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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:CDP-2,3-bis-O-(geranylgeranyl)-sn-glycerol
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Accession:CHEBI:50726 term browser browse the term
Definition:A nucleotide conjugate consisting of CDP joined at the 1-position of 2,3-bis-O-(geranylgeranyl)-sn-glycerol via a diphosphate linkage.
Synonyms:exact_synonym: 5'-O-[{[{[(2S)-2,3-bis{[(2E,6E,10E)-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraen-1-yl]oxy}propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]cytidine
 related_synonym: CDP-2,3-digeranylgeranyl sn-G-1-P;   Formula=C52H85N3O13P2;   InChI=1S/C52H85N3O13P2/c1-38(2)17-11-19-40(5)21-13-23-42(7)25-15-27-44(9)30-33-63-35-46(64-34-31-45(10)28-16-26-43(8)24-14-22-41(6)20-12-18-39(3)4)36-65-69(59,60)68-70(61,62)66-37-47-49(56)50(57)51(67-47)55-32-29-48(53)54-52(55)58/h17-18,21-22,25-26,29-32,46-47,49-51,56-57H,11-16,19-20,23-24,27-28,33-37H2,1-10H3,(H,59,60)(H,61,62)(H2,53,54,58)/b40-21+,41-22+,42-25+,43-26+,44-30+,45-31+/t46-,47+,49+,50+,51+/m0/s1;   InChIKey=DCAZOLWWPLSROK-DXHGDTBASA-N;   SMILES=CC(C)=CCC\\C(C)=C\\CC\\C(C)=C\\CC\\C(C)=C\\COC[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)n1ccc(N)nc1=O)OC\\C=C(/C)CC\\C=C(/C)CC\\C=C(/C)CCC=C(C)C
 xref: KEGG:C18059
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:58838


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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19771
    chemical entity 19771
      atom 19770
        nonmetal atom 19646
          nitrogen atom 18577
            nitrogen molecular entity 18577
              nucleobase-containing molecular entity 5347
                nucleotide conjugate 18
                  CDP-2,3-bis-O-(geranylgeranyl)-sn-glycerol 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19771
    subatomic particle 19770
      composite particle 19770
        hadron 19770
          baryon 19770
            nucleon 19770
              atomic nucleus 19770
                atom 19770
                  main group element atom 19658
                    p-block element atom 19658
                      chalcogen 19387
                        oxygen atom 19350
                          oxygen molecular entity 19350
                            hydroxides 19076
                              oxoacid 18275
                                pnictogen oxoacid 10312
                                  phosphorus oxoacid 9234
                                    phosphoric acids 7954
                                      phosphoric acid 7954
                                        phosphoric acid derivative 7634
                                          phosphate 7634
                                            organic phosphate 7633
                                              carbohydrate phosphate 1715
                                                phospho sugar 1640
                                                  aldose phosphate 1638
                                                    aldopentose phosphate 1632
                                                      ribose phosphate 1627
                                                        ribonucleotide 1588
                                                          ribonucleoside 5'-phosphate 602
                                                            ribonucleoside 5'-diphosphate 111
                                                              pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate 21
                                                                CDP 5
                                                                  CDP-2,3-bis-O-(geranylgeranyl)-sn-glycerol 0
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