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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:antibacterial drug
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Accession:CHEBI:36047 term browser browse the term
Definition:A drug used to treat or prevent bacterial infections.
Synonyms:related_synonym: antibacterial drugs
 xref: Wikipedia:Antibacterial


show annotations for term's descendants           Sort by:
marbofloxacin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G CASP8 caspase 8 multiple interactions
increases expression		 EXP TNFRSF1A mRNA promotes the reaction [marbofloxacin results in increased expression of CASP8 mRNA] CTD PMID:31005593 NCBI chr37:10,362,071...10,402,108
Ensembl chr37:10,391,048...10,401,822 		JBrowse link
G FADD Fas associated via death domain increases expression EXP marbofloxacin results in increased expression of FADD mRNA CTD PMID:31005593 NCBI chr18:48,087,447...48,094,497 JBrowse link
G TNF tumor necrosis factor increases expression EXP marbofloxacin results in increased expression of TNF mRNA; marbofloxacin results in increased expression of TNF protein CTD PMID:31005593 NCBI chr12:1,074,561...1,076,425
Ensembl chr12:1,074,552...1,076,425 		JBrowse link
G TNFRSF1A TNF receptor superfamily member 1A multiple interactions
increases expression		 EXP TNFRSF1A mRNA promotes the reaction [marbofloxacin results in increased expression of CASP8 mRNA]; TNFRSF1A mRNA promotes the reaction [marbofloxacin results in increased expression of TRADD mRNA]
marbofloxacin results in increased expression of TNFRSF1A mRNA; marbofloxacin results in increased expression of TNFRSF1A protein		 CTD PMID:31005593 NCBI chr27:38,641,837...38,654,693
Ensembl chr27:38,638,753...38,700,282 		JBrowse link
G TRADD TNFRSF1A associated via death domain multiple interactions
increases expression		 EXP TNFRSF1A mRNA promotes the reaction [marbofloxacin results in increased expression of TRADD mRNA] CTD PMID:31005593 NCBI chr 5:82,200,430...82,211,430
Ensembl chr 5:82,206,111...82,210,963 		JBrowse link
ofloxacin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G CAPN1 calpain 1 increases expression EXP Ofloxacin results in increased expression of CAPN1 mRNA CTD PMID:24582689 NCBI chr18:51,983,266...52,010,831
Ensembl chr18:51,983,824...52,010,757 		JBrowse link
G CASP12 caspase 12 increases expression EXP Ofloxacin results in increased expression of CASP12 mRNA; Ofloxacin results in increased expression of CASP12 protein CTD PMID:24582689 NCBI chr 5:27,162,840...27,176,964
Ensembl chr 5:27,161,700...27,177,683 		JBrowse link
G CASP8 caspase 8 multiple interactions
increases expression		 EXP TNFRSF1A mutant form inhibits the reaction [Ofloxacin results in increased expression of CASP8 mRNA] CTD PMID:24582689 NCBI chr37:10,362,071...10,402,108
Ensembl chr37:10,391,048...10,401,822 		JBrowse link
G DDIT3 DNA damage inducible transcript 3 increases expression EXP Ofloxacin results in increased expression of DDIT3 mRNA CTD PMID:24582689 NCBI chr10:1,606,693...1,612,410
Ensembl chr10:1,606,693...1,611,303 		JBrowse link
G HSPA5 heat shock protein family A (Hsp70) member 5 increases expression EXP Ofloxacin results in increased expression of HSPA5 mRNA CTD PMID:24582689 NCBI chr 9:57,850,870...57,855,607
Ensembl chr 9:57,850,922...57,855,257 		JBrowse link
G TNF tumor necrosis factor increases expression EXP Ofloxacin results in increased expression of TNF mRNA; Ofloxacin results in increased expression of TNF protein CTD PMID:24582689 NCBI chr12:1,074,561...1,076,425
Ensembl chr12:1,074,552...1,076,425 		JBrowse link
G TNFRSF1A TNF receptor superfamily member 1A multiple interactions
increases expression		 EXP TNFRSF1A mutant form inhibits the reaction [Ofloxacin results in increased expression of CASP8 mRNA]; TNFRSF1A mutant form inhibits the reaction [Ofloxacin results in increased expression of TRADD mRNA]
Ofloxacin results in increased expression of TNFRSF1A mRNA; Ofloxacin results in increased expression of TNFRSF1A protein		 CTD PMID:24582689 NCBI chr27:38,641,837...38,654,693
Ensembl chr27:38,638,753...38,700,282 		JBrowse link
G TRADD TNFRSF1A associated via death domain multiple interactions
increases expression		 EXP TNFRSF1A mutant form inhibits the reaction [Ofloxacin results in increased expression of TRADD mRNA] CTD PMID:24582689 NCBI chr 5:82,200,430...82,211,430
Ensembl chr 5:82,206,111...82,210,963 		JBrowse link
rifampicin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G ABCB1 ATP binding cassette subfamily B member 1 increases expression EXP Rifampin results in increased expression of ABCB1 mRNA; Rifampin results in increased expression of ABCB1 protein CTD PMID:22620706 NCBI chr14:13,644,891...13,852,829
Ensembl chr14:13,542,647...13,742,727 		JBrowse link
G NR1I2 nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 increases activity EXP Rifampin results in increased activity of NR1I2 protein CTD PMID:27732639 NCBI chr33:23,444,367...23,456,405
Ensembl chr33:23,432,690...23,455,347 		JBrowse link
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 494
    role 501
      biological role 494
        antimicrobial agent 122
          antibacterial agent 23
            antibacterial drug 11
              (R)-iclaprim + 0
              (R)-temafloxacin + 0
              (S)-iclaprim + 0
              (S)-temafloxacin + 0
              4-\{((R)-2-Carboxy-3-methoxymethyl-8-oxo-5-thia-1-aza-bicyclo[4.2.0]oct-2-en-7-ylcarbamoyl)-[(Z)-methoxyimino]-methyl\}-thiazol-2-yl-ammonium + 0
              Augmentin 0
              Avycaz 0
              amikacin 0
              amikacin disulfate 0
              amoxicillin + 0
              amoxicillin trihydrate + 0
              ampicillin + 0
              antimycobacterial drug + 2
              antitreponemal drug + 0
              apramycin 0
              arasertaconazole + 0
              arbekacin + 0
              avibactam 0
              avibactam sodium + 0
              azithromycin + 0
              azlocillin 0
              aztreonam + 0
              benzyl isothiocyanate 0
              benzylpenicillin + 0
              biapenem 0
              brodimoprim 0
              carbapenem MM22383 0
              carbenicillin + 0
              carumonam 0
              cefaclor 0
              cefadroxil + 0
              cefaloram 0
              cefaloridine 0
              cefalotin + 0
              cefamandole + 0
              cefamandole nafate 0
              cefamandole sodium 0
              cefatrizine 0
              cefazedone 0
              cefazolin 0
              cefcapene 0
              cefdaloxime 0
              cefdinir 0
              cefditoren + 0
              cefditoren pivoxil 0
              cefepime 0
              cefepime hydrochloride 0
              cefiderocol 0
              cefixime 0
              cefmenoxime + 0
              cefmetazole 0
              cefodizime 0
              cefonicid 0
              cefoperazone 0
              ceforanide 0
              cefotaxime 0
              cefotetan 0
              cefotetan disodium 0
              cefotiam + 0
              cefotiam dihydrochloride 0
              cefotiam hexetil dihydrochloride 0
              cefoxitin 0
              cefpiramide 0
              cefpodoxime + 0
              cefpodoxime proxetil 0
              cefprozil 0
              cefsulodin 0
              ceftaroline + 0
              ceftaroline fosamil + 0
              ceftaroline fosamil acetate + 0
              ceftaroline fosamil acetate monohydrate 0
              ceftazidime + 0
              ceftibuten + 0
              ceftibuten dihydrate 0
              ceftiolene 0
              ceftizoxime 0
              ceftriaxone 0
              cefuzonam 0
              cephalexin + 0
              cephalexin monohydrate 0
              cephapirin 0
              cephapirin sodium 0
              cephradine 0
              cethromycin 0
              chloramphenicol + 0
              chlorphenesin + 0
              chlorquinaldol 0
              chlortetracycline 0
              cinoxacin 0
              ciprofloxacin + 0
              ciprofloxacin dihydrochloride 0
              ciprofloxacin hydrochloride (anhydrous) + 0
              ciprofloxacin hydrochloride hydrate 0
              clarithromycin 0
              clavulanic acid 0
              clometocillin 0
              clomocycline 0
              cloxacillin 0
              co-trimoxazole 0
              cyclacillin 0
              dalbavancin 0
              dalfopristin 0
              daptomycin 0
              demeclocycline + 0
              demeclocycline hydrochloride 0
              dextrofloxacin + 8
              dicloxacillin 0
              difloxacin 0
              doxycycline + 0
              doxycycline hyclate 0
              doxycycline monohydrate 0
              durlobactam 0
              durlobactam sodium + 0
              enoxacin 0
              ertapenem 0
              ertapenem sodium 0
              fenticonazole 0
              fenticonazole nitrate 0
              fidaxomicin 0
              finafloxacin 0
              fleroxacin 0
              flomoxef 0
              flucloxacillin + 0
              flurithromycin 0
              framycetin + 0
              fumagillin + 0
              furagin 0
              furaltadone 0
              furazolidone 0
              gamithromycin 0
              garenoxacin 0
              gemifloxacin + 0
              hetacillin 0
              hexamethylenetetramine + 0
              humulone 0
              iclaprim 0
              imipenem + 0
              isoconazole 0
              isoconazole nitrate 0
              josamycin 0
              kanamycin A sulfate 0
              levofloxacin + 8
              linezolid 0
              loracarbef 0
              lymecycline 0
              malachite green cation + 0
              marbofloxacin 5
              mecillinam + 0
              meropenem + 0
              meropenem trihydrate 0
              methacycline 0
              methicillin + 0
              metronidazole + 0
              metronidazole benzoate 0
              metronidazole hydrochloride 0
              mezlocillin 0
              minocycline + 0
              moxalactam 0
              moxifloxacin 0
              moxifloxacin hydrochloride 0
              mupirocin 0
              mupirocin calcium (anhydrous) + 0
              mupirocin calcium hydrate 0
              nadifloxacin + 0
              nafcillin 0
              nalidixic acid 0
              neomycin sulfate 0
              nifurtoinol 0
              nitrofurantoin 0
              nitrofurazone 0
              norfloxacin 0
              ofloxacin 8
              oritavancin + 0
              oritavancin bisphosphate 0
              ornidazole 0
              oxacillin + 0
              oxolinic acid 0
              oxytetracycline 0
              paromomycin + 0
              paromomycin sulfate 0
              pefloxacin + 0
              pefloxacin mesylate 0
              penamecillin 0
              pipemidic acid 0
              piperacillin + 0
              piromidic acid 0
              pivmecillinam + 0
              potassium clavulanate + 0
              pristinamycin 0
              pristinamycin IA + 0
              pristinamycin IIA + 0
              prontosil 0
              quinacillin 0
              ribostamycin + 0
              ribostamycin sulfate 0
              ristocetin 0
              rolitetracycline 0
              rosoxacin 0
              roxarsone 0
              roxithromycin + 0
              salicylhydroxamic acid 0
              sertaconazole 0
              sertaconazole nitrate 0
              silver(1+) sulfadiazinate 0
              sirolimus + 0
              spectinomycin 0
              spectinomycin dihydrochloride 0
              spectinomycin hydrochloride hydrate 0
              spiramycin I 0
              spiramycin II 0
              streptomycin + 0
              sulfabenzamide 0
              sulfacetamide 0
              sulfachloropyridazine 0
              sulfadoxine 0
              sulfamazone 0
              sulfamethazine + 0
              sulfaperin 0
              sulfaphenazole 0
              sulfathiourea 0
              sulfisoxazole + 0
              sulfisoxazole diolamine 0
              teicoplanin 0
              telavancin + 0
              telavancin hydrochloride 0
              temafloxacin 0
              tetracycline + 0
              tetracycline zwitterion 0
              thiostrepton 0
              thiram 0
              tiamulin 0
              ticarcillin 0
              tigecycline + 0
              tilmicosin 0
              tinidazole 0
              trimethoprim + 0
              trovafloxacin 0
              trovafloxacin mesylate 0
              vancomycin + 0
              virginiamycin 0
              virginiamycin S1 + 0
              xacduro 0
              xibornol 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 494
    role 501
      application 452
        pharmaceutical 453
          drug 446
            antiinfective agent 77
              antimicrobial drug 33
                antibacterial drug 11
                  (R)-iclaprim + 0
                  (R)-temafloxacin + 0
                  (S)-iclaprim + 0
                  (S)-temafloxacin + 0
                  4-\{((R)-2-Carboxy-3-methoxymethyl-8-oxo-5-thia-1-aza-bicyclo[4.2.0]oct-2-en-7-ylcarbamoyl)-[(Z)-methoxyimino]-methyl\}-thiazol-2-yl-ammonium + 0
                  Augmentin 0
                  Avycaz 0
                  amikacin 0
                  amikacin disulfate 0
                  amoxicillin + 0
                  amoxicillin trihydrate + 0
                  ampicillin + 0
                  antimycobacterial drug + 2
                  antitreponemal drug + 0
                  apramycin 0
                  arasertaconazole + 0
                  arbekacin + 0
                  avibactam 0
                  avibactam sodium + 0
                  azithromycin + 0
                  azlocillin 0
                  aztreonam + 0
                  benzyl isothiocyanate 0
                  benzylpenicillin + 0
                  biapenem 0
                  brodimoprim 0
                  carbapenem MM22383 0
                  carbenicillin + 0
                  carumonam 0
                  cefaclor 0
                  cefadroxil + 0
                  cefaloram 0
                  cefaloridine 0
                  cefalotin + 0
                  cefamandole + 0
                  cefamandole nafate 0
                  cefamandole sodium 0
                  cefatrizine 0
                  cefazedone 0
                  cefazolin 0
                  cefcapene 0
                  cefdaloxime 0
                  cefdinir 0
                  cefditoren + 0
                  cefditoren pivoxil 0
                  cefepime 0
                  cefepime hydrochloride 0
                  cefiderocol 0
                  cefixime 0
                  cefmenoxime + 0
                  cefmetazole 0
                  cefodizime 0
                  cefonicid 0
                  cefoperazone 0
                  ceforanide 0
                  cefotaxime 0
                  cefotetan 0
                  cefotetan disodium 0
                  cefotiam + 0
                  cefotiam dihydrochloride 0
                  cefotiam hexetil dihydrochloride 0
                  cefoxitin 0
                  cefpiramide 0
                  cefpodoxime + 0
                  cefpodoxime proxetil 0
                  cefprozil 0
                  cefsulodin 0
                  ceftaroline + 0
                  ceftaroline fosamil + 0
                  ceftaroline fosamil acetate + 0
                  ceftaroline fosamil acetate monohydrate 0
                  ceftazidime + 0
                  ceftibuten + 0
                  ceftibuten dihydrate 0
                  ceftiolene 0
                  ceftizoxime 0
                  ceftriaxone 0
                  cefuzonam 0
                  cephalexin + 0
                  cephalexin monohydrate 0
                  cephapirin 0
                  cephapirin sodium 0
                  cephradine 0
                  cethromycin 0
                  chloramphenicol + 0
                  chlorphenesin + 0
                  chlorquinaldol 0
                  chlortetracycline 0
                  cinoxacin 0
                  ciprofloxacin + 0
                  ciprofloxacin dihydrochloride 0
                  ciprofloxacin hydrochloride (anhydrous) + 0
                  ciprofloxacin hydrochloride hydrate 0
                  clarithromycin 0
                  clavulanic acid 0
                  clometocillin 0
                  clomocycline 0
                  cloxacillin 0
                  co-trimoxazole 0
                  cyclacillin 0
                  dalbavancin 0
                  dalfopristin 0
                  daptomycin 0
                  demeclocycline + 0
                  demeclocycline hydrochloride 0
                  dextrofloxacin + 8
                  dicloxacillin 0
                  difloxacin 0
                  doxycycline + 0
                  doxycycline hyclate 0
                  doxycycline monohydrate 0
                  durlobactam 0
                  durlobactam sodium + 0
                  enoxacin 0
                  ertapenem 0
                  ertapenem sodium 0
                  fenticonazole 0
                  fenticonazole nitrate 0
                  fidaxomicin 0
                  finafloxacin 0
                  fleroxacin 0
                  flomoxef 0
                  flucloxacillin + 0
                  flurithromycin 0
                  framycetin + 0
                  fumagillin + 0
                  furagin 0
                  furaltadone 0
                  furazolidone 0
                  gamithromycin 0
                  garenoxacin 0
                  gemifloxacin + 0
                  hetacillin 0
                  hexamethylenetetramine + 0
                  humulone 0
                  iclaprim 0
                  imipenem + 0
                  isoconazole 0
                  isoconazole nitrate 0
                  josamycin 0
                  kanamycin A sulfate 0
                  levofloxacin + 8
                  linezolid 0
                  loracarbef 0
                  lymecycline 0
                  malachite green cation + 0
                  marbofloxacin 5
                  mecillinam + 0
                  meropenem + 0
                  meropenem trihydrate 0
                  methacycline 0
                  methicillin + 0
                  metronidazole + 0
                  metronidazole benzoate 0
                  metronidazole hydrochloride 0
                  mezlocillin 0
                  minocycline + 0
                  moxalactam 0
                  moxifloxacin 0
                  moxifloxacin hydrochloride 0
                  mupirocin 0
                  mupirocin calcium (anhydrous) + 0
                  mupirocin calcium hydrate 0
                  nadifloxacin + 0
                  nafcillin 0
                  nalidixic acid 0
                  neomycin sulfate 0
                  nifurtoinol 0
                  nitrofurantoin 0
                  nitrofurazone 0
                  norfloxacin 0
                  ofloxacin 8
                  oritavancin + 0
                  oritavancin bisphosphate 0
                  ornidazole 0
                  oxacillin + 0
                  oxolinic acid 0
                  oxytetracycline 0
                  paromomycin + 0
                  paromomycin sulfate 0
                  pefloxacin + 0
                  pefloxacin mesylate 0
                  penamecillin 0
                  pipemidic acid 0
                  piperacillin + 0
                  piromidic acid 0
                  pivmecillinam + 0
                  potassium clavulanate + 0
                  pristinamycin 0
                  pristinamycin IA + 0
                  pristinamycin IIA + 0
                  prontosil 0
                  quinacillin 0
                  ribostamycin + 0
                  ribostamycin sulfate 0
                  ristocetin 0
                  rolitetracycline 0
                  rosoxacin 0
                  roxarsone 0
                  roxithromycin + 0
                  salicylhydroxamic acid 0
                  sertaconazole 0
                  sertaconazole nitrate 0
                  silver(1+) sulfadiazinate 0
                  sirolimus + 0
                  spectinomycin 0
                  spectinomycin dihydrochloride 0
                  spectinomycin hydrochloride hydrate 0
                  spiramycin I 0
                  spiramycin II 0
                  streptomycin + 0
                  sulfabenzamide 0
                  sulfacetamide 0
                  sulfachloropyridazine 0
                  sulfadoxine 0
                  sulfamazone 0
                  sulfamethazine + 0
                  sulfaperin 0
                  sulfaphenazole 0
                  sulfathiourea 0
                  sulfisoxazole + 0
                  sulfisoxazole diolamine 0
                  teicoplanin 0
                  telavancin + 0
                  telavancin hydrochloride 0
                  temafloxacin 0
                  tetracycline + 0
                  tetracycline zwitterion 0
                  thiostrepton 0
                  thiram 0
                  tiamulin 0
                  ticarcillin 0
                  tigecycline + 0
                  tilmicosin 0
                  tinidazole 0
                  trimethoprim + 0
                  trovafloxacin 0
                  trovafloxacin mesylate 0
                  vancomycin + 0
                  virginiamycin 0
                  virginiamycin S1 + 0
                  xacduro 0
                  xibornol 0
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