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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine
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Accession:CHEBI:57875 term browser browse the term
Definition:The ammonium betaine of a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine arising from deprotonation of the phosphate OH; major species at pH 7.3.
Synonyms:related_synonym: 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine betaines;   Formula=C9H19NO7PR;   SMILES=C[N+](C)(C)CCOP([O-])(=O)OC[C@@H](CO)OC([*])=O;   a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine
 cyclic_relationship: is_conjugate_base_of CHEBI:16728


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Path 1
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  CHEBI ontology 21747
    chemical entity 21745
      molecular entity 21731
        ion 16612
          organic ion 8628
            organic cation 7449
              quaternary ammonium ion 5253
                quaternary nitrogen compound 655
                  ammonium betaine 346
                    2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-(5-oxovaleroyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-(9-oxononanoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(11R)-hydroxy-(5Z,8Z,12E,14Z)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(15R)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(15S)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(5Z,13E,15S)-11alpha,15-dihydroxy-9-oxoprosta-5,13-dien-1-oyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroperoxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                      2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                      2-[(9Z)-12-hydroxyoctadec-9-enoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-azelaoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-docosahexaenoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                      2-dodecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-heptanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-octanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-tetradecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      lysophosphatidylcholine (0:0/18:1) 0
                      lysophosphatidylcholine (0:0/18:3) 0
                      lysophosphatidylcholine (0:0/20:3) 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/16:0) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/16:1) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/18:0) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/18:2) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/20:4) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/20:5) 0
                      oxidized 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine zwitterion + 0
                      phosphatidylcholine (0:0/20:1) 0
Path 2
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  CHEBI ontology 21747
    subatomic particle 21732
      composite particle 21732
        hadron 21732
          baryon 21732
            nucleon 21732
              atomic nucleus 21732
                atom 21732
                  main group element atom 21649
                    p-block element atom 21649
                      chalcogen 20812
                        oxygen atom 20791
                          oxygen molecular entity 20791
                            hydroxides 20228
                              oxoacid 19566
                                pnictogen oxoacid 10846
                                  phosphorus oxoacid 9766
                                    phosphoric acids 8579
                                      phosphoric acid 8579
                                        phosphoric acid derivative 8269
                                          phosphate 8269
                                            organic phosphate 8268
                                              phospholipid 312
                                                glycerophospholipid 212
                                                  glycerophosphocholine 120
                                                    lysophosphatidylcholine 27
                                                      2-acylglycerophosphocholine 0
                                                        2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-(5-oxovaleroyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-(9-oxononanoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(11R)-hydroxy-(5Z,8Z,12E,14Z)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(15R)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(15S)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(5Z,13E,15S)-11alpha,15-dihydroxy-9-oxoprosta-5,13-dien-1-oyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroperoxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                                                          2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                                                          2-[(9Z)-12-hydroxyoctadec-9-enoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-azelaoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-docosahexaenoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                                                          2-dodecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-heptanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-octanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-tetradecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          lysophosphatidylcholine (0:0/18:1) 0
                                                          lysophosphatidylcholine (0:0/18:3) 0
                                                          lysophosphatidylcholine (0:0/20:3) 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/16:0) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/16:1) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/18:0) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/18:2) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/20:4) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/20:5) 0
                                                          oxidized 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine zwitterion + 0
                                                          phosphatidylcholine (0:0/20:1) 0
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