Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:pyrimidine nucleotide-sugar
go back to main search page
Accession:CHEBI:61109 term browser browse the term
Definition:A nucleotide-sugar whose nucleobase is a pyrimidine.
Synonyms:related_synonym: pyrimidine nucleotide-sugars


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
CMP-N-acetyl-beta-neuraminic acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Cmas cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase JBrowse link 4 176,994,129 177,012,445 RGD:6480464
UDP-alpha-D-galactose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
G Gpr17 G protein-coupled receptor 17 JBrowse link 18 24,733,306 24,739,194 RGD:6480464
G Uxs1 UDP-glucuronate decarboxylase 1 JBrowse link 9 11,165,006 11,240,329 RGD:6480464
UDP-alpha-D-glucose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
G Gpr17 G protein-coupled receptor 17 JBrowse link 18 24,733,306 24,739,194 RGD:6480464
G Uxs1 UDP-glucuronate decarboxylase 1 JBrowse link 9 11,165,006 11,240,329 RGD:6480464
UDP-alpha-D-glucuronic acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G B3gat3 beta-1,3-glucuronyltransferase 3 JBrowse link 1 225,120,061 225,126,579 RGD:6480464
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
G Ppargc1a PPARG coactivator 1 alpha JBrowse link 14 63,095,291 63,190,688 RGD:6480464
G Ugt1a1 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A1 JBrowse link 9 95,295,701 95,302,822 RGD:6480464
G Ugt2b7 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B7 JBrowse link 14 22,597,103 22,619,968 RGD:6480464
G Uxs1 UDP-glucuronate decarboxylase 1 JBrowse link 9 11,165,006 11,240,329 RGD:6480464
UDP-D-galactose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
G Gpr17 G protein-coupled receptor 17 JBrowse link 18 24,733,306 24,739,194 RGD:6480464
G Uxs1 UDP-glucuronate decarboxylase 1 JBrowse link 9 11,165,006 11,240,329 RGD:6480464
UDP-D-glucose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
G Gpr17 G protein-coupled receptor 17 JBrowse link 18 24,733,306 24,739,194 RGD:6480464
G Uxs1 UDP-glucuronate decarboxylase 1 JBrowse link 9 11,165,006 11,240,329 RGD:6480464
UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Idh2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 1 141,874,354 141,893,674 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19734
    chemical entity 19732
      atom 19730
        nonmetal atom 19601
          nitrogen atom 18402
            nitrogen molecular entity 18402
              nucleobase-containing molecular entity 5176
                nucleotide conjugate 16
                  nucleotide-carbohydrate 16
                    nucleotide-sugar 16
                      pyrimidine nucleotide-sugar 9
                        CDP-4-dehydro-3,6-dideoxy-D-glucose epimer 0
                        CDP-ascarylose 0
                        CDP-sugar + 0
                        CMP-sugar + 1
                        TDP-sugar + 0
                        UDP-4-keto-rhamnose 0
                        UDP-L-arabinofuranose 0
                        UDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid 0
                        UDP-N-acetylmuraminate 0
                        UDP-sugar + 8
                        dTDP 1-ester with 2,6-dideoxy-L-erythro-hexopyranos-3-ulose 0
                        dTDP-(3R)-amino-3,6-dideoxy-D-glucose 0
                        dTDP-2,6-dideoxy-D-kanosamine 0
                        dTDP-3,4-dioxo-2,6-dideoxy-L-glucose 0
                        dTDP-3-amino-2,3,6-trideoxy-C-methyl-D-erythro-hexopyranos-4-ulose 0
                        dTDP-3-amino-2,3,6-trideoxy-D-threo-hexopyranos-4-ulose 0
                        dTDP-3-methyl-4-oxo-2,6-dideoxy-D-glucose 0
                        dTDP-3-oxo-2,6-dideoxy-D-glucose 0
                        dTDP-4-(methylamino)-2,3,4,6-tetradeoxy-alpha-D-glucose 0
                        dTDP-4-amino-2,3,4,6-tetradeoxy-alpha-D-glucose 0
                        dTDP-4-amino-4,6-dideoxy-5-C-methyl-L-mannose 0
                        dTDP-4-dehydro-2,3,6-trideoxy-alpha-D-glucose 0
                        dTDP-4-dimethylamino-4,6-dideoxy-5-C-methyl-L-mannose 0
                        dTDP-4-oxo-2,6-dideoxy-D-allose 0
                        dTDP-4-oxo-2,6-dideoxy-L-mannose 0
                        dTDP-4-oxo-5-C-methyl-L-rhamnose 0
                        dTDP-D-angolosamine 0
                        dTDP-D-olivose 0
                        dTDP-L-4-oxovancosamine 0
                        dTDP-L-megosamine 0
                        dTDP-L-oleandrose 0
                        dTDP-L-olivose 0
                        dTDP-L-ristosamine 0
                        dTDP-alpha-D-forosamine 0
                        dTDP-beta-D-mycarose 0
                        dTDP-beta-D-oliose 0
                        dTDP-beta-L-rhodinose 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19734
    subatomic particle 19730
      composite particle 19730
        hadron 19730
          baryon 19730
            nucleon 19730
              atomic nucleus 19730
                atom 19730
                  main group element atom 19614
                    p-block element atom 19614
                      chalcogen 19323
                        oxygen atom 19284
                          oxygen molecular entity 19284
                            hydroxides 19042
                              oxoacid 18106
                                pnictogen oxoacid 9849
                                  phosphorus oxoacid 8671
                                    phosphoric acids 7340
                                      phosphoric acid 7340
                                        phosphoric acid derivative 6991
                                          phosphate 6991
                                            organic phosphate 6990
                                              nucleoside phosphate 1505
                                                nucleotide 1502
                                                  nucleotide conjugate 16
                                                    nucleotide-carbohydrate 16
                                                      nucleotide-sugar 16
                                                        pyrimidine nucleotide-sugar 9
                                                          CDP-4-dehydro-3,6-dideoxy-D-glucose epimer 0
                                                          CDP-ascarylose 0
                                                          CDP-sugar + 0
                                                          CMP-sugar + 1
                                                          TDP-sugar + 0
                                                          UDP-4-keto-rhamnose 0
                                                          UDP-L-arabinofuranose 0
                                                          UDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid 0
                                                          UDP-N-acetylmuraminate 0
                                                          UDP-sugar + 8
                                                          dTDP 1-ester with 2,6-dideoxy-L-erythro-hexopyranos-3-ulose 0
                                                          dTDP-(3R)-amino-3,6-dideoxy-D-glucose 0
                                                          dTDP-2,6-dideoxy-D-kanosamine 0
                                                          dTDP-3,4-dioxo-2,6-dideoxy-L-glucose 0
                                                          dTDP-3-amino-2,3,6-trideoxy-C-methyl-D-erythro-hexopyranos-4-ulose 0
                                                          dTDP-3-amino-2,3,6-trideoxy-D-threo-hexopyranos-4-ulose 0
                                                          dTDP-3-methyl-4-oxo-2,6-dideoxy-D-glucose 0
                                                          dTDP-3-oxo-2,6-dideoxy-D-glucose 0
                                                          dTDP-4-(methylamino)-2,3,4,6-tetradeoxy-alpha-D-glucose 0
                                                          dTDP-4-amino-2,3,4,6-tetradeoxy-alpha-D-glucose 0
                                                          dTDP-4-amino-4,6-dideoxy-5-C-methyl-L-mannose 0
                                                          dTDP-4-dehydro-2,3,6-trideoxy-alpha-D-glucose 0
                                                          dTDP-4-dimethylamino-4,6-dideoxy-5-C-methyl-L-mannose 0
                                                          dTDP-4-oxo-2,6-dideoxy-D-allose 0
                                                          dTDP-4-oxo-2,6-dideoxy-L-mannose 0
                                                          dTDP-4-oxo-5-C-methyl-L-rhamnose 0
                                                          dTDP-D-angolosamine 0
                                                          dTDP-D-olivose 0
                                                          dTDP-L-4-oxovancosamine 0
                                                          dTDP-L-megosamine 0
                                                          dTDP-L-oleandrose 0
                                                          dTDP-L-olivose 0
                                                          dTDP-L-ristosamine 0
                                                          dTDP-alpha-D-forosamine 0
                                                          dTDP-beta-D-mycarose 0
                                                          dTDP-beta-D-oliose 0
                                                          dTDP-beta-L-rhodinose 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.