Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:(omega-1)-hydroxy fatty acid
go back to main search page
Accession:CHEBI:78954 term browser browse the term
Definition:A hydroxy fatty acid that is a straight-chain fatty acid in which one of the hydrogens attached to the carbon adjacent to the terminal methyl group (i.e. at the (omega-1) position) is replaced by a hydroxy group.
Synonyms:related_synonym: (omega-1)-hydroxy fatty acids
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:84497


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
3-hydroxybutyric acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Aqp9 aquaporin 9 JBrowse link 8 77,559,621 77,599,781 RGD:6480464
G Atg5 autophagy related 5 JBrowse link 20 49,301,783 49,393,147 RGD:6480464
G Becn1 beclin 1 JBrowse link 10 89,209,944 89,225,297 RGD:6480464
G Casp3 caspase 3 JBrowse link 16 48,845,011 48,863,249 RGD:6480464
G Casp9 caspase 9 JBrowse link 5 160,356,211 160,373,774 RGD:6480464
G Ercc6 ERCC excision repair 6, chromatin remodeling factor JBrowse link 16 8,734,028 8,804,610 RGD:6480464
G Hcar2 hydroxycarboxylic acid receptor 2 JBrowse link 12 38,160,464 38,161,546 RGD:6480464
G Hmgcs2 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 JBrowse link 2 200,452,623 200,480,785 RGD:6480464
G Nfe2l2 nuclear factor, erythroid 2-like 2 JBrowse link 3 62,497,568 62,525,146 RGD:6480464
G Ppara peroxisome proliferator activated receptor alpha JBrowse link 7 126,618,872 126,687,282 RGD:6480464
G Sirt1 sirtuin 1 JBrowse link 20 26,831,971 26,851,587 RGD:6480464
G Snca synuclein alpha JBrowse link 4 90,782,412 90,883,236 RGD:6480464
G Tp53 tumor protein p53 JBrowse link 10 56,186,299 56,198,449 RGD:6480464
G Ucp2 uncoupling protein 2 JBrowse link 1 165,506,375 165,512,744 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    chemical entity 19652
      atom 19650
        nonmetal atom 19516
          carbon atom 19405
            organic molecular entity 19405
              lipid 16941
                fatty acid 15807
                  hydroxy fatty acid 175
                    (omega-1)-hydroxy fatty acid 14
                      (10R)-10-hydroxyundecanoic acid + 0
                      (12R)-12-hydroxytridecanoic acid + 0
                      (13R)-13-hydroxymyristic acid + 0
                      (14R)-14-hydroxypentadecanoic acid + 0
                      (15R)-15-hydroxypalmitic acid + 0
                      (16R)-16-hydroxymargaric acid + 0
                      (18R)-18-hydroxynonadecanoic acid + 0
                      (19R)-19-hydroxyicosanoic acid + 0
                      (2E,10R)-10-hydroxyundec-2-enoic acid + 0
                      (2E,11R)-11-hydroxydodec-2-enoic acid + 0
                      (2E,12R)-12-hydroxytridec-2-enoic acid + 0
                      (2E,13R)-13-hydroxytetradec-2-enoic acid + 0
                      (2E,14R)-14-hydroxypentadec-2-enoic acid + 0
                      (2E,15R)-15-hydroxyhexadec-2-enoic acid + 0
                      (2E,16R)-16-hydroxyheptadec-2-enoic acid + 0
                      (2E,17R)-17-hydroxyoctadec-2-enoic acid + 0
                      (2E,18R)-18-hydroxynonadec-2-enoic acid + 0
                      (2E,19R)-19-hydroxyicos-2-enoic acid + 0
                      (2E,20R)-20-hydroxyhenicos-2-enoic acid + 0
                      (2E,6R)-6-hydroxyhept-2-enoic acid + 0
                      (2E,7R)-7-hydroxyoct-2-enoic acid + 0
                      (2E,8R)-8-hydroxynon-2-enoic acid + 0
                      (2E,9R)-9-hydroxydec-2-enoic acid + 0
                      (3R,10R)-3,10-dihydroxyundecanoic acid + 0
                      (3R,11R)-3,11-dihydroxylauric acid + 0
                      (3R,12R)-3,12-dihydroxytridecanoic acid + 0
                      (3R,13R)-3,13-dihydroxymyristic acid + 0
                      (3R,14R)-3,14-dihydroxypentadecanoic acid + 0
                      (3R,15R)-3,15-dihydroxypalmitic acid + 0
                      (3R,16R)-3,16-dihydroxymargaric acid + 0
                      (3R,18R)-3,18-dihydroxynonadecanoic acid + 0
                      (3R,19R)-19-dihydroxyicosanoic acid + 0
                      (3R,20R)-3,20-dihydroxyhenicosanoic acid + 0
                      (3R,21R)-3,21-dihydroxybehenic acid + 0
                      (3R,22R)-3,22-dihydroxytricosanoic acid + 0
                      (3R,8R)-3,8-dihydroxynonanoic acid + 0
                      (3R,9R)-3,9-dihydroxydecanoic acid + 0
                      (4R)-4-hydroxypentanoic acid + 0
                      (5R)-5-hydroxyhexanoic acid + 0
                      (7R)-7-hydroxyoctanoic acid + 0
                      (8R)-8-hydroxynonanoic acid + 0
                      (9R)-9-hydroxydecanoic acid + 0
                      (9Z)-17-hydroxyoctadec-9-enoic acid 0
                      (R)-17-hydroxyoctadecanoic acid + 0
                      (R,R)-3,17-dihydroxyoctadecanoic acid + 0
                      (omega-1)-hydroxy fatty acid ascaroside + 0
                      11-hydroxylauric acid + 0
                      13-hydroxytetradecanoic acid 0
                      19-HETrE 0
                      19-hydroxyicosanoic acid 0
                      20-hydroxyhenicosanoic acid + 0
                      21-HDoHE 0
                      3-hydroxybutyric acid + 14
                      5-hydroxyhexanoic acid 0
                      6-hydroxyheptanoic acid + 0
                      9,10-epoxy-17-hydroxyoctadecanoic acid 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    subatomic particle 19650
      composite particle 19650
        hadron 19650
          baryon 19650
            nucleon 19650
              atomic nucleus 19650
                atom 19650
                  main group element atom 19531
                    p-block element atom 19531
                      carbon group element atom 19413
                        carbon atom 19405
                          organic molecular entity 19405
                            organic group 18331
                              organic divalent group 18321
                                organodiyl group 18321
                                  carbonyl group 18209
                                    carbonyl compound 18209
                                      carboxylic acid 17908
                                        monocarboxylic acid 17245
                                          fatty acid 15807
                                            hydroxy fatty acid 175
                                              (omega-1)-hydroxy fatty acid 14
                                                (10R)-10-hydroxyundecanoic acid + 0
                                                (12R)-12-hydroxytridecanoic acid + 0
                                                (13R)-13-hydroxymyristic acid + 0
                                                (14R)-14-hydroxypentadecanoic acid + 0
                                                (15R)-15-hydroxypalmitic acid + 0
                                                (16R)-16-hydroxymargaric acid + 0
                                                (18R)-18-hydroxynonadecanoic acid + 0
                                                (19R)-19-hydroxyicosanoic acid + 0
                                                (2E,10R)-10-hydroxyundec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,11R)-11-hydroxydodec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,12R)-12-hydroxytridec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,13R)-13-hydroxytetradec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,14R)-14-hydroxypentadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,15R)-15-hydroxyhexadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,16R)-16-hydroxyheptadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,17R)-17-hydroxyoctadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,18R)-18-hydroxynonadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E,19R)-19-hydroxyicos-2-enoic acid + 0
                                                (2E,20R)-20-hydroxyhenicos-2-enoic acid + 0
                                                (2E,6R)-6-hydroxyhept-2-enoic acid + 0
                                                (2E,7R)-7-hydroxyoct-2-enoic acid + 0
                                                (2E,8R)-8-hydroxynon-2-enoic acid + 0
                                                (2E,9R)-9-hydroxydec-2-enoic acid + 0
                                                (3R,10R)-3,10-dihydroxyundecanoic acid + 0
                                                (3R,11R)-3,11-dihydroxylauric acid + 0
                                                (3R,12R)-3,12-dihydroxytridecanoic acid + 0
                                                (3R,13R)-3,13-dihydroxymyristic acid + 0
                                                (3R,14R)-3,14-dihydroxypentadecanoic acid + 0
                                                (3R,15R)-3,15-dihydroxypalmitic acid + 0
                                                (3R,16R)-3,16-dihydroxymargaric acid + 0
                                                (3R,18R)-3,18-dihydroxynonadecanoic acid + 0
                                                (3R,19R)-19-dihydroxyicosanoic acid + 0
                                                (3R,20R)-3,20-dihydroxyhenicosanoic acid + 0
                                                (3R,21R)-3,21-dihydroxybehenic acid + 0
                                                (3R,22R)-3,22-dihydroxytricosanoic acid + 0
                                                (3R,8R)-3,8-dihydroxynonanoic acid + 0
                                                (3R,9R)-3,9-dihydroxydecanoic acid + 0
                                                (4R)-4-hydroxypentanoic acid + 0
                                                (5R)-5-hydroxyhexanoic acid + 0
                                                (7R)-7-hydroxyoctanoic acid + 0
                                                (8R)-8-hydroxynonanoic acid + 0
                                                (9R)-9-hydroxydecanoic acid + 0
                                                (9Z)-17-hydroxyoctadec-9-enoic acid 0
                                                (R)-17-hydroxyoctadecanoic acid + 0
                                                (R,R)-3,17-dihydroxyoctadecanoic acid + 0
                                                (omega-1)-hydroxy fatty acid ascaroside + 0
                                                11-hydroxylauric acid + 0
                                                13-hydroxytetradecanoic acid 0
                                                19-HETrE 0
                                                19-hydroxyicosanoic acid 0
                                                20-hydroxyhenicosanoic acid + 0
                                                21-HDoHE 0
                                                3-hydroxybutyric acid + 14
                                                5-hydroxyhexanoic acid 0
                                                6-hydroxyheptanoic acid + 0
                                                9,10-epoxy-17-hydroxyoctadecanoic acid 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.