Send us a Message



 Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap)  (beta) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer) Overgo Probe Designer
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease COVID-19 Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes GERRC (Gene Editing Rat Resource Center) Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Poster Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:carbobicyclic compound
go back to main search page
Accession:CHEBI:36785 term browser browse the term
Definition:A bicyclic compound in which all the ring atoms are carbon.
Synonyms:related_synonym: carbobicyclic compounds


show annotations for term's descendants           Sort by:


Your selection has 5878 annotated objects. The maximum number of objects that can be shown is 2000. The list is too large to display.

  • Select a more specific term using the term browser
  • Download the entire list for this term
  • Display annotations for this term only (exclude descendants)


    • Term paths to the root
    Path 1
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 19911
        chemical entity 19909
          molecular entity 19909
            polyatomic entity 19866
              molecule 19768
                cyclic compound 19581
                  bicyclic compound 17337
                    carbobicyclic compound 5878
                      (+)-(2S,3R,9R)-pristinol 0
                      (+)-4-Carene 0
                      (+)-5-epi-aristolochene + 0
                      (+)-8-hydroxycalamenene 0
                      (+)-albicanol 10
                      (+)-artemisinic acid 9
                      (+)-artemisinic alcohol + 9
                      (+)-cubenene 0
                      (+)-homalomenol A 0
                      (+)-homalomenol B 0
                      (+)-nootkatone 0
                      (+)-subersic acid 0
                      (+)-valencene 0
                      (-)-4-epi-eremophilene + 0
                      (-)-5-epi-eremophilene 0
                      (-)-7,7-Dimethyl-2-methylenebicyclo[2.2.1]heptane 0
                      (-)-Tau-muurolol 0
                      (-)-beta-santalene 0
                      (-)-endo-fenchol 0
                      (1R,4R,5S)-(-)-guaia-6,10(14)-diene 0
                      (21S)-21,22-epoxypolypoda-8(26)-13,17-trien-3beta-ol 0
                      (3E,7E)-dolabella-3,7-dien-18-ol 0
                      (3E,7E)-dolathalia-3,7,11-triene 0
                      (3S)-(+)-asterisca-2(9),6-diene 0
                      (4R,6R)-6-\{2-[(1S,2S,6S,8S,8aR)-6,8-dihydroxy-2-methyl-1,2,6,7,8,8a-hexahydronaphthalen-1-yl]ethyl\}-4-hydroxyoxan-2-one 0
                      (6R,7S)-2,2,6-trimethyl-10-methylenebicyclo[5.4.0]undec-1(11)-ene 0
                      (6R,7S)-himachala-9,11-diene 0
                      (8R)-3beta,8-dihydroxypolypoda-13E,17E,21-triene 0
                      1-[(1S,2S,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)bicyclo[3.1.0]hexan-2-yl]thymine 0
                      1-[(1S,3S,4R,5S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)bicyclo[3.1.0]hexan-1-yl]thymine 0
                      11,11-dimethyl-4,8-dimethylenebicyclo[7.2.0]undecan-5-one oxime 0
                      14-hydroxy-6,12-muuroloadien-15-oic acid 0
                      2beta-hydroxy-5-epi-aristolochene 0
                      3,4-secoisopimara-4(18),7,15-triene-3-oic acid 0
                      3-[(3aS,4S,5R,7aS)-5-hydroxy-7a-methyl-1-oxo-octahydroinden-4-yl]propanoic acid + 0
                      3-[(3aS,4S,7aS)-1,5-dioxo-octahydroinden-4-yl]propanoic acid 0
                      3-[2-chloro-4-(methylsulfonyl)benzoyl]-4-(phenylthio)bicyclo[3.2.1]oct-3-en-2-one + 0
                      3-[2-chloro-4-(methylsulfonyl)benzoyl]-4-hydroxybicyclo[3.2.1]oct-3-en-2-one + 0
                      3-hydroxy-9-oxo-9,10-seco-23,24-bisnorchola-1,3,5(10)-trien-22-oic acid + 0
                      3alpha-hydroxy-3,5-dihydromonacolin L acid 0
                      4,6,6-trimethylbicyclo[3.1.1]hept-3-en-2-one + 0
                      4beta,14-dihydroxy-6alpha,7beta-H-1(10)-cadinene 0
                      7-epi-ent-eudesmane-5,11-diol 0
                      8-epi-ilicicolin H 0
                      9,17-dioxo-1,2,3,4,10,19-hexanorandrostan-5-oic acid + 0
                      CAF-603 0
                      Euphosalicin 0
                      HU-308 24
                      ML-236C + 0
                      a bicycloelemene + 0
                      aculene A 0
                      aculene B 0
                      aculene C + 0
                      aculene D + 0
                      ajugaciliatin A 0
                      ajugaciliatin B 0
                      ajugaciliatin C 0
                      ajugaciliatin D 0
                      ajugaciliatin E 0
                      ajugaciliatin I 0
                      ajugaciliatin J 0
                      ajugacumbin F 0
                      ajugamarin A1 chlorohydrin 0
                      ajugamarin A2 chlorohydrin 0
                      alismorientol A 0
                      alpha-cadinol 0
                      alpha-guaiene 0
                      alpha-muurolene 0
                      andrographolide 167
                      artemisinic aldehyde + 0
                      asperaculane G 0
                      australifungin 0
                      azulenes + 0
                      ballodiolic acid 0
                      ballotenic acid 0
                      benzocyclobutene 0
                      beta-chamigrene + 0
                      beta-eudesmol 6
                      beta-hibitakanine 0
                      bicyclo[3.3.0]oct-2-ene 0
                      bicycloelemene 0
                      bicyclopyrone 0
                      bornane-2,3-dione + 14
                      brassiteraene A 0
                      brassiteraene B 0
                      buddledin A 0
                      bullatantriol 0
                      cadina-1(6),4-diene 0
                      cadinene + 0
                      callophycoic acid G 0
                      callophycoic acid H 0
                      callophycol A 0
                      callophycol B 0
                      camphene + 8
                      carane + 0
                      cis-muurola-3,5-diene 0
                      cis-muurola-4(14),5-diene 0
                      clavaphyllene 0
                      compactin diol lactone 0
                      copalyl diphosphate + 0
                      delta-guaiene 0
                      dihydroartemisinic acid 0
                      dihydromonacolin L acid + 0
                      dihydronaphthalenes + 1
                      discodiene 0
                      edaxadiene + 0
                      fenchane + 2
                      fenchone + 2
                      fusaproliferene 0
                      gamma-muurolene 0
                      guaia-1(5),6-diene 0
                      guaia-4,6-diene 0
                      helminthosporoside A 0
                      hexahydronaphthalenes + 950
                      hyperforin 31
                      ilicicolin H + 0
                      iloprost 19
                      indanes + 89
                      iritremulanol A 0
                      isoelisabethatriene 0
                      ivabradine 2
                      kadsurenin C 0
                      kadsurenin K 0
                      kadsurenin L 0
                      labd-13(16),14-diene-9-ol 0
                      labd-13Z-ene-9,15,16-triol 0
                      lobophytumin C 0
                      lobophytumin D 0
                      lyratol C 0
                      macrophomene 0
                      mancude carbobicyclic parent + 0
                      mevinolinic acid 0
                      mitchellene D 0
                      mitchellene E 0
                      monacolin J + 0
                      naphthalenes + 3835
                      norbornene 0
                      octahydronaphthalenes + 13
                      oplodiol 0
                      ortho-fused bicyclic hydrocarbon + 2433
                      paeonilactinone 0
                      peregrinol + 0
                      pinane + 1819
                      pinocarveol + 0
                      pravastatin 303
                      preterpestacin I 0
                      pseudolaratriene 0
                      rotundifuran 0
                      sch 210971 0
                      sch 210972 + 0
                      sch 213766 0
                      sch 725432 0
                      scoparic acid A 0
                      selina-4(15),7(11)-diene 0
                      sesterorbiculene 0
                      sodorifen 0
                      spiculoic acid A 0
                      talaropentaene 0
                      tau-cadinol 0
                      tetralins + 819
                      thujene + 0
                      trichobrasilenol 0
                      tschimganine 0
                      valerena-4,7(11)-diene 0
                      valerenic acid 0
                      viteagnusin D 0
                      viteagnusin I 0
                      vitetrifolin D 0
                      vitexilactone 0
    Path 2
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 19911
        subatomic particle 19909
          composite particle 19909
            hadron 19909
              baryon 19909
                nucleon 19909
                  atomic nucleus 19909
                    atom 19909
                      main group element atom 19856
                        p-block element atom 19856
                          carbon group element atom 19802
                            carbon group molecular entity 19802
                              organic molecular entity 19797
                                organic molecule 19754
                                  organic cyclic compound 19562
                                    carbocyclic compound 18603
                                      carbopolycyclic compound 17196
                                        carbobicyclic compound 5878
                                          (+)-(2S,3R,9R)-pristinol 0
                                          (+)-4-Carene 0
                                          (+)-5-epi-aristolochene + 0
                                          (+)-8-hydroxycalamenene 0
                                          (+)-albicanol 10
                                          (+)-artemisinic acid 9
                                          (+)-artemisinic alcohol + 9
                                          (+)-cubenene 0
                                          (+)-homalomenol A 0
                                          (+)-homalomenol B 0
                                          (+)-nootkatone 0
                                          (+)-subersic acid 0
                                          (+)-valencene 0
                                          (-)-4-epi-eremophilene + 0
                                          (-)-5-epi-eremophilene 0
                                          (-)-7,7-Dimethyl-2-methylenebicyclo[2.2.1]heptane 0
                                          (-)-Tau-muurolol 0
                                          (-)-beta-santalene 0
                                          (-)-endo-fenchol 0
                                          (1R,4R,5S)-(-)-guaia-6,10(14)-diene 0
                                          (21S)-21,22-epoxypolypoda-8(26)-13,17-trien-3beta-ol 0
                                          (3E,7E)-dolabella-3,7-dien-18-ol 0
                                          (3E,7E)-dolathalia-3,7,11-triene 0
                                          (3S)-(+)-asterisca-2(9),6-diene 0
                                          (4R,6R)-6-\{2-[(1S,2S,6S,8S,8aR)-6,8-dihydroxy-2-methyl-1,2,6,7,8,8a-hexahydronaphthalen-1-yl]ethyl\}-4-hydroxyoxan-2-one 0
                                          (6R,7S)-2,2,6-trimethyl-10-methylenebicyclo[5.4.0]undec-1(11)-ene 0
                                          (6R,7S)-himachala-9,11-diene 0
                                          (8R)-3beta,8-dihydroxypolypoda-13E,17E,21-triene 0
                                          1-[(1S,2S,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)bicyclo[3.1.0]hexan-2-yl]thymine 0
                                          1-[(1S,3S,4R,5S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)bicyclo[3.1.0]hexan-1-yl]thymine 0
                                          11,11-dimethyl-4,8-dimethylenebicyclo[7.2.0]undecan-5-one oxime 0
                                          14-hydroxy-6,12-muuroloadien-15-oic acid 0
                                          2beta-hydroxy-5-epi-aristolochene 0
                                          3,4-secoisopimara-4(18),7,15-triene-3-oic acid 0
                                          3-[(3aS,4S,5R,7aS)-5-hydroxy-7a-methyl-1-oxo-octahydroinden-4-yl]propanoic acid + 0
                                          3-[(3aS,4S,7aS)-1,5-dioxo-octahydroinden-4-yl]propanoic acid 0
                                          3-[2-chloro-4-(methylsulfonyl)benzoyl]-4-(phenylthio)bicyclo[3.2.1]oct-3-en-2-one + 0
                                          3-[2-chloro-4-(methylsulfonyl)benzoyl]-4-hydroxybicyclo[3.2.1]oct-3-en-2-one + 0
                                          3-hydroxy-9-oxo-9,10-seco-23,24-bisnorchola-1,3,5(10)-trien-22-oic acid + 0
                                          3alpha-hydroxy-3,5-dihydromonacolin L acid 0
                                          4,6,6-trimethylbicyclo[3.1.1]hept-3-en-2-one + 0
                                          4beta,14-dihydroxy-6alpha,7beta-H-1(10)-cadinene 0
                                          7-epi-ent-eudesmane-5,11-diol 0
                                          8-epi-ilicicolin H 0
                                          9,17-dioxo-1,2,3,4,10,19-hexanorandrostan-5-oic acid + 0
                                          CAF-603 0
                                          Euphosalicin 0
                                          HU-308 24
                                          ML-236C + 0
                                          a bicycloelemene + 0
                                          aculene A 0
                                          aculene B 0
                                          aculene C + 0
                                          aculene D + 0
                                          ajugaciliatin A 0
                                          ajugaciliatin B 0
                                          ajugaciliatin C 0
                                          ajugaciliatin D 0
                                          ajugaciliatin E 0
                                          ajugaciliatin I 0
                                          ajugaciliatin J 0
                                          ajugacumbin F 0
                                          ajugamarin A1 chlorohydrin 0
                                          ajugamarin A2 chlorohydrin 0
                                          alismorientol A 0
                                          alpha-cadinol 0
                                          alpha-guaiene 0
                                          alpha-muurolene 0
                                          andrographolide 167
                                          artemisinic aldehyde + 0
                                          asperaculane G 0
                                          australifungin 0
                                          azulenes + 0
                                          ballodiolic acid 0
                                          ballotenic acid 0
                                          benzocyclobutene 0
                                          beta-chamigrene + 0
                                          beta-eudesmol 6
                                          beta-hibitakanine 0
                                          bicyclo[3.3.0]oct-2-ene 0
                                          bicycloelemene 0
                                          bicyclopyrone 0
                                          bornane-2,3-dione + 14
                                          brassiteraene A 0
                                          brassiteraene B 0
                                          buddledin A 0
                                          bullatantriol 0
                                          cadina-1(6),4-diene 0
                                          cadinene + 0
                                          callophycoic acid G 0
                                          callophycoic acid H 0
                                          callophycol A 0
                                          callophycol B 0
                                          camphene + 8
                                          carane + 0
                                          cis-muurola-3,5-diene 0
                                          cis-muurola-4(14),5-diene 0
                                          clavaphyllene 0
                                          compactin diol lactone 0
                                          copalyl diphosphate + 0
                                          delta-guaiene 0
                                          dihydroartemisinic acid 0
                                          dihydromonacolin L acid + 0
                                          dihydronaphthalenes + 1
                                          discodiene 0
                                          edaxadiene + 0
                                          fenchane + 2
                                          fenchone + 2
                                          fusaproliferene 0
                                          gamma-muurolene 0
                                          guaia-1(5),6-diene 0
                                          guaia-4,6-diene 0
                                          helminthosporoside A 0
                                          hexahydronaphthalenes + 950
                                          hyperforin 31
                                          ilicicolin H + 0
                                          iloprost 19
                                          indanes + 89
                                          iritremulanol A 0
                                          isoelisabethatriene 0
                                          ivabradine 2
                                          kadsurenin C 0
                                          kadsurenin K 0
                                          kadsurenin L 0
                                          labd-13(16),14-diene-9-ol 0
                                          labd-13Z-ene-9,15,16-triol 0
                                          lobophytumin C 0
                                          lobophytumin D 0
                                          lyratol C 0
                                          macrophomene 0
                                          mancude carbobicyclic parent + 0
                                          mevinolinic acid 0
                                          mitchellene D 0
                                          mitchellene E 0
                                          monacolin J + 0
                                          naphthalenes + 3835
                                          norbornene 0
                                          octahydronaphthalenes + 13
                                          oplodiol 0
                                          ortho-fused bicyclic hydrocarbon + 2433
                                          paeonilactinone 0
                                          peregrinol + 0
                                          pinane + 1819
                                          pinocarveol + 0
                                          pravastatin 303
                                          preterpestacin I 0
                                          pseudolaratriene 0
                                          rotundifuran 0
                                          sch 210971 0
                                          sch 210972 + 0
                                          sch 213766 0
                                          sch 725432 0
                                          scoparic acid A 0
                                          selina-4(15),7(11)-diene 0
                                          sesterorbiculene 0
                                          sodorifen 0
                                          spiculoic acid A 0
                                          talaropentaene 0
                                          tau-cadinol 0
                                          tetralins + 819
                                          thujene + 0
                                          trichobrasilenol 0
                                          tschimganine 0
                                          valerena-4,7(11)-diene 0
                                          valerenic acid 0
                                          viteagnusin D 0
                                          viteagnusin I 0
                                          vitetrifolin D 0
                                          vitexilactone 0
    paths to the root