Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:fundamental metabolite
go back to main search page
Accession:CHEBI:78675 term browser browse the term
Definition:Any metabolite produced by all living cells.
Synonyms:related_synonym: essential metabolite;   essential metabolites;   fundamental metabolites



show annotations for term's descendants           Sort by:
 


Your selection has 12789 annotated objects. The maximum number of objects that can be shown is 2000. The list is too large to display.

  • Select a more specific term using the term browser
  • Download the entire list for this term
  • Display annotations for this term only (exclude descendants)



  • Term paths to the root
    Path 1
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 19812
        role 19763
          biological role 19763
            biochemical role 19380
              metabolite 19358
                fundamental metabolite 12789
                  1,4-butanediammonium 0
                  2'-deoxyadenosine 5'-monophosphate + 0
                  2'-deoxyadenosine 5'-monophosphate(2-) + 0
                  2-deoxy-D-ribofuranose 1-phosphate + 1
                  2-oxoglutarate(1-) 0
                  2-oxoglutaric acid + 0
                  3-phosphoglyceric acid + 2
                  3-phosphonato-D-glycerate(3-) 0
                  6-phospho-D-gluconic acid 0
                  6-phosphonatooxy-D-gluconate 0
                  ADP + 87
                  ADP(3-) + 0
                  ATP + 208
                  ATP(3-) 0
                  ATP(4-) + 0
                  D-aspartate(1-) + 0
                  D-cysteinate(1-) 0
                  D-cysteinate(2-) 0
                  D-cysteinium 0
                  D-cysteinyl radical + 0
                  D-erythro-isocitrate(3-) 0
                  D-fructofuranose 1,6-bisphosphate(4-) + 0
                  D-fructofuranose 1-phosphate(2-) + 0
                  D-fructofuranose 6-phosphate(2-) 0
                  D-fructose 1,6-bisphosphate + 5
                  D-fructose 6-phosphate + 0
                  D-galactopyranose 1-phosphate + 1
                  D-glucopyranose 1-phosphate + 1
                  D-glucopyranose 1-phosphate(2-) 0
                  D-glucose 6-phosphate + 7
                  D-mannopyranose 6-phosphate(2-) 0
                  D-mannose 1-phosphate + 0
                  D-mannose 6-phosphate + 2
                  D-ribose + 700
                  D-ribose 5-phosphate + 1
                  D-ribulose 5-phosphate(2-) 0
                  D-threo-isocitrate(3-) 0
                  IDP 2
                  L-alaninate + 0
                  L-alanine + 100
                  L-alaninium + 0
                  L-aspartate(1-) + 0
                  L-aspartate(2-) + 0
                  L-cysteinate(1-) + 0
                  L-cysteinate(2-) 0
                  L-cysteinium + 0
                  L-cysteinyl radical + 0
                  L-erythro-isocitrate(3-) 0
                  L-galactose 1-phosphate + 0
                  L-galactose 1-phosphate(2-) + 0
                  L-homocysteine zwitterion + 0
                  L-ribulose 5-phosphate(2-) 0
                  L-threo-isocitrate(3-) 0
                  L-tyrosinate(1-) 0
                  L-tyrosinate(2-) + 0
                  L-tyrosine + 9
                  L-tyrosinium + 0
                  L-xylulose 5-phosphate(2-) 0
                  N(6)-(1,2-dicarboxyethyl)-AMP 0
                  N,N,N-trimethylglycinium + 0
                  NAD + 89
                  NADH + 0
                  NADP zwitterion + 118
                  NADP(+) + 121
                  NADPH + 0
                  S-adenosyl-L-homocysteinate 0
                  S-adenosyl-L-homocysteine 23
                  UDP-alpha-D-glucose 3
                  UDP-alpha-D-xylose 0
                  acetyl-CoA + 10
                  adenosine + 353
                  adenosine 5'-monophosphate + 9
                  adenosine 5'-monophosphate(1+) 0
                  adenosine 5'-monophosphate(2-) + 0
                  alanine + 108
                  aldehydo-D-ribose 5-phosphate(2-) 0
                  alpha-D-glucose 1-phosphate(2-) 0
                  alpha-D-glucose 6-phosphate(2-) 0
                  alpha-D-mannose 6-phosphate(2-) 0
                  alpha-L-galactose 1-phosphate(2-) 0
                  arabinose + 0
                  arginine + 53
                  aspartate(1-) + 0
                  aspartate(2-) + 0
                  aspartic acid + 184
                  beta-D-fructofuranose 6-phosphate(2-) 0
                  beta-D-glucose 1-phosphate(2-) 0
                  beta-D-glucose 6-phosphate(2-) + 0
                  beta-L-galactose 1-phosphate(2-) 0
                  beta-alaninate 0
                  beta-alanine + 55
                  biotin + 21
                  cis-aconitic acid 0
                  citrate(1-) + 0
                  citrate(2-) + 0
                  citrate(3-) + 80
                  citric acid + 34
                  cysteine + 1333
                  dGDP 0
                  dTMP + 2
                  fructose + 308
                  fructose 1-phosphate + 0
                  fumarate(1-) + 0
                  fumaric acid + 50
                  galactose + 172
                  glucose + 2281
                  glutamate(1-) + 745
                  glutamate(2-) + 0
                  glutamic acid + 10226
                  glutamine + 5
                  glyceraldehyde + 9
                  glycerate + 0
                  glyceric acid + 6
                  glycinate + 24
                  glycine + 1599
                  glycine betaine + 164
                  glycine betaine hydrate 0
                  glycinium + 0
                  glycolaldehyde + 7
                  glycyl radical + 0
                  guanosine + 18
                  homocysteinate + 0
                  homocysteine + 132
                  hypoxanthine + 19
                  isocitric acid + 0
                  keto-phenylpyruvic acid + 2
                  lipoate + 0
                  lipoic acid + 187
                  malate(2-) + 0
                  malic acid + 93
                  mannose + 11
                  oxalatosuccinate(3-) + 0
                  oxalosuccinic acid + 0
                  phosphoenolpyruvate 2
                  phosphoenolpyruvic acid 0
                  phosphonatoenolpyruvate 0
                  pseudouridine + 0
                  purine + 4578
                  putrescine + 18
                  pyruvate + 0
                  pyruvic acid + 47
                  riboflavin + 31
                  ribulose 5-phosphate + 0
                  serinate + 0
                  serine + 47
                  serinium + 0
                  spermidine + 20
                  spermidine(3+) + 0
                  spermine + 67
                  spermine(4+) 0
                  succinate(1-) 0
                  succinic acid + 222
                  thiamine(1+) diphosphate + 0
                  trans-aconitate(3-) 0
                  trans-aconitic acid 0
                  uridine + 16
                  xanthine + 3911
                  xylulose 5-phosphate + 1
    paths to the root