Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:carbapenems
go back to main search page
Accession:CHEBI:46633 term browser browse the term
Definition:The class of beta-lactam antibiotics that whose members have a carbapenem skeleton which is variously substituted at positions 3, 4, and 6.
Synonyms:related_synonym: Formula=C7H4NO3R3;   SMILES=[H][C@@]12C([*])C(=O)N1C(C(O)=O)=C([*])C2[*]
 xref_mesh: MESH:D015780
 xref: PMID:18076336 "Europe PMC";   PMID:19199922 "Europe PMC";   PMID:19610642 "Europe PMC";   PMID:19617229 "Europe PMC";   PMID:19929840 "Europe PMC";   PMID:21859938 "Europe PMC";   Wikipedia:Carbapenem


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
carbapenems term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Apeh acylaminoacyl-peptide hydrolase JBrowse link 8 116,862,664 116,871,776 RGD:6480464
imipenem hydrate term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Abcb11 ATP binding cassette subfamily B member 11 JBrowse link 3 55,480,024 55,587,946 RGD:6480464
G Abcb1a ATP binding cassette subfamily B member 1A JBrowse link 4 22,339,829 22,517,642 RGD:6480464
G Abcc2 ATP binding cassette subfamily C member 2 JBrowse link 1 263,554,426 263,612,556 RGD:6480464
G Abcc3 ATP binding cassette subfamily C member 3 JBrowse link 10 82,047,308 82,116,928 RGD:6480464
G Abcg5 ATP binding cassette subfamily G member 5 JBrowse link 6 7,935,771 7,961,207 RGD:6480464
G Abcg8 ATP binding cassette subfamily G member 8 JBrowse link 6 7,961,413 7,980,708 RGD:6480464
G Baat bile acid CoA:amino acid N-acyltransferase JBrowse link 5 64,768,397 64,777,368 RGD:6480464
G Cyp7a1 cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 JBrowse link 5 19,358,734 19,368,431 RGD:6480464
G Cyp8b1 cytochrome P450 family 8 subfamily B member 1 JBrowse link 8 130,548,418 130,550,388 RGD:6480464
G Npc1l1 NPC1 like intracellular cholesterol transporter 1 JBrowse link 14 86,345,946 86,560,694 RGD:6480464
G Nr0b2 nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 JBrowse link 5 151,776,004 151,779,319 RGD:6480464
G Nr1i2 nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 JBrowse link 11 65,022,100 65,058,546 RGD:6480464
G Nr5a2 nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 JBrowse link 13 53,750,470 53,870,288 RGD:6480464
G Slc10a1 solute carrier family 10 member 1 JBrowse link 6 104,617,730 104,631,355 RGD:6480464
G Slc27a5 solute carrier family 27 member 5 JBrowse link 1 65,576,599 65,587,192 RGD:6480464
G Slc51a solute carrier family 51, alpha subunit JBrowse link 11 71,533,078 71,547,476 RGD:6480464
G Slco1a4 solute carrier organic anion transporter family, member 1a4 JBrowse link 4 175,969,549 176,026,227 RGD:6480464
G Slco1b2 solute carrier organic anion transporter family, member 1B2 JBrowse link 4 175,814,118 175,881,775 RGD:6480464
G Slco2b1 solute carrier organic anion transporter family, member 2b1 JBrowse link 1 164,623,313 164,671,612 RGD:6480464
meropenem term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G RT1-DOb RT1 class II, locus DOb JBrowse link 20 4,020,273 4,026,398 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    role 19613
      biological role 19611
        antimicrobial agent 17151
          antibacterial agent 12904
            carbapenems 21
              (4R,5S,6R)-3-[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl-6-[(1R)-1-hydroxyethyl]-4-methyl-7-oxo-1-azabicyclo[3.2.0]hept-2-ene-2-carboxylic acid 0
              (5R,6R)-3-[2-(aminomethylideneamino)ethylthio]-6-[(1R)-1-hydroxyethyl]-7-oxo-1-azabicyclo[3.2.0]hept-2-ene-2-carboxylic acid 0
              1beta-methylcarbapenem 0
              2,3-Dihydrothienamycin 0
              Asparenomycin A 0
              BO 2727 0
              Deacetylepithienamycin F 0
              Doripenem hydrate 0
              Epithienamycin A 0
              Epithienamycin B 0
              Epithienamycin C 0
              Epithienamycin F 0
              MK826 0
              N-Acetylthienamycin 0
              NS-5 0
              Northienamycin 0
              OA-6129 A 0
              OA-6129 B1 0
              OA-6129 B2 0
              OA-6129 D 0
              OA-6129 E 0
              PS-5 0
              PS-6 0
              SM-17466 0
              Thienamycin 0
              biapenem 0
              carbapenem + 0
              carbapenemcarboxylic acid + 1
              doripenem 0
              epithienamycin E 0
              imipenem + 19
              imipenem hydrate 19
              tebipenem pivoxil 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    subatomic particle 19665
      composite particle 19665
        hadron 19665
          baryon 19665
            nucleon 19665
              atomic nucleus 19665
                atom 19665
                  main group element atom 19545
                    p-block element atom 19545
                      carbon group element atom 19428
                        carbon atom 19420
                          organic molecular entity 19420
                            organic group 18343
                              organic divalent group 18334
                                organodiyl group 18334
                                  carbonyl group 18222
                                    carbonyl compound 18222
                                      carboxylic acid 17923
                                        carboacyl group 16943
                                          univalent carboacyl group 16943
                                            carbamoyl group 16622
                                              carboxamide 16622
                                                lactam 2855
                                                  beta-lactam 711
                                                    beta-lactam antibiotic 699
                                                      carbapenems 21
                                                        (4R,5S,6R)-3-[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl-6-[(1R)-1-hydroxyethyl]-4-methyl-7-oxo-1-azabicyclo[3.2.0]hept-2-ene-2-carboxylic acid 0
                                                        (5R,6R)-3-[2-(aminomethylideneamino)ethylthio]-6-[(1R)-1-hydroxyethyl]-7-oxo-1-azabicyclo[3.2.0]hept-2-ene-2-carboxylic acid 0
                                                        1beta-methylcarbapenem 0
                                                        2,3-Dihydrothienamycin 0
                                                        Asparenomycin A 0
                                                        BO 2727 0
                                                        Deacetylepithienamycin F 0
                                                        Doripenem hydrate 0
                                                        Epithienamycin A 0
                                                        Epithienamycin B 0
                                                        Epithienamycin C 0
                                                        Epithienamycin F 0
                                                        MK826 0
                                                        N-Acetylthienamycin 0
                                                        NS-5 0
                                                        Northienamycin 0
                                                        OA-6129 A 0
                                                        OA-6129 B1 0
                                                        OA-6129 B2 0
                                                        OA-6129 D 0
                                                        OA-6129 E 0
                                                        PS-5 0
                                                        PS-6 0
                                                        SM-17466 0
                                                        Thienamycin 0
                                                        biapenem 0
                                                        carbapenem + 0
                                                        carbapenemcarboxylic acid + 1
                                                        doripenem 0
                                                        epithienamycin E 0
                                                        imipenem + 19
                                                        imipenem hydrate 19
                                                        tebipenem pivoxil 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.