Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:3beta-hydroxy steroid
go back to main search page
Accession:CHEBI:36836 term browser browse the term
Definition:A 3-hydroxy steroid in which the 3-hydroxy substituent is in the beta-position.
Synonyms:related_synonym: 3beta-hydroxy steroids;   Formula=C19H31OR;   SMILES=C12C(C3C(C(CC3)*)(C)CC1)CCC4C2(CC[C@@H](C4)O)C;   a 3beta-hydroxysteroid
 alt_id: CHEBI:71195
 xref: KEGG:C02945;   MetaCyc:3-Beta-Hydroxysterols;   PMID:10535978;   PMID:12829805


show annotations for term's descendants           Sort by:
diosgenin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G CASP3 caspase 3 multiple interactions EXP Diosgenin inhibits the reaction [Calcium Oxalate results in increased activity of CASP3 protein] CTD PMID:25446497 NCBI chr16:45,920,074...45,940,507
Ensembl chr16:45,920,071...45,940,505 		JBrowse link
G CASP9 caspase 9 multiple interactions EXP Diosgenin inhibits the reaction [Calcium Oxalate results in increased activity of CASP9 protein] CTD PMID:25446497 NCBI chr 2:82,033,759...82,076,710
Ensembl chr 2:82,031,563...82,090,484 		JBrowse link
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 494
    chemical entity 501
      molecular entity 494
        polyatomic entity 487
          heteroatomic molecular entity 438
            hydroxides 418
              organic hydroxy compound 140
                alcohol 81
                  secondary alcohol 19
                    3beta-hydroxy steroid 2
                      (17Z)-protosta-17(20),24-dien-3beta-ol 0
                      (20S)-20-O-(beta-D-glucosyl)-3-hydroxydammarene 0
                      (20S)-ginsenoside Rh1 0
                      (20S,22E)-3beta-Hydroxy-5alpha-chol-22-en-24-oic Acid 0
                      (22E)-3beta-hydroxy-5alpha-chola-7,22-dien-24-oic acid 0
                      (22E,24R)-3beta,5alpha,9alpha-trihydroxyergosta-7,22-dien-6-one 0
                      (22E,24R)-3beta,5alpha-dihydroxyergosta-7,22-dien-6-one 0
                      (22E,24R)-ergosta-5alpha,6alpha-epoxide-8,22-diene-3beta,7alpha-diol 0
                      (22E,24R)-ergosta-7,22-diene-3beta,6beta-diol 0
                      (22E,24R)-ergosta-7,22-diene-6beta-methoxy-3beta,5alpha-diol 0
                      (24R)-24-methylcycloart-25-en-3beta-ol 0
                      (24S)-26-nor-5alpha-cholest-22E-en-3beta-ol 0
                      (24S)-hydroxycholestanol 0
                      (25R)-26-hydroxycholestanol 0
                      (25R)-5beta-spirostan-3beta-ol + 0
                      (3beta,5alpha,17beta)-3-hydroxyandrostan-17-yl sulfate 0
                      (3beta,5alpha,7alpha)-3,7-dihydroxyandrostan-17-one 0
                      (5alpha)-cholestan-3beta-ol + 0
                      (5alpha,22S)-22-hydroxycholestan-3beta-ol 0
                      (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,4beta,6alpha,7alpha,8,15alpha,16beta,26-octol + 0
                      (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,4beta,6beta,7alpha,8,15alpha,16beta,26-octol 0
                      (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,6alpha,8,15alpha,16beta,26-hexol + 0
                      (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,6beta,7alpha,8,15alpha,16beta,26-heptol 0
                      (Z)-24-ethylidenelophenol + 0
                      1beta-hydroxydeoxycholic acid 0
                      2,22,25-trideoxyecdysone 0
                      2-deoxyecdysone 0
                      20,22-dihydrodigoxigenin 0
                      23,24-dimethylcholest-16(17)-E-en-3beta,5alpha,6beta,20(S)-tetrol 0
                      23-acetoxysoladulcidine 0
                      24-methylenecycloartanol + 0
                      24-methylidenelophenol + 0
                      25-deoxyecdysone 0
                      27-Nor-4alpha-methyl-5alpha-ergosta-8(14),22-dien-3beta-ol 0
                      28-norteasterone 0
                      3beta,11alpha-dihydroxyergosta-8,24(28)-dien-7-one 0
                      3beta,12alpha-dihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                      3beta,6beta-dihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                      3beta,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                      3beta,7alpha-dihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                      3beta-hydroxy-4,4-dimethylsteroid + 0
                      3beta-hydroxy-4alpha-formyl-4beta-methylsteroid + 0
                      3beta-hydroxy-4alpha-hydroxymethyl-4beta-methylsteroid + 0
                      3beta-hydroxy-4alpha-methyl-5alpha-cholest-7-ene-4beta-carboxylic acid 0
                      3beta-hydroxy-4alpha-methyl-5alpha-cholesta-8,24-diene-4beta-carboxylic acid 0
                      3beta-hydroxy-4beta-formyl-4alpha-methylsteroid + 0
                      3beta-hydroxy-4beta-hydroxymethyl-4alpha-methylsteroid + 0
                      3beta-hydroxy-4beta-methyl-5alpha-cholest-7-ene-4alpha-carboxylic acid 0
                      3beta-hydroxy-5alpha-androstane-7,17-dione 0
                      3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8(14)-en-15-one 0
                      3beta-hydroxy-5alpha-cholestan-15-one 0
                      3beta-hydroxy-5beta-pregnan-20-one + 0
                      3beta-hydroxy-9beta-9,19-cyclolanost-24-en-28-oic acid 0
                      3beta-hydroxy-Delta(5)-steroid + 0
                      3beta-hydroxyergosta-8,24(28)-dien-7-one 0
                      3beta-sterol + 2
                      4,4-dimethyl-14alpha-formyl-5alpha-cholesta-8,24-dien-3beta,15alpha-diol 0
                      4-carboxy-4-methylzymosterol 0
                      4-methylzymosterol 0
                      4-pregnen-3beta,20alpha-diol 0
                      4-pregnen-3beta-ol-20-one 0
                      4alpha-formyl-ergosta-7,24(28)-dien-3beta-ol + 0
                      4alpha-hydroxymethyl-4beta-methyl-5alpha-cholest-7-en-3beta-ol + 0
                      4alpha-hydroxymethyl-5alpha-ergosta-7,24(28)-dien-3beta-ol + 0
                      4alpha-methyl-5alpha-cholest-7-en-3beta-ol 0
                      4beta-(hydroxymethyl)-4alpha-methyl-5alpha-cholest-7-en-3beta-ol 0
                      5,6alpha-epoxy-5alpha-cholestan-3beta-ol 0
                      5,6beta-epoxy-5alpha-cholestan-3beta-ol 0
                      5alpha-androstane-3beta,17alpha-diol + 0
                      5alpha-androstane-3beta,17beta-diol + 0
                      5alpha-androstane-3beta,17beta-diol 17-O-(beta-D-glucuronide) 0
                      5alpha-cholest-8(14)-en-3beta,15beta-diol 0
                      5alpha-cholesta-24-en-3beta,20beta-diol-23-one 0
                      5alpha-cholesta-9(11)-en-3beta, 20beta-diol 0
                      5alpha-cholestan-3beta,15beta-diol 0
                      5alpha-cholestane-3beta,5,6beta-triol 0
                      5beta-androstane-3beta,17beta-diol 0
                      6-deoxo-28-norteasterone 0
                      6-deoxoteasterone 0
                      6-deoxycathasterone 0
                      6alpha-hydroxy-28-norteasterone 0
                      6alpha-hydroxycholestanol 0
                      7-nor-ergosterolide 0
                      7-oxo-5alpha-cholestan-3beta-ol 0
                      7-oxoteasterone 0
                      7beta-hydroxyepiandrosterone 0
                      Antcamphorol A 0
                      B-norcholesterol 0
                      FR171456 0
                      Fornicatin C 0
                      Insignin A 0
                      Lanosta-8,24-dien-3beta,23-diol 0
                      Pollinastanol 0
                      Prazerigenin A 0
                      Xylarinorditerpene F 0
                      Xylarinorditerpene H 0
                      adonitoxigenin + 0
                      agigenin + 0
                      ajugalactone 0
                      andrastin F 0
                      antiogenin + 0
                      astropectenol A 0
                      astropectenol B 0
                      astropectenol C 0
                      astropectenol D 0
                      avenasterol 0
                      barogenin 0
                      bipindogenin + 0
                      blazein 0
                      bolandiol + 0
                      bufalin 0
                      cannogenin + 0
                      cathasterone + 0
                      cerevisterol + 0
                      certonardosterol l 0
                      cholestanol 7alpha,8alpha-epoxide 0
                      cholesterol beta-epoxide 0
                      convallasaponin A 0
                      cyasterone 0
                      cyclolaudenol 0
                      diginatigenin + 0
                      digitogenin + 0
                      digitoxigenin + 0
                      digoxigenin + 0
                      dihydrodigitoxin 0
                      dihydroouabagenin 0
                      epiandrosterone + 0
                      epietiocholanolone 0
                      esculeogenin A 0
                      ethynodiol + 0
                      fruticoside A 0
                      fruticoside B 0
                      fungisterol 0
                      ginsenoside C-K 0
                      ginsenoside C-Y 0
                      ginsenoside F1 0
                      ginsenoside Re 0
                      ginsenoside Rf 0
                      ginsenoside Rg2 0
                      gitoxigenin + 0
                      gypenoside LXXV 0
                      halosterol B 0
                      hellebrigenin + 0
                      inokosterone 0
                      isolithocholic acid 0
                      makisterone B 0
                      notoginsenoside R1 0
                      oleandrigenin + 0
                      ouabagenin + 0
                      podecdysone B 0
                      polypodine B 0
                      ponasterone A 0
                      poststerone 0
                      protopanaxadiol + 0
                      protopanaxatriol 0
                      sarmentogenin + 0
                      scillarenin + 0
                      sclerodol B 0
                      shidasterone 0
                      stigmastane-3beta,5alpha,6beta-triol 0
                      strophanthidin + 0
                      tanghinigenin + 0
                      teasterone + 0
                      tomatidine + 0
                      viscosalactone B 0
                      withalongolide L 0
                      withalongolide M 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 494
    subatomic particle 494
      composite particle 494
        hadron 501
          baryon 494
            nucleon 494
              atomic nucleus 494
                atom 494
                  main group element atom 487
                    p-block element atom 487
                      carbon group element atom 476
                        carbon atom 482
                          organic molecular entity 475
                            organic molecule 466
                              organic cyclic compound 449
                                organic polycyclic compound 65
                                  steroid 40
                                    hydroxy steroid 20
                                      3-hydroxy steroid 7
                                        3beta-hydroxy steroid 2
                                          (17Z)-protosta-17(20),24-dien-3beta-ol 0
                                          (20S)-20-O-(beta-D-glucosyl)-3-hydroxydammarene 0
                                          (20S)-ginsenoside Rh1 0
                                          (20S,22E)-3beta-Hydroxy-5alpha-chol-22-en-24-oic Acid 0
                                          (22E)-3beta-hydroxy-5alpha-chola-7,22-dien-24-oic acid 0
                                          (22E,24R)-3beta,5alpha,9alpha-trihydroxyergosta-7,22-dien-6-one 0
                                          (22E,24R)-3beta,5alpha-dihydroxyergosta-7,22-dien-6-one 0
                                          (22E,24R)-ergosta-5alpha,6alpha-epoxide-8,22-diene-3beta,7alpha-diol 0
                                          (22E,24R)-ergosta-7,22-diene-3beta,6beta-diol 0
                                          (22E,24R)-ergosta-7,22-diene-6beta-methoxy-3beta,5alpha-diol 0
                                          (24R)-24-methylcycloart-25-en-3beta-ol 0
                                          (24S)-26-nor-5alpha-cholest-22E-en-3beta-ol 0
                                          (24S)-hydroxycholestanol 0
                                          (25R)-26-hydroxycholestanol 0
                                          (25R)-5beta-spirostan-3beta-ol + 0
                                          (3beta,5alpha,17beta)-3-hydroxyandrostan-17-yl sulfate 0
                                          (3beta,5alpha,7alpha)-3,7-dihydroxyandrostan-17-one 0
                                          (5alpha)-cholestan-3beta-ol + 0
                                          (5alpha,22S)-22-hydroxycholestan-3beta-ol 0
                                          (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,4beta,6alpha,7alpha,8,15alpha,16beta,26-octol + 0
                                          (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,4beta,6beta,7alpha,8,15alpha,16beta,26-octol 0
                                          (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,6alpha,8,15alpha,16beta,26-hexol + 0
                                          (9xi,14xi,25S)-cholestane-3beta,6beta,7alpha,8,15alpha,16beta,26-heptol 0
                                          (Z)-24-ethylidenelophenol + 0
                                          1beta-hydroxydeoxycholic acid 0
                                          2,22,25-trideoxyecdysone 0
                                          2-deoxyecdysone 0
                                          20,22-dihydrodigoxigenin 0
                                          23,24-dimethylcholest-16(17)-E-en-3beta,5alpha,6beta,20(S)-tetrol 0
                                          23-acetoxysoladulcidine 0
                                          24-methylenecycloartanol + 0
                                          24-methylidenelophenol + 0
                                          25-deoxyecdysone 0
                                          27-Nor-4alpha-methyl-5alpha-ergosta-8(14),22-dien-3beta-ol 0
                                          28-norteasterone 0
                                          3beta,11alpha-dihydroxyergosta-8,24(28)-dien-7-one 0
                                          3beta,12alpha-dihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                                          3beta,6beta-dihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                                          3beta,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                                          3beta,7alpha-dihydroxy-5beta-cholan-24-oic acid 0
                                          3beta-hydroxy-4,4-dimethylsteroid + 0
                                          3beta-hydroxy-4alpha-formyl-4beta-methylsteroid + 0
                                          3beta-hydroxy-4alpha-hydroxymethyl-4beta-methylsteroid + 0
                                          3beta-hydroxy-4alpha-methyl-5alpha-cholest-7-ene-4beta-carboxylic acid 0
                                          3beta-hydroxy-4alpha-methyl-5alpha-cholesta-8,24-diene-4beta-carboxylic acid 0
                                          3beta-hydroxy-4beta-formyl-4alpha-methylsteroid + 0
                                          3beta-hydroxy-4beta-hydroxymethyl-4alpha-methylsteroid + 0
                                          3beta-hydroxy-4beta-methyl-5alpha-cholest-7-ene-4alpha-carboxylic acid 0
                                          3beta-hydroxy-5alpha-androstane-7,17-dione 0
                                          3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8(14)-en-15-one 0
                                          3beta-hydroxy-5alpha-cholestan-15-one 0
                                          3beta-hydroxy-5beta-pregnan-20-one + 0
                                          3beta-hydroxy-9beta-9,19-cyclolanost-24-en-28-oic acid 0
                                          3beta-hydroxy-Delta(5)-steroid + 0
                                          3beta-hydroxyergosta-8,24(28)-dien-7-one 0
                                          3beta-sterol + 2
                                          4,4-dimethyl-14alpha-formyl-5alpha-cholesta-8,24-dien-3beta,15alpha-diol 0
                                          4-carboxy-4-methylzymosterol 0
                                          4-methylzymosterol 0
                                          4-pregnen-3beta,20alpha-diol 0
                                          4-pregnen-3beta-ol-20-one 0
                                          4alpha-formyl-ergosta-7,24(28)-dien-3beta-ol + 0
                                          4alpha-hydroxymethyl-4beta-methyl-5alpha-cholest-7-en-3beta-ol + 0
                                          4alpha-hydroxymethyl-5alpha-ergosta-7,24(28)-dien-3beta-ol + 0
                                          4alpha-methyl-5alpha-cholest-7-en-3beta-ol 0
                                          4beta-(hydroxymethyl)-4alpha-methyl-5alpha-cholest-7-en-3beta-ol 0
                                          5,6alpha-epoxy-5alpha-cholestan-3beta-ol 0
                                          5,6beta-epoxy-5alpha-cholestan-3beta-ol 0
                                          5alpha-androstane-3beta,17alpha-diol + 0
                                          5alpha-androstane-3beta,17beta-diol + 0
                                          5alpha-androstane-3beta,17beta-diol 17-O-(beta-D-glucuronide) 0
                                          5alpha-cholest-8(14)-en-3beta,15beta-diol 0
                                          5alpha-cholesta-24-en-3beta,20beta-diol-23-one 0
                                          5alpha-cholesta-9(11)-en-3beta, 20beta-diol 0
                                          5alpha-cholestan-3beta,15beta-diol 0
                                          5alpha-cholestane-3beta,5,6beta-triol 0
                                          5beta-androstane-3beta,17beta-diol 0
                                          6-deoxo-28-norteasterone 0
                                          6-deoxoteasterone 0
                                          6-deoxycathasterone 0
                                          6alpha-hydroxy-28-norteasterone 0
                                          6alpha-hydroxycholestanol 0
                                          7-nor-ergosterolide 0
                                          7-oxo-5alpha-cholestan-3beta-ol 0
                                          7-oxoteasterone 0
                                          7beta-hydroxyepiandrosterone 0
                                          Antcamphorol A 0
                                          B-norcholesterol 0
                                          FR171456 0
                                          Fornicatin C 0
                                          Insignin A 0
                                          Lanosta-8,24-dien-3beta,23-diol 0
                                          Pollinastanol 0
                                          Prazerigenin A 0
                                          Xylarinorditerpene F 0
                                          Xylarinorditerpene H 0
                                          adonitoxigenin + 0
                                          agigenin + 0
                                          ajugalactone 0
                                          andrastin F 0
                                          antiogenin + 0
                                          astropectenol A 0
                                          astropectenol B 0
                                          astropectenol C 0
                                          astropectenol D 0
                                          avenasterol 0
                                          barogenin 0
                                          bipindogenin + 0
                                          blazein 0
                                          bolandiol + 0
                                          bufalin 0
                                          cannogenin + 0
                                          cathasterone + 0
                                          cerevisterol + 0
                                          certonardosterol l 0
                                          cholestanol 7alpha,8alpha-epoxide 0
                                          cholesterol beta-epoxide 0
                                          convallasaponin A 0
                                          cyasterone 0
                                          cyclolaudenol 0
                                          diginatigenin + 0
                                          digitogenin + 0
                                          digitoxigenin + 0
                                          digoxigenin + 0
                                          dihydrodigitoxin 0
                                          dihydroouabagenin 0
                                          epiandrosterone + 0
                                          epietiocholanolone 0
                                          esculeogenin A 0
                                          ethynodiol + 0
                                          fruticoside A 0
                                          fruticoside B 0
                                          fungisterol 0
                                          ginsenoside C-K 0
                                          ginsenoside C-Y 0
                                          ginsenoside F1 0
                                          ginsenoside Re 0
                                          ginsenoside Rf 0
                                          ginsenoside Rg2 0
                                          gitoxigenin + 0
                                          gypenoside LXXV 0
                                          halosterol B 0
                                          hellebrigenin + 0
                                          inokosterone 0
                                          isolithocholic acid 0
                                          makisterone B 0
                                          notoginsenoside R1 0
                                          oleandrigenin + 0
                                          ouabagenin + 0
                                          podecdysone B 0
                                          polypodine B 0
                                          ponasterone A 0
                                          poststerone 0
                                          protopanaxadiol + 0
                                          protopanaxatriol 0
                                          sarmentogenin + 0
                                          scillarenin + 0
                                          sclerodol B 0
                                          shidasterone 0
                                          stigmastane-3beta,5alpha,6beta-triol 0
                                          strophanthidin + 0
                                          tanghinigenin + 0
                                          teasterone + 0
                                          tomatidine + 0
                                          viscosalactone B 0
                                          withalongolide L 0
                                          withalongolide M 0
paths to the root