Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

RGD DISEASE ONTOLOGY - ANNOTATIONS

RGD uses the Human Disease Ontology (DO, https://disease-ontology.org/) for disease curation across species. RGD automatically downloads each new release of the ontology on a monthly basis. Some additional terms which are required for RGD's curation purposes but are not currently covered in the official version of DO have been added. As corresponding terms are added to DO, these custom terms are retired and the DO terms substituted in existing annotations and subsequently used for curation.

Term:Lynch syndrome
go back to main search page
Accession:DOID:3883 term browser browse the term
Definition:A group of autosomal-dominant inherited diseases in which COLON CANCER arises in discrete adenomas. Unlike FAMILIAL POLYPOSIS COLI with hundreds of polyps, hereditary nonpolyposis colorectal neoplasms occur much later, in the fourth and fifth decades. HNPCC has been associated with germline mutations in mismatch repair (MMR) genes. It has been subdivided into Lynch syndrome I or site-specific colonic cancer, and LYNCH SYNDROME II which includes extracolonic cancer.
Synonyms:exact_synonym: APC-mutation negative familial colorectal cancer;   Colorectal Cancer Hereditary Nonpolyposis;   Colorectal Cancer, Non-Polyposis;   Familial Nonpolyposis Colon Cancer;   HNPCC - hereditary nonpolyposis colon cancer;   Hereditary Nonpolyposis Colon Cancer;   hereditary defective mismatch repair syndrome;   hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma;   hereditary nonpolyposis colorectal neoplasm
 primary_id: MESH:D003123
 xref: GARD:9905;   NCI:C120083;   NCI:C8494;   OMIM:PS120435;   ORDO:144
For additional species annotation, visit the Alliance of Genome Resources.


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
Lynch syndrome term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Aimp2 aminoacyl tRNA synthetase complex-interacting multifunctional protein 2 ISO ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar PMID:17453009, PMID:18602922, PMID:20186688 NCBI chr12:12,738,784...12,748,345
Ensembl chr12:12,738,812...12,748,345
JBrowse link
G Ankrd61 ankyrin repeat domain 61 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer ClinVar PMID:17453009, PMID:18602922, PMID:20186688, PMID:20205264, PMID:20487569, PMID:22577899, PMID:23837913, PMID:25856668, PMID:26895986, PMID:30877237 NCBI chr12:12,756,480...12,760,838
Ensembl chr12:12,756,452...12,760,838
JBrowse link
G Apc APC regulator of WNT signaling pathway ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD PMID:7661930 NCBI chr18:27,011,710...27,106,323
Ensembl chr18:27,047,382...27,105,531
JBrowse link
G Cd44 CD44 molecule (Indian blood group) ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD PMID:28255344 NCBI chr 3:92,695,083...92,783,820
Ensembl chr 3:92,696,313...92,783,658
JBrowse link
G Cyp2a3 cytochrome P450, family 2, subfamily a, polypeptide 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: APC-mutation negative familial colorectal cancer ClinVar PMID:28306719 NCBI chr 1:83,653,248...83,662,118
Ensembl chr 1:83,653,234...83,766,484
JBrowse link
G Eif2ak1 eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer ClinVar PMID:17453009, PMID:18602922, PMID:20186688, PMID:20205264, PMID:20487569, PMID:22577899, PMID:23837913, PMID:25856668, PMID:26895986, PMID:30877237 NCBI chr12:12,749,026...12,782,078
Ensembl chr12:12,748,785...12,782,146
JBrowse link
G Eif2b2 eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome ClinVar PMID:25741868 NCBI chr 6:109,044,830...109,051,254
Ensembl chr 6:109,043,880...109,051,253
JBrowse link
G Epcam epithelial cell adhesion molecule ISO ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
CTD
PMID:19177550, PMID:21145788, PMID:21227399, PMID:22243433, PMID:23264089, PMID:23938213, PMID:24033266, PMID:25637381, PMID:25701956, PMID:25741868, PMID:28492532, PMID:30374176 NCBI chr 6:11,282,194...11,308,870
Ensembl chr 6:11,281,964...11,298,216
JBrowse link
G Epm2aip1 EPM2A interacting protein 1 ISO ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer ClinVar NCBI chr 8:119,524,039...119,531,387
Ensembl chr 8:119,524,039...119,531,387
JBrowse link
G Fbxo11 F-box protein 11 ISO ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer ClinVar NCBI chr 6:11,662,356...11,737,427
Ensembl chr 6:11,662,356...11,686,682
JBrowse link
G Gstm1 glutathione S-transferase mu 1 ISO DNA:deletion, haplotype: : (human) RGD PMID:9834266 RGD:12792228 NCBI chr 2:210,803,869...210,809,461
Ensembl chr 2:210,803,869...210,809,306
JBrowse link
G Gstt1 glutathione S-transferase theta 1 ISO DNA:deletion, haplotype:: (human) RGD PMID:9834266 RGD:12792228 NCBI chr20:13,799,102...13,816,527
Ensembl chr20:13,799,102...13,816,526
JBrowse link
G Lrrfip2 LRR binding FLII interacting protein 2 ISO ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar PMID:12658575, PMID:14635101, PMID:15713769, PMID:16143124, PMID:18556772, PMID:18566915, PMID:19690142, PMID:21348412, PMID:26681312, PMID:28135145 NCBI chr 8:119,381,666...119,484,125
Ensembl chr 8:119,382,011...119,483,043
JBrowse link
G Mlh1 mutL homolog 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Familial nonpolyposis colon cancer
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I
ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by synonym: Lynch Syndrome
ClinVar
CTD
PMID:16, PMID:1522200, PMID:1749856, PMID:1756143, PMID:2022152, PMID:4063166, PMID:5713769, PMID:7557107, PMID:7584997, PMID:7704024, PMID:7705822, PMID:7728749, PMID:7757073, PMID:7812952, PMID:8128251, PMID:8145827, PMID:8198129, PMID:8521394, PMID:8521398, PMID:8566964, PMID:8571956, PMID:8574961, PMID:8581513, PMID:8592341, PMID:8646682, PMID:8751876, PMID:8776590, PMID:8797773, PMID:08808596, PMID:8863153, PMID:8872463, PMID:8880570, PMID:8895729, PMID:8938136, PMID:8940269, PMID:8971183, PMID:8993976, PMID:9032648, PMID:9052445, PMID:9071575, PMID:9087566, PMID:9218993, PMID:9234704, PMID:9272156, PMID:9288790, PMID:9298827, PMID:9311737, PMID:9322509, PMID:9326924, PMID:9377556, PMID:9399661, PMID:9419403, PMID:9490293, PMID:9506527, PMID:9526167, PMID:9559627, PMID:9611074, PMID:9634524, PMID:9697702, PMID:9718327, PMID:9777949, PMID:9788388, PMID:9806477, PMID:9820400, PMID:9831355, PMID:9833759, PMID:9927033, PMID:9927034, PMID:10037723, PMID:10082584, PMID:10196371, PMID:10200055, PMID:10323887, PMID:10348818, PMID:10375096, PMID:10386556, PMID:10389971, PMID:10422993, PMID:10446963, PMID:10448273, PMID:10471527, PMID:10480359, PMID:10495924, PMID:10521294, PMID:10533476, PMID:10534773, PMID:10573010, PMID:10598809, PMID:10601588, PMID:10612827, PMID:10660333, PMID:10709098, PMID:10713887, PMID:10732761, PMID:10777691, PMID:10793088, PMID:10799973, PMID:10829038, PMID:10861474, PMID:10874307, PMID:10882759, PMID:10923051, PMID:10970186, PMID:10985134, PMID:10995807, PMID:11015456, PMID:11093816, PMID:11112663, PMID:11139242, PMID:11151427, PMID:11179758, PMID:11208710, PMID:11291077, PMID:11292842, PMID:11304573, PMID:11306449, PMID:11342971, PMID:11343035, PMID:11369138, PMID:11376800, PMID:11385712, PMID:11427529, PMID:11429708, PMID:11474654, PMID:11507050, PMID:11524701, PMID:11555625, PMID:11585727, PMID:11601928, PMID:11606497, PMID:11726306, PMID:11748856, PMID:11754112, PMID:11781295, PMID:11793442, PMID:11839723, PMID:11879922, PMID:11920458, PMID:11920650, PMID:11948175, PMID:12011148, PMID:12037578, PMID:12052501, PMID:12067992, PMID:12070261, PMID:12095971, PMID:12112654, PMID:12115348, PMID:12132870, PMID:12173039, PMID:12183410, PMID:12200596, PMID:12362047, PMID:12362848, PMID:12373605, PMID:12377806, PMID:12386821, PMID:12414623, PMID:12414824, PMID:12419761, PMID:12513688, PMID:12522551, PMID:12537657, PMID:12547705, PMID:12555990, PMID:12618391, PMID:12624141, PMID:12655562, PMID:12655568, PMID:12658575, PMID:12799449, PMID:12808326, PMID:12810663, PMID:12874865, PMID:12919137, PMID:12919140, PMID:14504054, PMID:14512394, PMID:14514376, PMID:14517962, PMID:14526391, PMID:14574010, PMID:14635101, PMID:14645426, PMID:14688830, PMID:14699485, PMID:14756672, PMID:14762794, PMID:14871975, PMID:14961575, PMID:14970868, PMID:14985405, PMID:15024732, PMID:15046089, PMID:15099349, PMID:15133479, PMID:15139004, PMID:15173238, PMID:15178966, PMID:15184898, PMID:15217520, PMID:15222003, PMID:15235038, PMID:15253764, PMID:15254659, PMID:15289847, PMID:15300854, PMID:15309712, PMID:15340264, PMID:15342696, PMID:15345113, PMID:15365995, PMID:15365996, PMID:15466831, PMID:15475387, PMID:15494688, PMID:15520370, PMID:15555211, PMID:15563510, PMID:15571801, PMID:15613555, PMID:15655560, PMID:15713769, PMID:15731775, PMID:15765394, PMID:15786548, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15849752, PMID:15855432, PMID:15864295, PMID:15870828, PMID:15872200, PMID:15926618, PMID:15943554, PMID:15955785, PMID:15991064, PMID:15991306, PMID:15996210, PMID:16034045, PMID:16083711, PMID:16116158, PMID:16142001, PMID:16143124, PMID:16181381, PMID:16203774, PMID:16206289, PMID:16216036, PMID:16276679, PMID:16288214, PMID:16338176, PMID:16341550, PMID:16341804, PMID:16395668, PMID:16425354, PMID:16451135, PMID:16456782, PMID:16521201, PMID:16616355, PMID:16636019, PMID:16685411, PMID:16724012, PMID:16736289, PMID:16736291, PMID:16807412, PMID:16810763, PMID:16830052, PMID:16837128, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16941473, PMID:16963262, PMID:16982745, PMID:16995940, PMID:17011982, PMID:17054581, PMID:17074586, PMID:17087981, PMID:17095871, PMID:17117178, PMID:17135187, PMID:17192056, PMID:17199584, PMID:17203532, PMID:17210669, PMID:17222328, PMID:17228328, PMID:17267619, PMID:17301300, PMID:17312306, PMID:17348456, PMID:17417778, PMID:17440950, PMID:17440981, PMID:17453009, PMID:17473388, PMID:17505997, PMID:17510385, PMID:17569143, PMID:17576681, PMID:17594722, PMID:17653898, PMID:17665423, PMID:17690979, PMID:17889038, PMID:17895478, PMID:18033691, PMID:18069769, PMID:18094436, PMID:18205192, PMID:18227862, PMID:18270343, PMID:18301448, PMID:18307539, PMID:18325052, PMID:18337503, PMID:18373977, PMID:18383312, PMID:18389388, PMID:18415027, PMID:18470917, PMID:18518984, PMID:18547406, PMID:18556772, PMID:18561205, PMID:18566915, PMID:18618713, PMID:18625694, PMID:18636350, PMID:18713544, PMID:18726168, PMID:18759827, PMID:18772310, PMID:18809606, PMID:18931482, PMID:18951437, PMID:19015241, PMID:19047842, PMID:19072991, PMID:19116412, PMID:19117025, PMID:19120036, PMID:19130300, PMID:19133695, PMID:19142183, PMID:19224586, PMID:19250818, PMID:19267393, PMID:19324997, PMID:19389263, PMID:19419416, PMID:19459153, PMID:19504447, PMID:19526325, PMID:19575290, PMID:19621678, PMID:19665066, PMID:19669161, PMID:19685281, PMID:19690142, PMID:19697156, PMID:19698169, PMID:19731080, PMID:19760518, PMID:19863800, PMID:20007843, PMID:20020535, PMID:20045164, PMID:20167975, PMID:20176655, PMID:20176959, PMID:20215533, PMID:20223024, PMID:20233461, PMID:20305446, PMID:20373145, PMID:20459533, PMID:20533529, PMID:20587412, PMID:20682701, PMID:20704743, PMID:20717847, PMID:20858721, PMID:20864636, PMID:20937110, PMID:20978114, PMID:20978117, PMID:21034533, PMID:21056691, PMID:21064154, PMID:21120944, PMID:21153778, PMID:21155023, PMID:21239990, PMID:21247423, PMID:21286667, PMID:21286823, PMID:21311894, PMID:21348412, PMID:21387278, PMID:21404117, PMID:21404177, PMID:21475916, PMID:21520333, PMID:21598002, PMID:21636617, PMID:21642682, PMID:21671081, PMID:21671475, PMID:21681552, PMID:21778331, PMID:21868491, PMID:21901500, PMID:21952876, PMID:22081473, PMID:22086678, PMID:22102614, PMID:22136435, PMID:22252508, PMID:22290698, PMID:22322191, PMID:22395473, PMID:22426235, PMID:22453149, PMID:22480969, PMID:22658618, PMID:22691310, PMID:22692065, PMID:22703879, PMID:22736432, PMID:22753075, PMID:22773173, PMID:22776989, PMID:22788692, PMID:22843852, PMID:22854115, PMID:22875147, PMID:22878509, PMID:22883484, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:22987205, PMID:22995991, PMID:23047549, PMID:23112559, PMID:23329266, PMID:23354017, PMID:23403630, PMID:23431106, PMID:23523604, PMID:23544471, PMID:23573243, PMID:23612316, PMID:23640085, PMID:23695190, PMID:23712482, PMID:23729658, PMID:23741719, PMID:23747338, PMID:23752102, PMID:23760103, PMID:23990280, PMID:24032978, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24090359, PMID:24122200, PMID:24204293, PMID:24278394, PMID:24292105, PMID:24323032, PMID:24333619, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24440087, PMID:24456667, PMID:24549055, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728327, PMID:24743384, PMID:24802709, PMID:24811117, PMID:24851142, PMID:24933000, PMID:24953332, PMID:25060679, PMID:25077178, PMID:25081409, PMID:25110875, PMID:25111426, PMID:25115387, PMID:25117503, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25148578, PMID:25157968, PMID:25186627, PMID:25197397, PMID:25338684, PMID:25345868, PMID:25420488, PMID:25430799, PMID:25435955, PMID:25477341, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25530820, PMID:25559809, PMID:25576899, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25640679, PMID:25648859, PMID:25701956, PMID:25741868, PMID:25762362, PMID:25782445, PMID:25823662, PMID:25851949, PMID:25871441, PMID:25871621, PMID:25882375, PMID:25892863, PMID:25927356, PMID:25980754, PMID:26053027, PMID:26078562, PMID:26096739, PMID:26202870, PMID:26206375, PMID:26247049, PMID:26248088, PMID:26249686, PMID:26300997, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26437257, PMID:26437357, PMID:26467025, PMID:26485756, PMID:26517685, PMID:26552419, PMID:26557847, PMID:26580448, PMID:26628864, PMID:26637282, PMID:26659639, PMID:26666765, PMID:26681312, PMID:26761715, PMID:26811195, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26895986, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26976419, PMID:27064304, PMID:27093186, PMID:27152634, PMID:27153395, PMID:27173243, PMID:27185373, PMID:27295708, PMID:27435373, PMID:27449771, PMID:27487738, PMID:27498913, PMID:27553368, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27602174, PMID:27629256, PMID:27647783, PMID:27696107, PMID:27732944, PMID:27831900, PMID:27978560, PMID:28127413, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28259476, PMID:28334867, PMID:28349240, PMID:28445943, PMID:28449805, PMID:28492532, PMID:28514183, PMID:28526081, PMID:28528518, PMID:28687356, PMID:28724667, PMID:28767289, PMID:28822769, PMID:28874130, PMID:28932927, PMID:28944238, PMID:29050249, PMID:29124495, PMID:29151953, PMID:29212164, PMID:29228462, PMID:29288294, PMID:29360161, PMID:29360550, PMID:29368341, PMID:29419868, PMID:29472279, PMID:29505604, PMID:29506128, PMID:29520894, PMID:29575718, PMID:29596542, PMID:29755653, PMID:29758216, PMID:29887214, PMID:30013564, PMID:30019097, PMID:30093976, PMID:30256826, PMID:30374176, PMID:30504929, PMID:30521064, PMID:30702970, PMID:30720243, PMID:30917047, PMID:30998989, PMID:31118792, PMID:31386297, PMID:31391288, PMID:31784484, PMID:32566746, PMID:15571801 RGD:1625106 NCBI chr 8:119,486,655...119,523,716
Ensembl chr 8:119,486,691...119,523,964
JBrowse link
G Mlh3 mutL homolog 3 ISO DNA:point mutations:exon:Q24E, N499S, E624Q, E1451K
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Colorectal cancer, non-polyposis
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
CTD
PMID:11586295, PMID:12702580, PMID:18521850, PMID:19156873, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:28492532, PMID:29212164, PMID:11586295 RGD:1600415 NCBI chr 6:109,059,386...109,095,876
Ensembl chr 6:109,059,341...109,095,557
JBrowse link
G Msh2 mutS homolog 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar
CTD
PMID:1061282, PMID:1710317, PMID:2695166, PMID:3616036, PMID:6096739, PMID:7557107, PMID:7585065, PMID:7713503, PMID:7717919, PMID:7726159, PMID:7874129, PMID:7937795, PMID:8062247, PMID:8261515, PMID:8521394, PMID:8566964, PMID:8574961, PMID:8581513, PMID:8589682, PMID:8592341, PMID:8613431, PMID:8723682, PMID:8808596, PMID:8872463, PMID:8880570, PMID:8895729, PMID:8931714, PMID:8993976, PMID:9002677, PMID:9036882, PMID:9052445, PMID:9087566, PMID:9125109, PMID:9217825, PMID:9222765, PMID:9240418, PMID:9288790, PMID:9298827, PMID:9311737, PMID:9506527, PMID:9611074, PMID:9621522, PMID:9634524, PMID:9709044, PMID:9718327, PMID:9739019, PMID:9774676, PMID:9777949, PMID:10023327, PMID:10051005, PMID:10077621, PMID:10080150, PMID:10196371, PMID:10323887, PMID:10369701, PMID:10375096, PMID:10397236, PMID:10404063, PMID:10413423, PMID:10422993, PMID:10432927, PMID:10446963, PMID:10448273, PMID:10469597, PMID:10480359, PMID:10495924, PMID:10523644, PMID:10528862, PMID:10530344, PMID:10564582, PMID:10573010, PMID:10612827, PMID:10612836, PMID:10712226, PMID:10713887, PMID:10732761, PMID:10777691, PMID:10793088, PMID:10812001, PMID:10874307, PMID:10874318, PMID:10882759, PMID:10978353, PMID:10995807, PMID:11074494, PMID:11112663, PMID:11151427, PMID:11179758, PMID:11208710, PMID:11291077, PMID:11304573, PMID:11379475, PMID:11385712, PMID:11420466, PMID:11524701, PMID:11535541, PMID:11555625, PMID:11601928, PMID:11606497, PMID:11691782, PMID:11720433, PMID:11754112, PMID:11769729, PMID:11772966, PMID:11782355, PMID:11809679, PMID:11830542, PMID:11854906, PMID:11870161, PMID:11879922, PMID:11910346, PMID:11920458, PMID:11920650, PMID:11975096, PMID:12067992, PMID:12070261, PMID:12112654, PMID:12115348, PMID:12115503, PMID:12124176, PMID:12132870, PMID:12173039, PMID:12200596, PMID:12324578, PMID:12352241, PMID:12362047, PMID:12373605, PMID:12385013, PMID:12386821, PMID:12414824, PMID:12419761, PMID:12436451, PMID:12454801, PMID:12522549, PMID:12537652, PMID:12547705, PMID:12549480, PMID:12624141, PMID:12626904, PMID:12655562, PMID:12655564, PMID:12655568, PMID:12658575, PMID:12660027, PMID:12694232, PMID:12702580, PMID:12792735, PMID:12875840, PMID:12949792, PMID:14499697, PMID:14504054, PMID:14512394, PMID:14514376, PMID:14526391, PMID:14574162, PMID:14574163, PMID:14580774, PMID:14594944, PMID:14635101, PMID:14729822, PMID:14756672, PMID:14871915, PMID:14871975, PMID:14970868, PMID:14994245, PMID:15046089, PMID:15075785, PMID:15178966, PMID:15217520, PMID:15222003, PMID:15235030, PMID:15235034, PMID:15254659, PMID:15309712, PMID:15340264, PMID:15342696, PMID:15350299, PMID:15365995, PMID:15365996, PMID:15516845, PMID:15520224, PMID:15520370, PMID:15527911, PMID:15571801, PMID:15655560, PMID:15680406, PMID:15713769, PMID:15731775, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15855432, PMID:15862756, PMID:15872200, PMID:15926618, PMID:15929773, PMID:15942939, PMID:15943554, PMID:15945244, PMID:15955785, PMID:15991308, PMID:15991314, PMID:15996210, PMID:16015629, PMID:16034045, PMID:16086322, PMID:16116158, PMID:16142001, PMID:16143124, PMID:16175654, PMID:16181381, PMID:16199548, PMID:16203774, PMID:16216036, PMID:16237223, PMID:16251890, PMID:16311127, PMID:16327991, PMID:16341550, PMID:16395668, PMID:16408224, PMID:16423994, PMID:16425354, PMID:16451135, PMID:16476474, PMID:16479259, PMID:16500024, PMID:16534870, PMID:16574953, PMID:16614121, PMID:16616355, PMID:16636019, PMID:16639607, PMID:16736289, PMID:16803540, PMID:16807412, PMID:16810763, PMID:16830052, PMID:16837128, PMID:16884359, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16995940, PMID:16996571, PMID:17011982, PMID:17074586, PMID:17095871, PMID:17101317, PMID:17165155, PMID:17189986, PMID:17192056, PMID:17229076, PMID:17250661, PMID:17250665, PMID:17250671, PMID:17312306, PMID:17348456, PMID:17350822, PMID:17374836, PMID:17414604, PMID:17440950, PMID:17453009, PMID:17473388, PMID:17483304, PMID:17505997, PMID:17531815, PMID:17569143, PMID:17594722, PMID:17601929, PMID:17653898, PMID:17661183, PMID:17720936, PMID:17846840, PMID:17939062, PMID:18033691, PMID:18257912, PMID:18270343, PMID:18289827, PMID:18307539, PMID:18325052, PMID:18383312, PMID:18389388, PMID:18406877, PMID:18415027, PMID:18470917, PMID:18547406, PMID:18556772, PMID:18559331, PMID:18561205, PMID:18566915, PMID:18618713, PMID:18625694, PMID:18636359, PMID:18641418, PMID:18674656, PMID:18726168, PMID:18759827, PMID:18772310, PMID:18781192, PMID:18781619, PMID:18822302, PMID:18841495, PMID:18931482, PMID:18951462, PMID:18951465, PMID:18990764, PMID:19047842, PMID:19072991, PMID:19101824, PMID:19117025, PMID:19250818, PMID:19267393, PMID:19324997, PMID:19389263, PMID:19419416, PMID:19459153, PMID:19659756, PMID:19669161, PMID:19669601, PMID:19685281, PMID:19690142, PMID:19697156, PMID:19698169, PMID:19706203, PMID:19723918, PMID:19728162, PMID:19731080, PMID:19760518, PMID:19930554, PMID:20007843, PMID:20010080, PMID:20052760, PMID:20068152, PMID:20176959, PMID:20215533, PMID:20223024, PMID:20233461, PMID:20301390, PMID:20305446, PMID:20388775, PMID:20459533, PMID:20587412, PMID:20591884, PMID:20672385, PMID:20682701, PMID:20850175, PMID:20872076, PMID:20965939, PMID:21056691, PMID:21120944, PMID:21145788, PMID:21153778, PMID:21155023, PMID:21225464, PMID:21227399, PMID:21239990, PMID:21309037, PMID:21311894, PMID:21387278, PMID:21419771, PMID:21431882, PMID:21520333, PMID:21550136, PMID:21590452, PMID:21598002, PMID:21615986, PMID:21642682, PMID:21671081, PMID:21681552, PMID:21778331, PMID:21788563, PMID:21791569, PMID:21837758, PMID:21868491, PMID:21879275, PMID:21926548, PMID:22006311, PMID:22034109, PMID:22039344, PMID:22067334, PMID:22102614, PMID:22144684, PMID:22166501, PMID:22219001, PMID:22234272, PMID:22283331, PMID:22290698, PMID:22321913, PMID:22322191, PMID:22371642, PMID:22480969, PMID:22581703, PMID:22585170, PMID:22658618, PMID:22691310, PMID:22703879, PMID:22712459, PMID:22739024, PMID:22781090, PMID:22883484, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:22977643, PMID:22987205, PMID:22995991, PMID:23047549, PMID:23170986, PMID:23248292, PMID:23329266, PMID:23443670, PMID:23454724, PMID:23523604, PMID:23526924, PMID:23537056, PMID:23573243, PMID:23604856, PMID:23640085, PMID:23690608, PMID:23729658, PMID:23733757, PMID:23760103, PMID:23960188, PMID:23990280, PMID:24033266, PMID:24040339, PMID:24055113, PMID:24078570, PMID:24082139, PMID:24090359, PMID:24100870, PMID:24114314, PMID:24194902, PMID:24240112, PMID:24244552, PMID:24278394, PMID:24310308, PMID:24323032, PMID:24326041, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24393486, PMID:24396821, PMID:24415873, PMID:24474082, PMID:24501230, PMID:24506336, PMID:24549055, PMID:24603434, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24735542, PMID:24763289, PMID:24851142, PMID:24933000, PMID:24933100, PMID:24953332, PMID:25006859, PMID:25032700, PMID:25081409, PMID:25093288, PMID:25107687, PMID:25110875, PMID:25117502, PMID:25117503, PMID:25133505, PMID:25173403, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25200962, PMID:25420488, PMID:25430799, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25569433, PMID:25637381, PMID:25639900, PMID:25648859, PMID:25701956, PMID:25712738, PMID:25741868, PMID:25782445, PMID:25871441, PMID:25872134, PMID:25964535, PMID:25980754, PMID:26053027, PMID:26076155, PMID:26094658, PMID:26096739, PMID:26182300, PMID:26202870, PMID:26247049, PMID:26248088, PMID:26250988, PMID:26270727, PMID:26289772, PMID:26300997, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26344056, PMID:26381082, PMID:26437257, PMID:26446363, PMID:26467025, PMID:26485756, PMID:26517685, PMID:26528695, PMID:26552419, PMID:26556299, PMID:26580448, PMID:26635394, PMID:26659599, PMID:26659639, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26718727, PMID:26824983, PMID:26845104, PMID:26866578, PMID:26878173, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26951660, PMID:26976419, PMID:27007491, PMID:27013479, PMID:27016151, PMID:27064304, PMID:27153395, PMID:27273229, PMID:27284491, PMID:27287813, PMID:27328445, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27468915, PMID:27556954, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27606285, PMID:27628256, PMID:27629256, PMID:27720647, PMID:27978560, PMID:28050010, PMID:28125075, PMID:28127413, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28195393, PMID:28202063, PMID:28349240, PMID:28422960, PMID:28445943, PMID:28449805, PMID:28491141, PMID:28492532, PMID:28494185, PMID:28514183, PMID:28526081, PMID:28537014, PMID:28577310, PMID:28580595, PMID:28640387, PMID:28687971, PMID:28724667, PMID:28767289, PMID:28769567, PMID:28785832, PMID:28790115, PMID:28828701, PMID:28874130, PMID:28932927, PMID:28944238, PMID:29020732, PMID:29050249, PMID:29164703, PMID:29192238, PMID:29212164, PMID:29238914, PMID:29333623, PMID:29345684, PMID:29348823, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29371908, PMID:29458332, PMID:29489754, PMID:29568967, PMID:29575718, PMID:29684080, PMID:29690800, PMID:29706558, PMID:29706640, PMID:29731845, PMID:29752822, PMID:29769598, PMID:29887214, PMID:29889250, PMID:29945567, PMID:30019097, PMID:30089731, PMID:30093976, PMID:30131383, PMID:30217226, PMID:30306255, PMID:30311386, PMID:30322717, PMID:30374176, PMID:30376427, PMID:30521064, PMID:30702970, PMID:30742731, PMID:30798936, PMID:30850667, PMID:30998989, PMID:31101557, PMID:31307542, PMID:31366136, PMID:31386297, PMID:31422574, PMID:31647837, PMID:32566746, PMID:32587781, PMID:206672385, PMID:15571801 RGD:1625106 NCBI chr 6:11,215,951...11,274,916
Ensembl chr 6:11,215,963...11,274,932
JBrowse link
G Msh6 mutS homolog 6 ISO ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer
ClinVar Annotator: match by term: Familial nonpolyposis colon cancer
ClinVar
CTD
PMID:1548301, PMID:1734424, PMID:1736038, PMID:1851154, PMID:1958276, PMID:2059188, PMID:2563738, PMID:5559809, PMID:8063241, PMID:8176851, PMID:8838326, PMID:9307272, PMID:9354786, PMID:9774676, PMID:9819445, PMID:9929971, PMID:10348829, PMID:10413423, PMID:10471527, PMID:10507723, PMID:10508506, PMID:10521294, PMID:10537275, PMID:10612827, PMID:10675480, PMID:10699937, PMID:10938287, PMID:11153917, PMID:11470537, PMID:11479205, PMID:11586295, PMID:11641390, PMID:11709755, PMID:11807791, PMID:11900875, PMID:12019211, PMID:12202775, PMID:12376507, PMID:12376742, PMID:12522549, PMID:12537658, PMID:12547705, PMID:12658575, PMID:12732731, PMID:14520694, PMID:14574004, PMID:14585961, PMID:14871975, PMID:14961575, PMID:14974087, PMID:15098177, PMID:15184898, PMID:15217520, PMID:15236168, PMID:15340264, PMID:15354210, PMID:15365995, PMID:15483016, PMID:15805151, PMID:15837969, PMID:15872200, PMID:15952900, PMID:16010685, PMID:16034045, PMID:16203774, PMID:16237223, PMID:16270383, PMID:16283678, PMID:16283884, PMID:16341805, PMID:16360201, PMID:16408224, PMID:16418736, PMID:16464007, PMID:16525781, PMID:16636019, PMID:16638864, PMID:16736289, PMID:16771955, PMID:16807412, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16940983, PMID:17117178, PMID:17199584, PMID:17205513, PMID:17259933, PMID:17323113, PMID:17344846, PMID:17417778, PMID:17440981, PMID:17453009, PMID:17498565, PMID:17531815, PMID:17557300, PMID:17594722, PMID:17653898, PMID:17661183, PMID:17718861, PMID:17854147, PMID:17909073, PMID:18033691, PMID:18067074, PMID:18176851, PMID:18236172, PMID:18269114, PMID:18301448, PMID:18307539, PMID:18355840, PMID:18389388, PMID:18409202, PMID:18415027, PMID:18417481, PMID:18521850, PMID:18523027, PMID:18550572, PMID:18566915, PMID:18625694, PMID:18701435, PMID:18790734, PMID:18809606, PMID:19072991, PMID:19130300, PMID:19194194, PMID:19250818, PMID:19324997, PMID:19389263, PMID:19459153, PMID:19526325, PMID:19575290, PMID:19659577, PMID:19685280, PMID:19685281, PMID:19698169, PMID:19766128, PMID:19781088, PMID:19851887, PMID:19924528, PMID:19931546, PMID:20007843, PMID:20028993, PMID:20045164, PMID:20149637, PMID:20176959, PMID:20379851, PMID:20487569, PMID:20587412, PMID:20591884, PMID:20682701, PMID:20924129, PMID:20937110, PMID:21039432, PMID:21056691, PMID:21081928, PMID:21120944, PMID:21153778, PMID:21155762, PMID:21247423, PMID:21437237, PMID:21520333, PMID:21642682, PMID:21671081, PMID:21674763, PMID:21836479, PMID:21868491, PMID:22006311, PMID:22081473, PMID:22102614, PMID:22144684, PMID:22180424, PMID:22219001, PMID:22250089, PMID:22283331, PMID:22290698, PMID:22480969, PMID:22495361, PMID:22581703, PMID:22658618, PMID:22691310, PMID:22692065, PMID:22703879, PMID:22734033, PMID:22766992, PMID:22810696, PMID:22851212, PMID:22895193, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:23047549, PMID:23104009, PMID:23263490, PMID:23294250, PMID:23354634, PMID:23523604, PMID:23530095, PMID:23541221, PMID:23544471, PMID:23554159, PMID:23612316, PMID:23621914, PMID:23652311, PMID:23700467, PMID:23729658, PMID:23733757, PMID:23757202, PMID:23990280, PMID:24033266, PMID:24040339, PMID:24055113, PMID:24068316, PMID:24072394, PMID:24073290, PMID:24100870, PMID:24244552, PMID:24278394, PMID:24323032, PMID:24362816, PMID:24393486, PMID:24425144, PMID:24440087, PMID:24448499, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24737826, PMID:24763289, PMID:24933000, PMID:24933100, PMID:25006859, PMID:25081409, PMID:25093288, PMID:25110875, PMID:25111426, PMID:25117503, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25224212, PMID:25231023, PMID:25307252, PMID:25318351, PMID:25318681, PMID:25370038, PMID:25430799, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25536104, PMID:25559809, PMID:25561518, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25670083, PMID:25701956, PMID:25741868, PMID:25751794, PMID:25782445, PMID:25801821, PMID:25871441, PMID:25980754, PMID:25985138, PMID:26023681, PMID:26046366, PMID:26099011, PMID:26177554, PMID:26181448, PMID:26206375, PMID:26270727, PMID:26274037, PMID:26300997, PMID:26318770, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26374070, PMID:26436109, PMID:26436112, PMID:26437257, PMID:26440929, PMID:26457233, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26485756, PMID:26517685, PMID:26530882, PMID:26544533, PMID:26552419, PMID:26580448, PMID:26633542, PMID:26648449, PMID:26666765, PMID:26674132, PMID:26681312, PMID:26687385, PMID:26689913, PMID:26720728, PMID:26787237, PMID:26805314, PMID:26811195, PMID:26832770, PMID:26845104, PMID:26866578, PMID:26888055, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26901136, PMID:26976419, PMID:27013479, PMID:27028851, PMID:27060149, PMID:27064304, PMID:27153395, PMID:27165744, PMID:27273229, PMID:27329137, PMID:27432916, PMID:27433846, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27456091, PMID:27498913, PMID:27553368, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27696107, PMID:27714650, PMID:27723366, PMID:27854360, PMID:27878467, PMID:27920101, PMID:27928858, PMID:27978560, PMID:28125075, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28153049, PMID:28176205, PMID:28195393, PMID:28206961, PMID:28283864, PMID:28323777, PMID:28369758, PMID:28449805, PMID:28460341, PMID:28466842, PMID:28481244, PMID:28492532, PMID:28502729, PMID:28503720, PMID:28514183, PMID:28528517, PMID:28528518, PMID:28531214, PMID:28596308, PMID:28687356, PMID:28724667, PMID:28765196, PMID:28767289, PMID:28873162, PMID:28874130, PMID:28878254, PMID:28922847, PMID:28944238, PMID:29107668, PMID:29212164, PMID:29263802, PMID:29345684, PMID:29348823, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29575718, PMID:29596542, PMID:29659569, PMID:29684080, PMID:29750335, PMID:29753700, PMID:29785566, PMID:29880898, PMID:29887214, PMID:29915797, PMID:29922827, PMID:29946849, PMID:29967336, PMID:30013564, PMID:30128536, PMID:30306255, PMID:30311386, PMID:30374176, PMID:30376427, PMID:30498870, PMID:30521064, PMID:30670635, PMID:31100584, PMID:31204389, PMID:31297337, PMID:31307542, PMID:31391288, PMID:31422818, PMID:31666926, PMID:31965077, PMID:32141610, PMID:32566746, PMID:32773772 NCBI chr 6:11,644,565...11,662,389
Ensembl chr 6:11,644,578...11,662,499
JBrowse link
G Nr0b2 nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: APC-mutation negative familial colorectal cancer ClinVar NCBI chr 5:151,776,004...151,779,319
Ensembl chr 5:151,776,004...151,779,319
JBrowse link
G Nudc nuclear distribution C, dynein complex regulator ISO ClinVar Annotator: match by term: APC-mutation negative familial colorectal cancer ClinVar NCBI chr 5:151,754,723...151,768,104
Ensembl chr 5:151,754,716...151,768,123
JBrowse link
G Ormdl1 ORMDL sphingolipid biosynthesis regulator 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome ClinVar NCBI chr 9:53,110,628...53,120,454
Ensembl chr 9:53,111,371...53,118,613
JBrowse link
G Pms1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
ClinVar PMID:25741868, PMID:8072530 RGD:1599137 NCBI chr 9:53,120,656...53,206,520
Ensembl chr 9:53,120,656...53,206,516
JBrowse link
G Pms2 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colon cancer
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I
ClinVar Annotator: match by synonym: Hereditary nonpolyposis colon cancer
ClinVar
CTD
PMID:2440087, PMID:7628019, PMID:7629132, PMID:7632227, PMID:7661930, PMID:7704024, PMID:8072530, PMID:8993976, PMID:9419979, PMID:9488480, PMID:9683794, PMID:10037723, PMID:10199405, PMID:10479499, PMID:10480359, PMID:10763829, PMID:11574484, PMID:11897781, PMID:12208142, PMID:12714694, PMID:14574005, PMID:14756672, PMID:15077197, PMID:15256438, PMID:15304120, PMID:15448003, PMID:15470502, PMID:15521988, PMID:15845562, PMID:15872200, PMID:15887099, PMID:15887124, PMID:15942939, PMID:16144131, PMID:16283678, PMID:16426742, PMID:16472587, PMID:16507833, PMID:16609022, PMID:16619239, PMID:16774946, PMID:16817031, PMID:16873062, PMID:17016615, PMID:17029773, PMID:17072973, PMID:17139668, PMID:17258725, PMID:17312306, PMID:17453009, PMID:17557300, PMID:17567544, PMID:17993636, PMID:18007577, PMID:18030674, PMID:18178629, PMID:18268114, PMID:18273873, PMID:18310077, PMID:18415027, PMID:18602922, PMID:18619468, PMID:18768816, PMID:18824584, PMID:19132747, PMID:19156169, PMID:19283792, PMID:19479271, PMID:19495563, PMID:19526325, PMID:20176959, PMID:20186688, PMID:20186689, PMID:20205264, PMID:20487569, PMID:20531397, PMID:20624957, PMID:20698049, PMID:21182953, PMID:21204794, PMID:21239990, PMID:21356188, PMID:21376568, PMID:21520333, PMID:21618646, PMID:21984973, PMID:22081473, PMID:22086678, PMID:22120844, PMID:22290698, PMID:22577899, PMID:22585707, PMID:22608206, PMID:22658618, PMID:22692065, PMID:22703879, PMID:22875147, PMID:22918162, PMID:22941189, PMID:22949387, PMID:23012243, PMID:23017166, PMID:23376243, PMID:23435383, PMID:23582141, PMID:23612316, PMID:23629955, PMID:23652311, PMID:23709753, PMID:23837913, PMID:23960188, PMID:23981578, PMID:24027009, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24072394, PMID:24113346, PMID:24130102, PMID:24326041, PMID:24351291, PMID:24362816, PMID:24434690, PMID:24440087, PMID:24549055, PMID:24556621, PMID:24618965, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24763289, PMID:24897087, PMID:25006859, PMID:25117502, PMID:25142776, PMID:25151201, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25326637, PMID:25345868, PMID:25430799, PMID:25477341, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25512458, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25567908, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25701956, PMID:25741868, PMID:25801821, PMID:25850602, PMID:25856668, PMID:25871621, PMID:25938944, PMID:25964535, PMID:25980754, PMID:26110232, PMID:26116798, PMID:26232782, PMID:26247049, PMID:26249686, PMID:26270727, PMID:26272126, PMID:26318770, PMID:26437257, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26544533, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26720728, PMID:26811195, PMID:26837502, PMID:26845104, PMID:26866578, PMID:26895986, PMID:26898890, PMID:26976419, PMID:27001570, PMID:27017610, PMID:27028851, PMID:27037742, PMID:27060149, PMID:27060170, PMID:27064304, PMID:27153395, PMID:27273229, PMID:27392081, PMID:27433846, PMID:27435373, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27476653, PMID:27498913, PMID:27535533, PMID:27589204, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27647783, PMID:27863258, PMID:27878467, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28195393, PMID:28365877, PMID:28381238, PMID:28449805, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28503822, PMID:28514183, PMID:28528518, PMID:28562508, PMID:28596308, PMID:28640387, PMID:28724667, PMID:28726808, PMID:28765196, PMID:28805995, PMID:28873162, PMID:28874130, PMID:28975465, PMID:29335925, PMID:29345684, PMID:29356034, PMID:29489754, PMID:29566657, PMID:29659569, PMID:29667044, PMID:29752822, PMID:29785153, PMID:29887214, PMID:29945567, PMID:29946849, PMID:30039884, PMID:30093976, PMID:30155321, PMID:30161022, PMID:30256826, PMID:30306255, PMID:30311386, PMID:30337059, PMID:30374176, PMID:30376427, PMID:30447919, PMID:30521064, PMID:30572730, PMID:30653781, PMID:30680046, PMID:30760869, PMID:30877237, PMID:31101557, PMID:31159747, PMID:31300551, PMID:32773772, PMID:16472587, PMID:8072530 RGD:1599142, RGD:1599137 NCBI chr12:12,714,394...12,738,654
Ensembl chr12:12,714,394...12,738,641
JBrowse link
G Rnasel ribonuclease L onset ISO RGD PMID:16054567 RGD:2292000 NCBI chr13:71,188,712...71,202,636
Ensembl chr13:71,192,142...71,202,625
JBrowse link
G Smad2 SMAD family member 2 ISO RGD PMID:10819637 RGD:1599900 NCBI chr18:72,550,107...72,612,078
Ensembl chr18:72,550,219...72,612,078
JBrowse link
G Smad3 SMAD family member 3 ISO RGD PMID:10819637 RGD:1599900 NCBI chr 8:68,569,530...68,678,349
Ensembl chr 8:68,569,530...68,678,349
JBrowse link
G Smad4 SMAD family member 4 ISO RGD PMID:10819637 RGD:1599900 NCBI chr18:69,626,682...69,657,373
Ensembl chr18:69,627,757...69,671,199
JBrowse link
G Stpg4 sperm-tail PG-rich repeat containing 4 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome ClinVar PMID:30374176 NCBI chr 6:11,014,596...11,063,509
Ensembl chr 6:11,022,034...11,063,092
JBrowse link
G Tgfbr1 transforming growth factor, beta receptor 1 ISO RGD PMID:17613544 RGD:2306282 NCBI chr 5:63,056,071...63,119,635
Ensembl chr 5:63,050,758...63,119,635
JBrowse link
G Tgfbr2 transforming growth factor, beta receptor 2 ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome
CTD
ClinVar
PMID:9590282, PMID:25741868, PMID:28492532, PMID:28659821 NCBI chr 8:124,310,288...124,399,345
Ensembl chr 8:124,312,754...124,399,494
JBrowse link
G Trank1 tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome ClinVar NCBI chr 8:119,566,509...119,644,249
Ensembl chr 8:119,566,509...119,644,249
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 2 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mlh1 mutL homolog 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: COLON CANCER, FAMILIAL NONPOLYPOSIS, TYPE 2
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome II
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by OMIM:609310
OMIM
ClinVar
CTD
PMID:16, PMID:1522200, PMID:1756143, PMID:2022152, PMID:5713769, PMID:7557107, PMID:7584997, PMID:8145827, PMID:8521398, PMID:8566964, PMID:8571956, PMID:8574961, PMID:8581513, PMID:8592341, PMID:8797773, PMID:08808596, PMID:8872463, PMID:8880570, PMID:8938136, PMID:8940269, PMID:8993976, PMID:9052445, PMID:9057658, PMID:9071575, PMID:9087566, PMID:9218993, PMID:9234704, PMID:9272156, PMID:9298827, PMID:9322509, PMID:9326924, PMID:9377556, PMID:9419403, PMID:9506527, PMID:9526167, PMID:9559627, PMID:9611074, PMID:9697702, PMID:9718327, PMID:9777949, PMID:9806477, PMID:9831355, PMID:9833759, PMID:9927033, PMID:9927034, PMID:10037723, PMID:10200055, PMID:10323887, PMID:10348818, PMID:10386556, PMID:10389971, PMID:10422993, PMID:10446963, PMID:10448273, PMID:10480359, PMID:10495924, PMID:10573010, PMID:10598809, PMID:10601588, PMID:10612827, PMID:10671064, PMID:10709098, PMID:10713887, PMID:10732761, PMID:10793088, PMID:10829038, PMID:10861474, PMID:10874307, PMID:10923051, PMID:10970186, PMID:10995807, PMID:11015456, PMID:11112663, PMID:11139242, PMID:11151427, PMID:11179758, PMID:11208710, PMID:11342971, PMID:11343035, PMID:11369138, PMID:11376800, PMID:11385712, PMID:11389087, PMID:11427529, PMID:11429708, PMID:11474654, PMID:11524701, PMID:11555625, PMID:11574484, PMID:11585727, PMID:11601928, PMID:11606497, PMID:11726306, PMID:11748856, PMID:11781295, PMID:11793442, PMID:11839723, PMID:11870161, PMID:11879922, PMID:11920458, PMID:11920650, PMID:11948175, PMID:12011148, PMID:12037578, PMID:12067992, PMID:12070261, PMID:12095971, PMID:12112654, PMID:12115348, PMID:12173039, PMID:12183410, PMID:12200596, PMID:12362047, PMID:12373605, PMID:12377806, PMID:12386821, PMID:12414824, PMID:12419761, PMID:12513688, PMID:12522551, PMID:12547705, PMID:12618391, PMID:12624141, PMID:12655568, PMID:12658575, PMID:12799449, PMID:12808326, PMID:12810663, PMID:12874865, PMID:12919137, PMID:12919140, PMID:14512394, PMID:14514376, PMID:14574010, PMID:14635101, PMID:14645426, PMID:14688830, PMID:14699485, PMID:14762794, PMID:14871975, PMID:14961575, PMID:15024732, PMID:15133479, PMID:15139004, PMID:15173238, PMID:15178966, PMID:15184898, PMID:15222003, PMID:15235038, PMID:15253764, PMID:15254659, PMID:15256438, PMID:15289847, PMID:15300854, PMID:15309712, PMID:15340264, PMID:15342696, PMID:15345113, PMID:15365995, PMID:15475387, PMID:15494688, PMID:15520370, PMID:15563510, PMID:15571801, PMID:15613555, PMID:15655560, PMID:15713769, PMID:15731775, PMID:15765394, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15864295, PMID:15870828, PMID:15872200, PMID:15926618, PMID:15943554, PMID:15955785, PMID:15991064, PMID:15991306, PMID:15996210, PMID:16034045, PMID:16083711, PMID:16142001, PMID:16181381, PMID:16203774, PMID:16206289, PMID:16216036, PMID:16270383, PMID:16288214, PMID:16338176, PMID:16341550, PMID:16341804, PMID:16395668, PMID:16425354, PMID:16451135, PMID:16456782, PMID:16636019, PMID:16685411, PMID:16724012, PMID:16736289, PMID:16807412, PMID:16810763, PMID:16830052, PMID:16837128, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16963262, PMID:16982745, PMID:16995940, PMID:17011982, PMID:17054581, PMID:17074586, PMID:17117178, PMID:17135187, PMID:17192056, PMID:17199584, PMID:17210669, PMID:17250665, PMID:17267619, PMID:17301300, PMID:17312306, PMID:17348456, PMID:17417778, PMID:17440950, PMID:17453009, PMID:17473388, PMID:17505997, PMID:17510385, PMID:17569143, PMID:17576681, PMID:17594722, PMID:17653898, PMID:17690979, PMID:17889038, PMID:17895478, PMID:18033691, PMID:18069769, PMID:18094436, PMID:18205192, PMID:18307539, PMID:18325052, PMID:18337503, PMID:18373977, PMID:18383312, PMID:18389388, PMID:18415027, PMID:18470917, PMID:18518984, PMID:18547406, PMID:18561205, PMID:18566915, PMID:18625694, PMID:18636350, PMID:18713544, PMID:18726168, PMID:18772310, PMID:18792805, PMID:18809606, PMID:18931482, PMID:18951437, PMID:18951440, PMID:19116412, PMID:19117025, PMID:19120036, PMID:19142183, PMID:19224586, PMID:19250818, PMID:19267393, PMID:19386570, PMID:19389263, PMID:19419416, PMID:19459153, PMID:19504447, PMID:19526325, PMID:19665066, PMID:19669161, PMID:19685281, PMID:19690142, PMID:19697156, PMID:19698169, PMID:19760518, PMID:19863800, PMID:20020535, PMID:20034658, PMID:20045164, PMID:20176655, PMID:20176959, PMID:20223024, PMID:20233461, PMID:20373145, PMID:20473912, PMID:20533529, PMID:20587412, PMID:20682701, PMID:20858721, PMID:20864636, PMID:20937110, PMID:20978114, PMID:20978117, PMID:21034533, PMID:21056691, PMID:21120944, PMID:21153778, PMID:21155023, PMID:21239990, PMID:21247423, PMID:21286667, PMID:21311894, PMID:21387278, PMID:21404117, PMID:21475916, PMID:21520333, PMID:21598002, PMID:21636617, PMID:21642682, PMID:21671475, PMID:21681552, PMID:21785361, PMID:21840485, PMID:21868491, PMID:21901500, PMID:21952876, PMID:22006311, PMID:22081473, PMID:22086678, PMID:22136435, PMID:22144684, PMID:22252508, PMID:22290698, PMID:22322191, PMID:22395473, PMID:22691310, PMID:22703879, PMID:22736432, PMID:22753075, PMID:22776989, PMID:22875147, PMID:22878509, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:22995991, PMID:23047549, PMID:23329266, PMID:23354017, PMID:23403630, PMID:23431106, PMID:23523604, PMID:23544471, PMID:23573243, PMID:23640085, PMID:23695190, PMID:23729658, PMID:23741719, PMID:23747338, PMID:23760103, PMID:24032978, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24073290, PMID:24084575, PMID:24090359, PMID:24278394, PMID:24323032, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24383517, PMID:24440087, PMID:24456667, PMID:24549055, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728327, PMID:24743384, PMID:24802709, PMID:24933000, PMID:24953332, PMID:25077178, PMID:25110875, PMID:25111426, PMID:25115387, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25148578, PMID:25157968, PMID:25186627, PMID:25197397, PMID:25338684, PMID:25430799, PMID:25437057, PMID:25477341, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25579085, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25741868, PMID:25762362, PMID:25823662, PMID:25871441, PMID:25871621, PMID:25882375, PMID:25892863, PMID:25980754, PMID:26053027, PMID:26078562, PMID:26096739, PMID:26206375, PMID:26247049, PMID:26247079, PMID:26248088, PMID:26249686, PMID:26300997, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26437257, PMID:26437357, PMID:26467025, PMID:26485756, PMID:26510091, PMID:26580448, PMID:26637282, PMID:26659599, PMID:26659639, PMID:26681312, PMID:26761715, PMID:26811195, PMID:26817999, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26895986, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26976419, PMID:27064304, PMID:27093186, PMID:27121310, PMID:27152634, PMID:27153395, PMID:27173243, PMID:27185373, PMID:27284491, PMID:27295708, PMID:27300758, PMID:27435373, PMID:27449771, PMID:27487738, PMID:27498913, PMID:27527004, PMID:27553368, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27629256, PMID:27647783, PMID:27696107, PMID:27732944, PMID:27831900, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:28127413, PMID:28135145, PMID:28445943, PMID:28449805, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28514183, PMID:28526081, PMID:28528518, PMID:28687356, PMID:28724667, PMID:28767289, PMID:28822769, PMID:28874130, PMID:28932927, PMID:28944238, PMID:29050249, PMID:29151953, PMID:29212164, PMID:29228462, PMID:29288294, PMID:29360550, PMID:29368341, PMID:29419868, PMID:29472279, PMID:29484706, PMID:29505604, PMID:29506128, PMID:29520894, PMID:29575718, PMID:29596542, PMID:29758216, PMID:29887214, PMID:29922827, PMID:30019097, PMID:30093976, PMID:30238922, PMID:30256826, PMID:30324682, PMID:30521064, PMID:30720243, PMID:30866919, PMID:30998989, PMID:31273885, PMID:31386297, PMID:31391288, PMID:31642931, PMID:31784484, PMID:32566746 NCBI chr 8:119,486,655...119,523,716
Ensembl chr 8:119,486,691...119,523,964
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Pms2 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4
ClinVar Annotator: match by OMIM:614337
OMIM
ClinVar
PMID:2440087, PMID:7628019, PMID:7629132, PMID:7632227, PMID:7661930, PMID:7704024, PMID:8072530, PMID:8993976, PMID:9488480, PMID:9683794, PMID:10037723, PMID:10199405, PMID:10479499, PMID:10480359, PMID:11574484, PMID:11793469, PMID:11897781, PMID:12208142, PMID:12714694, PMID:14756672, PMID:15077197, PMID:15256438, PMID:15304120, PMID:15448003, PMID:15470502, PMID:15521988, PMID:15845562, PMID:15872200, PMID:15887099, PMID:15887124, PMID:15955779, PMID:16144131, PMID:16426742, PMID:16472587, PMID:16507833, PMID:16609022, PMID:16619239, PMID:17016615, PMID:17072973, PMID:17139668, PMID:17557300, PMID:17976239, PMID:17993636, PMID:18178629, PMID:18268114, PMID:18273873, PMID:18602922, PMID:18768816, PMID:18824584, PMID:19132747, PMID:19156169, PMID:19283792, PMID:19389263, PMID:19479271, PMID:19495563, PMID:19526325, PMID:19690142, PMID:20176959, PMID:20186688, PMID:20186689, PMID:20205264, PMID:20487569, PMID:20531397, PMID:20698049, PMID:21204794, PMID:21239990, PMID:21261604, PMID:21356188, PMID:21376568, PMID:21618646, PMID:21984973, PMID:22081473, PMID:22086678, PMID:22120844, PMID:22290698, PMID:22577899, PMID:22658618, PMID:22703879, PMID:22848017, PMID:22875147, PMID:22918162, PMID:22941189, PMID:22949387, PMID:23012243, PMID:23017166, PMID:23376243, PMID:23435383, PMID:23499907, PMID:23652311, PMID:23709753, PMID:23837913, PMID:23960188, PMID:23981578, PMID:24027009, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24072394, PMID:24326041, PMID:24351291, PMID:24362816, PMID:24434690, PMID:24440087, PMID:24549055, PMID:24556621, PMID:24618965, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24763289, PMID:24897087, PMID:25117502, PMID:25142776, PMID:25151201, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25326637, PMID:25345868, PMID:25430799, PMID:25477341, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25512458, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25567908, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25741868, PMID:25801821, PMID:25850602, PMID:25856668, PMID:25871621, PMID:25938944, PMID:25964535, PMID:25980754, PMID:26110232, PMID:26116798, PMID:26163658, PMID:26232782, PMID:26247049, PMID:26249686, PMID:26270727, PMID:26272126, PMID:26318770, PMID:26320870, PMID:26333163, PMID:26423401, PMID:26437257, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26552419, PMID:26580448, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26720728, PMID:26798439, PMID:26811195, PMID:26837502, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26895986, PMID:26898890, PMID:26976419, PMID:27001570, PMID:27017610, PMID:27028851, PMID:27037742, PMID:27060149, PMID:27060170, PMID:27064304, PMID:27146957, PMID:27153395, PMID:27203213, PMID:27356891, PMID:27379089, PMID:27433846, PMID:27435373, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27476653, PMID:27498913, PMID:27535533, PMID:27589204, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27647783, PMID:27696107, PMID:27863258, PMID:27878467, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:27997549, PMID:28135048, PMID:28135145, PMID:28195393, PMID:28365877, PMID:28449805, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28494185, PMID:28503720, PMID:28503822, PMID:28514183, PMID:28528518, PMID:28562508, PMID:28577310, PMID:28596308, PMID:28640387, PMID:28724667, PMID:28726808, PMID:28765196, PMID:28805995, PMID:28873162, PMID:28874130, PMID:28975465, PMID:29335925, PMID:29345684, PMID:29659569, PMID:29684080, PMID:29785153, PMID:29887214, PMID:29945567, PMID:29967336, PMID:30039884, PMID:30093976, PMID:30122538, PMID:30155321, PMID:30256826, PMID:30311386, PMID:30337059, PMID:30374176, PMID:30376427, PMID:30447919, PMID:30521064, PMID:30653781, PMID:30680046, PMID:30760869, PMID:30787465, PMID:31101557, PMID:31159747, PMID:31300551, PMID:31391288, PMID:31433215, PMID:31921681, PMID:32566746, PMID:32773772 NCBI chr12:12,714,394...12,738,654
Ensembl chr12:12,714,394...12,738,641
JBrowse link
G Rb1 RB transcriptional corepressor 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4 ClinVar PMID:7795591, PMID:12541220, PMID:14722923, PMID:15884040, PMID:16343894 NCBI chr15:55,081,582...55,209,060
Ensembl chr15:55,083,140...55,209,342
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fbxo11 F-box protein 11 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5 ClinVar PMID:19250818, PMID:24689082, PMID:26467025 NCBI chr 6:11,662,356...11,737,427
Ensembl chr 6:11,662,356...11,686,682
JBrowse link
G Msh6 mutS homolog 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5
ClinVar Annotator: match by OMIM:614350
OMIM
ClinVar
PMID:1548301, PMID:1734424, PMID:1736038, PMID:1851154, PMID:1958276, PMID:2059188, PMID:2563738, PMID:2633163, PMID:7604266, PMID:8063241, PMID:8838326, PMID:9307272, PMID:9354786, PMID:9390556, PMID:9510473, PMID:9929971, PMID:10413423, PMID:10471527, PMID:10480359, PMID:10507723, PMID:10508506, PMID:10521294, PMID:10537275, PMID:10612827, PMID:10675480, PMID:10699937, PMID:11153917, PMID:11333868, PMID:11470537, PMID:11586295, PMID:11709755, PMID:11807791, PMID:11900875, PMID:12019211, PMID:12202775, PMID:12376742, PMID:12522549, PMID:12537658, PMID:12547705, PMID:12658575, PMID:12732731, PMID:12920072, PMID:14520694, PMID:14574004, PMID:14585961, PMID:14871975, PMID:14961575, PMID:15098177, PMID:15184898, PMID:15236168, PMID:15340264, PMID:15354210, PMID:15365995, PMID:15483016, PMID:15713769, PMID:15782118, PMID:15805151, PMID:15837969, PMID:15872200, PMID:15952900, PMID:16010685, PMID:16034045, PMID:16203774, PMID:16237223, PMID:16270383, PMID:16283678, PMID:16283884, PMID:16341805, PMID:16408224, PMID:16418736, PMID:16464007, PMID:16525781, PMID:16636019, PMID:16638864, PMID:16771955, PMID:16807412, PMID:16813607, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16940983, PMID:17117178, PMID:17205513, PMID:17312306, PMID:17323113, PMID:17344846, PMID:17417778, PMID:17440981, PMID:17453009, PMID:17498565, PMID:17531815, PMID:17557300, PMID:17594722, PMID:17661183, PMID:17718861, PMID:17854147, PMID:17973265, PMID:18033691, PMID:18067074, PMID:18269114, PMID:18301448, PMID:18355840, PMID:18389388, PMID:18409202, PMID:18415027, PMID:18521850, PMID:18523027, PMID:18566915, PMID:18625694, PMID:18701435, PMID:18790734, PMID:18809606, PMID:19072991, PMID:19130300, PMID:19194194, PMID:19250818, PMID:19389263, PMID:19575290, PMID:19685280, PMID:19685281, PMID:19766128, PMID:19781088, PMID:19851887, PMID:19924528, PMID:20007843, PMID:20028993, PMID:20045164, PMID:20149637, PMID:20176959, PMID:20301390, PMID:20379851, PMID:20459533, PMID:20487569, PMID:20587412, PMID:20591884, PMID:20682701, PMID:20937110, PMID:21039432, PMID:21056691, PMID:21081928, PMID:21120944, PMID:21153778, PMID:21155762, PMID:21239990, PMID:21247423, PMID:21437237, PMID:21520333, PMID:21642682, PMID:21674763, PMID:21836479, PMID:22006311, PMID:22081473, PMID:22102614, PMID:22180424, PMID:22219001, PMID:22250089, PMID:22290698, PMID:22495361, PMID:22581703, PMID:22692065, PMID:22703879, PMID:22766992, PMID:22810696, PMID:22851212, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:23047549, PMID:23104009, PMID:23263490, PMID:23354634, PMID:23359684, PMID:23403630, PMID:23523604, PMID:23530095, PMID:23541221, PMID:23544471, PMID:23621914, PMID:23652311, PMID:23729658, PMID:23733757, PMID:23755103, PMID:23757202, PMID:23990280, PMID:24033266, PMID:24040339, PMID:24055113, PMID:24068316, PMID:24073290, PMID:24100870, PMID:24278394, PMID:24307375, PMID:24323032, PMID:24362816, PMID:24393486, PMID:24425144, PMID:24440087, PMID:24448499, PMID:24608573, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24737826, PMID:24763289, PMID:24933000, PMID:25006859, PMID:25110875, PMID:25111426, PMID:25117503, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25203624, PMID:25224212, PMID:25231023, PMID:25303977, PMID:25307252, PMID:25318351, PMID:25318681, PMID:25370038, PMID:25419514, PMID:25430799, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25561518, PMID:25583476, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25670083, PMID:25741868, PMID:25801821, PMID:25848751, PMID:25871441, PMID:25892863, PMID:25980754, PMID:26099011, PMID:26181448, PMID:26206375, PMID:26296696, PMID:26300997, PMID:26318770, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26436109, PMID:26437257, PMID:26440929, PMID:26457233, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26530882, PMID:26544533, PMID:26552419, PMID:26580448, PMID:26635394, PMID:26648449, PMID:26666765, PMID:26674132, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26691941, PMID:26720728, PMID:26805314, PMID:26832770, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26901136, PMID:26976419, PMID:27028851, PMID:27060149, PMID:27153395, PMID:27273229, PMID:27294619, PMID:27300552, PMID:27329137, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27487738, PMID:27553368, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27696107, PMID:27723366, PMID:27760322, PMID:27854360, PMID:27878467, PMID:27920101, PMID:27928858, PMID:27978560, PMID:28125075, PMID:28135145, PMID:28153049, PMID:28176205, PMID:28195393, PMID:28283864, PMID:28323777, PMID:28460341, PMID:28466842, PMID:28481244, PMID:28492532, PMID:28502729, PMID:28503720, PMID:28514183, PMID:28528518, PMID:28531214, PMID:28596308, PMID:28640387, PMID:28687356, PMID:28726808, PMID:28767289, PMID:28873162, PMID:28874130, PMID:28878254, PMID:28932927, PMID:28944238, PMID:29212164, PMID:29345684, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29575718, PMID:29596542, PMID:29659569, PMID:29684080, PMID:29750335, PMID:29785566, PMID:29887214, PMID:29915797, PMID:29922827, PMID:29945567, PMID:30013564, PMID:30128536, PMID:30225334, PMID:30256826, PMID:30306255, PMID:30311386, PMID:30498870, PMID:30521064, PMID:30982232, PMID:31100584, PMID:31204389, PMID:31307542, PMID:31386297, PMID:31391288, PMID:31422574, PMID:31422818, PMID:31666926, PMID:31965077, PMID:32141610, PMID:32566746, PMID:32773772 NCBI chr 6:11,644,565...11,662,389
Ensembl chr 6:11,644,578...11,662,499
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 6 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Tgfbr2 transforming growth factor, beta receptor 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Colon cancer, hereditary nonpolyposis, type 6
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 6
OMIM
ClinVar
PMID:9590282, PMID:9927040, PMID:11212236, PMID:15235604, PMID:15731757, PMID:16791849, PMID:16928994, PMID:17061023, PMID:17319955, PMID:17344846, PMID:17652900, PMID:17935258, PMID:18084123, PMID:18781618, PMID:19996017, PMID:20956634, PMID:21267002, PMID:21524434, PMID:22113417, PMID:22488992, PMID:23103230, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24941995, PMID:25116393, PMID:25741868, PMID:26017485, PMID:27879313, PMID:27930701, PMID:28492532, PMID:28659821 NCBI chr 8:124,310,288...124,399,345
Ensembl chr 8:124,312,754...124,399,494
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Arel1 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: MLH3-Related Lynch Syndrome ClinVar PMID:12702580, PMID:17656264, PMID:22290698, PMID:28492532 NCBI chr 6:108,630,790...108,796,096
Ensembl chr 6:108,635,220...108,796,124
JBrowse link
G Eif2b2 eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7 ClinVar NCBI chr 6:109,044,830...109,051,254
Ensembl chr 6:109,043,880...109,051,253
JBrowse link
G Mlh3 mutL homolog 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7
ClinVar Annotator: match by term: MLH3-Related Lynch Syndrome
ClinVar Annotator: match by OMIM:614385
OMIM
ClinVar
PMID:11586295, PMID:12702580, PMID:12800209, PMID:16885347, PMID:16981255, PMID:17656264, PMID:18414213, PMID:18521850, PMID:19156873, PMID:21153778, PMID:22290698, PMID:23960188, PMID:24549055, PMID:25142776, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:26296701, PMID:27696107, PMID:28492532, PMID:29212164, PMID:30311386 NCBI chr 6:109,059,386...109,095,876
Ensembl chr 6:109,059,341...109,095,557
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 8 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Epcam epithelial cell adhesion molecule ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 8
ClinVar Annotator: match by OMIM:613244
OMIM
ClinVar
PMID:16951683, PMID:19098912, PMID:23462293, PMID:24142340, PMID:25741868, PMID:28492532, PMID:28701297 NCBI chr 6:11,282,194...11,308,870
Ensembl chr 6:11,281,964...11,298,216
JBrowse link
Lynch syndrome 1 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Epcam epithelial cell adhesion molecule ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I
CTD
ClinVar
PMID:19098912, PMID:24033266, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 6:11,282,194...11,308,870
Ensembl chr 6:11,281,964...11,298,216
JBrowse link
G Kcnk12 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I ClinVar NCBI chr 6:11,373,917...11,494,459
Ensembl chr 6:11,373,917...11,494,459
JBrowse link
G Mlh1 mutL homolog 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome II
ClinVar PMID:16, PMID:661956, PMID:1522200, PMID:1756143, PMID:2022152, PMID:5713769, PMID:7557107, PMID:7584997, PMID:8145827, PMID:8521398, PMID:8566964, PMID:8571956, PMID:8574961, PMID:8581513, PMID:8592341, PMID:8797773, PMID:08808596, PMID:8863153, PMID:8872463, PMID:8880570, PMID:8938136, PMID:8940269, PMID:8993976, PMID:9052445, PMID:9057658, PMID:9071575, PMID:9087566, PMID:9218993, PMID:9234704, PMID:9272156, PMID:9298827, PMID:9311737, PMID:9322509, PMID:9326924, PMID:9377556, PMID:9419403, PMID:9506527, PMID:9526167, PMID:9559627, PMID:9611074, PMID:9697702, PMID:9718327, PMID:9777949, PMID:9806477, PMID:9831355, PMID:9833759, PMID:9927033, PMID:9927034, PMID:10037723, PMID:10200055, PMID:10323887, PMID:10348818, PMID:10386556, PMID:10389971, PMID:10413423, PMID:10422993, PMID:10446963, PMID:10448273, PMID:10480359, PMID:10495924, PMID:10573010, PMID:10598809, PMID:10601588, PMID:10612827, PMID:10671064, PMID:10709098, PMID:10713887, PMID:10732761, PMID:10793088, PMID:10829038, PMID:10861474, PMID:10874307, PMID:10923051, PMID:10956410, PMID:10970186, PMID:10995807, PMID:11015456, PMID:11093816, PMID:11112663, PMID:11139242, PMID:11151427, PMID:11179758, PMID:11208710, PMID:11342971, PMID:11343035, PMID:11369138, PMID:11376800, PMID:11385712, PMID:11389087, PMID:11427529, PMID:11429708, PMID:11474654, PMID:11524701, PMID:11555625, PMID:11574484, PMID:11585727, PMID:11601928, PMID:11606497, PMID:11726306, PMID:11748856, PMID:11781295, PMID:11793442, PMID:11839723, PMID:11870161, PMID:11879922, PMID:11920458, PMID:11920650, PMID:11948175, PMID:12011148, PMID:12037578, PMID:12067992, PMID:12070261, PMID:12095971, PMID:12112654, PMID:12115348, PMID:12173039, PMID:12183410, PMID:12200596, PMID:12362047, PMID:12373605, PMID:12377806, PMID:12386821, PMID:12414824, PMID:12419761, PMID:12513688, PMID:12522551, PMID:12537657, PMID:12547705, PMID:12618391, PMID:12624141, PMID:12655568, PMID:12658575, PMID:12799449, PMID:12808326, PMID:12810663, PMID:12874865, PMID:12919137, PMID:12919140, PMID:14512394, PMID:14514376, PMID:14526391, PMID:14574010, PMID:14635101, PMID:14645426, PMID:14688830, PMID:14699485, PMID:14762794, PMID:14871975, PMID:14961575, PMID:15024732, PMID:15099349, PMID:15133479, PMID:15139004, PMID:15173238, PMID:15178966, PMID:15184898, PMID:15222003, PMID:15235038, PMID:15253764, PMID:15254659, PMID:15256438, PMID:15289847, PMID:15300854, PMID:15309712, PMID:15340264, PMID:15342696, PMID:15345113, PMID:15365995, PMID:15475387, PMID:15494688, PMID:15520370, PMID:15563510, PMID:15571801, PMID:15613555, PMID:15655560, PMID:15713769, PMID:15731775, PMID:15765394, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15864295, PMID:15870828, PMID:15872200, PMID:15926618, PMID:15943554, PMID:15955785, PMID:15991064, PMID:15991306, PMID:15996210, PMID:16034045, PMID:16083711, PMID:16142001, PMID:16181381, PMID:16203774, PMID:16206289, PMID:16216036, PMID:16270383, PMID:16288214, PMID:16338176, PMID:16341550, PMID:16341804, PMID:16395668, PMID:16425354, PMID:16451135, PMID:16456782, PMID:16636019, PMID:16685411, PMID:16724012, PMID:16736289, PMID:16807412, PMID:16810763, PMID:16830052, PMID:16837128, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16963262, PMID:16982745, PMID:16995940, PMID:17011982, PMID:17054581, PMID:17074586, PMID:17117178, PMID:17135187, PMID:17192056, PMID:17199584, PMID:17210669, PMID:17250665, PMID:17267619, PMID:17301300, PMID:17312306, PMID:17348456, PMID:17370310, PMID:17414604, PMID:17417778, PMID:17440950, PMID:17453009, PMID:17473388, PMID:17505997, PMID:17510385, PMID:17569143, PMID:17576681, PMID:17594722, PMID:17653898, PMID:17690979, PMID:17889038, PMID:17895478, PMID:18033691, PMID:18069769, PMID:18094436, PMID:18205192, PMID:18301448, PMID:18307539, PMID:18325052, PMID:18337503, PMID:18373977, PMID:18383312, PMID:18389388, PMID:18415027, PMID:18470917, PMID:18518984, PMID:18547406, PMID:18561205, PMID:18566915, PMID:18625694, PMID:18636350, PMID:18713544, PMID:18726168, PMID:18772310, PMID:18792805, PMID:18809606, PMID:18931482, PMID:18951437, PMID:18951440, PMID:18999873, PMID:19116412, PMID:19117025, PMID:19120036, PMID:19142183, PMID:19224586, PMID:19250818, PMID:19267393, PMID:19339519, PMID:19386570, PMID:19389263, PMID:19419416, PMID:19423266, PMID:19459153, PMID:19504447, PMID:19526325, PMID:19665066, PMID:19669161, PMID:19685281, PMID:19690142, PMID:19697156, PMID:19698169, PMID:19760518, PMID:19863800, PMID:20020535, PMID:20034658, PMID:20045164, PMID:20052760, PMID:20176655, PMID:20176959, PMID:20223024, PMID:20233461, PMID:20373145, PMID:20473912, PMID:20533529, PMID:20587412, PMID:20682701, PMID:20858721, PMID:20864636, PMID:20937110, PMID:20978114, PMID:20978117, PMID:21034533, PMID:21056691, PMID:21120944, PMID:21136174, PMID:21153778, PMID:21155023, PMID:21239990, PMID:21247423, PMID:21286667, PMID:21311894, PMID:21387278, PMID:21404117, PMID:21404177, PMID:21475916, PMID:21520333, PMID:21598002, PMID:21615986, PMID:21636617, PMID:21642682, PMID:21671475, PMID:21681552, PMID:21785361, PMID:21840485, PMID:21868491, PMID:21901500, PMID:21952876, PMID:22006311, PMID:22034109, PMID:22081473, PMID:22086678, PMID:22136435, PMID:22144684, PMID:22252508, PMID:22290698, PMID:22322191, PMID:22395473, PMID:22691310, PMID:22703879, PMID:22736432, PMID:22753075, PMID:22776989, PMID:22843852, PMID:22875147, PMID:22878509, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:22995991, PMID:23047549, PMID:23329266, PMID:23354017, PMID:23403630, PMID:23431106, PMID:23523604, PMID:23544471, PMID:23573243, PMID:23640085, PMID:23695190, PMID:23729658, PMID:23741719, PMID:23747338, PMID:23760103, PMID:24032978, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24073290, PMID:24084575, PMID:24090359, PMID:24278394, PMID:24302565, PMID:24323032, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24383517, PMID:24440087, PMID:24456667, PMID:24549055, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728327, PMID:24743384, PMID:24802709, PMID:24933000, PMID:24953332, PMID:25110875, PMID:25111426, PMID:25115387, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25148578, PMID:25157968, PMID:25186627, PMID:25197397, PMID:25338684, PMID:25430799, PMID:25437057, PMID:25477341, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25579085, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25741868, PMID:25762362, PMID:25823662, PMID:25871441, PMID:25871621, PMID:25882375, PMID:25892863, PMID:25980754, PMID:26053027, PMID:26078562, PMID:26096739, PMID:26206375, PMID:26247049, PMID:26247079, PMID:26248088, PMID:26249686, PMID:26300997, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26437257, PMID:26437357, PMID:26467025, PMID:26485756, PMID:26510091, PMID:26552419, PMID:26580448, PMID:26637282, PMID:26659599, PMID:26659639, PMID:26681312, PMID:26761715, PMID:26811195, PMID:26817999, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26895986, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26976419, PMID:27064304, PMID:27093186, PMID:27121310, PMID:27152634, PMID:27153395, PMID:27173243, PMID:27185373, PMID:27284491, PMID:27295708, PMID:27300758, PMID:27435373, PMID:27449771, PMID:27487738, PMID:27498913, PMID:27527004, PMID:27553368, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27629256, PMID:27647783, PMID:27696107, PMID:27732944, PMID:27831900, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:28127413, PMID:28135145, PMID:28445943, PMID:28449805, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28514183, PMID:28526081, PMID:28528518, PMID:28687356, PMID:28724667, PMID:28767289, PMID:28822769, PMID:28874130, PMID:28932927, PMID:28944238, PMID:29050249, PMID:29151953, PMID:29212164, PMID:29228462, PMID:29288294, PMID:29360550, PMID:29368341, PMID:29419868, PMID:29472279, PMID:29478780, PMID:29484706, PMID:29505604, PMID:29506128, PMID:29520894, PMID:29575718, PMID:29596542, PMID:29758216, PMID:29887214, PMID:29922827, PMID:30019097, PMID:30093976, PMID:30238922, PMID:30256826, PMID:30324682, PMID:30504929, PMID:30521064, PMID:30720243, PMID:30866919, PMID:30998989, PMID:31273885, PMID:31386297, PMID:31391288, PMID:31642931, PMID:31784484, PMID:32566746 NCBI chr 8:119,486,655...119,523,716
Ensembl chr 8:119,486,691...119,523,964
JBrowse link
G Msh2 mutS homolog 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Colorectal cancer, hereditary, nonpolyposis, type 1
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome 1
ClinVar Annotator: match by term: COLORECTAL CANCER, HEREDITARY NONPOLYPOSIS, TYPE 1
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
CTD
OMIM
PMID:2695166, PMID:3616036, PMID:6096739, PMID:7585065, PMID:7717919, PMID:7726159, PMID:7874129, PMID:7937795, PMID:8062247, PMID:8261515, PMID:8521394, PMID:8566964, PMID:8574961, PMID:8589682, PMID:8592341, PMID:8640829, PMID:8723682, PMID:8872463, PMID:8880570, PMID:8895729, PMID:8993976, PMID:8993979, PMID:9002677, PMID:9052445, PMID:9125109, PMID:9222765, PMID:9240418, PMID:9288790, PMID:9298827, PMID:9311737, PMID:9322509, PMID:9559627, PMID:9611074, PMID:9621522, PMID:9709044, PMID:9718327, PMID:9739019, PMID:9774676, PMID:10023327, PMID:10051005, PMID:10077621, PMID:10080150, PMID:10196371, PMID:10323887, PMID:10348818, PMID:10369701, PMID:10375096, PMID:10404063, PMID:10413423, PMID:10422993, PMID:10446963, PMID:10448273, PMID:10469597, PMID:10480359, PMID:10528862, PMID:10564582, PMID:10573010, PMID:10612827, PMID:10612836, PMID:10693791, PMID:10712226, PMID:10732761, PMID:10777691, PMID:10793088, PMID:10874307, PMID:10874318, PMID:10882759, PMID:10978353, PMID:11112663, PMID:11151427, PMID:11179758, PMID:11208710, PMID:11291077, PMID:11376800, PMID:11379475, PMID:11524701, PMID:11535541, PMID:11555625, PMID:11579115, PMID:11601928, PMID:11606497, PMID:11691782, PMID:11769729, PMID:11772966, PMID:11782355, PMID:11854906, PMID:11870161, PMID:11879922, PMID:11920458, PMID:11920650, PMID:12067992, PMID:12070261, PMID:12095971, PMID:12112654, PMID:12115348, PMID:12115503, PMID:12124176, PMID:12132870, PMID:12200596, PMID:12352241, PMID:12362047, PMID:12373605, PMID:12376507, PMID:12385013, PMID:12414824, PMID:12419761, PMID:12454801, PMID:12522549, PMID:12537652, PMID:12547705, PMID:12549480, PMID:12624141, PMID:12626904, PMID:12655562, PMID:12655564, PMID:12658575, PMID:12694232, PMID:12792735, PMID:14499697, PMID:14512394, PMID:14514376, PMID:14526391, PMID:14574162, PMID:14574163, PMID:14580774, PMID:14594944, PMID:14635101, PMID:14871915, PMID:14970868, PMID:14994245, PMID:15046089, PMID:15075785, PMID:15178966, PMID:15222003, PMID:15235030, PMID:15235034, PMID:15254659, PMID:15340264, PMID:15342696, PMID:15345113, PMID:15350299, PMID:15365995, PMID:15365996, PMID:15516845, PMID:15520224, PMID:15520370, PMID:15527911, PMID:15655560, PMID:15680406, PMID:15713769, PMID:15731775, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15855432, PMID:15858146, PMID:15872200, PMID:15926618, PMID:15929773, PMID:15942939, PMID:15943554, PMID:15947132, PMID:15955785, PMID:15991314, PMID:15996210, PMID:16007150, PMID:16034045, PMID:16116158, PMID:16142001, PMID:16175654, PMID:16181381, PMID:16199548, PMID:16203774, PMID:16216036, PMID:16237223, PMID:16311127, PMID:16341550, PMID:16395668, PMID:16408224, PMID:16425354, PMID:16451135, PMID:16479259, PMID:16534870, PMID:16574953, PMID:16614121, PMID:16616355, PMID:16636019, PMID:16639607, PMID:16736289, PMID:16751773, PMID:16807412, PMID:16810763, PMID:16830052, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16995940, PMID:16996571, PMID:17011982, PMID:17074586, PMID:17095871, PMID:17101317, PMID:17186090, PMID:17192056, PMID:17229076, PMID:17250661, PMID:17250665, PMID:17312306, PMID:17348456, PMID:17350822, PMID:17374836, PMID:17414604, PMID:17440950, PMID:17453009, PMID:17473388, PMID:17505997, PMID:17531815, PMID:17555131, PMID:17569143, PMID:17594722, PMID:17661183, PMID:17720936, PMID:18033691, PMID:18227862, PMID:18257912, PMID:18270343, PMID:18289827, PMID:18325052, PMID:18383312, PMID:18389388, PMID:18406877, PMID:18415027, PMID:18446350, PMID:18470917, PMID:18547406, PMID:18559331, PMID:18561205, PMID:18566915, PMID:18636359, PMID:18641418, PMID:18674656, PMID:18726168, PMID:18759827, PMID:18772310, PMID:18781192, PMID:18781619, PMID:18803051, PMID:18822302, PMID:18841495, PMID:18931482, PMID:18951462, PMID:18951465, PMID:18990764, PMID:19072991, PMID:19098912, PMID:19101824, PMID:19117025, PMID:19267393, PMID:19389263, PMID:19419416, PMID:19459153, PMID:19526325, PMID:19659756, PMID:19669161, PMID:19685281, PMID:19690142, PMID:19698169, PMID:19706203, PMID:19723918, PMID:19731080, PMID:19760518, PMID:20007843, PMID:20010080, PMID:20052760, PMID:20068152, PMID:20176959, PMID:20215533, PMID:20223024, PMID:20223835, PMID:20233461, PMID:20301390, PMID:20305446, PMID:20388775, PMID:20587412, PMID:20591884, PMID:20672385, PMID:20682701, PMID:20850175, PMID:20872076, PMID:20965939, PMID:21056691, PMID:21120944, PMID:21153778, PMID:21155023, PMID:21225464, PMID:21239990, PMID:21286823, PMID:21309037, PMID:21311894, PMID:21387278, PMID:21419771, PMID:21520333, PMID:21590452, PMID:21598002, PMID:21615986, PMID:21642682, PMID:21671081, PMID:21681552, PMID:21778331, PMID:21788563, PMID:21837758, PMID:21879275, PMID:21926548, PMID:21946537, PMID:22006311, PMID:22034109, PMID:22039344, PMID:22102614, PMID:22144684, PMID:22179786, PMID:22219001, PMID:22283331, PMID:22290698, PMID:22322191, PMID:22371642, PMID:22480969, PMID:22581703, PMID:22585170, PMID:22703879, PMID:22739024, PMID:22781090, PMID:22883484, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:22977643, PMID:22995991, PMID:23047549, PMID:23170986, PMID:23248292, PMID:23329266, PMID:23354017, PMID:23454724, PMID:23526924, PMID:23573243, PMID:23604856, PMID:23690608, PMID:23729658, PMID:23733757, PMID:23741719, PMID:23760103, PMID:23960188, PMID:23990280, PMID:24033266, PMID:24040339, PMID:24055113, PMID:24078570, PMID:24100870, PMID:24194902, PMID:24240112, PMID:24244552, PMID:24278394, PMID:24310308, PMID:24323032, PMID:24326041, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24393486, PMID:24396821, PMID:24415873, PMID:24474082, PMID:24501230, PMID:24506336, PMID:24549055, PMID:24710284, PMID:24728327, PMID:24735542, PMID:24763289, PMID:24851142, PMID:24933000, PMID:24953332, PMID:25006859, PMID:25032700, PMID:25093288, PMID:25107687, PMID:25110875, PMID:25117502, PMID:25117503, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25173403, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25224212, PMID:25318351, PMID:25420488, PMID:25430799, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25569433, PMID:25637381, PMID:25639900, PMID:25648859, PMID:25712738, PMID:25741868, PMID:25871441, PMID:25944380, PMID:25964535, PMID:25980754, PMID:26053027, PMID:26092435, PMID:26094658, PMID:26096739, PMID:26182300, PMID:26206375, PMID:26247049, PMID:26248088, PMID:26250988, PMID:26270727, PMID:26289772, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26344056, PMID:26381082, PMID:26437257, PMID:26446363, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26528695, PMID:26552419, PMID:26556299, PMID:26580448, PMID:26635394, PMID:26659599, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26822237, PMID:26824983, PMID:26845104, PMID:26878173, PMID:26888055, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26951660, PMID:26976419, PMID:27013479, PMID:27016151, PMID:27153395, PMID:27273229, PMID:27328445, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27468915, PMID:27487738, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27602174, PMID:27606285, PMID:27720647, PMID:27974047, PMID:27978560, PMID:28050010, PMID:28051113, PMID:28125075, PMID:28127413, PMID:28135145, PMID:28195393, PMID:28202063, PMID:28376765, PMID:28422960, PMID:28449805, PMID:28491141, PMID:28492532, PMID:28494185, PMID:28503720, PMID:28514183, PMID:28526081, PMID:28537014, PMID:28577310, PMID:28580595, PMID:28640387, PMID:28687971, PMID:28765196, PMID:28767289, PMID:28769567, PMID:28785832, PMID:28828701, PMID:28873162, PMID:28874130, PMID:28944238, PMID:29050249, PMID:29192238, PMID:29212164, PMID:29238914, PMID:29302048, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29371908, PMID:29458332, PMID:29489754, PMID:29596542, PMID:29684080, PMID:29690800, PMID:29706558, PMID:29731845, PMID:29752822, PMID:29769598, PMID:29887214, PMID:29889250, PMID:29945567, PMID:29967336, PMID:30019097, PMID:30089731, PMID:30093976, PMID:30122538, PMID:30131383, PMID:30217226, PMID:30238922, PMID:30306255, PMID:30311386, PMID:30374176, PMID:30376427, PMID:30521064, PMID:30630526, PMID:30702970, PMID:30798936, PMID:30833958, PMID:30850667, PMID:30982232, PMID:30998989, PMID:31235699, PMID:31307542, PMID:31360874, PMID:31366136, PMID:31386297, PMID:31422574, PMID:31569399, PMID:32566746, PMID:206672385 NCBI chr 6:11,215,951...11,274,916
Ensembl chr 6:11,215,963...11,274,932
JBrowse link
G Msh6 mutS homolog 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I ClinVar PMID:1548301, PMID:1958276, PMID:8838326, PMID:9354786, PMID:9510473, PMID:10348829, PMID:10508506, PMID:10537275, PMID:10612827, PMID:10699937, PMID:11153917, PMID:11470537, PMID:11807791, PMID:12376507, PMID:14520694, PMID:14871975, PMID:14974087, PMID:15184898, PMID:15217520, PMID:15236168, PMID:15340264, PMID:15483016, PMID:15805151, PMID:15872200, PMID:16010685, PMID:16034045, PMID:16203774, PMID:16237223, PMID:16270383, PMID:16341805, PMID:16408224, PMID:16418736, PMID:16525781, PMID:16771955, PMID:16813607, PMID:17117178, PMID:17205513, PMID:17417778, PMID:17453009, PMID:17531815, PMID:18033691, PMID:18269114, PMID:18301448, PMID:18355840, PMID:18409202, PMID:18523027, PMID:18566915, PMID:18625694, PMID:18701435, PMID:18809606, PMID:19072991, PMID:19250818, PMID:19389263, PMID:19685280, PMID:19723918, PMID:19781088, PMID:19924528, PMID:20028993, PMID:20176959, PMID:20379851, PMID:20487569, PMID:20587412, PMID:20937110, PMID:21039432, PMID:21056691, PMID:21239990, PMID:21520333, PMID:21836479, PMID:22006311, PMID:22081473, PMID:22102614, PMID:22250089, PMID:22283331, PMID:22290698, PMID:22495361, PMID:22703879, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:23047549, PMID:23104009, PMID:23403630, PMID:23612316, PMID:23621914, PMID:23733757, PMID:23755103, PMID:24033266, PMID:24072394, PMID:24323032, PMID:24362816, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25536104, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:25751794, PMID:26023681, PMID:26046366, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26530882, PMID:26689913, PMID:26832770, PMID:26845104, PMID:26898890, PMID:27028851, PMID:27153395, PMID:27273229, PMID:27498913, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27696107, PMID:28153049, PMID:28481244, PMID:28492532, PMID:28531214, PMID:28767289, PMID:28873162, PMID:28878254, PMID:28944238, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29684080, PMID:29750335, PMID:29785566, PMID:29922827, PMID:30013564, PMID:30128536, PMID:30521064, PMID:31100584, PMID:31391288, PMID:31422818, PMID:31965077 NCBI chr 6:11,644,565...11,662,389
Ensembl chr 6:11,644,578...11,662,499
JBrowse link
G Pms1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD NCBI chr 9:53,120,656...53,206,520
Ensembl chr 9:53,120,656...53,206,516
JBrowse link
G Pms2 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I ClinVar PMID:7704024, PMID:8072530, PMID:9419979, PMID:9683794, PMID:10479499, PMID:10480359, PMID:11574484, PMID:11793469, PMID:12208142, PMID:14756672, PMID:15256438, PMID:15304120, PMID:15448003, PMID:15521988, PMID:15872200, PMID:15887099, PMID:16472587, PMID:16619239, PMID:16817031, PMID:16873062, PMID:17029773, PMID:17312306, PMID:17567544, PMID:17993636, PMID:18602922, PMID:18768816, PMID:19132747, PMID:19389263, PMID:20176959, PMID:20186688, PMID:20186689, PMID:20205264, PMID:20487569, PMID:20624957, PMID:20698049, PMID:21153778, PMID:21239990, PMID:21984973, PMID:22120844, PMID:22290698, PMID:22577899, PMID:22703879, PMID:22949387, PMID:23012243, PMID:23612316, PMID:23652311, PMID:23709753, PMID:23960188, PMID:23981578, PMID:24027009, PMID:24033266, PMID:24326041, PMID:24351291, PMID:24362816, PMID:24434690, PMID:24556621, PMID:24618965, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:25117502, PMID:25186627, PMID:25512458, PMID:25741868, PMID:25856668, PMID:25964535, PMID:25980754, PMID:26110232, PMID:26116798, PMID:26272126, PMID:26318770, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26837502, PMID:26845104, PMID:26898890, PMID:27017610, PMID:27037742, PMID:27064304, PMID:27435373, PMID:27449771, PMID:27601186, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:28135145, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28562508, PMID:28726808, PMID:28765196, PMID:29659569, PMID:29752822, PMID:29785153, PMID:29887214, PMID:29946849, PMID:30155321, PMID:30256826, PMID:30337059, PMID:30521064, PMID:30572730, PMID:30760869, PMID:32773772 NCBI chr12:12,714,394...12,738,654
Ensembl chr12:12,714,394...12,738,641
JBrowse link
G Rad51d RAD51 paralog D ISO ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome I ClinVar PMID:21822267, PMID:25741868, PMID:26261251, PMID:26467025, PMID:28492532, PMID:29371908 NCBI chr10:70,222,703...70,241,352
Ensembl chr10:70,227,163...70,241,254
JBrowse link
Muir-Torre syndrome term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fhit fragile histidine triad diadenosine triphosphatase ISS OMIM:158320 MouseDO NCBI chr15:15,697,292...16,862,873 JBrowse link
G Mlh1 mutL homolog 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cutaneous sebaceous neoplasms and keratoacanthomas multiple with gastrointestinal and other carcinomas
ClinVar Annotator: match by term: Muir-Torré syndrome
OMIM
ClinVar
PMID:16, PMID:1522200, PMID:4063166, PMID:5713769, PMID:7705822, PMID:8198129, PMID:8751876, PMID:8880570, PMID:9377556, PMID:9526167, PMID:9697702, PMID:9777949, PMID:10037723, PMID:10348818, PMID:10422993, PMID:10612827, PMID:10713887, PMID:10861474, PMID:10995807, PMID:11139242, PMID:11208710, PMID:11427529, PMID:11585727, PMID:11726306, PMID:11748856, PMID:11839723, PMID:11920458, PMID:11920650, PMID:12037578, PMID:12095971, PMID:12362047, PMID:12624141, PMID:12658575, PMID:12810663, PMID:12874865, PMID:14635101, PMID:14762794, PMID:15139004, PMID:15173238, PMID:15184898, PMID:15222003, PMID:15254659, PMID:15340264, PMID:15345113, PMID:15475387, PMID:15520370, PMID:15613555, PMID:15713769, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15864295, PMID:15870828, PMID:15991306, PMID:15996210, PMID:16083711, PMID:16142001, PMID:16181381, PMID:16203774, PMID:16206289, PMID:16216036, PMID:16288214, PMID:16341550, PMID:16395668, PMID:16451135, PMID:16724012, PMID:16995940, PMID:17054581, PMID:17074586, PMID:17117178, PMID:17192056, PMID:17210669, PMID:17250665, PMID:17312306, PMID:17453009, PMID:17473388, PMID:17505997, PMID:17510385, PMID:17594722, PMID:18033691, PMID:18069769, PMID:18094436, PMID:18307539, PMID:18383312, PMID:18389388, PMID:18561205, PMID:18566915, PMID:18726168, PMID:18809606, PMID:19116412, PMID:19224586, PMID:19250818, PMID:19267393, PMID:19419416, PMID:19669161, PMID:19690142, PMID:19697156, PMID:20373145, PMID:20533529, PMID:20858721, PMID:21034533, PMID:21120944, PMID:21404117, PMID:21475916, PMID:21636617, PMID:21642682, PMID:21681552, PMID:22086678, PMID:22136435, PMID:22252508, PMID:22290698, PMID:22703879, PMID:22736432, PMID:22753075, PMID:22776989, PMID:22875147, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:23047549, PMID:23354017, PMID:23403630, PMID:23523604, PMID:23729658, PMID:23760103, PMID:24032978, PMID:24033266, PMID:24090359, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24440087, PMID:24549055, PMID:24728327, PMID:24933000, PMID:25115387, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25157968, PMID:25186627, PMID:25430799, PMID:25477341, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25579085, PMID:25741868, PMID:25823662, PMID:25871621, PMID:25980754, PMID:26053027, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26437257, PMID:26467025, PMID:26485756, PMID:26580448, PMID:26681312, PMID:26817999, PMID:26845104, PMID:26898890, PMID:26976419, PMID:27064304, PMID:27121310, PMID:27152634, PMID:27498913, PMID:27601186, PMID:27629256, PMID:27732944, PMID:27831900, PMID:27978560, PMID:28135145, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28724667, PMID:28767289, PMID:28822769, PMID:28874130, PMID:29288294, PMID:29360550, PMID:29419868, PMID:29520894, PMID:29596542, PMID:29887214, PMID:30093976, PMID:30720243, PMID:30998989, PMID:31391288, PMID:31784484, PMID:32566746 NCBI chr 8:119,486,655...119,523,716
Ensembl chr 8:119,486,691...119,523,964
JBrowse link
G Msh2 mutS homolog 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cutaneous sebaceous neoplasms and keratoacanthomas multiple with gastrointestinal and other carcinomas
ClinVar Annotator: match by term: Muir-Torré syndrome
OMIM
ClinVar
PMID:6096739, PMID:7585065, PMID:7713503, PMID:8062247, PMID:8261515, PMID:8566964, PMID:8592341, PMID:8993976, PMID:9002677, PMID:9217825, PMID:9288790, PMID:9718327, PMID:9739019, PMID:10080150, PMID:10323887, PMID:10375096, PMID:10397236, PMID:10480359, PMID:10528862, PMID:10573010, PMID:10793088, PMID:10978353, PMID:11151427, PMID:11291077, PMID:11601928, PMID:11691782, PMID:12112654, PMID:12132870, PMID:12362047, PMID:12454801, PMID:12522549, PMID:12624141, PMID:12658575, PMID:14970868, PMID:14994245, PMID:15235030, PMID:15254659, PMID:15516845, PMID:15520224, PMID:15520370, PMID:15655560, PMID:15713769, PMID:15731775, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15855432, PMID:15872200, PMID:15929773, PMID:15942939, PMID:15955785, PMID:16034045, PMID:16199548, PMID:16203774, PMID:16216036, PMID:16395668, PMID:16451135, PMID:16574953, PMID:16614121, PMID:16636019, PMID:16736289, PMID:16830052, PMID:16996571, PMID:17101317, PMID:17192056, PMID:17250661, PMID:17312306, PMID:17414604, PMID:17473388, PMID:17569143, PMID:17594722, PMID:17720936, PMID:18033691, PMID:18270343, PMID:18289827, PMID:18325052, PMID:18383312, PMID:18674656, PMID:18772310, PMID:18951462, PMID:19101824, PMID:19267393, PMID:19389263, PMID:19419416, PMID:19459153, PMID:19669161, PMID:19698169, PMID:19723918, PMID:19731080, PMID:19760518, PMID:20007843, PMID:20068152, PMID:20176959, PMID:20223024, PMID:20587412, PMID:20591884, PMID:20850175, PMID:21120944, PMID:21239990, PMID:21419771, PMID:21590452, PMID:21598002, PMID:21642682, PMID:21681552, PMID:21788563, PMID:21926548, PMID:22034109, PMID:22039344, PMID:22102614, PMID:22144684, PMID:22219001, PMID:22290698, PMID:22581703, PMID:22703879, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:23047549, PMID:23990280, PMID:24033266, PMID:24040339, PMID:24278394, PMID:24326041, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24415873, PMID:24474082, PMID:24506336, PMID:24549055, PMID:24710284, PMID:24728327, PMID:24763289, PMID:24851142, PMID:24933000, PMID:24953332, PMID:25093288, PMID:25110875, PMID:25117503, PMID:25133505, PMID:25194673, PMID:25430799, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:26094658, PMID:26096739, PMID:26250988, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26344056, PMID:26437257, PMID:26467025, PMID:26517685, PMID:26580448, PMID:26845104, PMID:26878173, PMID:26898890, PMID:26951660, PMID:27016151, PMID:27153395, PMID:27328445, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27606285, PMID:28125075, PMID:28195393, PMID:28202063, PMID:28449805, PMID:28492532, PMID:28494185, PMID:28640387, PMID:28767289, PMID:28874130, PMID:28944238, PMID:29212164, PMID:29238914, PMID:29368341, PMID:29458332, PMID:29489754, PMID:29684080, PMID:29887214, PMID:29889250, PMID:29945567, PMID:30093976, PMID:30131383, PMID:30238922, PMID:30306255, PMID:30374176, PMID:30376427, PMID:30998989, PMID:31366136, PMID:31422574 NCBI chr 6:11,215,951...11,274,916
Ensembl chr 6:11,215,963...11,274,932
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  disease 16058
    syndrome 6996
      Lynch syndrome 35
        Hereditary Nonpolyposis Colorectal Cancer Type 3 0
        Lynch syndrome 1 8
        hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 2 + 3
        hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4 2
        hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5 2
        hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 6 1
        hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7 3
        hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 8 1
Path 2
Term Annotations click to browse term
  disease 16058
    disease of anatomical entity 15305
      gastrointestinal system disease 4621
        Gastrointestinal Diseases 2541
          intestinal disease 1503
            colonic disease 1016
              Colorectal Neoplasms 668
                Lynch syndrome 35
                  Hereditary Nonpolyposis Colorectal Cancer Type 3 0
                  Lynch syndrome 1 8
                  hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 2 + 3
                  hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4 2
                  hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5 2
                  hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 6 1
                  hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7 3
                  hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 8 1
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.