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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine
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Accession:CHEBI:57875 term browser browse the term
Definition:The ammonium betaine of a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine arising from deprotonation of the phosphate OH; major species at pH 7.3.
Synonyms:related_synonym: 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine betaines;   Formula=C9H19NO7PR;   SMILES=C[N+](C)(C)CCOP([O-])(=O)OC[C@@H](CO)OC([*])=O;   a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine
 cyclic_relationship: is_conjugate_base_of CHEBI:16728


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Path 1
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  CHEBI ontology 19775
    chemical entity 19775
      molecular entity 19774
        ion 15946
          organic ion 8470
            organic cation 7323
              quaternary ammonium ion 5112
                quaternary nitrogen compound 620
                  ammonium betaine 337
                    2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-(5-oxovaleroyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-(9-oxononanoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(11R)-hydroxy-(5Z,8Z,12E,14Z)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(15R)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(15S)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(5Z,13E,15S)-11alpha,15-dihydroxy-9-oxoprosta-5,13-dien-1-oyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroperoxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                      2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                      2-[(9Z)-12-hydroxyoctadec-9-enoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-azelaoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-docosahexaenoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                      2-dodecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-heptanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-octanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      2-tetradecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                      lysophosphatidylcholine (0:0/18:1) 0
                      lysophosphatidylcholine (0:0/18:3) 0
                      lysophosphatidylcholine (0:0/20:3) 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/16:0) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/16:1) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/18:0) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/18:2) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/20:4) + 0
                      lysophosphatidylcholine(0:0/20:5) 0
                      oxidized 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine zwitterion + 0
                      phosphatidylcholine (0:0/20:1) 0
Path 2
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  CHEBI ontology 19775
    subatomic particle 19774
      composite particle 19774
        hadron 19774
          baryon 19774
            nucleon 19774
              atomic nucleus 19774
                atom 19774
                  main group element atom 19665
                    p-block element atom 19665
                      chalcogen 19403
                        oxygen atom 19368
                          oxygen molecular entity 19368
                            hydroxides 19097
                              oxoacid 18340
                                pnictogen oxoacid 10658
                                  phosphorus oxoacid 9637
                                    phosphoric acids 8431
                                      phosphoric acid 8431
                                        phosphoric acid derivative 8132
                                          phosphate 8132
                                            organic phosphate 8131
                                              phospholipid 302
                                                glycerophospholipid 203
                                                  glycerophosphocholine 118
                                                    lysophosphatidylcholine 27
                                                      2-acylglycerophosphocholine 0
                                                        2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-(5-oxovaleroyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-(9-oxononanoyl)-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(11R)-hydroxy-(5Z,8Z,12E,14Z)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(15R)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(15S)-hydroxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-icosatetraenoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(5Z,13E,15S)-11alpha,15-dihydroxy-9-oxoprosta-5,13-dien-1-oyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroperoxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                                                          2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3- phosphocholine 0
                                                          2-[(9Z)-12-hydroxyoctadec-9-enoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-azelaoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-docosahexaenoyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                                                          2-dodecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-heptanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-octanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          2-tetradecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                          lysophosphatidylcholine (0:0/18:1) 0
                                                          lysophosphatidylcholine (0:0/18:3) 0
                                                          lysophosphatidylcholine (0:0/20:3) 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/16:0) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/16:1) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/18:0) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/18:2) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/20:4) + 0
                                                          lysophosphatidylcholine(0:0/20:5) 0
                                                          oxidized 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine zwitterion + 0
                                                          phosphatidylcholine (0:0/20:1) 0
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