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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:omega-carboxyacyl-CoA
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Accession:CHEBI:37555 term browser browse the term
Definition:An acyl-CoA that results from the formal condensation of the thiol group of coenzyme A with one of the carboxy groups of any alpha,omega-dicarboxylic acid.
Synonyms:alt_id: CHEBI:10614;   CHEBI:13782;   CHEBI:25688
 xref: KEGG:C03188
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:133241


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glutaryl-CoA term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Acot4 acyl-CoA thioesterase 4 affects hydrolysis ISO ACOT4 protein affects the hydrolysis of glutaryl-coenzyme A CTD PMID:16141203 NCBI chr 6:107,517,668...107,522,952
Ensembl chr 6:107,517,668...107,522,952
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G Acot8 acyl-CoA thioesterase 8 affects hydrolysis ISO ACOT8 protein affects the hydrolysis of glutaryl-coenzyme A CTD PMID:16141203 NCBI chr 3:161,260,837...161,272,495
Ensembl chr 3:161,259,735...161,272,460
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succinyl-CoA term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Acot4 acyl-CoA thioesterase 4 affects hydrolysis ISO ACOT4 protein affects the hydrolysis of succinyl-coenzyme A CTD PMID:16141203 NCBI chr 6:107,517,668...107,522,952
Ensembl chr 6:107,517,668...107,522,952
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Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19773
    role 19719
      chemical role 19262
        donor 18486
          acyl donor 28
            acyl-CoA 28
              omega-carboxyacyl-CoA 2
                (R)-ethylmalonyl-CoA 0
                (S)-ethylmalonyl-CoA 0
                2-benzylsuccinyl-CoA + 0
                3-carboxy-3-hydroxypropanoyl-CoA 0
                3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA + 0
                3-hydroxypimeloyl-CoA 0
                3-methylfumaryl-CoA 0
                adipoyl-CoA + 0
                decanedioyl-CoA 0
                dodecanedioyl-CoA 0
                glutaryl-CoAs + 2
                mesaconyl-CoA 0
                octanedioyl-CoA 0
                oxalyl-CoA 0
                pimeloyl-CoA + 0
                succinyl-CoA 1
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19773
    subatomic particle 19772
      composite particle 19772
        hadron 19772
          baryon 19772
            nucleon 19772
              atomic nucleus 19772
                atom 19772
                  main group element atom 19662
                    p-block element atom 19662
                      chalcogen 19393
                        oxygen atom 19356
                          oxygen molecular entity 19356
                            hydroxides 19083
                              oxoacid 18310
                                pnictogen oxoacid 10315
                                  phosphorus oxoacid 9240
                                    phosphoric acids 7960
                                      phosphoric acid 7960
                                        phosphoric acid derivative 7640
                                          phosphate 7640
                                            organic phosphate 7639
                                              carbohydrate phosphate 1732
                                                phospho sugar 1657
                                                  aldose phosphate 1655
                                                    aldopentose phosphate 1649
                                                      ribose phosphate 1644
                                                        ribonucleotide 1605
                                                          purine ribonucleotide 1578
                                                            adenyl ribonucleotide 1279
                                                              adenosine phosphate 266
                                                                adenosine 5'-phosphate 265
                                                                  ADP 87
                                                                    coenzyme A 28
                                                                      acyl-CoA 28
                                                                        omega-carboxyacyl-CoA 2
                                                                          (R)-ethylmalonyl-CoA 0
                                                                          (S)-ethylmalonyl-CoA 0
                                                                          2-benzylsuccinyl-CoA + 0
                                                                          3-carboxy-3-hydroxypropanoyl-CoA 0
                                                                          3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA + 0
                                                                          3-hydroxypimeloyl-CoA 0
                                                                          3-methylfumaryl-CoA 0
                                                                          adipoyl-CoA + 0
                                                                          decanedioyl-CoA 0
                                                                          dodecanedioyl-CoA 0
                                                                          glutaryl-CoAs + 2
                                                                          mesaconyl-CoA 0
                                                                          octanedioyl-CoA 0
                                                                          oxalyl-CoA 0
                                                                          pimeloyl-CoA + 0
                                                                          succinyl-CoA 1
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