Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:gibberellin monocarboxylic acid
go back to main search page
Accession:CHEBI:38305 term browser browse the term
Synonyms:related_synonym: gibberellin monocarboxylic acids


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
gibberellin A3 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Casp3 caspase 3 multiple interactions
increases expression
EXP Decitabine promotes the reaction [gibberellic acid results in increased expression of CASP3 mRNA]; gibberellic acid promotes the reaction [Decitabine results in increased expression of CASP3 mRNA]
gibberellic acid results in increased expression of CASP3 mRNA; gibberellic acid results in increased expression of CASP3 protein
CTD PMID:31733319 NCBI chr16:48,845,011...48,863,249
Ensembl chr16:48,845,012...48,863,204
JBrowse link
G Casp8 caspase 8 decreases methylation
increases expression
EXP gibberellic acid results in decreased methylation of CASP8 gene; gibberellic acid results in decreased methylation of CASP8 promoter
gibberellic acid results in increased expression of CASP8 mRNA; gibberellic acid results in increased expression of CASP8 protein
CTD PMID:31733319 NCBI chr 9:65,614,142...65,662,624
Ensembl chr 9:65,614,142...65,662,106
JBrowse link
G Casp9 caspase 9 increases expression EXP gibberellic acid results in increased expression of CASP9 mRNA; gibberellic acid results in increased expression of CASP9 protein CTD PMID:31733319 NCBI chr 5:160,356,211...160,373,774
Ensembl chr 5:160,355,833...160,373,778
JBrowse link
G Dnmt3a DNA methyltransferase 3 alpha decreases expression EXP gibberellic acid results in decreased expression of DNMT3A mRNA CTD PMID:31733319 NCBI chr 6:28,205,375...28,346,052
Ensembl chr 6:28,235,695...28,340,577
JBrowse link
G Dnmt3b DNA methyltransferase 3 beta decreases expression EXP gibberellic acid results in decreased expression of DNMT3B mRNA CTD PMID:31733319 NCBI chr 3:149,131,541...149,170,061
Ensembl chr 3:149,131,785...149,208,786
JBrowse link
G Fas Fas cell surface death receptor increases expression EXP gibberellic acid results in increased expression of FAS mRNA; gibberellic acid results in increased expression of FAS protein CTD PMID:31733319 NCBI chr 1:252,589,785...252,624,790
Ensembl chr 1:252,589,785...252,624,790
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19786
    role 19732
      chemical role 19281
        donor 18522
          Bronsted acid 18391
            oxoacid 18350
              carbon oxoacid 18221
                carboxylic acid 18215
                  monocarboxylic acid 17609
                    gibberellin monocarboxylic acid 6
                      11beta-Hydroxygibberellin A7 0
                      15beta-OH gibberellin A3 0
                      2,3-didehydro-gibberellin A9 0
                      Gibberellic acid 0
                      Gibberellin A101 0
                      Gibberellin A105 0
                      Gibberellin A108 0
                      Gibberellin A113 0
                      Gibberellin A120 0
                      Gibberellin A121 0
                      Gibberellin A124 0
                      Gibberellin A21 0
                      Gibberellin A22 0
                      Gibberellin A32 0
                      Gibberellin A38 0
                      Gibberellin A49 0
                      Gibberellin A50 0
                      Gibberellin A52 0
                      Gibberellin A54 0
                      Gibberellin A55 0
                      Gibberellin A58 0
                      Gibberellin A59 0
                      Gibberellin A62 0
                      Gibberellin A64 0
                      Gibberellin A70 0
                      Gibberellin A75 0
                      Gibberellin A76 0
                      Gibberellin A77 0
                      Gibberellin A79 0
                      Gibberellin A86 0
                      Gibberellin A87 0
                      Gibberellin A90 0
                      Gibberellin A92 0
                      Gibberellin A93 0
                      Gibberellin A94 0
                      Gibberellin A95 0
                      Gibberellin GA126 0
                      LSM-6641 0
                      gibberellin A1 + 0
                      gibberellin A10 0
                      gibberellin A14 + 0
                      gibberellin A14 aldehyde 0
                      gibberellin A15 (lactone form) + 0
                      gibberellin A2 + 0
                      gibberellin A20 + 0
                      gibberellin A29 0
                      gibberellin A3 + 6
                      gibberellin A34 0
                      gibberellin A37 0
                      gibberellin A4 + 0
                      gibberellin A44 0
                      gibberellin A45 0
                      gibberellin A5 0
                      gibberellin A51 + 0
                      gibberellin A53 aldehyde 0
                      gibberellin A6 0
                      gibberellin A60 0
                      gibberellin A61 0
                      gibberellin A63 0
                      gibberellin A67 0
                      gibberellin A68 0
                      gibberellin A7 0
                      gibberellin A72 0
                      gibberellin A8 + 0
                      gibberellin A9 + 0
                      gibberellin A98 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19786
    subatomic particle 19784
      composite particle 19784
        hadron 19784
          baryon 19784
            nucleon 19784
              atomic nucleus 19784
                atom 19784
                  main group element atom 19675
                    p-block element atom 19675
                      carbon group element atom 19596
                        carbon atom 19586
                          organic molecular entity 19586
                            organic group 18631
                              organic divalent group 18622
                                organodiyl group 18622
                                  carbonyl group 18537
                                    carbonyl compound 18537
                                      carboxylic acid 18215
                                        monocarboxylic acid 17609
                                          gibberellin monocarboxylic acid 6
                                            11beta-Hydroxygibberellin A7 0
                                            15beta-OH gibberellin A3 0
                                            2,3-didehydro-gibberellin A9 0
                                            Gibberellic acid 0
                                            Gibberellin A101 0
                                            Gibberellin A105 0
                                            Gibberellin A108 0
                                            Gibberellin A113 0
                                            Gibberellin A120 0
                                            Gibberellin A121 0
                                            Gibberellin A124 0
                                            Gibberellin A21 0
                                            Gibberellin A22 0
                                            Gibberellin A32 0
                                            Gibberellin A38 0
                                            Gibberellin A49 0
                                            Gibberellin A50 0
                                            Gibberellin A52 0
                                            Gibberellin A54 0
                                            Gibberellin A55 0
                                            Gibberellin A58 0
                                            Gibberellin A59 0
                                            Gibberellin A62 0
                                            Gibberellin A64 0
                                            Gibberellin A70 0
                                            Gibberellin A75 0
                                            Gibberellin A76 0
                                            Gibberellin A77 0
                                            Gibberellin A79 0
                                            Gibberellin A86 0
                                            Gibberellin A87 0
                                            Gibberellin A90 0
                                            Gibberellin A92 0
                                            Gibberellin A93 0
                                            Gibberellin A94 0
                                            Gibberellin A95 0
                                            Gibberellin GA126 0
                                            LSM-6641 0
                                            gibberellin A1 + 0
                                            gibberellin A10 0
                                            gibberellin A14 + 0
                                            gibberellin A14 aldehyde 0
                                            gibberellin A15 (lactone form) + 0
                                            gibberellin A2 + 0
                                            gibberellin A20 + 0
                                            gibberellin A29 0
                                            gibberellin A3 + 6
                                            gibberellin A34 0
                                            gibberellin A37 0
                                            gibberellin A4 + 0
                                            gibberellin A44 0
                                            gibberellin A45 0
                                            gibberellin A5 0
                                            gibberellin A51 + 0
                                            gibberellin A53 aldehyde 0
                                            gibberellin A6 0
                                            gibberellin A60 0
                                            gibberellin A61 0
                                            gibberellin A63 0
                                            gibberellin A67 0
                                            gibberellin A68 0
                                            gibberellin A7 0
                                            gibberellin A72 0
                                            gibberellin A8 + 0
                                            gibberellin A9 + 0
                                            gibberellin A98 0
paths to the root