Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:pyrrolidinecarboxamide
go back to main search page
Accession:CHEBI:46770 term browser browse the term
Synonyms:related_synonym: pyrrolidinecarboxamides


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
clindamycin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mmp13 matrix metallopeptidase 13 increases expression ISO Clindamycin results in increased expression of MMP13 mRNA CTD PMID:20338993 NCBI chr 8:5,522,739...5,533,018
Ensembl chr 8:5,522,739...5,533,018
JBrowse link
G RT1-Db1 RT1 class II, locus Db1 affects expression ISO Clindamycin affects the expression of HLA-DRB1 mRNA CTD PMID:25811541 NCBI chr20:4,087,621...4,097,190
Ensembl chr20:4,087,618...4,097,190
JBrowse link
G RT1-S3 RT1 class Ib, locus S3 affects expression ISO Clindamycin affects the expression of HLA-E mRNA CTD PMID:25811541 NCBI chr20:3,176,124...3,180,825
Ensembl chr20:3,176,107...3,179,818
JBrowse link
clindamycin phosphate term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Pon1 paraoxonase 1 decreases activity ISO clindamycin phosphate results in decreased activity of PON1 protein CTD PMID:16880604 NCBI chr 4:30,249,749...30,276,297
Ensembl chr 4:30,249,742...30,276,372
JBrowse link
lincomycin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mr1 major histocompatibility complex, class I-related affects expression ISO Lincomycin affects the expression of MR1 mRNA CTD PMID:25811541 NCBI chr13:72,771,992...72,789,861
Ensembl chr13:72,771,984...72,789,841
JBrowse link
G RT1-S3 RT1 class Ib, locus S3 affects expression ISO Lincomycin affects the expression of HLA-E mRNA CTD PMID:25811541 NCBI chr20:3,176,124...3,180,825
Ensembl chr20:3,176,107...3,179,818
JBrowse link
meropenem term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G RT1-DOb RT1 class II, locus DOb affects expression ISO meropenem affects the expression of HLA-DOB mRNA CTD PMID:25811541 NCBI chr20:4,020,273...4,026,398
Ensembl chr20:4,020,317...4,026,346
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    chemical entity 19787
      atom 19784
        nonmetal atom 19659
          nitrogen atom 18542
            nitrogen molecular entity 18542
              organonitrogen compound 18312
                carboxamide 17134
                  monocarboxylic acid amide 14553
                    pyrrolidinecarboxamide 6
                      (2R,4R)-N(1)-(4-chlorophenyl)-N(2)-[3-fluoro-2'-(methylsulfonyl)biphenyl-4-yl]-4-methoxypyrrolidine-1,2-dicarboxamide 0
                      (2S,4R)-1-acetyl-N-[(1S)-4-[(aminoiminomethyl)amino]-1-(benzothiazol-2-ylcarbonyl)butyl]-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide 0
                      (3S)-1-cyclohexyl-5-oxo-N-phenylpyrrolidine-3-carboxamide 0
                      (3S)-1-cyclohexyl-N-(3,5-dichlorophenyl)-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                      (3S)-N-(3-bromophenyl)-1-cyclohexyl-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                      (3S)-N-(3-chloro-2-methylphenyl)-1-cyclohexyl-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                      (3S)-N-(5-chloro-2-methylphenyl)-1-cyclohexyl-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                      (4S)-N-hydroxy-4-(methoxyamino)-1-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-D-prolinamide 0
                      1-(4-azido-2-nitrophenyl)amino-3-(1-oxyl-2,2,5,5-pyrrolidin-3-ylcarbonylamino)propan-2-yl diphosphate 0
                      1-[(2R)-2-amino-2-cyclohexylacetyl]-N-\{5-chloro-2-[2-(ethylamino)-2-oxoethoxy]benzyl\}-L-prolinamide 0
                      1-[2-(4-methylphenyl)ethyl]-N-[3-(4-methyl-1-piperazinyl)propyl]-5-oxo-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                      1-[3,3-dimethyl-2-(2-2-methylaminopropionylamino)butyryl]-4-phenoxypyrrolidine-2-[N-(1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl)]carboxamide 0
                      1-\{[1-(2-amino-3-phenylpropionyl)pyrrolidine-2-carbonyl]amino\}-2-(3-cyanophenyl)ethaneboronic acid 0
                      L-prolinamide 0
                      LSM-10075 0
                      LSM-10127 0
                      LSM-10130 0
                      LSM-10265 0
                      LSM-10374 0
                      LSM-10378 0
                      LSM-10843 0
                      LSM-10850 0
                      LSM-10968 0
                      LSM-10996 0
                      LSM-10997 0
                      LSM-11016 0
                      LSM-11045 0
                      LSM-11067 0
                      LSM-11199 0
                      LSM-11239 0
                      LSM-11262 0
                      LSM-11360 0
                      LSM-11372 0
                      LSM-11835 0
                      LSM-11836 0
                      LSM-11871 0
                      LSM-11966 0
                      LSM-11980 0
                      LSM-12023 0
                      LSM-12251 0
                      LSM-12321 0
                      LSM-12437 0
                      LSM-12589 0
                      LSM-12961 0
                      LSM-13016 0
                      LSM-13017 0
                      LSM-13040 0
                      LSM-13071 0
                      LSM-13157 0
                      LSM-13215 0
                      LSM-13242 0
                      LSM-13260 0
                      LSM-13303 0
                      LSM-13310 0
                      LSM-13469 0
                      LSM-13512 0
                      LSM-13684 0
                      LSM-13713 0
                      LSM-13728 0
                      LSM-13731 0
                      LSM-13921 0
                      LSM-13945 0
                      LSM-14013 0
                      LSM-14114 0
                      LSM-14443 0
                      LSM-14580 0
                      LSM-14583 0
                      LSM-14588 0
                      LSM-14590 0
                      LSM-14596 0
                      LSM-14599 0
                      LSM-14600 0
                      LSM-14602 0
                      LSM-14611 0
                      LSM-14617 0
                      LSM-14619 0
                      LSM-14623 0
                      LSM-14632 0
                      LSM-14635 0
                      LSM-14638 0
                      LSM-14639 0
                      LSM-14642 0
                      LSM-14643 0
                      LSM-14644 0
                      LSM-14648 0
                      LSM-14652 0
                      LSM-14661 0
                      LSM-14662 0
                      LSM-14665 0
                      LSM-14668 0
                      LSM-14670 0
                      LSM-14671 0
                      LSM-14959 0
                      LSM-41954 0
                      LSM-8600 0
                      LSM-8607 0
                      LSM-8678 0
                      LSM-8714 0
                      LSM-8744 0
                      LSM-8961 0
                      LSM-9024 0
                      LSM-9088 0
                      LSM-9202 0
                      LSM-9270 0
                      LSM-9380 0
                      LSM-9383 0
                      LSM-9422 0
                      LSM-9575 0
                      LSM-9591 0
                      LSM-9659 0
                      LSM-9681 0
                      LSM-9694 0
                      LSM-9698 0
                      LSM-9771 0
                      LSM-9838 0
                      LSM-9856 0
                      N-(3-\{[5-bromo-2-(\{3-[(pyrrolidin-1-ylcarbonyl)amino]phenyl\}amino)pyrimidin-4-yl]amino\}propyl)-2,2-dimethylmalonamide 0
                      N-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)ethyl]-1-[2-(1H-imidazol-1-yl)-6-methylpyrimidin-4-yl]-D-prolinamide 0
                      N-[3-(1-azepanyl)propyl]-1-[(4-methoxyphenyl)methyl]-5-oxo-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                      N-[3-(1-azepanyl)propyl]-5-oxo-1-(2-phenylethyl)-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                      N-[4-(morpholin-4-ylcarbonyl)benzoyl]-L-valyl-N-[(3S)-5,5,6,6,6-pentafluoro-2-methyl-4-oxohexan-3-yl]-L-prolinamide 0
                      N-\{[(3S,5S)-5-(1,3-thiazolidin-3-ylcarbonyl)pyrrolidin-3-yl]methyl\}-1,3-thiazole-4-carboxamide 0
                      N-butan-2-yl-1-[2-(4-fluorophenyl)ethyl]-5-oxo-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                      beta-phenyl-D-phenylalanyl-N-(2,5-dichlorobenzyl)-L-prolinamide 0
                      celesticetin 0
                      clindamycin + 4
                      ertapenem 0
                      lincomycin + 5
                      meropenem + 1
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    subatomic particle 19784
      composite particle 19784
        hadron 19784
          baryon 19784
            nucleon 19784
              atomic nucleus 19784
                atom 19784
                  main group element atom 19672
                    p-block element atom 19672
                      carbon group element atom 19574
                        carbon atom 19563
                          organic molecular entity 19563
                            organic group 18495
                              organic divalent group 18488
                                organodiyl group 18488
                                  carbonyl group 18391
                                    carbonyl compound 18391
                                      carboxylic acid 18061
                                        carboacyl group 17348
                                          univalent carboacyl group 17348
                                            carbamoyl group 17134
                                              carboxamide 17134
                                                monocarboxylic acid amide 14553
                                                  pyrrolidinecarboxamide 6
                                                    (2R,4R)-N(1)-(4-chlorophenyl)-N(2)-[3-fluoro-2'-(methylsulfonyl)biphenyl-4-yl]-4-methoxypyrrolidine-1,2-dicarboxamide 0
                                                    (2S,4R)-1-acetyl-N-[(1S)-4-[(aminoiminomethyl)amino]-1-(benzothiazol-2-ylcarbonyl)butyl]-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide 0
                                                    (3S)-1-cyclohexyl-5-oxo-N-phenylpyrrolidine-3-carboxamide 0
                                                    (3S)-1-cyclohexyl-N-(3,5-dichlorophenyl)-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                                                    (3S)-N-(3-bromophenyl)-1-cyclohexyl-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                                                    (3S)-N-(3-chloro-2-methylphenyl)-1-cyclohexyl-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                                                    (3S)-N-(5-chloro-2-methylphenyl)-1-cyclohexyl-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 0
                                                    (4S)-N-hydroxy-4-(methoxyamino)-1-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-D-prolinamide 0
                                                    1-(4-azido-2-nitrophenyl)amino-3-(1-oxyl-2,2,5,5-pyrrolidin-3-ylcarbonylamino)propan-2-yl diphosphate 0
                                                    1-[(2R)-2-amino-2-cyclohexylacetyl]-N-\{5-chloro-2-[2-(ethylamino)-2-oxoethoxy]benzyl\}-L-prolinamide 0
                                                    1-[2-(4-methylphenyl)ethyl]-N-[3-(4-methyl-1-piperazinyl)propyl]-5-oxo-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                                                    1-[3,3-dimethyl-2-(2-2-methylaminopropionylamino)butyryl]-4-phenoxypyrrolidine-2-[N-(1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl)]carboxamide 0
                                                    1-\{[1-(2-amino-3-phenylpropionyl)pyrrolidine-2-carbonyl]amino\}-2-(3-cyanophenyl)ethaneboronic acid 0
                                                    L-prolinamide 0
                                                    LSM-10075 0
                                                    LSM-10127 0
                                                    LSM-10130 0
                                                    LSM-10265 0
                                                    LSM-10374 0
                                                    LSM-10378 0
                                                    LSM-10843 0
                                                    LSM-10850 0
                                                    LSM-10968 0
                                                    LSM-10996 0
                                                    LSM-10997 0
                                                    LSM-11016 0
                                                    LSM-11045 0
                                                    LSM-11067 0
                                                    LSM-11199 0
                                                    LSM-11239 0
                                                    LSM-11262 0
                                                    LSM-11360 0
                                                    LSM-11372 0
                                                    LSM-11835 0
                                                    LSM-11836 0
                                                    LSM-11871 0
                                                    LSM-11966 0
                                                    LSM-11980 0
                                                    LSM-12023 0
                                                    LSM-12251 0
                                                    LSM-12321 0
                                                    LSM-12437 0
                                                    LSM-12589 0
                                                    LSM-12961 0
                                                    LSM-13016 0
                                                    LSM-13017 0
                                                    LSM-13040 0
                                                    LSM-13071 0
                                                    LSM-13157 0
                                                    LSM-13215 0
                                                    LSM-13242 0
                                                    LSM-13260 0
                                                    LSM-13303 0
                                                    LSM-13310 0
                                                    LSM-13469 0
                                                    LSM-13512 0
                                                    LSM-13684 0
                                                    LSM-13713 0
                                                    LSM-13728 0
                                                    LSM-13731 0
                                                    LSM-13921 0
                                                    LSM-13945 0
                                                    LSM-14013 0
                                                    LSM-14114 0
                                                    LSM-14443 0
                                                    LSM-14580 0
                                                    LSM-14583 0
                                                    LSM-14588 0
                                                    LSM-14590 0
                                                    LSM-14596 0
                                                    LSM-14599 0
                                                    LSM-14600 0
                                                    LSM-14602 0
                                                    LSM-14611 0
                                                    LSM-14617 0
                                                    LSM-14619 0
                                                    LSM-14623 0
                                                    LSM-14632 0
                                                    LSM-14635 0
                                                    LSM-14638 0
                                                    LSM-14639 0
                                                    LSM-14642 0
                                                    LSM-14643 0
                                                    LSM-14644 0
                                                    LSM-14648 0
                                                    LSM-14652 0
                                                    LSM-14661 0
                                                    LSM-14662 0
                                                    LSM-14665 0
                                                    LSM-14668 0
                                                    LSM-14670 0
                                                    LSM-14671 0
                                                    LSM-14959 0
                                                    LSM-41954 0
                                                    LSM-8600 0
                                                    LSM-8607 0
                                                    LSM-8678 0
                                                    LSM-8714 0
                                                    LSM-8744 0
                                                    LSM-8961 0
                                                    LSM-9024 0
                                                    LSM-9088 0
                                                    LSM-9202 0
                                                    LSM-9270 0
                                                    LSM-9380 0
                                                    LSM-9383 0
                                                    LSM-9422 0
                                                    LSM-9575 0
                                                    LSM-9591 0
                                                    LSM-9659 0
                                                    LSM-9681 0
                                                    LSM-9694 0
                                                    LSM-9698 0
                                                    LSM-9771 0
                                                    LSM-9838 0
                                                    LSM-9856 0
                                                    N-(3-\{[5-bromo-2-(\{3-[(pyrrolidin-1-ylcarbonyl)amino]phenyl\}amino)pyrimidin-4-yl]amino\}propyl)-2,2-dimethylmalonamide 0
                                                    N-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)ethyl]-1-[2-(1H-imidazol-1-yl)-6-methylpyrimidin-4-yl]-D-prolinamide 0
                                                    N-[3-(1-azepanyl)propyl]-1-[(4-methoxyphenyl)methyl]-5-oxo-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                                                    N-[3-(1-azepanyl)propyl]-5-oxo-1-(2-phenylethyl)-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                                                    N-[4-(morpholin-4-ylcarbonyl)benzoyl]-L-valyl-N-[(3S)-5,5,6,6,6-pentafluoro-2-methyl-4-oxohexan-3-yl]-L-prolinamide 0
                                                    N-\{[(3S,5S)-5-(1,3-thiazolidin-3-ylcarbonyl)pyrrolidin-3-yl]methyl\}-1,3-thiazole-4-carboxamide 0
                                                    N-butan-2-yl-1-[2-(4-fluorophenyl)ethyl]-5-oxo-3-pyrrolidinecarboxamide 0
                                                    beta-phenyl-D-phenylalanyl-N-(2,5-dichlorobenzyl)-L-prolinamide 0
                                                    celesticetin 0
                                                    clindamycin + 4
                                                    ertapenem 0
                                                    lincomycin + 5
                                                    meropenem + 1
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.