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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:proteinogenic amino acid
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Accession:CHEBI:83813 term browser browse the term
Definition:Any of the 23 alpha-amino acids that are precursors to proteins, and are incorporated into proteins during translation. The group includes the 20 amino acids encoded by the nuclear genes of eukaryotes together with selenocysteine, pyrrolysine, and N-formylmethionine. Apart from glycine, which is non-chiral, all have L configuration.
Synonyms:related_synonym: canonical amino acid;   canonical amino acids;   proteinogenic amino acids
 xref: Wikipedia:Proteinogenic_amino_acid



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      CHEBI ontology 19904
        role 19880
          application 19715
            NMR chemical shift reference compound 17973
              ammonia 17818
                organic amino compound 17818
                  amino acid 15645
                    proteinogenic amino acid 12848
                      L-alanine + 107
                      L-arginine + 77
                      L-asparagine + 78
                      L-aspartic acid + 182
                      L-cysteine + 3409
                      L-glutamic acid + 10263
                      L-glutamine + 10
                      L-histidine + 12
                      L-isoleucine + 1
                      L-leucine + 167
                      L-lysine + 54
                      L-methionine + 3516
                      L-phenylalanine + 2373
                      L-proline + 297
                      L-pyrrolysine 0
                      L-selenocysteine + 83
                      L-serine + 56
                      L-threonine + 2
                      L-tryptophan + 17
                      L-tyrosine + 17
                      L-valine + 117
                      N-formyl-L-methionine + 52
                      aspartate family amino acid + 3676
                      erythrose 4-phosphate/phosphoenolpyruvate family amino acid + 2378
                      glutamine family amino acid + 10321
                      glycine + 3046
                      proteinogenic amino acid derivative + 12379
                      pyruvate family amino acid + 325
                      serine family amino acid + 5539
    Path 2
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 19904
        subatomic particle 19902
          composite particle 19902
            hadron 19902
              baryon 19902
                nucleon 19902
                  atomic nucleus 19902
                    atom 19902
                      main group element atom 19852
                        p-block element atom 19852
                          carbon group element atom 19797
                            carbon atom 19792
                              organic molecular entity 19792
                                organic group 18983
                                  organic divalent group 18958
                                    organodiyl group 18958
                                      carbonyl group 18911
                                        carbonyl compound 18911
                                          carboxylic acid 18634
                                            amino acid 15645
                                              proteinogenic amino acid 12848
                                                L-alanine + 107
                                                L-arginine + 77
                                                L-asparagine + 78
                                                L-aspartic acid + 182
                                                L-cysteine + 3409
                                                L-glutamic acid + 10263
                                                L-glutamine + 10
                                                L-histidine + 12
                                                L-isoleucine + 1
                                                L-leucine + 167
                                                L-lysine + 54
                                                L-methionine + 3516
                                                L-phenylalanine + 2373
                                                L-proline + 297
                                                L-pyrrolysine 0
                                                L-selenocysteine + 83
                                                L-serine + 56
                                                L-threonine + 2
                                                L-tryptophan + 17
                                                L-tyrosine + 17
                                                L-valine + 117
                                                N-formyl-L-methionine + 52
                                                aspartate family amino acid + 3676
                                                erythrose 4-phosphate/phosphoenolpyruvate family amino acid + 2378
                                                glutamine family amino acid + 10321
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