Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:medium-chain fatty acyl-CoA
go back to main search page
Accession:CHEBI:61907 term browser browse the term
Definition:A fatty acyl-CoA that results from the formal condensation of the thiol group of coenzyme A with the carboxy group of any medium-chain fatty acid.
Synonyms:related_synonym: MCFA-CoA;   MCFA-CoAs;   MCFA-coenzyme A;   MCFA-coenzyme As;   medium-chain fatty acyl-CoAs;   medium-chain fatty acyl-coenzyme A;   medium-chain fatty acyl-coenzyme As
 xref: PMID:11027146 "Europe PMC";   PMID:1309181 "Europe PMC";   PMID:19170545 "Europe PMC";   PMID:8218225 "Europe PMC";   PMID:8267794 "Europe PMC"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:90546


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
decanoyl-CoA term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Hsdl2 hydroxysteroid dehydrogenase like 2 JBrowse link 5 76,812,881 76,848,853 RGD:6480464
G Pecr peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase JBrowse link 9 79,601,937 79,630,547 RGD:6480464
hexanoyl-CoA term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Pecr peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase JBrowse link 9 79,601,937 79,630,547 RGD:6480464
lauroyl-CoA term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gsta1 glutathione S-transferase alpha 1 JBrowse link 9 27,366,404 27,381,004 RGD:6480464
G Hsdl2 hydroxysteroid dehydrogenase like 2 JBrowse link 5 76,812,881 76,848,853 RGD:6480464
G Pecr peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase JBrowse link 9 79,601,937 79,630,547 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19741
    role 19688
      chemical role 19199
        donor 18318
          acyl donor 28
            acyl-CoA 28
              fatty acyl-CoA 16
                medium-chain fatty acyl-CoA 3
                  (2-trans,6-cis)-dodeca-2,6-dienoyl-CoA 0
                  (2E,4Z)-deca-2,4-dienoyl-CoA 0
                  (2E,5Z)-octadienoyl-CoA 0
                  (3E)-nonenoyl-CoA 0
                  (3E)-octenoyl-CoA 0
                  (3E,5Z)-dodecadienoyl-CoA 0
                  (3Z,6Z)-dodecadienoyl-CoA 0
                  (E)-hex-4-enoyl-CoA 0
                  (R)-3-hydroxyhexanoyl-CoA 0
                  (R)-3-hydroxylauroyl-CoA 0
                  (S)-3-hydroxylauroyl-CoA 0
                  (Z)-hex-3-enoyl-CoA 0
                  2,6-dimethylheptanoyl-CoA + 0
                  2-hydroxy-3-methyldodecanoyl-CoA 0
                  2-hydroxy-3-methylnonanoyl-CoA 0
                  2-hydroxy-3-methylundecanoyl-CoA 0
                  2-hydroxydecanoyl-CoA 0
                  2-hydroxydodecanoyl-CoA 0
                  2-hydroxyhexanoyl-CoA 0
                  2-hydroxyoctanoyl-CoA 0
                  2-methylhexanoyl-CoA 0
                  2-methylhexenoyl-CoA 0
                  3,5,7-trioxododecanoyl-CoA 0
                  3-hydroxydecanoyl-CoA + 0
                  3-hydroxyoctanoyl-CoA 0
                  3-methyldodecanoyl-CoA 0
                  3-methylnonanoyl-CoA 0
                  3-methylundecanoyl-CoA 0
                  3-thiaoctanoyl-CoA 0
                  4,8-dimethylnonanoyl-CoA 0
                  7-methyloctanoyl-CoA 0
                  9-decenoyl-CoA 0
                  cis-3-octenoyl-CoA 0
                  cis-dec-4-enoyl-CoA 0
                  decanoyl-CoA + 2
                  dodecenoyl-CoA + 0
                  farnesoyl-CoA 0
                  heptanoyl-CoA + 0
                  hexanoyl-CoA + 1
                  isotridecanoyl-CoA 0
                  lauroyl-CoA + 3
                  nonanoyl-CoA 0
                  octanoyl-CoA + 0
                  trans,trans-2,4-hexadienoyl-CoA 0
                  trans-2-undecenoyl-CoA 0
                  trans-3-cis-5-octadienoyl-CoA 0
                  trans-3-hexenoyl-CoA 0
                  trans-dec-2-enoyl-CoA 0
                  trans-dec-3-enoyl-CoA 0
                  trans-hex-2-enoyl-CoA 0
                  trans-oct-2-enoyl-CoA 0
                  undecanoyl-CoA 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19741
    subatomic particle 19737
      composite particle 19737
        hadron 19737
          baryon 19737
            nucleon 19737
              atomic nucleus 19737
                atom 19737
                  main group element atom 19622
                    p-block element atom 19622
                      chalcogen 19334
                        oxygen atom 19295
                          oxygen molecular entity 19295
                            hydroxides 19048
                              oxoacid 18111
                                pnictogen oxoacid 9840
                                  phosphorus oxoacid 8659
                                    phosphoric acids 7332
                                      phosphoric acid 7332
                                        phosphoric acid derivative 6983
                                          phosphate 6983
                                            organic phosphate 6982
                                              carbohydrate phosphate 1508
                                                phospho sugar 1443
                                                  aldose phosphate 1441
                                                    aldopentose phosphate 1435
                                                      ribose phosphate 1429
                                                        ribonucleotide 1388
                                                          purine ribonucleotide 1361
                                                            adenyl ribonucleotide 1239
                                                              adenosine phosphate 248
                                                                adenosine 5'-phosphate 247
                                                                  ADP 82
                                                                    coenzyme A 28
                                                                      acyl-CoA 28
                                                                        fatty acyl-CoA 16
                                                                          medium-chain fatty acyl-CoA 3
                                                                            (2-trans,6-cis)-dodeca-2,6-dienoyl-CoA 0
                                                                            (2E,4Z)-deca-2,4-dienoyl-CoA 0
                                                                            (2E,5Z)-octadienoyl-CoA 0
                                                                            (3E)-nonenoyl-CoA 0
                                                                            (3E)-octenoyl-CoA 0
                                                                            (3E,5Z)-dodecadienoyl-CoA 0
                                                                            (3Z,6Z)-dodecadienoyl-CoA 0
                                                                            (E)-hex-4-enoyl-CoA 0
                                                                            (R)-3-hydroxyhexanoyl-CoA 0
                                                                            (R)-3-hydroxylauroyl-CoA 0
                                                                            (S)-3-hydroxylauroyl-CoA 0
                                                                            (Z)-hex-3-enoyl-CoA 0
                                                                            2,6-dimethylheptanoyl-CoA + 0
                                                                            2-hydroxy-3-methyldodecanoyl-CoA 0
                                                                            2-hydroxy-3-methylnonanoyl-CoA 0
                                                                            2-hydroxy-3-methylundecanoyl-CoA 0
                                                                            2-hydroxydecanoyl-CoA 0
                                                                            2-hydroxydodecanoyl-CoA 0
                                                                            2-hydroxyhexanoyl-CoA 0
                                                                            2-hydroxyoctanoyl-CoA 0
                                                                            2-methylhexanoyl-CoA 0
                                                                            2-methylhexenoyl-CoA 0
                                                                            3,5,7-trioxododecanoyl-CoA 0
                                                                            3-hydroxydecanoyl-CoA + 0
                                                                            3-hydroxyoctanoyl-CoA 0
                                                                            3-methyldodecanoyl-CoA 0
                                                                            3-methylnonanoyl-CoA 0
                                                                            3-methylundecanoyl-CoA 0
                                                                            3-thiaoctanoyl-CoA 0
                                                                            4,8-dimethylnonanoyl-CoA 0
                                                                            7-methyloctanoyl-CoA 0
                                                                            9-decenoyl-CoA 0
                                                                            cis-3-octenoyl-CoA 0
                                                                            cis-dec-4-enoyl-CoA 0
                                                                            decanoyl-CoA + 2
                                                                            dodecenoyl-CoA + 0
                                                                            farnesoyl-CoA 0
                                                                            heptanoyl-CoA + 0
                                                                            hexanoyl-CoA + 1
                                                                            isotridecanoyl-CoA 0
                                                                            lauroyl-CoA + 3
                                                                            nonanoyl-CoA 0
                                                                            octanoyl-CoA + 0
                                                                            trans,trans-2,4-hexadienoyl-CoA 0
                                                                            trans-2-undecenoyl-CoA 0
                                                                            trans-3-cis-5-octadienoyl-CoA 0
                                                                            trans-3-hexenoyl-CoA 0
                                                                            trans-dec-2-enoyl-CoA 0
                                                                            trans-dec-3-enoyl-CoA 0
                                                                            trans-hex-2-enoyl-CoA 0
                                                                            trans-oct-2-enoyl-CoA 0
                                                                            undecanoyl-CoA 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.