Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:D-xylopyranose
go back to main search page
Accession:CHEBI:53455 term browser browse the term
Definition:D-Xylose in its pyranose form.
Synonyms:related_synonym: (3R,4S,5R)-tetrahydro-2H-pyran-2,3,4,5-tetrol;   D-xylopentose;   D-xylose;   Formula=C5H10O5;   InChI=1S/C5H10O5/c6-2-1-10-5(9)4(8)3(2)7/h2-9H,1H2/t2-,3+,4-,5?/m1/s1;   InChIKey=SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N;   SMILES=O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O;   WURCS=2.0/1,1,0/[a212h-1x_1-5]/1/;   Wood sugar
 xref: Beilstein:1280757;   CAS:58-86-6;   Drug_Central:2854;   GlyGen:G53308XG;   GlyTouCan:G53308XG;   HMDB:HMDB0000098;   KEGG:C00181;   KEGG:D06346;   KNApSAcK:C00007290;   PMID:13338266;   PMID:17979222;   PMID:22770225;   PMID:23279585;   PMID:23359361;   PMID:23721368;   PMID:23872280;   PMID:24053822;   PMID:24065156;   PMID:24643482;   PMID:25108762;   PMID:7540499;   Reaxys:1280757;   Wikipedia:Xylose


show annotations for term's descendants           Sort by:
 

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19781
    role 19726
      biological role 19726
        biochemical role 19319
          metabolite 19301
            eukaryotic metabolite 18965
              plant metabolite 17447
                xylose 2
                  D-xylose 0
                    D-xylopyranose 0
                      D-Glcp-(1<->1)-D-Xylp 0
                      alpha-D-Glcp-(1->4)-D-Xylp 0
                      alpha-D-xylose + 0
                      beta-D-Galp-(1->3)-D-Xylp 0
                      beta-D-Galp-(1->4)-D-Xylp + 0
                      beta-D-Glcp-(1->2)-D-Xylp 0
                      beta-D-Glcp-(1->4)-D-Xylp 0
                      beta-D-GlcpA-(1->4)-D-Xylp 0
                      beta-D-xylose + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19781
    subatomic particle 19779
      composite particle 19779
        hadron 19779
          baryon 19779
            nucleon 19779
              atomic nucleus 19779
                atom 19779
                  main group element atom 19669
                    p-block element atom 19669
                      carbon group element atom 19588
                        carbon atom 19578
                          organic molecular entity 19578
                            heteroorganic entity 19216
                              organochalcogen compound 18966
                                organooxygen compound 18893
                                  carbohydrates and carbohydrate derivatives 12343
                                    carbohydrate 12343
                                      monosaccharide 4293
                                        aldose 2665
                                          aldopentose 692
                                            xylose 2
                                              D-xylose 0
                                                D-xylopyranose 0
                                                  D-Glcp-(1<->1)-D-Xylp 0
                                                  alpha-D-Glcp-(1->4)-D-Xylp 0
                                                  alpha-D-xylose + 0
                                                  beta-D-Galp-(1->3)-D-Xylp 0
                                                  beta-D-Galp-(1->4)-D-Xylp + 0
                                                  beta-D-Glcp-(1->2)-D-Xylp 0
                                                  beta-D-Glcp-(1->4)-D-Xylp 0
                                                  beta-D-GlcpA-(1->4)-D-Xylp 0
                                                  beta-D-xylose + 0
paths to the root