Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:sphingomyelin
go back to main search page
Accession:CHEBI:64583 term browser browse the term
Definition:Any of a class of phospholipids in which the amino group of a sphingoid base is in amide linkage with one of several fatty acids, while the terminal hydroxy group of the sphingoid base is esterified to phosphorylcholine.
Synonyms:related_synonym: Ceramide phosphocholine;   Formula=C9H19N2O6PR2;   SMILES=C[N+](C)(C)CCOP([O-])(=O)OC[C@H](NC([*])=O)[C@H](O)[*];   an N-(acyl)-sphingosylphosphocholine
 xref: LIPID_MAPS_class:LMSP0301;   PMID:27242221


show annotations for term's descendants           Sort by:
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19831
    role 19807
      biological role 19805
        molecular messenger 18637
          neurotransmitter 11533
            choline 3583
              choline ester 133
                phosphocholines 133
                  sphingomyelin 0
                    N-(acyl)-4-hydroxyheptadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-(acyl)-heptadecasphing-4-enine-1-phosphocholine 0
                    N-(acyl)-heptadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-acyl-15-methylhexadecasphing-4-enine-1-phosphocholine + 0
                    N-acyl-15-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-acyl-4-hydroxy-15-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine + 0
                    N-acylhexadecaphytosphingosine-1-phosphocholine 0
                    N-acylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-acylhexadecasphingosine-1-phosphocholine + 0
                    N-acylicosaphytosphingosine-1-phosphocholine 0
                    N-acylicosasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-acylicosasphingosine-1-phosphocholine 0
                    N-acylphytosphingosine-1-phosphocholine + 0
                    N-acylsphinganine-1-phosphocholine + 0
                    N-acyltetradecaphytosphingosine-1-phosphocholine 0
                    N-acyltetradecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-acyltetradecasphingosine-1-phosphocholine 0
                    N-docosanoyl-14-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-hexacosanoyl-14-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-hexacosanoyl-14-methylhexadecasphingosine-1-phosphocholine 0
                    N-hexanoylsphingosine-1-phosphocholine + 0
                    N-tetracosanoyl-14-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                    N-tricosenoylsphing-4-enine-1-phosphocholine 0
                    SM C16:1 0
                    SM(d16:1/24:1(15Z)) 0
                    SM(d16:1/24:1) 0
                    SM(d17:1/17:0) 0
                    SM(d17:1/24:0) 0
                    SM(d18:0/12:0) 0
                    SM(d18:0/14:0) 0
                    SM(d18:0/16:1(9Z)) 0
                    SM(d18:0/18:0) 0
                    SM(d18:0/18:2) 0
                    SM(d18:0/20:0) 0
                    SM(d18:0/20:2(11Z,14Z)) 0
                    SM(d18:0/22:0) 0
                    SM(d18:0/22:3(10Z,13Z,16Z)) 0
                    SM(d18:0/24:1(15Z)) 0
                    SM(d18:2/25:0) 0
                    sphingomyelin 12:0 0
                    sphingomyelin 14:0 0
                    sphingomyelin 16:0 0
                    sphingomyelin 16:1 0
                    sphingomyelin 18:0 0
                    sphingomyelin 18:1 0
                    sphingomyelin 22:0 0
                    sphingomyelin 24:0 0
                    sphingomyelin 24:1 0
                    sphingomyelin 28:0 0
                    sphingomyelin 28:1 0
                    sphingomyelin 28:2 0
                    sphingomyelin 28:3 0
                    sphingomyelin 28:4 0
                    sphingomyelin 30:0 0
                    sphingomyelin 30:1 + 0
                    sphingomyelin 30:2 0
                    sphingomyelin 30:3 0
                    sphingomyelin 30:4 0
                    sphingomyelin 31:0 0
                    sphingomyelin 31:1 0
                    sphingomyelin 32:0 0
                    sphingomyelin 32:1 + 0
                    sphingomyelin 32:2 + 0
                    sphingomyelin 32:3 0
                    sphingomyelin 32:4 0
                    sphingomyelin 33:0 0
                    sphingomyelin 33:1 + 0
                    sphingomyelin 33:2 + 0
                    sphingomyelin 34:0 + 0
                    sphingomyelin 34:1 + 0
                    sphingomyelin 34:2 + 0
                    sphingomyelin 34:3 0
                    sphingomyelin 34:4 0
                    sphingomyelin 35:0 0
                    sphingomyelin 35:1 + 0
                    sphingomyelin 36:0 0
                    sphingomyelin 36:1 + 0
                    sphingomyelin 36:2 + 0
                    sphingomyelin 36:3 + 0
                    sphingomyelin 36:4 + 0
                    sphingomyelin 37:0 + 0
                    sphingomyelin 37:1 0
                    sphingomyelin 38:0 0
                    sphingomyelin 38:1 + 0
                    sphingomyelin 38:2 + 0
                    sphingomyelin 38:3 + 0
                    sphingomyelin 38:4 0
                    sphingomyelin 39:1 + 0
                    sphingomyelin 39:2 + 0
                    sphingomyelin 39:6 0
                    sphingomyelin 40:0 0
                    sphingomyelin 40:1 + 0
                    sphingomyelin 40:2 + 0
                    sphingomyelin 40:3 0
                    sphingomyelin 40:4 + 0
                    sphingomyelin 41:1 + 0
                    sphingomyelin 41:2 + 0
                    sphingomyelin 41:3 0
                    sphingomyelin 42:0 + 0
                    sphingomyelin 42:1 + 0
                    sphingomyelin 42:2 + 0
                    sphingomyelin 42:3 + 0
                    sphingomyelin 42:4 0
                    sphingomyelin 43:1 + 0
                    sphingomyelin 43:2 + 0
                    sphingomyelin 43:7 0
                    sphingomyelin 44:0 + 0
                    sphingomyelin 44:1 + 0
                    sphingomyelin 44:2 + 0
                    sphingomyelin 44:3 + 0
                    sphingomyelin 44:4 0
                    sphingomyelin 44:5 0
                    sphingomyelin 44:6 0
                    sphingomyelin 45:1 0
                    sphingomyelin 45:4 + 0
                    sphingomyelin 46:1 0
                    sphingomyelin d18:1 + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19831
    subatomic particle 19829
      composite particle 19829
        hadron 19829
          baryon 19829
            nucleon 19829
              atomic nucleus 19829
                atom 19829
                  main group element atom 19779
                    p-block element atom 19779
                      chalcogen 19534
                        oxygen atom 19509
                          oxygen molecular entity 19509
                            hydroxides 19320
                              oxoacid 18744
                                pnictogen oxoacid 13224
                                  phosphorus oxoacid 12429
                                    phosphoric acids 11430
                                      phosphoric acid 11430
                                        phosphoric acid derivative 11239
                                          phosphate 11238
                                            organic phosphate 11238
                                              phospholipid 316
                                                phosphosphingolipid 98
                                                  sphingomyelin 0
                                                    N-(acyl)-4-hydroxyheptadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-(acyl)-heptadecasphing-4-enine-1-phosphocholine 0
                                                    N-(acyl)-heptadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acyl-15-methylhexadecasphing-4-enine-1-phosphocholine + 0
                                                    N-acyl-15-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acyl-4-hydroxy-15-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine + 0
                                                    N-acylhexadecaphytosphingosine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acylhexadecasphingosine-1-phosphocholine + 0
                                                    N-acylicosaphytosphingosine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acylicosasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acylicosasphingosine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acylphytosphingosine-1-phosphocholine + 0
                                                    N-acylsphinganine-1-phosphocholine + 0
                                                    N-acyltetradecaphytosphingosine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acyltetradecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-acyltetradecasphingosine-1-phosphocholine 0
                                                    N-docosanoyl-14-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-hexacosanoyl-14-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-hexacosanoyl-14-methylhexadecasphingosine-1-phosphocholine 0
                                                    N-hexanoylsphingosine-1-phosphocholine + 0
                                                    N-tetracosanoyl-14-methylhexadecasphinganine-1-phosphocholine 0
                                                    N-tricosenoylsphing-4-enine-1-phosphocholine 0
                                                    SM C16:1 0
                                                    SM(d16:1/24:1(15Z)) 0
                                                    SM(d16:1/24:1) 0
                                                    SM(d17:1/17:0) 0
                                                    SM(d17:1/24:0) 0
                                                    SM(d18:0/12:0) 0
                                                    SM(d18:0/14:0) 0
                                                    SM(d18:0/16:1(9Z)) 0
                                                    SM(d18:0/18:0) 0
                                                    SM(d18:0/18:2) 0
                                                    SM(d18:0/20:0) 0
                                                    SM(d18:0/20:2(11Z,14Z)) 0
                                                    SM(d18:0/22:0) 0
                                                    SM(d18:0/22:3(10Z,13Z,16Z)) 0
                                                    SM(d18:0/24:1(15Z)) 0
                                                    SM(d18:2/25:0) 0
                                                    sphingomyelin 12:0 0
                                                    sphingomyelin 14:0 0
                                                    sphingomyelin 16:0 0
                                                    sphingomyelin 16:1 0
                                                    sphingomyelin 18:0 0
                                                    sphingomyelin 18:1 0
                                                    sphingomyelin 22:0 0
                                                    sphingomyelin 24:0 0
                                                    sphingomyelin 24:1 0
                                                    sphingomyelin 28:0 0
                                                    sphingomyelin 28:1 0
                                                    sphingomyelin 28:2 0
                                                    sphingomyelin 28:3 0
                                                    sphingomyelin 28:4 0
                                                    sphingomyelin 30:0 0
                                                    sphingomyelin 30:1 + 0
                                                    sphingomyelin 30:2 0
                                                    sphingomyelin 30:3 0
                                                    sphingomyelin 30:4 0
                                                    sphingomyelin 31:0 0
                                                    sphingomyelin 31:1 0
                                                    sphingomyelin 32:0 0
                                                    sphingomyelin 32:1 + 0
                                                    sphingomyelin 32:2 + 0
                                                    sphingomyelin 32:3 0
                                                    sphingomyelin 32:4 0
                                                    sphingomyelin 33:0 0
                                                    sphingomyelin 33:1 + 0
                                                    sphingomyelin 33:2 + 0
                                                    sphingomyelin 34:0 + 0
                                                    sphingomyelin 34:1 + 0
                                                    sphingomyelin 34:2 + 0
                                                    sphingomyelin 34:3 0
                                                    sphingomyelin 34:4 0
                                                    sphingomyelin 35:0 0
                                                    sphingomyelin 35:1 + 0
                                                    sphingomyelin 36:0 0
                                                    sphingomyelin 36:1 + 0
                                                    sphingomyelin 36:2 + 0
                                                    sphingomyelin 36:3 + 0
                                                    sphingomyelin 36:4 + 0
                                                    sphingomyelin 37:0 + 0
                                                    sphingomyelin 37:1 0
                                                    sphingomyelin 38:0 0
                                                    sphingomyelin 38:1 + 0
                                                    sphingomyelin 38:2 + 0
                                                    sphingomyelin 38:3 + 0
                                                    sphingomyelin 38:4 0
                                                    sphingomyelin 39:1 + 0
                                                    sphingomyelin 39:2 + 0
                                                    sphingomyelin 39:6 0
                                                    sphingomyelin 40:0 0
                                                    sphingomyelin 40:1 + 0
                                                    sphingomyelin 40:2 + 0
                                                    sphingomyelin 40:3 0
                                                    sphingomyelin 40:4 + 0
                                                    sphingomyelin 41:1 + 0
                                                    sphingomyelin 41:2 + 0
                                                    sphingomyelin 41:3 0
                                                    sphingomyelin 42:0 + 0
                                                    sphingomyelin 42:1 + 0
                                                    sphingomyelin 42:2 + 0
                                                    sphingomyelin 42:3 + 0
                                                    sphingomyelin 42:4 0
                                                    sphingomyelin 43:1 + 0
                                                    sphingomyelin 43:2 + 0
                                                    sphingomyelin 43:7 0
                                                    sphingomyelin 44:0 + 0
                                                    sphingomyelin 44:1 + 0
                                                    sphingomyelin 44:2 + 0
                                                    sphingomyelin 44:3 + 0
                                                    sphingomyelin 44:4 0
                                                    sphingomyelin 44:5 0
                                                    sphingomyelin 44:6 0
                                                    sphingomyelin 45:1 0
                                                    sphingomyelin 45:4 + 0
                                                    sphingomyelin 46:1 0
                                                    sphingomyelin d18:1 + 0
paths to the root