMID:18039947, PMID:18247425, PMID:18470943, PMID:18978862, PMID:19206176, PMID:19371735, PMID:19382114, PMID:19669404, PMID:20660566, PMID:20979192, PMID:21834037, PMID:21850009, PMID:22087699, PMID:22317973, PMID:22499344, PMID:22683711, PMID:22926243, PMID:23751039, PMID:24033266, PMID:24129065, PMID:24169525, PMID:24224811, PMID:25157968, PMID:25741868, PMID:25914166, PMID:26619011, PMID:27195699, PMID:27589201, PMID:28027064, PMID:28139825, PMID:28390077, PMID:28492532, PMID:29073591, PMID:29493581, PMID:31775759 NCBI chr 1:214,182,232...214,197,184
Ensembl chr 1:214,182,830...214,197,184
JBrowse link
G Met MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar
OMIM
PMID:1104268, PMID:9140397, PMID:9326629, PMID:9563489, PMID:9731534, PMID:9826708, PMID:10327054, PMID:10417759, PMID:10433944, PMID:11042681, PMID:11354004, PMID:11750879, PMID:11927612, PMID:12920089, PMID:14559814, PMID:15371818, PMID:15592501, PMID:15735036, PMID:16189274, PMID:17088437, PMID:17483355, PMID:18564920, PMID:19318576, PMID:19723643, PMID:20126411, PMID:20139696, PMID:20670955, PMID:20949619, PMID:21904579, PMID:21970370, PMID:22703879, PMID:22717761, PMID:23213094, PMID:23806086, PMID:24033266, PMID:24061647, PMID:24088041, PMID:24121490, PMID:24658158, PMID:24728327, PMID:25157968, PMID:25605252, PMID:25636233, PMID:25637381, PMID:25736269, PMID:25741868, PMID:25859546, PMID:26173098, PMID:26467025, PMID:26700204, PMID:26718692, PMID:26887047, PMID:27153395, PMID:27666373, PMID:27696107, PMID:28294470, PMID:28476232, PMID:28492532, PMID:28603720, PMID:28619094 NCBI chr 4:44,747,467...44,854,628
Ensembl chr 4:44,774,741...44,852,665
JBrowse link
G Mlh1 mutL homolog 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma ClinVar PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 8:119,486,655...119,523,716
Ensembl chr 8:119,486,691...119,523,964
JBrowse link
G Msh2 mutS homolog 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:18325052, PMID:21926548, PMID:24506336, PMID:24763289, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:26467025, PMID:26878173, PMID:26951660, PMID:28195393, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28640387, PMID:29887214 NCBI chr 6:11,215,951...11,274,916
Ensembl chr 6:11,215,963...11,274,932
JBrowse link
G Mtor mechanistic target of rapamycin kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic
ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1
ClinVar PMID:24631838, PMID:25741868, PMID:26018084, PMID:26619011, PMID:27159400, PMID:27830187 NCBI chr 5:165,263,813...165,373,967
Ensembl chr 5:165,263,800...165,373,967
JBrowse link
G Nfe2l2 nuclear factor, erythroid 2-like 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 3:62,497,568...62,525,146
Ensembl chr 3:62,497,571...62,524,996
JBrowse link
G Nras NRAS proto-oncogene, GTPase ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:1654209, PMID:2278970, PMID:2674680, PMID:3122217, PMID:6587382, PMID:8120410, PMID:10821536, PMID:12460918, PMID:12727991, PMID:14508525, PMID:15899789, PMID:16273091, PMID:16291983, PMID:16434492, PMID:17699718, PMID:18390968, PMID:18633438, PMID:18668139, PMID:18948947, PMID:19075190, PMID:19657110, PMID:19880792, PMID:20130576, PMID:20149136, PMID:20179705, PMID:20406486, PMID:20619739, PMID:20736745, PMID:21107323, PMID:21305640, PMID:21576590, PMID:21729679, PMID:21829508, PMID:22407852, PMID:22499344, PMID:22718121, PMID:22761467, PMID:22773810, PMID:23076151, PMID:23392294, PMID:23400451, PMID:23414587, PMID:23515407, PMID:23538902, PMID:23569304, PMID:23614898, PMID:24006476, PMID:24033266, PMID:24148783, PMID:24370118, PMID:24671188, PMID:25157968, PMID:25348872, PMID:25695684, PMID:26619011, PMID:26821351, PMID:27050078, PMID:28492532, PMID:28780248 NCBI chr 2:205,553,119...205,563,716
Ensembl chr 2:205,553,163...205,560,791
JBrowse link
G Pik3ca phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit alpha ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic
ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1
ClinVar PMID:15016963, PMID:15254419, PMID:15520168, PMID:15608678, PMID:15647370, PMID:15805248, PMID:16847462, PMID:16906227, PMID:16930767, PMID:17376864, PMID:17673550, PMID:18676830, PMID:18725974, PMID:19029981, PMID:19223544, PMID:19366826, PMID:19513541, PMID:19903786, PMID:20453058, PMID:20619739, PMID:21430269, PMID:21558396, PMID:21824802, PMID:22162582, PMID:22162589, PMID:22228622, PMID:22271473, PMID:22357840, PMID:22658544, PMID:22729222, PMID:22729223, PMID:22729224, PMID:23066039, PMID:23100325, PMID:23246288, PMID:23408298, PMID:23754335, PMID:23888070, PMID:24033266, PMID:24265155, PMID:24497998, PMID:24559322, PMID:24782230, PMID:25157968, PMID:25557259, PMID:25741868, PMID:26266975, PMID:26266985, PMID:26301495, PMID:26593112, PMID:26619011, PMID:26822237, PMID:26851524, PMID:27426476, PMID:27626068, PMID:27631024, PMID:27870750, PMID:28492532, PMID:28941273, PMID:29446767, PMID:31775759 NCBI chr 2:118,831,350...118,861,456
Ensembl chr 2:118,831,350...118,861,454
JBrowse link
G Prcc proline rich mitotic checkpoint control factor ISO OMIM NCBI chr 2:187,232,458...187,258,140
Ensembl chr 2:187,232,458...187,258,140
JBrowse link
G Pten phosphatase and tensin homolog ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:9467011, PMID:9915974, PMID:10866302, PMID:11504908, PMID:11875759, PMID:16773562, PMID:17526801, PMID:17942903, PMID:18767981, PMID:19457929, PMID:20085938, PMID:20300775, PMID:21659347, PMID:21822720, PMID:21824802, PMID:21828076, PMID:22266152, PMID:22320991, PMID:22327138, PMID:22595938, PMID:23335809, PMID:23399955, PMID:23470840, PMID:24778394, PMID:25157968, PMID:25527629, PMID:25741868, PMID:26619011, PMID:26798346, PMID:27477328, PMID:27535533, PMID:28475857, PMID:28492532, PMID:29359449, PMID:29706350 NCBI chr 1:251,421,814...251,487,634
Ensembl chr 1:251,421,596...251,487,832
JBrowse link
G Rheb Ras homolog, mTORC1 binding ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 4:6,827,429...6,873,384
Ensembl chr 4:6,827,429...6,873,383
JBrowse link
G Sdhb succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:18728283, PMID:19184535, PMID:19576851, PMID:22835832, PMID:24055113, PMID:24092654, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:26332594, PMID:28492532 NCBI chr 5:159,484,378...159,505,063
Ensembl chr 5:159,484,370...159,505,064
JBrowse link
G Sf3b1 splicing factor 3b, subunit 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 9:61,594,620...61,634,510
Ensembl chr 9:61,594,620...61,634,510
JBrowse link
G Sf3b2 splicing factor 3b, subunit 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 1:220,645,685...220,665,611
Ensembl chr 1:220,645,672...220,665,603
JBrowse link
G ST7 suppression of tumorigenicity 7 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 4:45,000,223...45,247,793
Ensembl chr 4:45,000,973...45,247,790
JBrowse link
G Tp53 tumor protein p53 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic
ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1
ClinVar PMID:1349175, PMID:1565143, PMID:1565144, PMID:1644930, PMID:1737852, PMID:7651740, PMID:7707106, PMID:7732013, PMID:7887414, PMID:8023157, PMID:8080050, PMID:8118819, PMID:8242631, PMID:8401536, PMID:8633021, PMID:8718514, PMID:8829627, PMID:8869100, PMID:9096669, PMID:9242456, PMID:9290701, PMID:9546439, PMID:9572492, PMID:9627118, PMID:9635828, PMID:9662334, PMID:9667734, PMID:10064694, PMID:10366100, PMID:10432928, PMID:10589545, PMID:10753186, PMID:10761705, PMID:10864200, PMID:10922393, PMID:11370630, PMID:11429705, PMID:11793474, PMID:11896595, PMID:11920788, PMID:11920959, PMID:12826609, PMID:12909720, PMID:12917626, PMID:14559903, PMID:14584079, PMID:15037740, PMID:15161705, PMID:15850016, PMID:15925506, PMID:15977174, PMID:15982667, PMID:16312222, PMID:16494995, PMID:16508005, PMID:16736287, PMID:16861262, PMID:17015838, PMID:17390010, PMID:17401428, PMID:17541742, PMID:17572079, PMID:17606709, PMID:18208484, PMID:18307025, PMID:18453682, PMID:18511570, PMID:18555592, PMID:19012332, PMID:19101993, PMID:19147582, PMID:19171880, PMID:19336573, PMID:19468865, PMID:19556618, PMID:19681600, PMID:19850740, PMID:19913028, PMID:20028212, PMID:20118236, PMID:20127978, PMID:20128691, PMID:20234365, PMID:20308654, PMID:20407015, PMID:20505364, PMID:20506564, PMID:20522432, PMID:20805372, PMID:20972454, PMID:21056685, PMID:21059199, PMID:21159183, PMID:21232794, PMID:21305319, PMID:21319261, PMID:21343334, PMID:21356188, PMID:21483000, PMID:21514416, PMID:21519010, PMID:21626334, PMID:21674059, PMID:21761402, PMID:22090360, PMID:22186996, PMID:22265402, PMID:22672556, PMID:22710932, PMID:22844452, PMID:22887876, PMID:22923379, PMID:22983585, PMID:23031740, PMID:23161690, PMID:23165212, PMID:23175693, PMID:23259501, PMID:23315175, PMID:23630318, PMID:23894400, PMID:24033266, PMID:24256616, PMID:24381225, PMID:24384472, PMID:24395441, PMID:24487413, PMID:24573247, PMID:24641375, PMID:24702488, PMID:24728327, PMID:24766216, PMID:25293557, PMID:25503501, PMID:25584008, PMID:25584637, PMID:25619955, PMID:25741868, PMID:25787918, PMID:25896519, PMID:25945745, PMID:25952993, PMID:25980754, PMID:26014290, PMID:26022348, PMID:26230955, PMID:26270727, PMID:26425688, PMID:26467025, PMID:26554828, PMID:26556299, PMID:26585234, PMID:26619011, PMID:26659639, PMID:26787237, PMID:26845104, PMID:26878390, PMID:26911350, PMID:26976419, PMID:27022024, PMID:27077130, PMID:27189670, PMID:27276561, PMID:27463065, PMID:27493922, PMID:27533082, PMID:27616075, PMID:27622479, PMID:27680515, PMID:27895058, PMID:27959731, PMID:28135145, PMID:28279309, PMID:28369373, PMID:28472496, PMID:28476805, PMID:28492532, PMID:28724667, PMID:28802053, PMID:28861920, PMID:28915717, PMID:28975465, PMID:29070607, PMID:29126202, PMID:29324801, PMID:29489754, PMID:29753700, PMID:29979965, PMID:30128536, PMID:30216591, PMID:30224644, PMID:30297838, PMID:30306255, PMID:30311369, PMID:30352134, PMID:30450585, PMID:30720243, PMID:31775759 NCBI chr10:56,186,299...56,198,449
Ensembl chr10:56,187,020...56,198,449
JBrowse link
G Vhl von Hippel-Lindau tumor suppressor ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:7660122, PMID:7728151, PMID:7784063, PMID:7987306, PMID:7987327, PMID:8270255, PMID:8522307, PMID:8592333, PMID:8707293, PMID:8730290, PMID:8956040, PMID:9156047, PMID:9452032, PMID:9829911, PMID:9829912, PMID:10567493, PMID:10900011, PMID:11309459, PMID:11921283, PMID:12000816, PMID:12114495, PMID:14722919, PMID:14973063, PMID:14987375, PMID:15300849, PMID:15574766, PMID:17102069, PMID:17350623, PMID:18446368, PMID:18836774, PMID:19030229, PMID:19252526, PMID:19270817, PMID:19464396, PMID:19602254, PMID:20660572, PMID:21362373, PMID:21715564, PMID:22799452, PMID:23512077, PMID:24206762, PMID:24301059, PMID:25119015, PMID:25157968, PMID:25371412, PMID:25563310, PMID:25720320, PMID:25741868, PMID:25867206, PMID:26822237, PMID:27527340, PMID:27539324, PMID:27617348, PMID:28492532, PMID:28944243, PMID:29616089, PMID:30042107 NCBI chr 4:145,580,869...145,587,835
Ensembl chr 4:145,580,799...145,587,845
JBrowse link
G Wnt2 Wnt family member 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Renal cell carcinoma, papillary, 1 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 4:45,286,845...45,332,899
Ensembl chr 4:45,292,437...45,332,420
JBrowse link
Sporadic Papillary Renal Cell Carcinoma term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Araf A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:24569458, PMID:26619011 NCBI chr  X:1,369,534...1,391,603
Ensembl chr  X:1,379,194...1,390,873
JBrowse link
G Braf B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:12068308, PMID:12198537, PMID:12447372, PMID:12460918, PMID:12460919, PMID:12619120, PMID:12644542, PMID:12670889, PMID:12794760, PMID:12960123, PMID:14513361, PMID:14602780, PMID:14679157, PMID:15001635, PMID:15035987, PMID:15126572, PMID:15181070, PMID:15342696, PMID:15356022, PMID:15386408, PMID:15687339, PMID:15998781, PMID:16015629, PMID:16174717, PMID:16187918, PMID:16772349, PMID:17374713, PMID:17488796, PMID:17785355, PMID:18398503, PMID:19001320, PMID:19010912, PMID:19018267, PMID:19238210, PMID:19404918, PMID:19537845, PMID:19561230, PMID:20008640, PMID:20350999, PMID:20413299, PMID:20619739, PMID:20630094, PMID:20818844, PMID:20823850, PMID:20857202, PMID:21107320, PMID:21107323, PMID:21129611, PMID:21156289, PMID:21163703, PMID:21426297, PMID:21483012, PMID:21502544, PMID:21639808, PMID:21641636, PMID:21683865, PMID:21975775, PMID:22038996, PMID:22048237, PMID:22113612, PMID:22180495, PMID:22281684, PMID:22351686, PMID:22356324, PMID:22389471, PMID:22448344, PMID:22536370, PMID:22586120, PMID:22608338, PMID:22649091, PMID:22663011, PMID:22735384, PMID:22743296, PMID:22773810, PMID:22805292, PMID:22972589, PMID:22997239, PMID:23020132, PMID:23031422, PMID:23251002, PMID:23302800, PMID:23325582, PMID:23470635, PMID:23524406, PMID:23549875, PMID:23614898, PMID:23685455, PMID:23812671, PMID:23833300, PMID:23845441, PMID:23918947, PMID:24033266, PMID:24107445, PMID:24112392, PMID:24163374, PMID:24388723, PMID:24446311, PMID:24508103, PMID:24512911, PMID:24576830, PMID:24583796, PMID:24586605, PMID:24594804, PMID:24670642, PMID:24717435, PMID:25024077, PMID:25037139, PMID:25079330, PMID:25157968, PMID:25265492, PMID:25265494, PMID:25370471, PMID:25399551, PMID:25950823, PMID:25989278, PMID:26619011, PMID:26678033, PMID:27404270, PMID:27480103, PMID:28854169, PMID:28891408, PMID:29925953, PMID:31779674, PMID:31891627 NCBI chr 4:67,389,331...67,520,549
Ensembl chr 4:67,396,192...67,520,356
JBrowse link
G Cdkn2a cyclin-dependent kinase inhibitor 2A ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:25741868, PMID:26619011 NCBI chr 5:107,823,323...107,832,405
Ensembl chr 5:107,823,330...107,841,175
JBrowse link
G Erbb2 erb-b2 receptor tyrosine kinase 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:18413839, PMID:22046346, PMID:23220880, PMID:25157968, PMID:26619011 NCBI chr10:86,367,596...86,391,728
Ensembl chr10:86,367,596...86,391,728
JBrowse link
G Fbxw7 F-box and WD repeat domain containing 7 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 2:184,230,191...184,309,805
Ensembl chr 2:184,231,260...184,309,664
JBrowse link
G Fgfr3 fibroblast growth factor receptor 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:8589699, PMID:8845844, PMID:9438390, PMID:9843049, PMID:10471491, PMID:11038465, PMID:11429702, PMID:11879084, PMID:15772091, PMID:17384684, PMID:19088846, PMID:19331127, PMID:19381019, PMID:19749790, PMID:20542753, PMID:21273588, PMID:22869148, PMID:23200862, PMID:24476948, PMID:25157968, PMID:25606676, PMID:25741868, PMID:26619011, PMID:28249712, PMID:28492532, PMID:30311386 NCBI chr14:82,272,322...82,287,739
Ensembl chr14:82,273,070...82,287,706
JBrowse link
G Hras HRas proto-oncogene, GTPase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:11150980, PMID:12210337, PMID:14608654, PMID:16155195, PMID:16170316, PMID:16329078, PMID:16372351, PMID:16443854, PMID:16835863, PMID:16881968, PMID:16969868, PMID:17054105, PMID:17250658, PMID:17412879, PMID:17979197, PMID:18039947, PMID:18247425, PMID:18470943, PMID:18978862, PMID:19206176, PMID:19371735, PMID:19382114, PMID:19669404, PMID:20660566, PMID:20979192, PMID:21834037, PMID:21850009, PMID:22087699, PMID:22317973, PMID:22499344, PMID:22683711, PMID:22926243, PMID:23751039, PMID:24033266, PMID:24129065, PMID:24169525, PMID:24224811, PMID:25157968, PMID:25741868, PMID:25914166, PMID:26619011, PMID:27195699, PMID:27589201, PMID:28027064, PMID:28139825, PMID:28390077, PMID:28492532, PMID:29073591, PMID:29493581, PMID:31775759 NCBI chr 1:214,178,404...214,181,841
Ensembl chr 1:214,178,407...214,181,686
JBrowse link
G Lrrc56 leucine rich repeat containing 56 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:11150980, PMID:12210337, PMID:14608654, PMID:16155195, PMID:16170316, PMID:16329078, PMID:16372351, PMID:16443854, PMID:16835863, PMID:16881968, PMID:16969868, PMID:17054105, PMID:17250658, PMID:17412879, PMID:17979197, PMID:18039947, PMID:18247425, PMID:18470943, PMID:18978862, PMID:19206176, PMID:19371735, PMID:19382114, PMID:19669404, PMID:20660566, PMID:20979192, PMID:21834037, PMID:21850009, PMID:22087699, PMID:22317973, PMID:22499344, PMID:22683711, PMID:22926243, PMID:23751039, PMID:24033266, PMID:24129065, PMID:24169525, PMID:24224811, PMID:25157968, PMID:25741868, PMID:25914166, PMID:26619011, PMID:27195699, PMID:27589201, PMID:28027064, PMID:28139825, PMID:28390077, PMID:28492532, PMID:29073591, PMID:29493581, PMID:31775759 NCBI chr 1:214,182,232...214,197,184
Ensembl chr 1:214,182,830...214,197,184
JBrowse link
G Mtor mechanistic target of rapamycin kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:24631838, PMID:26018084, PMID:26619011, PMID:27159400, PMID:27830187 NCBI chr 5:165,263,813...165,373,967
Ensembl chr 5:165,263,800...165,373,967
JBrowse link
G Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor severity ISO mRNA:increased expression:renal cortex (human)
protein:increased expression:kidney (human)
RGD PMID:19384955, PMID:17409424 RGD:7240562, RGD:7240563 NCBI chr 7:102,586,313...102,591,240
Ensembl chr 7:102,586,313...102,591,240
JBrowse link
G Pik3ca phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit alpha ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:15016963, PMID:15254419, PMID:15520168, PMID:15608678, PMID:15647370, PMID:15805248, PMID:16847462, PMID:16906227, PMID:16930767, PMID:17376864, PMID:17673550, PMID:18676830, PMID:18725974, PMID:19029981, PMID:19223544, PMID:19366826, PMID:19513541, PMID:19903786, PMID:20453058, PMID:20619739, PMID:21430269, PMID:21558396, PMID:22162582, PMID:22162589, PMID:22228622, PMID:22271473, PMID:22357840, PMID:22658544, PMID:22729223, PMID:22729224, PMID:23066039, PMID:23246288, PMID:23408298, PMID:23754335, PMID:23888070, PMID:24033266, PMID:24265155, PMID:24497998, PMID:24559322, PMID:25157968, PMID:25557259, PMID:26301495, PMID:26593112, PMID:26619011, PMID:26851524, PMID:27426476, PMID:27631024, PMID:27870750, PMID:28941273, PMID:29446767, PMID:31775759 NCBI chr 2:118,831,350...118,861,456
Ensembl chr 2:118,831,350...118,861,454
JBrowse link
G Rheb Ras homolog, mTORC1 binding ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:26619011 NCBI chr 4:6,827,429...6,873,384
Ensembl chr 4:6,827,429...6,873,383
JBrowse link
G Tp53 tumor protein p53 ISO ClinVar Annotator: match by term: Papillary renal cell carcinoma, sporadic ClinVar PMID:1565143, PMID:7887414, PMID:8023157, PMID:8118819, PMID:8242631, PMID:8401536, PMID:8633021, PMID:9242456, PMID:9627118, PMID:9662334, PMID:10432928, PMID:10589545, PMID:10922393, PMID:12826609, PMID:14559903, PMID:15037740, PMID:15977174, PMID:16312222, PMID:16861262, PMID:17015838, PMID:17390010, PMID:17606709, PMID:18307025, PMID:19101993, PMID:19556618, PMID:20028212, PMID:20128691, PMID:20234365, PMID:20308654, PMID:20407015, PMID:20805372, PMID:21056685, PMID:21343334, PMID:21356188, PMID:21483000, PMID:21514416, PMID:21761402, PMID:22265402, PMID:22887876, PMID:22923379, PMID:23031740, PMID:23259501, PMID:23315175, PMID:23630318, PMID:24381225, PMID:24395441, PMID:24487413, PMID:24641375, PMID:24702488, PMID:25584008, PMID:25741868, PMID:25945745, PMID:26425688, PMID:26467025, PMID:26585234, PMID:26619011, PMID:26911350, PMID:27189670, PMID:28279309, PMID:28369373, PMID:28476805, PMID:28492532, PMID:28724667, PMID:28975465, PMID:29979965, PMID:30224644, PMID:30297838, PMID:30720243, PMID:31775759 NCBI chr10:56,186,299...56,198,449
Ensembl chr10:56,187,020...56,198,449
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  disease 16045
    disease of cellular proliferation 5917
      Neoplasms by Histologic Type 3728
        Glandular and Epithelial Neoplasms 2315
          carcinoma 2114
            papillary carcinoma 35
              papillary renal cell carcinoma 33
                Sporadic Papillary Renal Cell Carcinoma 13
Path 2
Term Annotations click to browse term
  disease 16045
    disease of anatomical entity 15292
      Urogenital Diseases 4147
        urinary system disease 2069
          kidney disease 1857
            Kidney Neoplasms 427
              kidney cancer 399
                renal carcinoma 345
                  renal cell carcinoma 339
                    papillary renal cell carcinoma 33
                      Sporadic Papillary Renal Cell Carcinoma 13
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.