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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:proteinogenic amino acid
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Accession:CHEBI:83813 term browser browse the term
Definition:Any of the 23 alpha-amino acids that are precursors to proteins, and are incorporated into proteins during translation. The group includes the 20 amino acids encoded by the nuclear genes of eukaryotes together with selenocysteine, pyrrolysine, and N-formylmethionine. Apart from glycine, which is non-chiral, all have L configuration.
Synonyms:related_synonym: canonical amino acid;   canonical amino acids;   proteinogenic amino acids
 xref: Wikipedia:Proteinogenic_amino_acid



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      CHEBI ontology 20089
        chemical entity 20088
          atom 20058
            nonmetal atom 19979
              nitrogen atom 18963
                nitrogen molecular entity 18937
                  organonitrogen compound 18736
                    proteinogenic amino acid 11607
                      L-alanine + 100
                      L-arginine + 65
                      L-asparagine + 78
                      L-aspartic acid + 172
                      L-cysteine + 1342
                      L-glutamic acid + 10234
                      L-glutamine + 6
                      L-histidine + 10
                      L-isoleucine + 1
                      L-leucine + 122
                      L-lysine + 29
                      L-methionine + 3466
                      L-phenylalanine + 2283
                      L-proline + 279
                      L-pyrrolysine 0
                      L-selenocysteine + 80
                      L-serine + 40
                      L-threonine + 2
                      L-tryptophan + 16
                      L-tyrosine + 9
                      L-valine + 113
                      N-formyl-L-methionine + 0
                      aspartate family amino acid + 3626
                      erythrose 4-phosphate/phosphoenolpyruvate family amino acid + 2288
                      glutamine family amino acid + 10290
                      glycine + 1617
                      proteinogenic amino acid derivative + 10989
                      pyruvate family amino acid + 275
                      serine family amino acid + 2579
    Path 2
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 20089
        subatomic particle 20058
          composite particle 20058
            hadron 20088
              baryon 20088
                nucleon 20088
                  atomic nucleus 20088
                    atom 20058
                      main group element atom 19960
                        p-block element atom 19990
                          carbon group element atom 19916
                            carbon atom 19909
                              organic molecular entity 19909
                                organic group 18988
                                  organic divalent group 18950
                                    organodiyl group 18974
                                      carbonyl group 18903
                                        carbonyl compound 18925
                                          carboxylic acid 18597
                                            proteinogenic amino acid 11607
                                              L-alanine + 100
                                              L-arginine + 65
                                              L-asparagine + 78
                                              L-aspartic acid + 172
                                              L-cysteine + 1342
                                              L-glutamic acid + 10234
                                              L-glutamine + 6
                                              L-histidine + 10
                                              L-isoleucine + 1
                                              L-leucine + 122
                                              L-lysine + 29
                                              L-methionine + 3466
                                              L-phenylalanine + 2283
                                              L-proline + 279
                                              L-pyrrolysine 0
                                              L-selenocysteine + 80
                                              L-serine + 40
                                              L-threonine + 2
                                              L-tryptophan + 16
                                              L-tyrosine + 9
                                              L-valine + 113
                                              N-formyl-L-methionine + 0
                                              aspartate family amino acid + 3626
                                              erythrose 4-phosphate/phosphoenolpyruvate family amino acid + 2288
                                              glutamine family amino acid + 10290
                                              glycine + 1617
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