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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:1-O-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine
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Accession:CHEBI:58168 term browser browse the term
Definition:The ammonium betaine of a 1-O-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine arising from deprotonation of the phosphate OH; major species at pH 7.3.
Synonyms:related_synonym: Formula=C9H19NO7PR;   SMILES=C[N+](C)(C)CCOP([O-])(=O)OC[C@H](O)COC([*])=O;   a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine
 alt_id: CHEBI:64614
 cyclic_relationship: is_conjugate_base_of CHEBI:17504


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1-O-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Nr5a2 nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 multiple interactions ISO [NR5A2 gene mutant form results in increased susceptibility to Dietary Fats] which results in increased abundance of 1-oleoyl lysophosphatidylcholine CTD PMID:29515023 NCBI chr13:48,313,634...48,433,494
Ensembl chr13:48,316,301...48,433,326 		JBrowse link
G Smad3 SMAD family member 3 decreases abundance ISO SMAD3 protein results in decreased abundance of 1-oleoyl lysophosphatidylcholine CTD PMID:23034213 NCBI chr 8:64,126,829...64,236,960
Ensembl chr 8:64,110,039...64,236,960 		JBrowse link
1-stearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Lipc lipase C, hepatic type multiple interactions ISO [LIPC gene mutant form co-treated with LIPG gene mutant form] results in increased abundance of stearoyl alpha-lysolecithin CTD PMID:24777581 NCBI chr 8:71,509,633...71,635,663
Ensembl chr 8:71,509,635...71,635,464 		JBrowse link
G Lipg lipase G, endothelial type multiple interactions ISO [LIPC gene mutant form co-treated with LIPG gene mutant form] results in increased abundance of stearoyl alpha-lysolecithin CTD PMID:24777581 NCBI chr18:68,514,923...68,536,105
Ensembl chr18:68,514,923...68,536,260 		JBrowse link
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  CHEBI ontology 20089
    chemical entity 20088
      molecular entity 20058
        ion 16481
          organic ion 9185
            organic cation 8126
              quaternary ammonium ion 5131
                quaternary nitrogen compound 628
                  ammonium betaine 344
                    1-O-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 4
                      (2-Hydroxy-3-octadeca-6,9,12-trienoyloxypropyl) 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate 0
                      (2-Hydroxy-3-octadeca-9,12-dienoyloxypropyl) 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate 0
                      (2-\{[(2R)-3-(hexacosanoyloxy)-2-hydroxypropyl phosphonato]oxy\}ethyl)trimethylazanium 0
                      1-O-(11-hydroxyoleoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-O-(8-hydroxyoleoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-O-[(9R,10S)-epoxystearoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-O-[(9S,10R)-epoxystearoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-O-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 2
                      1-[(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)-docosapentaenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-[(7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosapentaenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-[(8Z,11Z,14Z)-icosatrienoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-[(9Z)-hexadecenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-[(9Z,12Z)-heptadecadienoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-acetyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-azelaoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-behenoyl-2-hydroxy-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-decanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-docosahexaenoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                      1-heptanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-hexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                      1-hexanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
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                      1-myristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
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                      1-octanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine zwitterion + 0
                      1-pentadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1-stearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 2
                      1-tetracosanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      1_18_1_lysophosphatidylcholine 0
                      2-[Hydroxy-[2-hydroxy-3-[(Z)-octadec-9-enoyl]oxypropoxy]phosphoryl]oxyethyl-trimethylazanium 0
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                      lysophosphatidylcholine(20:4/0:0) + 0
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  CHEBI ontology 20089
    subatomic particle 20058
      composite particle 20058
        hadron 20088
          baryon 20088
            nucleon 20088
              atomic nucleus 20088
                atom 20058
                  main group element atom 19960
                    p-block element atom 19990
                      chalcogen 19732
                        oxygen atom 19674
                          oxygen molecular entity 19674
                            hydroxides 19454
                              oxoacid 18744
                                pnictogen oxoacid 11007
                                  phosphorus oxoacid 9818
                                    phosphoric acids 8644
                                      phosphoric acid 8639
                                        phosphoric acid derivative 8348
                                          phosphate 8348
                                            organic phosphate 8342
                                              phospholipid 310
                                                glycerophospholipid 209
                                                  glycerophosphocholine 123
                                                    lysophosphatidylcholine 33
                                                      2-lysophosphatidylcholine 4
                                                        1-O-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 4
                                                          (2-Hydroxy-3-octadeca-6,9,12-trienoyloxypropyl) 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate 0
                                                          (2-Hydroxy-3-octadeca-9,12-dienoyloxypropyl) 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate 0
                                                          (2-\{[(2R)-3-(hexacosanoyloxy)-2-hydroxypropyl phosphonato]oxy\}ethyl)trimethylazanium 0
                                                          1-O-(11-hydroxyoleoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          1-O-(8-hydroxyoleoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          1-O-[(9R,10S)-epoxystearoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          1-O-[(9S,10R)-epoxystearoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          1-O-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 2
                                                          1-[(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)-docosapentaenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          1-[(7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)-docosapentaenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          1-[(8Z,11Z,14Z)-icosatrienoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          1-[(9Z)-hexadecenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
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                                                          1-azelaoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
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